More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0386 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_0386  Phosphoribosylamine--glycine ligase  100 
 
 		 410 aa  806    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0170  phosphoribosylamine/glycine ligase  77.13 
 
 		 420 aa  621  1e-177  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.133071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0197  phosphoribosylamine/glycine ligase  71.39 
 
 		 415 aa  553  1e-156  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3013  phosphoribosylamine--glycine ligase  68.95 
 
 		 424 aa  544  1e-153  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4636  phosphoribosylamine/glycine ligase  65.86 
 
 		 416 aa  516  1.0000000000000001e-145  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.728715  normal  0.385617 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18510  phosphoribosylamine--glycine ligase  65.45 
 
 		 429 aa  498  1e-140  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35150  phosphoribosylamine--glycine ligase  61.88 
 
 		 429 aa  478  1e-134  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3187  phosphoribosylamine--glycine ligase  61.39 
 
 		 438 aa  479  1e-134  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0134  phosphoribosylamine--glycine ligase  66.01 
 
 		 416 aa  471  1e-132  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.415315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0279  phosphoribosylamine/glycine ligase  62.1 
 
 		 417 aa  472  1e-132  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3406  phosphoribosylamine--glycine ligase  61.39 
 
 		 446 aa  473  1e-132  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6903  phosphoribosylamine/glycine ligase  63.75 
 
 		 419 aa  466  9.999999999999999e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4342  phosphoribosylamine--glycine ligase  64.95 
 
 		 416 aa  465  9.999999999999999e-131  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.466735  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3600  phosphoribosylamine/glycine ligase  62.08 
 
 		 433 aa  463  1e-129  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2960  phosphoribosylamine/glycine ligase  64.17 
 
 		 433 aa  461  1e-129  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0140  phosphoribosylamine--glycine ligase  66.01 
 
 		 416 aa  459  9.999999999999999e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000376127 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2413  phosphoribosylamine/glycine ligase  57.61 
 
 		 436 aa  457  1e-127  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.545734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38170  phosphoribosylamine--glycine ligase  62.8 
 
 		 429 aa  454  1.0000000000000001e-126  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0831  phosphoribosylamine/glycine ligase  61.22 
 
 		 417 aa  444  1e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0251625  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3134  phosphoribosylamine/glycine ligase  60.82 
 
 		 428 aa  441  9.999999999999999e-123  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.808887  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6145  phosphoribosylamine/glycine ligase  61.44 
 
 		 411 aa  439  9.999999999999999e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.106409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2127  phosphoribosylamine--glycine ligase  62.81 
 
 		 420 aa  439  9.999999999999999e-123  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10787  phosphoribosylamine--glycine ligase  59.52 
 
 		 422 aa  437  1e-121  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3626  phosphoribosylamine/glycine ligase  62.17 
 
 		 411 aa  435  1e-121  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.241782  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4774  phosphoribosylamine/glycine ligase  62.41 
 
 		 421 aa  431  1e-120  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5132  phosphoribosylamine/glycine ligase  61.54 
 
 		 420 aa  425  1e-118  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23300  phosphoribosylamine--glycine ligase  59.28 
 
 		 433 aa  426  1e-118  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5150  phosphoribosylamine--glycine ligase  61.69 
 
 		 430 aa  422  1e-117  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4954  phosphoribosylamine--glycine ligase  60.72 
 
 		 422 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.1743 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4571  phosphoribosylamine--glycine ligase  60.72 
 
 		 422 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.840997  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1608  phosphoribosylamine--glycine ligase  60 
 
 		 427 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4659  phosphoribosylamine--glycine ligase  60.72 
 
 		 422 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0824941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4100  phosphoribosylamine--glycine ligase  66.5 
 
 		 404 aa  414  1e-114  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.464449 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0208  phosphoribosylamine--glycine ligase  57.97 
 
 		 439 aa  410  1e-113  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.428663 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4370  phosphoribosylamine--glycine ligase  58.21 
 
 		 436 aa  410  1e-113  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.766514 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05830  phosphoribosylamine--glycine ligase  55.23 
 
 		 446 aa  398  9.999999999999999e-111  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.822028  normal  0.495847 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1699  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.81 
 
 		 427 aa  369  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.251383  normal  0.989876 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1777  phosphoribosylamine/glycine ligase  48.69 
 
 		 428 aa  368  1e-100  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0026  phosphoribosylamine/glycine ligase  48.67 
 
 		 704 aa  365  1e-99  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0172  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.96 
 
 		 429 aa  365  1e-99  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0991  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.6 
 
