More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3626 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3626  phosphoribosylamine/glycine ligase  100 
 
 		 411 aa  805    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.241782  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0831  phosphoribosylamine/glycine ligase  77.37 
 
 		 417 aa  608  1e-173  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0251625  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4954  phosphoribosylamine--glycine ligase  75.9 
 
 		 422 aa  574  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.1743 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4571  phosphoribosylamine--glycine ligase  75.9 
 
 		 422 aa  574  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.840997  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4659  phosphoribosylamine--glycine ligase  75.9 
 
 		 422 aa  574  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0824941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1608  phosphoribosylamine--glycine ligase  73.98 
 
 		 427 aa  565  1e-160  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10787  phosphoribosylamine--glycine ligase  70.12 
 
 		 422 aa  561  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5150  phosphoribosylamine--glycine ligase  74.28 
 
 		 430 aa  556  1e-157  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38170  phosphoribosylamine--glycine ligase  67.64 
 
 		 429 aa  525  1e-148  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6903  phosphoribosylamine/glycine ligase  66.67 
 
 		 419 aa  525  1e-148  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0170  phosphoribosylamine/glycine ligase  61.35 
 
 		 420 aa  466  9.999999999999999e-131  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.133071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0197  phosphoribosylamine/glycine ligase  60.1 
 
 		 415 aa  462  1e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35150  phosphoribosylamine--glycine ligase  58.02 
 
 		 429 aa  458  9.999999999999999e-129  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3600  phosphoribosylamine/glycine ligase  60.63 
 
 		 433 aa  461  9.999999999999999e-129  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3013  phosphoribosylamine--glycine ligase  59.71 
 
 		 424 aa  455  1e-127  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0386  Phosphoribosylamine--glycine ligase  62.17 
 
 		 410 aa  451  1e-125  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5132  phosphoribosylamine/glycine ligase  63.79 
 
 		 420 aa  444  1e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4636  phosphoribosylamine/glycine ligase  59.38 
 
 		 416 aa  439  9.999999999999999e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.728715  normal  0.385617 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18510  phosphoribosylamine--glycine ligase  58.17 
 
 		 429 aa  440  9.999999999999999e-123  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0279  phosphoribosylamine/glycine ligase  58.74 
 
 		 417 aa  440  9.999999999999999e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0134  phosphoribosylamine--glycine ligase  61.17 
 
 		 416 aa  436  1e-121  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.415315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4774  phosphoribosylamine/glycine ligase  62.41 
 
 		 421 aa  437  1e-121  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2413  phosphoribosylamine/glycine ligase  55.61 
 
 		 436 aa  432  1e-120  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.545734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4342  phosphoribosylamine--glycine ligase  60.92 
 
 		 416 aa  427  1e-118  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.466735  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3187  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.61 
 
 		 438 aa  423  1e-117  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0140  phosphoribosylamine--glycine ligase  60.19 
 
 		 416 aa  422  1e-117  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000376127 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6145  phosphoribosylamine/glycine ligase  58.6 
 
 		 411 aa  424  1e-117  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.106409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4370  phosphoribosylamine--glycine ligase  58.51 
 
 		 436 aa  418  1e-116  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.766514 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3406  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.37 
 
 		 446 aa  414  1e-114  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2960  phosphoribosylamine/glycine ligase  59.15 
 
 		 433 aa  408  1.0000000000000001e-112  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0208  phosphoribosylamine--glycine ligase  57.59 
 
 		 439 aa  405  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.428663 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2127  phosphoribosylamine--glycine ligase  60.48 
 
 		 420 aa  406  1.0000000000000001e-112  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3134  phosphoribosylamine/glycine ligase  56.43 
 
 		 428 aa  396  1e-109  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.808887  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23300  phosphoribosylamine--glycine ligase  56.14 
 
 		 433 aa  397  1e-109  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05830  phosphoribosylamine--glycine ligase  54.21 
 
 		 446 aa  392  1e-108  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.822028  normal  0.495847 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0627  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.05 
 
 		 425 aa  372  1e-102  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.154285 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1777  phosphoribosylamine/glycine ligase  48.11 
 
 		 428 aa  365  1e-99  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2453  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.65 
 
 		 424 aa  355  7.999999999999999e-97  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.386914  normal  0.350843 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1480  phosphoribosylamine/glycine ligase  45.82 
 
 		 419 aa  355  1e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3997  phosphoribosylamine/glycine ligase  45.24 
 
 		 423 aa  349  5e-95  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4039  phosphoribosylamine/glycine ligase  45.24 
 
 		 423 aa  349  5e-95  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.324775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4100  phosphoribosylamine--glycine ligase  57.71 
 
