More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2960 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_2960  phosphoribosylamine/glycine ligase  100 
 
 		 433 aa  832    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35150  phosphoribosylamine--glycine ligase  68.49 
 
 		 429 aa  551  1e-155  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3600  phosphoribosylamine/glycine ligase  67.45 
 
 		 433 aa  518  1.0000000000000001e-145  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3134  phosphoribosylamine/glycine ligase  70.05 
 
 		 428 aa  516  1.0000000000000001e-145  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.808887  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2413  phosphoribosylamine/glycine ligase  63.8 
 
 		 436 aa  512  1e-144  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.545734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0197  phosphoribosylamine/glycine ligase  65.05 
 
 		 415 aa  514  1e-144  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3013  phosphoribosylamine--glycine ligase  63.23 
 
 		 424 aa  505  9.999999999999999e-143  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18510  phosphoribosylamine--glycine ligase  64.42 
 
 		 429 aa  505  9.999999999999999e-143  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3406  phosphoribosylamine--glycine ligase  64.5 
 
 		 446 aa  505  9.999999999999999e-143  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3187  phosphoribosylamine--glycine ligase  63.66 
 
 		 438 aa  499  1e-140  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0170  phosphoribosylamine/glycine ligase  62.41 
 
 		 420 aa  495  1e-139  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.133071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0386  Phosphoribosylamine--glycine ligase  64.17 
 
 		 410 aa  491  9.999999999999999e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23300  phosphoribosylamine--glycine ligase  63.95 
 
 		 433 aa  480  1e-134  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0279  phosphoribosylamine/glycine ligase  62.76 
 
 		 417 aa  480  1e-134  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4636  phosphoribosylamine/glycine ligase  62.06 
 
 		 416 aa  481  1e-134  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.728715  normal  0.385617 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6903  phosphoribosylamine/glycine ligase  62.5 
 
 		 419 aa  468  9.999999999999999e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4342  phosphoribosylamine--glycine ligase  64.64 
 
 		 416 aa  466  9.999999999999999e-131  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.466735  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0134  phosphoribosylamine--glycine ligase  62.96 
 
 		 416 aa  456  1e-127  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.415315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0140  phosphoribosylamine--glycine ligase  63.26 
 
 		 416 aa  444  1e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000376127 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2127  phosphoribosylamine--glycine ligase  61.86 
 
 		 420 aa  441  1e-123  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4774  phosphoribosylamine/glycine ligase  63.99 
 
 		 421 aa  438  9.999999999999999e-123  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6145  phosphoribosylamine/glycine ligase  61.36 
 
 		 411 aa  439  9.999999999999999e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.106409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38170  phosphoribosylamine--glycine ligase  60.89 
 
 		 429 aa  436  1e-121  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4100  phosphoribosylamine--glycine ligase  69.78 
 
 		 404 aa  434  1e-120  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.464449 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3626  phosphoribosylamine/glycine ligase  59.15 
 
 		 411 aa  416  9.999999999999999e-116  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.241782  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0831  phosphoribosylamine/glycine ligase  57.18 
 
 		 417 aa  412  1e-114  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0251625  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05830  phosphoribosylamine--glycine ligase  59.59 
 
 		 446 aa  414  1e-114  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.822028  normal  0.495847 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4370  phosphoribosylamine--glycine ligase  58.55 
 
 		 436 aa  411  1e-114  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.766514 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4954  phosphoribosylamine--glycine ligase  58.12 
 
 		 422 aa  412  1e-114  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.1743 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5132  phosphoribosylamine/glycine ligase  59.72 
 
 		 420 aa  410  1e-113  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4571  phosphoribosylamine--glycine ligase  58.12 
 
 		 422 aa  411  1e-113  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.840997  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0208  phosphoribosylamine--glycine ligase  57.61 
 
 		 439 aa  410  1e-113  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.428663 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4659  phosphoribosylamine--glycine ligase  58.12 
 
 		 422 aa  411  1e-113  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0824941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10787  phosphoribosylamine--glycine ligase  54.46 
 
 		 422 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1608  phosphoribosylamine--glycine ligase  57.44 
 
 		 427 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5150  phosphoribosylamine--glycine ligase  56.98 
 
 		 430 aa  393  1e-108  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1699  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.49 
 
 		 427 aa  365  1e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.251383  normal  0.989876 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4029  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.85 
 
 		 420 aa  361  1e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0635  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.08 
 
 		 420 aa  360  4e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0991  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.62 
 
 		 425 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0471  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.77 
 
 		 423 aa  357  2.9999999999999997e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1777  phosphoribosylamine/glycine ligase  47.34 
 