 		 425 aa  363  4e-99  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0646  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.91 
 
 		 436 aa  362  6e-99  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4619  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.24 
 
 		 427 aa  361  2e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2231  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.96 
 
 		 423 aa  359  4e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0529  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.6 
 
 		 429 aa  358  8e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.863272  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2453  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.92 
 
 		 424 aa  358  9e-98  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.386914  normal  0.350843 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4104  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.1 
 
 		 427 aa  356  3.9999999999999996e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0471  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.34 
 
 		 423 aa  356  3.9999999999999996e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1480  phosphoribosylamine/glycine ligase  45.89 
 
 		 419 aa  356  5e-97  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3845  phosphoribosylamine--glycine ligase  47 
 
 		 423 aa  355  5.999999999999999e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000183828  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2361  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.23 
 
 		 422 aa  355  6.999999999999999e-97  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3149  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.64 
 
 		 433 aa  355  1e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.868678  normal  0.802626 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2043  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.24 
 
 		 421 aa  354  2e-96  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.453314 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1353  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.14 
 
 		 427 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.2506  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0414  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.04 
 
 		 427 aa  353  4e-96  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.31965  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0422  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.04 
 
 		 427 aa  353  5e-96  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4039  phosphoribosylamine/glycine ligase  46.54 
 
 		 423 aa  352  8.999999999999999e-96  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.324775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3997  phosphoribosylamine/glycine ligase  46.54 
 
 		 423 aa  352  8.999999999999999e-96  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2389  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.75 
 
 		 422 aa  351  2e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0264  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.95 
 
 		 430 aa  349  6e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.46971  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2552  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.36 
 
 		 426 aa  348  1e-94  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0177333  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1989  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.28 
 
 		 422 aa  348  1e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.187802  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23090  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.79 
 
 		 425 aa  348  1e-94  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.121893  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2191  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.75 
 
 		 422 aa  347  2e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0610  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.48 
 
 		 423 aa  346  3e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00101284  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3173  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.12 
 
 		 428 aa  347  3e-94  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0826007  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0960  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.93 
 
 		 426 aa  346  5e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1863  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.14 
 
 		 442 aa  345  6e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.466784  hitchhiker  0.0074915 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4975  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.02 
 
 		 423 aa  345  6e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1983  phosphoribosylamine/glycine ligase  47 
 
 		 423 aa  345  1e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.853313 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0909  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.24 
 
 		 432 aa  345  1e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1628  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.76 
 
 		 425 aa  344  1e-93  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2591  phosphoribosylamine--glycine ligase  47 
 
 		 423 aa  345  1e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2904  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.72 
 
 		 423 aa  344  2e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000288348  normal  0.785686 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0619  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.88 
 
 		 427 aa  343  2.9999999999999997e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.374111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1392  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.56 
 
 		 420 aa  343  4e-93  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0345  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.3 
 
 		 423 aa  342  5.999999999999999e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1442  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.06 
 
 		 426 aa  342  5.999999999999999e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.577495  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0331  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.3 
 
 		 423 aa  342  8e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0838  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.88 
 
 		 425 aa  342  9e-93  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.083606  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0735  phosphoribosylamine/glycine ligase  46.41 
 
 		 425 aa  341  1e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.525706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1722  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.96 
 
 		 425 aa  341  1e-92  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0627  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.37 
 
 		 425 aa  341  2e-92  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.154285 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0372  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.06 
 
 		 423 aa  339  4e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0271  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.06 
 
 		 423 aa  340  4e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3467  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.17 
 
 		 423 aa  340  4e-92  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2323  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.61 
 
 		 429 aa  340  4e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.125717  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0286  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.3 
 
 		 423 aa  339  5e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0299  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.3 
 
 		 423 aa  339  5e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0535  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.1 
 
 		 427 aa  339  5.9999999999999996e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.201111 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0392  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.75 
 
 		 424 aa  339  5.9999999999999996e-92  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.423575  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3708  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.67 
 
 		 428 aa  338  9.999999999999999e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0202463  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5575  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.35 
 
 		 429 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1969  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.2 
 
 		 433 aa  338  9.999999999999999e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.949647 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1140  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.51 
 
 		 430 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4544  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.76 
 
 		 428 aa  337  1.9999999999999998e-91  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.185185 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2871  phosphoribosylamine/glycine ligase  47.95 
 
 		 449 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0927595 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3379  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.57 
 
 		 414 aa  337  1.9999999999999998e-91  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.104647 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2759  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.28 
 
 		 424 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000179977  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27830  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.63 
 
 		 421 aa  337  1.9999999999999998e-91  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>