More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_5132 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_5132  phosphoribosylamine/glycine ligase  100 
 
 		 420 aa  816    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6903  phosphoribosylamine/glycine ligase  66.27 
 
 		 419 aa  519  1e-146  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0831  phosphoribosylamine/glycine ligase  65.71 
 
 		 417 aa  500  1e-140  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0251625  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0134  phosphoribosylamine--glycine ligase  65.87 
 
 		 416 aa  494  9.999999999999999e-139  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.415315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0197  phosphoribosylamine/glycine ligase  61.96 
 
 		 415 aa  489  1e-137  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3013  phosphoribosylamine--glycine ligase  62.95 
 
 		 424 aa  486  1e-136  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4954  phosphoribosylamine--glycine ligase  65.24 
 
 		 422 aa  485  1e-136  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.1743 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4571  phosphoribosylamine--glycine ligase  65.24 
 
 		 422 aa  484  1e-136  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.840997  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4659  phosphoribosylamine--glycine ligase  65.24 
 
 		 422 aa  484  1e-136  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0824941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10787  phosphoribosylamine--glycine ligase  61.37 
 
 		 422 aa  483  1e-135  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1608  phosphoribosylamine--glycine ligase  65.24 
 
 		 427 aa  481  1e-135  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0170  phosphoribosylamine/glycine ligase  61.93 
 
 		 420 aa  481  1e-134  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.133071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38170  phosphoribosylamine--glycine ligase  62.92 
 
 		 429 aa  475  1e-133  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4636  phosphoribosylamine/glycine ligase  62.83 
 
 		 416 aa  474  1e-132  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.728715  normal  0.385617 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5150  phosphoribosylamine--glycine ligase  64.85 
 
 		 430 aa  472  1e-132  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3626  phosphoribosylamine/glycine ligase  63.79 
 
 		 411 aa  458  9.999999999999999e-129  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.241782  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4774  phosphoribosylamine/glycine ligase  65.16 
 
 		 421 aa  461  9.999999999999999e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0386  Phosphoribosylamine--glycine ligase  62.29 
 
 		 410 aa  456  1e-127  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18510  phosphoribosylamine--glycine ligase  59.15 
 
 		 429 aa  457  1e-127  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0140  phosphoribosylamine--glycine ligase  63.25 
 
 		 416 aa  454  1.0000000000000001e-126  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000376127 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3187  phosphoribosylamine--glycine ligase  55.9 
 
 		 438 aa  446  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2413  phosphoribosylamine/glycine ligase  56.68 
 
 		 436 aa  445  1.0000000000000001e-124  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.545734  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3600  phosphoribosylamine/glycine ligase  59.42 
 
 		 433 aa  439  9.999999999999999e-123  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35150  phosphoribosylamine--glycine ligase  57.65 
 
 		 429 aa  436  1e-121  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6145  phosphoribosylamine/glycine ligase  60.63 
 
 		 411 aa  434  1e-120  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.106409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23300  phosphoribosylamine--glycine ligase  59.28 
 
 		 433 aa  429  1e-119  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3406  phosphoribosylamine--glycine ligase  55.32 
 
 		 446 aa  425  1e-118  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0279  phosphoribosylamine/glycine ligase  54.85 
 
 		 417 aa  417  9.999999999999999e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4370  phosphoribosylamine--glycine ligase  59.81 
 
 		 436 aa  416  9.999999999999999e-116  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.766514 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3134  phosphoribosylamine/glycine ligase  56.91 
 
 		 428 aa  417  9.999999999999999e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.808887  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2960  phosphoribosylamine/glycine ligase  59.72 
 
 		 433 aa  411  1e-113  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0208  phosphoribosylamine--glycine ligase  57.38 
 
 		 439 aa  408  1e-113  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.428663 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4342  phosphoribosylamine--glycine ligase  58.35 
 
 		 416 aa  402  1e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.466735  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2127  phosphoribosylamine--glycine ligase  59.14 
 
 		 420 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4100  phosphoribosylamine--glycine ligase  60.64 
 
 		 404 aa  369  1e-101  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.464449 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05830  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.69 
 
 		 446 aa  365  1e-99  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.822028  normal  0.495847 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2361  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.02 
 
 		 422 aa  360  3e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3379  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.82 
 
 		 414 aa  350  2e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.104647 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0991  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.29 
 
 		 425 aa  348  1e-94  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0529  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.21 
 
 		 429 aa  347  2e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.863272  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2043  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.1 
 
 		 421 aa  344  2e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.453314 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0627  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.56 
 
 		 425 aa  343  2.9999999999999997e-93  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.154285 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1480  phosphoribosylamine/glycine ligase  43.72 
 
 		 419 aa  343  5e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0646  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.07 
 
