More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4100 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_4100  phosphoribosylamine--glycine ligase  100 
 
 		 404 aa  764    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.464449 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3600  phosphoribosylamine/glycine ligase  68.5 
 
 		 433 aa  488  1e-137  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0170  phosphoribosylamine/glycine ligase  67.08 
 
 		 420 aa  483  1e-135  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.133071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3406  phosphoribosylamine--glycine ligase  64.36 
 
 		 446 aa  482  1e-135  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3187  phosphoribosylamine--glycine ligase  63.86 
 
 		 438 aa  476  1e-133  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0197  phosphoribosylamine/glycine ligase  64.27 
 
 		 415 aa  474  1e-132  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35150  phosphoribosylamine--glycine ligase  66.75 
 
 		 429 aa  471  1e-132  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2413  phosphoribosylamine/glycine ligase  64.65 
 
 		 436 aa  471  1e-132  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.545734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3013  phosphoribosylamine--glycine ligase  64.11 
 
 		 424 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0386  Phosphoribosylamine--glycine ligase  66.75 
 
 		 410 aa  460  9.999999999999999e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3134  phosphoribosylamine/glycine ligase  68.96 
 
 		 428 aa  455  1e-127  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.808887  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18510  phosphoribosylamine--glycine ligase  62.62 
 
 		 429 aa  452  1.0000000000000001e-126  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2960  phosphoribosylamine/glycine ligase  69.78 
 
 		 433 aa  439  9.999999999999999e-123  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4636  phosphoribosylamine/glycine ligase  61.44 
 
 		 416 aa  432  1e-120  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.728715  normal  0.385617 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6145  phosphoribosylamine/glycine ligase  61.35 
 
 		 411 aa  428  1e-118  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.106409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38170  phosphoribosylamine--glycine ligase  63.57 
 
 		 429 aa  422  1e-117  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6903  phosphoribosylamine/glycine ligase  62.44 
 
 		 419 aa  424  1e-117  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0279  phosphoribosylamine/glycine ligase  60.2 
 
 		 417 aa  424  1e-117  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0134  phosphoribosylamine--glycine ligase  61.21 
 
 		 416 aa  410  1e-113  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.415315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10787  phosphoribosylamine--glycine ligase  57.95 
 
 		 422 aa  404  1e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4774  phosphoribosylamine/glycine ligase  63.57 
 
 		 421 aa  402  1e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4342  phosphoribosylamine--glycine ligase  61.39 
 
 		 416 aa  400  9.999999999999999e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.466735  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1608  phosphoribosylamine--glycine ligase  60.39 
 
 		 427 aa  397  1e-109  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05830  phosphoribosylamine--glycine ligase  60.29 
 
 		 446 aa  397  1e-109  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.822028  normal  0.495847 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4954  phosphoribosylamine--glycine ligase  60.39 
 
 		 422 aa  392  1e-108  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.1743 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4571  phosphoribosylamine--glycine ligase  60.39 
 
 		 422 aa  392  1e-108  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.840997  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4659  phosphoribosylamine--glycine ligase  60.39 
 
 		 422 aa  392  1e-108  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0824941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5150  phosphoribosylamine--glycine ligase  59.9 
 
 		 430 aa  392  1e-108  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23300  phosphoribosylamine--glycine ligase  58.96 
 
 		 433 aa  390  1e-107  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0208  phosphoribosylamine--glycine ligase  60 
 
 		 439 aa  390  1e-107  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.428663 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0140  phosphoribosylamine--glycine ligase  61.31 
 
 		 416 aa  390  1e-107  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000376127 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0831  phosphoribosylamine/glycine ligase  57.86 
 
 		 417 aa  388  1e-106  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0251625  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4370  phosphoribosylamine--glycine ligase  59.25 
 
 		 436 aa  382  1e-105  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.766514 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5132  phosphoribosylamine/glycine ligase  61.14 
 
 		 420 aa  377  1e-103  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3626  phosphoribosylamine/glycine ligase  57.96 
 
 		 411 aa  372  1e-102  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.241782  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2127  phosphoribosylamine--glycine ligase  60.2 
 
 		 420 aa  373  1e-102  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0026  phosphoribosylamine/glycine ligase  50 
 
 		 704 aa  368  1e-101  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1777  phosphoribosylamine/glycine ligase  46.15 
 
 		 428 aa  318  7.999999999999999e-86  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2871  phosphoribosylamine/glycine ligase  48.18 
 
 		 449 aa  315  8e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0927595 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0807  phosphoribosylamine/glycine ligase  51.47 
 
