More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0197 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_0197  phosphoribosylamine/glycine ligase  100 
 
 
415 aa  817    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3013  phosphoribosylamine--glycine ligase  74.03 
 
 
424 aa  597  1e-169  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4636  phosphoribosylamine/glycine ligase  70.46 
 
 
416 aa  561  1.0000000000000001e-159  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.728715  normal  0.385617 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0170  phosphoribosylamine/glycine ligase  69.49 
 
 
420 aa  554  1e-156  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.133071  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0386  Phosphoribosylamine--glycine ligase  71.39 
 
 
410 aa  540  9.999999999999999e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3600  phosphoribosylamine/glycine ligase  65.46 
 
 
433 aa  517  1.0000000000000001e-145  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35150  phosphoribosylamine--glycine ligase  63.53 
 
 
429 aa  504  1e-141  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0279  phosphoribosylamine/glycine ligase  63.81 
 
 
417 aa  500  1e-140  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4342  phosphoribosylamine--glycine ligase  67.24 
 
 
416 aa  496  1e-139  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.466735  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18510  phosphoribosylamine--glycine ligase  63.4 
 
 
429 aa  489  1e-137  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2413  phosphoribosylamine/glycine ligase  61.07 
 
 
436 aa  483  1e-135  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.545734  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2960  phosphoribosylamine/glycine ligase  65.05 
 
 
433 aa  472  1e-132  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3187  phosphoribosylamine--glycine ligase  59.81 
 
 
438 aa  474  1e-132  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0134  phosphoribosylamine--glycine ligase  64.58 
 
 
416 aa  474  1e-132  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.415315  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3134  phosphoribosylamine/glycine ligase  63.66 
 
 
428 aa  471  1e-132  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.808887  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3406  phosphoribosylamine--glycine ligase  59.57 
 
 
446 aa  473  1e-132  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38170  phosphoribosylamine--glycine ligase  62.26 
 
 
429 aa  468  1.0000000000000001e-131  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6903  phosphoribosylamine/glycine ligase  60.77 
 
 
419 aa  462  1e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0140  phosphoribosylamine--glycine ligase  64.89 
 
 
416 aa  457  1e-127  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000376127 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5132  phosphoribosylamine/glycine ligase  61.48 
 
 
420 aa  448  1e-125  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23300  phosphoribosylamine--glycine ligase  61.3 
 
 
433 aa  450  1e-125  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2127  phosphoribosylamine--glycine ligase  63.59 
 
 
420 aa  448  1e-125  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4774  phosphoribosylamine/glycine ligase  63.27 
 
 
421 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10787  phosphoribosylamine--glycine ligase  57.45 
 
 
422 aa  444  1e-123  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4954  phosphoribosylamine--glycine ligase  60.05 
 
 
422 aa  438  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.1743 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0831  phosphoribosylamine/glycine ligase  58.37 
 
 
417 aa  437  1e-121  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0251625  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4571  phosphoribosylamine--glycine ligase  59.81 
 
 
422 aa  437  1e-121  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.840997  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6145  phosphoribosylamine/glycine ligase  59.9 
 
 
411 aa  436  1e-121  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.106409  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4659  phosphoribosylamine--glycine ligase  59.81 
 
 
422 aa  437  1e-121  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0824941  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3626  phosphoribosylamine/glycine ligase  60.1 
 
 
411 aa  434  1e-120  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.241782  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1608  phosphoribosylamine--glycine ligase  59.1 
 
 
427 aa  427  1e-118  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05830  phosphoribosylamine--glycine ligase  58.05 
 
 
446 aa  421  1e-116  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.822028  normal  0.495847 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4370  phosphoribosylamine--glycine ligase  58.94 
 
 
436 aa  421  1e-116  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.766514 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0208  phosphoribosylamine--glycine ligase  58.45 
 
 
439 aa  421  1e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.428663 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5150  phosphoribosylamine--glycine ligase  59.1 
 
 
430 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4100  phosphoribosylamine--glycine ligase  64.27 
 
 
404 aa  409  1e-113  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.464449 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0991  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.53 
 
 
425 aa  373  1e-102  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1777  phosphoribosylamine/glycine ligase  48.7 
 
 
428 aa  371  1e-101  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0026  phosphoribosylamine/glycine ligase  48.34 
 
 
704 aa  369  1e-101  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1480  phosphoribosylamine/glycine ligase  46.3 
 
 
419 aa  355  6.999999999999999e-97  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1699  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.82 
 
 
427 aa  355  1e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.251383  normal  0.989876 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23090  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.26 
 