 		 428 aa  354  2e-96  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0026  phosphoribosylamine/glycine ligase  46.31 
 
 		 704 aa  354  2e-96  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0172  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.93 
 
 		 429 aa  354  2e-96  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0627  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.77 
 
 		 425 aa  352  8.999999999999999e-96  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.154285 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0960  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.54 
 
 		 426 aa  351  1e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4619  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.17 
 
 		 427 aa  352  1e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1480  phosphoribosylamine/glycine ligase  45.37 
 
 		 419 aa  351  2e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0529  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.95 
 
 		 429 aa  349  5e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.863272  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23090  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.45 
 
 		 425 aa  349  6e-95  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.121893  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1412  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.8 
 
 		 422 aa  348  8e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.8215  normal  0.900094 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2231  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.22 
 
 		 423 aa  348  9e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3302  phosphoribosylamine--glycine ligase  47 
 
 		 422 aa  348  9e-95  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0635766 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2323  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.08 
 
 		 429 aa  348  1e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.125717  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0036  phosphoribosylamine/glycine ligase  46.65 
 
 		 430 aa  347  2e-94  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4104  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.12 
 
 		 427 aa  347  3e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1722  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.26 
 
 		 425 aa  346  5e-94  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0459  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.59 
 
 		 429 aa  343  4e-93  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0535  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.56 
 
 		 427 aa  343  4e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.201111 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3149  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.91 
 
 		 433 aa  342  7e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.868678  normal  0.802626 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1847  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.39 
 
 		 420 aa  341  1e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.180423  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0496  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.39 
 
 		 420 aa  342  1e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.18255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1863  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.98 
 
 		 442 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.466784  hitchhiker  0.0074915 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0719  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.41 
 
 		 426 aa  339  4e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.63678  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0578  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.1 
 
 		 425 aa  339  5.9999999999999996e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0909  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.44 
 
 		 432 aa  338  8e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2453  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.56 
 
 		 424 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.386914  normal  0.350843 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0422  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.95 
 
 		 427 aa  337  1.9999999999999998e-91  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0414  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.95 
 
 		 427 aa  336  3.9999999999999995e-91  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.31965  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0807  phosphoribosylamine/glycine ligase  52.64 
 
 		 427 aa  336  3.9999999999999995e-91  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.966412 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1353  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.06 
 
 		 427 aa  335  7e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.2506  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1140  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.31 
 
 		 430 aa  335  1e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2361  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.14 
 
 		 422 aa  335  1e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1946  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.08 
 
 		 420 aa  334  2e-90  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0479651 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2552  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.93 
 
 		 426 aa  333  3e-90  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0177333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0526  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.68 
 
 		 419 aa  333  4e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4327  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.36 
 
 		 431 aa  333  4e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.101605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2342  phosphoribosylamine/glycine ligase  45.6 
 
 		 428 aa  332  6e-90  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.51337  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0231  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.37 
 
 		 425 aa  332  8e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.595549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0619  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.72 
 
 		 427 aa  331  1e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.374111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0646  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.74 
 
 		 436 aa  331  1e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0264  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.79 
 
 		 430 aa  332  1e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.46971  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3379  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.14 
 
 		 414 aa  330  4e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.104647 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0392  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.86 
 
 		 424 aa  328  9e-89  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.423575  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27830  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.83 
 
 		 421 aa  328  1.0000000000000001e-88  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0345  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.91 
 
 		 423 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0360  Phosphoribosylamine--glycine ligase  46.35 
 
 		 430 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1540  phosphoribosylamine/glycine ligase  48.04 
 
 		 433 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.427577  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2728  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.62 
 
 		 420 aa  327  2.0000000000000001e-88  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0882976  normal  0.135316 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2389  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.7 
 
 		 422 aa  327  4.0000000000000003e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4544  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.62 
 
 		 428 aa  326  5e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.185185 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0331  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.45 
 
 		 423 aa  326  6e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0271  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.45 
 
 		 423 aa  325  7e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3871  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.81 
 
 		 435 aa  325  7e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.485049  normal  0.0530756 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0177  phosphoribosylamine/glycine ligase  46.38 
 
 		 429 aa  325  1e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.348487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11500  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.75 
 
 		 430 aa  324  1e-87  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.089244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1628  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.95 
 
 		 425 aa  325  1e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3173  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.24 
 
 		 428 aa  325  1e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0826007  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4180  phosphoribosylamine/glycine ligase  47.58 
 
 		 435 aa  325  1e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.94163  normal  0.510323 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0372  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.99 
 
 		 423 aa  325  1e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>