 		 436 aa  339  4e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1540  phosphoribosylamine/glycine ligase  48.34 
 
 		 433 aa  338  8e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.427577  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1777  phosphoribosylamine/glycine ligase  45.45 
 
 		 428 aa  337  1.9999999999999998e-91  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2453  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.69 
 
 		 424 aa  337  2.9999999999999997e-91  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.386914  normal  0.350843 
 
 
-
 
NC_004310  BR0414  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.92 
 
 		 427 aa  334  2e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.31965  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1699  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.19 
 
 		 427 aa  333  3e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.251383  normal  0.989876 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0960  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.98 
 
 		 426 aa  333  4e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0177  phosphoribosylamine/glycine ligase  46.6 
 
 		 429 aa  332  7.000000000000001e-90  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.348487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4029  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.43 
 
 		 420 aa  332  7.000000000000001e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4453  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.71 
 
 		 429 aa  331  1e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0221711  hitchhiker  0.000392069 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5474  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.56 
 
 		 429 aa  331  1e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.13476  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0555  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.53 
 
 		 431 aa  331  2e-89  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1775  phosphoribosylamine/glycine ligase  46.78 
 
 		 433 aa  330  2e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.780493 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0422  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.45 
 
 		 427 aa  330  3e-89  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1774  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.96 
 
 		 428 aa  330  3e-89  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000323466  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03882  phosphoribosylamine-glycine ligase  44.24 
 
 		 429 aa  329  4e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000860274  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03835  hypothetical protein  44.24 
 
 		 429 aa  329  4e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000931477  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0909  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.19 
 
 		 432 aa  329  7e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0459  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.45 
 
 		 429 aa  328  8e-89  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3451  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.39 
 
 		 428 aa  328  8e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.264337  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4548  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.24 
 
 		 429 aa  328  9e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000304372  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3227  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.82 
 
 		 425 aa  328  9e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4020  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.24 
 
 		 429 aa  328  9e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000927217  normal  0.0101467 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23090  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.81 
 
 		 425 aa  327  3e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.121893  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0875  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.12 
 
 		 430 aa  327  3e-88  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.712895  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0597  phosphoribosylamine/glycine ligase  41.51 
 
 		 424 aa  327  3e-88  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4239  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.47 
 
 		 429 aa  326  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00124381  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3997  phosphoribosylamine/glycine ligase  44.82 
 
 		 423 aa  326  4.0000000000000003e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4039  phosphoribosylamine/glycine ligase  44.82 
 
 		 423 aa  326  4.0000000000000003e-88  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.324775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0707  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.15 
 
 		 429 aa  326  5e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2871  phosphoribosylamine/glycine ligase  46.62 
 
 		 449 aa  326  5e-88  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0927595 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0026  phosphoribosylamine/glycine ligase  43.53 
 
 		 704 aa  326  5e-88  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0231  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.02 
 
 		 425 aa  326  5e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.595549  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3988  phosphoribosylamine/glycine ligase  44.86 
 
 		 429 aa  326  6e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0361396  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4496  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.86 
 
 		 429 aa  326  6e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000225394  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0997  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.41 
 
 		 430 aa  325  8.000000000000001e-88  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4613  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.39 
 
 		 431 aa  325  1e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.302277 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2652  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.21 
 
 		 429 aa  324  1e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4506  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.29 
 
 		 429 aa  325  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0278032 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0807  phosphoribosylamine/glycine ligase  50 
 
 		 427 aa  325  1e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.966412 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4508  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.29 
 
 		 429 aa  325  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0778373 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4419  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.71 
 
 		 429 aa  325  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.160091  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4823  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.15 
 
 		 431 aa  324  2e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4876  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.15 
 
 		 431 aa  323  2e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0735  phosphoribosylamine/glycine ligase  44.76 
 
 		 425 aa  324  2e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.525706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4386  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.71 
 
 		 429 aa  323  3e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.677738 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0401  phosphoribosylamine/glycine ligase  46.51 
 
 		 428 aa  323  3e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000120381  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3665  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.03 
 
 		 428 aa  323  3e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4698  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.92 
 
 		 430 aa  322  6e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.744432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4582  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.24 
 
 		 429 aa  322  7e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.213422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0215  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.73 
 
 		 430 aa  322  9.000000000000001e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0406099  normal  0.0125796 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02964  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.45 
 
 		 429 aa  322  9.999999999999999e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0526  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.95 
 
 		 419 aa  322  9.999999999999999e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0471  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.98 
 
 		 423 aa  321  9.999999999999999e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64220  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.15 
 
 		 429 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.88359  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1267  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.58 
 
 		 437 aa  321  1.9999999999999998e-86  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00682849  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002184  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.79 
 
 		 429 aa  321  1.9999999999999998e-86  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.25624  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>