 		 404 aa  348  1e-94  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.464449 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3149  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.74 
 
 		 433 aa  347  2e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.868678  normal  0.802626 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0529  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.73 
 
 		 429 aa  346  5e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.863272  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0946  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.46 
 
 		 420 aa  345  8e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0026  phosphoribosylamine/glycine ligase  45.65 
 
 		 704 aa  343  2e-93  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1540  phosphoribosylamine/glycine ligase  47.31 
 
 		 433 aa  342  1e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.427577  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0960  phosphoribosylamine--glycine ligase  45 
 
 		 426 aa  338  9.999999999999999e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2043  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.65 
 
 		 421 aa  338  9.999999999999999e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.453314 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0991  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.65 
 
 		 425 aa  338  9.999999999999999e-92  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2361  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.84 
 
 		 422 aa  337  1.9999999999999998e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3379  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.63 
 
 		 414 aa  337  1.9999999999999998e-91  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.104647 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0459  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.49 
 
 		 429 aa  337  1.9999999999999998e-91  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1722  phosphoribosylamine--glycine ligase  48 
 
 		 425 aa  337  2.9999999999999997e-91  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0331  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.81 
 
 		 423 aa  335  1e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0535  phosphoribosylamine--glycine ligase  45 
 
 		 427 aa  333  4e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.201111 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1775  phosphoribosylamine/glycine ligase  46.57 
 
 		 433 aa  333  4e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.780493 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0271  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.33 
 
 		 423 aa  332  7.000000000000001e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0286  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.57 
 
 		 423 aa  331  1e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1628  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.87 
 
 		 425 aa  331  1e-89  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0299  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.57 
 
 		 423 aa  331  1e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0177  phosphoribosylamine/glycine ligase  46.6 
 
 		 429 aa  331  1e-89  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.348487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0735  phosphoribosylamine/glycine ligase  45.5 
 
 		 425 aa  332  1e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.525706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2863  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.52 
 
 		 426 aa  331  1e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0385682  normal  0.548732 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3458  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.92 
 
 		 423 aa  330  2e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0172  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.66 
 
 		 429 aa  330  2e-89  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0392  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.94 
 
 		 424 aa  330  2e-89  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.423575  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1983  phosphoribosylamine/glycine ligase  44.26 
 
 		 423 aa  330  3e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.853313 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0578  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.76 
 
 		 425 aa  330  3e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3227  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.97 
 
 		 425 aa  330  4e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2759  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.21 
 
 		 424 aa  330  4e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000179977  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0719  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.37 
 
 		 426 aa  330  4e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.63678  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0274  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.86 
 
 		 423 aa  329  5.0000000000000004e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3175  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.21 
 
 		 418 aa  328  1.0000000000000001e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0345  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.86 
 
 		 423 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0779  phosphoribosylamine/glycine ligase  43.29 
 
 		 428 aa  327  2.0000000000000001e-88  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00193673  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2591  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.97 
 
 		 423 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2871  phosphoribosylamine/glycine ligase  46.43 
 
 		 449 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0927595 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0526  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.81 
 
 		 419 aa  326  4.0000000000000003e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0414  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.02 
 
 		 427 aa  326  4.0000000000000003e-88  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.31965  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4029  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.45 
 
 		 420 aa  326  5e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4613  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.47 
 
 		 431 aa  325  6e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.302277 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1338  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.91 
 
 		 430 aa  325  8.000000000000001e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2323  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.81 
 
 		 429 aa  325  9e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.125717  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0909  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.24 
 
 		 432 aa  325  9e-88  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0422  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.79 
 
 		 427 aa  325  9e-88  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1532  phosphoribosylamine/glycine ligase  45.63 
 
 		 423 aa  325  1e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.612843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02964  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.37 
 
 		 429 aa  325  1e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4876  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.47 
 
 		 431 aa  324  1e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4698  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.24 
 
 		 430 aa  323  2e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.744432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5622  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.5 
 
 		 425 aa  324  2e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1412  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.86 
 
 		 422 aa  324  2e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.8215  normal  0.900094 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0784  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.34 
 
 		 422 aa  324  2e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.110869  normal  0.244609 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2389  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.16 
 
 		 422 aa  324  2e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4823  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.24 
 
 		 431 aa  323  3e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2342  phosphoribosylamine/glycine ligase  44.55 
 
 		 428 aa  323  3e-87  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.51337  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2191  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.26 
 
 		 422 aa  323  4e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1384  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.21 
 
 		 425 aa  323  4e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.563842  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4975  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.86 
 
 		 423 aa  323  4e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1239  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.21 
 
 		 425 aa  323  4e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0277108  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>