More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0831 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_0831  phosphoribosylamine/glycine ligase  100 
 
 
417 aa  815    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0251625  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10787  phosphoribosylamine--glycine ligase  73.46 
 
 
422 aa  608  1e-173  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3626  phosphoribosylamine/glycine ligase  77.37 
 
 
411 aa  591  1e-168  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.241782  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1608  phosphoribosylamine--glycine ligase  76.25 
 
 
427 aa  592  1e-168  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4571  phosphoribosylamine--glycine ligase  75.83 
 
 
422 aa  589  1e-167  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.840997  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4954  phosphoribosylamine--glycine ligase  75.59 
 
 
422 aa  588  1e-167  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.1743 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4659  phosphoribosylamine--glycine ligase  75.83 
 
 
422 aa  589  1e-167  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0824941  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5150  phosphoribosylamine--glycine ligase  75.65 
 
 
430 aa  581  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38170  phosphoribosylamine--glycine ligase  69.78 
 
 
429 aa  557  1e-157  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6903  phosphoribosylamine/glycine ligase  68.82 
 
 
419 aa  547  1e-154  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5132  phosphoribosylamine/glycine ligase  64.99 
 
 
420 aa  471  1e-132  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0170  phosphoribosylamine/glycine ligase  61.59 
 
 
420 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.133071  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3600  phosphoribosylamine/glycine ligase  61.59 
 
 
433 aa  471  1.0000000000000001e-131  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3013  phosphoribosylamine--glycine ligase  59.24 
 
 
424 aa  464  1e-129  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0134  phosphoribosylamine--glycine ligase  61.96 
 
 
416 aa  462  1e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.415315  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4774  phosphoribosylamine/glycine ligase  64.05 
 
 
421 aa  457  1e-127  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0197  phosphoribosylamine/glycine ligase  58.37 
 
 
415 aa  450  1e-125  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18510  phosphoribosylamine--glycine ligase  57.68 
 
 
429 aa  446  1.0000000000000001e-124  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0386  Phosphoribosylamine--glycine ligase  61.22 
 
 
410 aa  442  1e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6145  phosphoribosylamine/glycine ligase  60.98 
 
 
411 aa  443  1e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.106409  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3187  phosphoribosylamine--glycine ligase  55.32 
 
 
438 aa  441  9.999999999999999e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2413  phosphoribosylamine/glycine ligase  56.68 
 
 
436 aa  437  1e-121  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.545734  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0140  phosphoribosylamine--glycine ligase  60.77 
 
 
416 aa  436  1e-121  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000376127 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0279  phosphoribosylamine/glycine ligase  57.77 
 
 
417 aa  433  1e-120  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35150  phosphoribosylamine--glycine ligase  56.13 
 
 
429 aa  429  1e-119  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3406  phosphoribosylamine--glycine ligase  55.08 
 
 
446 aa  429  1e-119  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4636  phosphoribosylamine/glycine ligase  57.69 
 
 
416 aa  426  1e-118  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.728715  normal  0.385617 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4370  phosphoribosylamine--glycine ligase  57.52 
 
 
436 aa  409  1e-113  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.766514 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0208  phosphoribosylamine--glycine ligase  57.59 
 
 
439 aa  406  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.428663 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3134  phosphoribosylamine/glycine ligase  57.28 
 
 
428 aa  406  1.0000000000000001e-112  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.808887  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4342  phosphoribosylamine--glycine ligase  58.98 
 
 
416 aa  406  1.0000000000000001e-112  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.466735  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23300  phosphoribosylamine--glycine ligase  56.87 
 
 
433 aa  402  1e-111  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2127  phosphoribosylamine--glycine ligase  58.91 
 
 
420 aa  398  1e-109  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2960  phosphoribosylamine/glycine ligase  57.18 
 
 
433 aa  385  1e-106  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05830  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.57 
 
 
446 aa  383  1e-105  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.822028  normal  0.495847 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1777  phosphoribosylamine/glycine ligase  46.62 
 
 
428 aa  353  2.9999999999999997e-96  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0627  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.04 
 
 
425 aa  353  2.9999999999999997e-96  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.154285 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0529  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.1 
 
 
429 aa  352  8.999999999999999e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.863272  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0946  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.88 
 
 
420 aa  352  8.999999999999999e-96  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2453  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.88 
 
 
424 aa  346  3e-94  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.386914  normal  0.350843 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0026  phosphoribosylamine/glycine ligase  46.46 
 
 
704 aa  346  5e-94  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2361  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.42 
 