 		 427 aa  313  2.9999999999999996e-84  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.966412 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1480  phosphoribosylamine/glycine ligase  44.97 
 
 		 419 aa  311  1e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27830  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.38 
 
 		 421 aa  311  1e-83  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3149  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.96 
 
 		 433 aa  311  1e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.868678  normal  0.802626 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1699  phosphoribosylamine--glycine ligase  47 
 
 		 427 aa  311  1e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.251383  normal  0.989876 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2231  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.6 
 
 		 423 aa  308  8e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0529  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.02 
 
 		 429 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.863272  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0635  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.9 
 
 		 420 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0627  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.02 
 
 		 425 aa  307  2.0000000000000002e-82  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.154285 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0177  phosphoribosylamine/glycine ligase  48.42 
 
 		 429 aa  306  5.0000000000000004e-82  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.348487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0991  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.62 
 
 		 425 aa  306  5.0000000000000004e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3104  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.5 
 
 		 411 aa  305  1.0000000000000001e-81  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23090  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.61 
 
 		 425 aa  304  1.0000000000000001e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.121893  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4029  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.15 
 
 		 420 aa  302  6.000000000000001e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0172  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.25 
 
 		 429 aa  302  7.000000000000001e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4619  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.51 
 
 		 427 aa  302  7.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1946  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.94 
 
 		 420 aa  301  1e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0479651 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0960  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.53 
 
 		 426 aa  300  2e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0619  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.68 
 
 		 427 aa  300  2e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.374111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3379  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.98 
 
 		 414 aa  300  4e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.104647 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0422  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.52 
 
 		 427 aa  300  4e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4544  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.89 
 
 		 428 aa  299  5e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.185185 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3302  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.3 
 
 		 422 aa  299  6e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0635766 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1847  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.4 
 
 		 420 aa  298  8e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.180423  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0496  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.4 
 
 		 420 aa  298  8e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.18255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3668  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.41 
 
 		 425 aa  298  1e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2728  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.27 
 
 		 420 aa  297  2e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0882976  normal  0.135316 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4104  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.29 
 
 		 427 aa  298  2e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0414  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.27 
 
 		 427 aa  297  3e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.31965  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0735  phosphoribosylamine/glycine ligase  46.17 
 
 		 425 aa  296  4e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.525706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0459  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.18 
 
 		 429 aa  296  5e-79  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2323  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.27 
 
 		 429 aa  296  6e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.125717  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1140  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.93 
 
 		 430 aa  296  6e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0526  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.93 
 
 		 419 aa  295  7e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0909  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.28 
 
 		 432 aa  295  7e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0036  phosphoribosylamine/glycine ligase  46.17 
 
 		 430 aa  295  8e-79  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0578  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.55 
 
 		 425 aa  295  9e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336164  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1983  phosphoribosylamine/glycine ligase  43.86 
 
 		 423 aa  295  9e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.853313 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2453  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.13 
 
 		 424 aa  295  1e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.386914  normal  0.350843 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3467  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.95 
 
 		 423 aa  294  2e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0646  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.53 
 
 		 436 aa  293  3e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0535  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.31 
 
 		 427 aa  293  3e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.201111 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0784  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.83 
 
 		 422 aa  292  6e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.110869  normal  0.244609 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2361  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.39 
 
 		 422 aa  292  8e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2180  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.65 
 
 		 419 aa  292  8e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.900628  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1353  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.75 
 
 		 427 aa  291  1e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.2506  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0264  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.75 
 
 		 430 aa  291  2e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.46971  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2552  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.75 
 
 		 426 aa  291  2e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0177333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1412  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.64 
 
 		 422 aa  291  2e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.8215  normal  0.900094 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0278  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.11 
 
 		 423 aa  290  3e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3173  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.71 
 
 		 428 aa  290  3e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0826007  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1245  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.4 
 
 		 419 aa  290  4e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.495633  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0331  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.11 
 
 		 423 aa  289  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1722  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.13 
 
 		 425 aa  289  5.0000000000000004e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0551  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.38 
 
 		 435 aa  289  7e-77  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2333  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.84 
 
 		 426 aa  289  7e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0928506  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0271  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.11 
 
 		 423 aa  289  8e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1628  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.65 
 
 		 425 aa  289  8e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0345  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.85 
 
 		 423 aa  287  2e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0127  phosphoribosylamine/glycine ligase  45.96 
 
 		 413 aa  287  2e-76  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2318  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.09 
 
 		 426 aa  287  2e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.57608 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>