 
425 aa  353  2e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.121893  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2453  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.22 
 
 
424 aa  353  2.9999999999999997e-96  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.386914  normal  0.350843 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0172  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.81 
 
 
429 aa  353  4e-96  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3379  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.76 
 
 
414 aa  350  3e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.104647 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1774  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.84 
 
 
428 aa  349  5e-95  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000323466  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3149  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.29 
 
 
433 aa  348  9e-95  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.868678  normal  0.802626 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0459  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.79 
 
 
429 aa  348  1e-94  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0471  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.03 
 
 
423 aa  348  1e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27830  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.93 
 
 
421 aa  347  2e-94  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3845  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.26 
 
 
423 aa  344  2e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000183828  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3175  phosphoribosylamine--glycine ligase  50 
 
 
418 aa  343  2e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2871  phosphoribosylamine/glycine ligase  48.45 
 
 
449 aa  344  2e-93  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0927595 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0264  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.55 
 
 
430 aa  340  2e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.46971  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0779  phosphoribosylamine/glycine ligase  46.43 
 
 
428 aa  340  2.9999999999999998e-92  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00193673  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2323  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.39 
 
 
429 aa  338  8e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.125717  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1628  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.82 
 
 
425 aa  337  2.9999999999999997e-91  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0526  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.33 
 
 
419 aa  337  2.9999999999999997e-91  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2552  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.32 
 
 
426 aa  336  3.9999999999999995e-91  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0177333  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0619  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.86 
 
 
427 aa  336  5e-91  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.374111  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0036  phosphoribosylamine/glycine ligase  47.61 
 
 
430 aa  336  5e-91  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11500  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.76 
 
 
430 aa  336  5e-91  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.089244  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2231  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.26 
 
 
423 aa  335  5.999999999999999e-91  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0627  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.61 
 
 
425 aa  335  7e-91  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.154285 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0529  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.1 
 
 
429 aa  335  7.999999999999999e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.863272  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2692  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.29 
 
 
418 aa  335  1e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.813213  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2904  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.21 
 
 
423 aa  334  1e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000288348  normal  0.785686 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0807  phosphoribosylamine/glycine ligase  51.18 
 
 
427 aa  335  1e-90  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.966412 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2043  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.88 
 
 
421 aa  333  2e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.453314 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2591  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.97 
 
 
423 aa  334  2e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1540  phosphoribosylamine/glycine ligase  48.94 
 
 
433 aa  333  3e-90  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.427577  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0177  phosphoribosylamine/glycine ligase  47.43 
 
 
429 aa  333  3e-90  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.348487  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0345  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.36 
 
 
423 aa  333  3e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0946  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.74 
 
 
420 aa  333  5e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0422  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.81 
 
 
427 aa  332  8e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0231  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.94 
 
 
425 aa  332  8e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.595549  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0646  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.16 
 
 
436 aa  332  9e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0414  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.81 
 
 
427 aa  331  1e-89  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.31965  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2361  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.73 
 
 
422 aa  331  1e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0610  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.5 
 
 
423 aa  330  2e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00101284  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3457  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.31 
 
 
423 aa  330  2e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.021302  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03941  Phosphoribosylamine-glycine ligase  45.65 
 
 
430 aa  331  2e-89  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4039  phosphoribosylamine/glycine ligase  46.19 
 
 
423 aa  330  2e-89  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.324775  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3997  phosphoribosylamine/glycine ligase  46.19 
 
 
423 aa  330  2e-89  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0372  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.89 
 
 
423 aa  331  2e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3227  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.41 
 
 
425 aa  330  3e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0331  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.13 
 
 
423 aa  330  3e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0271  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.13 
 
 
423 aa  330  4e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3523  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.31 
 
 
423 aa  329  4e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0437232 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1983  phosphoribosylamine/glycine ligase  45.37 
 
 
423 aa  329  4e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.853313 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0735  phosphoribosylamine/glycine ligase  44.84 
 
 
425 aa  329  7e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.525706  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0707  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.59 
 
 
429 aa  328  8e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1442  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.81 
 
 
426 aa  328  9e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.577495  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0274  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.89 
 
 
423 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0280  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.65 
 
 
423 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0635  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.74 
 
 
420 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3302  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.03 
 
 
422 aa  328  1.0000000000000001e-88  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0635766 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1952  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.35 
 
 
427 aa  328  1.0000000000000001e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0401  phosphoribosylamine/glycine ligase  49.16 
 
 
428 aa  328  1.0000000000000001e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000120381  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1400  phosphoribosylamine--glycine ligase  50 
 
 
420 aa  328  1.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>