 
422 aa  345  1e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4100  phosphoribosylamine--glycine ligase  57.61 
 
 
404 aa  342  5e-93  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.464449 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0735  phosphoribosylamine/glycine ligase  45.97 
 
 
425 aa  341  1e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.525706  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2231  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.04 
 
 
423 aa  338  9e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2043  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.22 
 
 
421 aa  337  1.9999999999999998e-91  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.453314 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02964  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.71 
 
 
429 aa  336  3.9999999999999995e-91  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0215  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.88 
 
 
430 aa  335  7.999999999999999e-91  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0406099  normal  0.0125796 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0177  phosphoribosylamine/glycine ligase  48.71 
 
 
429 aa  335  9e-91  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.348487  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3379  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.62 
 
 
414 aa  335  1e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.104647 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3997  phosphoribosylamine/glycine ligase  43.94 
 
 
423 aa  335  1e-90  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3862  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.69 
 
 
429 aa  334  1e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.256361  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4039  phosphoribosylamine/glycine ligase  43.94 
 
 
423 aa  335  1e-90  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.324775  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0414  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.81 
 
 
427 aa  334  2e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.31965  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3708  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.73 
 
 
428 aa  334  2e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0202463  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0909  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.29 
 
 
432 aa  333  2e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0960  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.76 
 
 
426 aa  334  2e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0459  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.23 
 
 
429 aa  333  3e-90  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4453  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.9 
 
 
429 aa  332  5e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0221711  hitchhiker  0.000392069 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1480  phosphoribosylamine/glycine ligase  43.94 
 
 
419 aa  333  5e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5474  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.6 
 
 
429 aa  332  6e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.13476  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0875  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.07 
 
 
430 aa  332  7.000000000000001e-90  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.712895  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0224  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.07 
 
 
428 aa  332  9e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0267401  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0422  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.57 
 
 
427 aa  332  9e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1699  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.26 
 
 
427 aa  331  1e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.251383  normal  0.989876 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0991  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.07 
 
 
425 aa  332  1e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1722  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.79 
 
 
425 aa  331  1e-89  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4239  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.6 
 
 
429 aa  331  2e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00124381  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1419  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.5 
 
 
425 aa  331  2e-89  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4020  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.6 
 
 
429 aa  330  2e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000927217  normal  0.0101467 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4548  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.6 
 
 
429 aa  330  2e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000304372  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1774  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.15 
 
 
428 aa  331  2e-89  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000323466  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03882  phosphoribosylamine-glycine ligase  46.6 
 
 
429 aa  330  3e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000860274  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03835  hypothetical protein  46.6 
 
 
429 aa  330  3e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000931477  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0526  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.87 
 
 
419 aa  330  3e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1412  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.02 
 
 
422 aa  330  3e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.8215  normal  0.900094 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0292  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.84 
 
 
427 aa  330  3e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00181025  normal  0.0133648 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0578  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.13 
 
 
425 aa  330  4e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336164  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3665  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.37 
 
 
428 aa  330  4e-89  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3844  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.13 
 
 
428 aa  329  6e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000315171  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1983  phosphoribosylamine/glycine ligase  45.19 
 
 
423 aa  329  6e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.853313 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0228  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.6 
 
 
428 aa  328  9e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0316556  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4386  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.37 
 
 
429 aa  328  9e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.677738 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0356  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.13 
 
 
428 aa  328  1.0000000000000001e-88  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0104682  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4508  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.14 
 
 
429 aa  328  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0778373 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4419  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.14 
 
 
429 aa  328  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.160091  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002184  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.9 
 
 
429 aa  328  1.0000000000000001e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.25624  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0535  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.89 
 
 
427 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.201111 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4506  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.9 
 
 
429 aa  327  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0278032 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2863  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.99 
 
 
426 aa  328  2.0000000000000001e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0385682  normal  0.548732 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3988  phosphoribosylamine/glycine ligase  45.77 
 
 
429 aa  327  3e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0361396  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4582  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.9 
 
 
429 aa  327  3e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.213422  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4496  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.77 
 
 
429 aa  327  3e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000225394  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2323  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.23 
 
 
429 aa  327  3e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.125717  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4029  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.21 
 
 
420 aa  327  3e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0555  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.13 
 
 
431 aa  327  4.0000000000000003e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00211  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.66 
 
 
429 aa  326  4.0000000000000003e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3219  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.71 
 
 
429 aa  326  5e-88  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.708681 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0464  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.9 
 
 
428 aa  326  6e-88  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00032027  normal  0.0111484 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4544  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.51 
 
 
428 aa  326  6e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.185185 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>