More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0134 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0134  phosphoribosylamine--glycine ligase  100 
 
 		 416 aa  805    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.415315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0140  phosphoribosylamine--glycine ligase  91.11 
 
 		 416 aa  697    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000376127 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0279  phosphoribosylamine/glycine ligase  65.28 
 
 		 417 aa  499  1e-140  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0197  phosphoribosylamine/glycine ligase  64.58 
 
 		 415 aa  492  9.999999999999999e-139  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6903  phosphoribosylamine/glycine ligase  63.96 
 
 		 419 aa  486  1e-136  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38170  phosphoribosylamine--glycine ligase  64.05 
 
 		 429 aa  483  1e-135  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0170  phosphoribosylamine/glycine ligase  63.24 
 
 		 420 aa  479  1e-134  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.133071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6145  phosphoribosylamine/glycine ligase  63.41 
 
 		 411 aa  481  1e-134  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.106409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0386  Phosphoribosylamine--glycine ligase  66.01 
 
 		 410 aa  475  1e-133  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3600  phosphoribosylamine/glycine ligase  63.86 
 
 		 433 aa  471  1e-132  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3013  phosphoribosylamine--glycine ligase  61.37 
 
 		 424 aa  474  1e-132  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4774  phosphoribosylamine/glycine ligase  66.27 
 
 		 421 aa  474  1e-132  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4636  phosphoribosylamine/glycine ligase  62.95 
 
 		 416 aa  473  1e-132  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.728715  normal  0.385617 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0831  phosphoribosylamine/glycine ligase  61.96 
 
 		 417 aa  462  1e-129  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0251625  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5132  phosphoribosylamine/glycine ligase  65.87 
 
 		 420 aa  464  1e-129  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35150  phosphoribosylamine--glycine ligase  60.94 
 
 		 429 aa  462  1e-129  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10787  phosphoribosylamine--glycine ligase  60.99 
 
 		 422 aa  461  1e-129  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2413  phosphoribosylamine/glycine ligase  58.62 
 
 		 436 aa  456  1e-127  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.545734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4954  phosphoribosylamine--glycine ligase  63.36 
 
 		 422 aa  455  1e-127  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.1743 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4571  phosphoribosylamine--glycine ligase  63.36 
 
 		 422 aa  454  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.840997  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4659  phosphoribosylamine--glycine ligase  63.36 
 
 		 422 aa  454  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0824941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1608  phosphoribosylamine--glycine ligase  62.32 
 
 		 427 aa  451  1e-125  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18510  phosphoribosylamine--glycine ligase  57.98 
 
 		 429 aa  441  9.999999999999999e-123  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5150  phosphoribosylamine--glycine ligase  62.5 
 
 		 430 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3187  phosphoribosylamine--glycine ligase  56.94 
 
 		 438 aa  436  1e-121  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2960  phosphoribosylamine/glycine ligase  62.96 
 
 		 433 aa  433  1e-120  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2127  phosphoribosylamine--glycine ligase  63.01 
 
 		 420 aa  434  1e-120  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4342  phosphoribosylamine--glycine ligase  63.02 
 
 		 416 aa  434  1e-120  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.466735  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3134  phosphoribosylamine/glycine ligase  60.98 
 
 		 428 aa  429  1e-119  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.808887  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3406  phosphoribosylamine--glycine ligase  57.31 
 
 		 446 aa  430  1e-119  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3626  phosphoribosylamine/glycine ligase  61.17 
 
 		 411 aa  422  1e-117  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.241782  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0208  phosphoribosylamine--glycine ligase  57.83 
 
 		 439 aa  411  1e-113  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.428663 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4370  phosphoribosylamine--glycine ligase  58.8 
 
 		 436 aa  410  1e-113  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.766514 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23300  phosphoribosylamine--glycine ligase  58.65 
 
 		 433 aa  407  1.0000000000000001e-112  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05830  phosphoribosylamine--glycine ligase  56.28 
 
 		 446 aa  404  1e-111  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.822028  normal  0.495847 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4100  phosphoribosylamine--glycine ligase  60.96 
 
 		 404 aa  369  1e-101  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.464449 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0529  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.47 
 
 		 429 aa  363  3e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.863272  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0414  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.41 
 
 		 427 aa  355  1e-96  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.31965  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0422  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.18 
 
 		 427 aa  353  2e-96  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0471  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.74 
 
 		 423 aa  350  2e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3149  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.88 
 
 		 433 aa  347  3e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.868678  normal  0.802626 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0991  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.48 
 
 		 425 aa  346  5e-94  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2361  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.15 
 
 		 422 aa  345  6e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0719  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.65 
 
