More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_3013 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_4636  phosphoribosylamine/glycine ligase  81.8 
 
 		 416 aa  659    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.728715  normal  0.385617 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3013  phosphoribosylamine--glycine ligase  100 
 
 		 424 aa  838    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0197  phosphoribosylamine/glycine ligase  74.03 
 
 		 415 aa  597  1e-169  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0170  phosphoribosylamine/glycine ligase  70.63 
 
 		 420 aa  553  1e-156  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.133071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0386  Phosphoribosylamine--glycine ligase  68.95 
 
 		 410 aa  530  1e-149  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18510  phosphoribosylamine--glycine ligase  62.32 
 
 		 429 aa  503  1e-141  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35150  phosphoribosylamine--glycine ligase  62.03 
 
 		 429 aa  495  1e-139  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3600  phosphoribosylamine/glycine ligase  64.73 
 
 		 433 aa  494  1e-139  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3187  phosphoribosylamine--glycine ligase  59.24 
 
 		 438 aa  481  1e-134  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0279  phosphoribosylamine/glycine ligase  60.64 
 
 		 417 aa  473  1e-132  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3406  phosphoribosylamine--glycine ligase  58.55 
 
 		 446 aa  474  1e-132  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4342  phosphoribosylamine--glycine ligase  63.55 
 
 		 416 aa  473  1e-132  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.466735  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2413  phosphoribosylamine/glycine ligase  57.51 
 
 		 436 aa  465  9.999999999999999e-131  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.545734  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2960  phosphoribosylamine/glycine ligase  62.76 
 
 		 433 aa  457  1e-127  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38170  phosphoribosylamine--glycine ligase  60.98 
 
 		 429 aa  457  1e-127  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0134  phosphoribosylamine--glycine ligase  61.37 
 
 		 416 aa  456  1e-127  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.415315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6903  phosphoribosylamine/glycine ligase  60.1 
 
 		 419 aa  453  1.0000000000000001e-126  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3134  phosphoribosylamine/glycine ligase  60.71 
 
 		 428 aa  454  1.0000000000000001e-126  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.808887  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0831  phosphoribosylamine/glycine ligase  59.24 
 
 		 417 aa  449  1e-125  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0251625  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0140  phosphoribosylamine--glycine ligase  61.52 
 
 		 416 aa  445  1.0000000000000001e-124  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000376127 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2127  phosphoribosylamine--glycine ligase  62.68 
 
 		 420 aa  440  9.999999999999999e-123  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5132  phosphoribosylamine/glycine ligase  61.76 
 
 		 420 aa  437  1e-121  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0208  phosphoribosylamine--glycine ligase  61.19 
 
 		 439 aa  433  1e-120  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.428663 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10787  phosphoribosylamine--glycine ligase  57.14 
 
 		 422 aa  431  1e-120  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23300  phosphoribosylamine--glycine ligase  59.62 
 
 		 433 aa  431  1e-119  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4370  phosphoribosylamine--glycine ligase  60.24 
 
 		 436 aa  429  1e-119  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.766514 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05830  phosphoribosylamine--glycine ligase  57.53 
 
 		 446 aa  426  1e-118  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.822028  normal  0.495847 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3626  phosphoribosylamine/glycine ligase  59.71 
 
 		 411 aa  427  1e-118  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.241782  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4954  phosphoribosylamine--glycine ligase  58.78 
 
 		 422 aa  423  1e-117  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.1743 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4774  phosphoribosylamine/glycine ligase  60.33 
 
 		 421 aa  425  1e-117  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4571  phosphoribosylamine--glycine ligase  58.55 
 
 		 422 aa  422  1e-117  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.840997  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6145  phosphoribosylamine/glycine ligase  58.66 
 
 		 411 aa  424  1e-117  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.106409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4659  phosphoribosylamine--glycine ligase  58.55 
 
 		 422 aa  422  1e-117  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0824941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1608  phosphoribosylamine--glycine ligase  57.85 
 
 		 427 aa  421  1e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5150  phosphoribosylamine--glycine ligase  57.38 
 
 		 430 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4100  phosphoribosylamine--glycine ligase  64.11 
 
 		 404 aa  402  1e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.464449 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1777  phosphoribosylamine/glycine ligase  48.02 
 
 		 428 aa  369  1e-101  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0991  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.88 
 
 		 425 aa  363  4e-99  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0627  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.63 
 
 		 425 aa  363  4e-99  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.154285 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1699  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.92 
 
 		 427 aa  355  5.999999999999999e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.251383  normal  0.989876 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4619  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.87 
 
 		 427 aa  353  2e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2591  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.52 
 
 		 423 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1480  phosphoribosylamine/glycine ligase  45.84 
 
 		 419 aa  345  6e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0459  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.24 
 
 		 429 aa  343  4e-93  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0529  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.73 
 
 		 429 aa  343  5e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.863272  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23090  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.81 
 
 		 425 aa  342  5.999999999999999e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.121893  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0526  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.18 
 
 		 419 aa  342  8e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2759  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.6 
 
 		 424 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000179977  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0619  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.21 
 
 		 427 aa  339  5.9999999999999996e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.374111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2904  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.57 
 
 		 423 aa  338  7e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000288348  normal  0.785686 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3149  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.68 
 
 		 433 aa  338  8e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.868678  normal  0.802626 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2231  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.34 
 
 		 423 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0925  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.31 
 
 		 433 aa  336  3.9999999999999995e-91  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0646  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.75 
 
 		 436 aa  336  3.9999999999999995e-91  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3845  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.39 
 
 		 423 aa  336  5e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000183828  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1969  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.5 
 
 		 433 aa  336  5e-91  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.949647 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27830  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.39 
 
 		 421 aa  336  5.999999999999999e-91  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0266  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.31 
 
 		 427 aa  335  1e-90  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000213794  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0779  phosphoribosylamine/glycine ligase  46.12 
 
 		 428 aa  334  2e-90  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00193673  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2652  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.15 
 
 		 429 aa  334  2e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1628  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.46 
 
 		 425 aa  334  2e-90  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3451  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.54 
 
 		 428 aa  333  3e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.264337  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2552  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.73 
 
 		 426 aa  333  4e-90  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0177333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1442  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.65 
 
 		 426 aa  332  6e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.577495  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0414  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.46 
 
 		 427 aa  332  7.000000000000001e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.31965  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0026  phosphoribosylamine/glycine ligase  45.58 
 
 		 704 aa  332  8e-90  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3173  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.02 
 
 		 428 aa  332  8e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0826007  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4029  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.1 
 
 		 420 aa  332  9e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3379  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.24 
 
 		 414 aa  332  1e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.104647 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2043  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.29 
 
 		 421 aa  331  1e-89  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.453314 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3523  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.86 
 
 		 423 aa  331  1e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0437232 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2453  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.28 
 
 		 424 aa  331  1e-89  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.386914  normal  0.350843 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1952  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.78 
 
 		 427 aa  330  2e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3457  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.63 
 
 		 423 aa  331  2e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.021302  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0422  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.35 
 
 		 427 aa  330  2e-89  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1863  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.26 
 
 		 442 aa  330  2e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.466784  hitchhiker  0.0074915 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0610  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.92 
 
 		 423 aa  330  3e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00101284  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0036  phosphoribosylamine/glycine ligase  45.83 
 
 		 430 aa  330  3e-89  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3668  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.24 
 
 		 425 aa  330  3e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0231  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.92 
 
 		 425 aa  330  3e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.595549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1899  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.45 
 
 		 428 aa  330  3e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.543102  normal  0.253787 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03941  Phosphoribosylamine-glycine ligase  45.07 
 
 		 430 aa  330  4e-89  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0345  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.34 
 
 		 423 aa  330  4e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11500  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.14 
 
 		 430 aa  329  6e-89  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.089244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0392  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.94 
 
 		 424 aa  329  6e-89  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.423575  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2361  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.68 
 
 		 422 aa  329  6e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4613  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.81 
 
 		 431 aa  329  7e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.302277 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3997  phosphoribosylamine/glycine ligase  45.37 
 
 		 423 aa  328  1.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3227  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.67 
 
 		 425 aa  328  1.0000000000000001e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4039  phosphoribosylamine/glycine ligase  45.37 
 
 		 423 aa  328  1.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.324775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4876  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.56 
 
 		 431 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1704  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.22 
 
 		 428 aa  328  1.0000000000000001e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.382123  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0372  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.87 
 
 		 423 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0331  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.87 
 
 		 423 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4544  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.63 
 
 		 428 aa  327  2.0000000000000001e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.185185 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002184  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.52 
 
 		 429 aa  327  2.0000000000000001e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.25624  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0807  phosphoribosylamine/glycine ligase  50.83 
 
 		 427 aa  328  2.0000000000000001e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.966412 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1353  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.31 
 
 		 427 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.2506  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4104  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.79 
 
 		 427 aa  327  3e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0909  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.62 
 
 		 432 aa  327  3e-88  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>