 		 426 aa  345  8.999999999999999e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.63678  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0172  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.99 
 
 		 429 aa  343  4e-93  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1699  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.58 
 
 		 427 aa  340  2e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.251383  normal  0.989876 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4039  phosphoribosylamine/glycine ligase  44.92 
 
 		 423 aa  334  2e-90  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.324775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3997  phosphoribosylamine/glycine ligase  44.92 
 
 		 423 aa  334  2e-90  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0627  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.46 
 
 		 425 aa  334  2e-90  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.154285 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0960  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.73 
 
 		 426 aa  333  3e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3379  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.08 
 
 		 414 aa  333  4e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.104647 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0946  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.4 
 
 		 420 aa  332  6e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1480  phosphoribosylamine/glycine ligase  45.54 
 
 		 419 aa  332  7.000000000000001e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0459  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.23 
 
 		 429 aa  332  9e-90  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4544  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.64 
 
 		 428 aa  332  1e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.185185 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0909  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.95 
 
 		 432 aa  331  2e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1330  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.12 
 
 		 421 aa  329  6e-89  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.152836  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2453  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.94 
 
 		 424 aa  329  7e-89  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.386914  normal  0.350843 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1775  phosphoribosylamine/glycine ligase  47.14 
 
 		 433 aa  328  1.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.780493 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0526  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.73 
 
 		 419 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0535  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.81 
 
 		 427 aa  327  3e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.201111 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1983  phosphoribosylamine/glycine ligase  44.71 
 
 		 423 aa  324  2e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.853313 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1774  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.82 
 
 		 428 aa  324  2e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000323466  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0026  phosphoribosylamine/glycine ligase  45.05 
 
 		 704 aa  323  3e-87  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002184  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.43 
 
 		 429 aa  323  3e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.25624  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23090  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.22 
 
 		 425 aa  323  3e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.121893  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1969  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.91 
 
 		 433 aa  323  3e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.949647 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1729  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.75 
 
 		 430 aa  323  3e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.576125 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0619  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.99 
 
 		 427 aa  322  6e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.374111  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1777  phosphoribosylamine/glycine ligase  43.72 
 
 		 428 aa  322  6e-87  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0635  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.41 
 
 		 420 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1442  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.92 
 
 		 426 aa  320  3e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.577495  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0707  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.84 
 
 		 429 aa  320  3e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3302  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.22 
 
 		 422 aa  320  3.9999999999999996e-86  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0635766 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00211  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.72 
 
 		 429 aa  319  5e-86  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3871  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.69 
 
 		 435 aa  318  7.999999999999999e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.485049  normal  0.0530756 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0392  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.72 
 
 		 424 aa  318  9e-86  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.423575  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1540  phosphoribosylamine/glycine ligase  47.63 
 
 		 433 aa  318  9e-86  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.427577  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03941  Phosphoribosylamine-glycine ligase  43.43 
 
 		 430 aa  318  1e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0231  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.26 
 
 		 425 aa  318  1e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.595549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1471  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.05 
 
 		 423 aa  318  1e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0600936 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0177  phosphoribosylamine/glycine ligase  47.91 
 
 		 429 aa  317  2e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.348487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3175  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.1 
 
 		 418 aa  317  2e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1400  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.64 
 
 		 420 aa  317  3e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0578  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.1 
 
 		 425 aa  316  4e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336164  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2843  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.29 
 
 		 430 aa  316  4e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.294227  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4327  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.81 
 
 		 431 aa  316  4e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.101605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3451  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.43 
 
 		 428 aa  317  4e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.264337  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2389  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.21 
 
 		 422 aa  316  5e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0779  phosphoribosylamine/glycine ligase  43.33 
 
 		 428 aa  316  6e-85  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00193673  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3227  phosphoribosylamine--glycine ligase  45 
 
 		 425 aa  315  7e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1628  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.8 
 
 		 425 aa  315  7e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5474  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.73 
 
 		 429 aa  315  8e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.13476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4180  phosphoribosylamine/glycine ligase  48.09 
 
 		 435 aa  315  8e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.94163  normal  0.510323 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4548  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.73 
 
 		 429 aa  315  9.999999999999999e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000304372  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2122  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.63 
 
 		 435 aa  315  9.999999999999999e-85  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0264  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.87 
 
 		 430 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.46971  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4020  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.73 
 
 		 429 aa  315  9.999999999999999e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000927217  normal  0.0101467 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2043  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.97 
 
 		 421 aa  314  1.9999999999999998e-84  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.453314 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2342  phosphoribosylamine/glycine ligase  44.39 
 
 		 428 aa  314  1.9999999999999998e-84  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.51337  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>