More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0170 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0170  phosphoribosylamine/glycine ligase  100 
 
 
420 aa  835    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.133071  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0386  Phosphoribosylamine--glycine ligase  77.13 
 
 
410 aa  606  9.999999999999999e-173  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3013  phosphoribosylamine--glycine ligase  70.63 
 
 
424 aa  553  1e-156  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0197  phosphoribosylamine/glycine ligase  69.49 
 
 
415 aa  554  1e-156  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4636  phosphoribosylamine/glycine ligase  66.75 
 
 
416 aa  520  1e-146  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.728715  normal  0.385617 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35150  phosphoribosylamine--glycine ligase  61.74 
 
 
429 aa  489  1e-137  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3600  phosphoribosylamine/glycine ligase  64.01 
 
 
433 aa  489  1e-137  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3187  phosphoribosylamine--glycine ligase  61.15 
 
 
438 aa  486  1e-136  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3406  phosphoribosylamine--glycine ligase  61.1 
 
 
446 aa  484  1e-135  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18510  phosphoribosylamine--glycine ligase  62.11 
 
 
429 aa  478  1e-134  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2413  phosphoribosylamine/glycine ligase  59.44 
 
 
436 aa  478  1e-133  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.545734  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0279  phosphoribosylamine/glycine ligase  60.29 
 
 
417 aa  473  1e-132  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38170  phosphoribosylamine--glycine ligase  64.49 
 
 
429 aa  467  9.999999999999999e-131  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3134  phosphoribosylamine/glycine ligase  62.14 
 
 
428 aa  459  9.999999999999999e-129  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.808887  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0134  phosphoribosylamine--glycine ligase  63.24 
 
 
416 aa  461  9.999999999999999e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.415315  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6903  phosphoribosylamine/glycine ligase  62.08 
 
 
419 aa  459  9.999999999999999e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0831  phosphoribosylamine/glycine ligase  61.59 
 
 
417 aa  460  9.999999999999999e-129  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0251625  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6145  phosphoribosylamine/glycine ligase  62.56 
 
 
411 aa  457  1e-127  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.106409  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10787  phosphoribosylamine--glycine ligase  60.48 
 
 
422 aa  453  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4342  phosphoribosylamine--glycine ligase  62.41 
 
 
416 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.466735  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4954  phosphoribosylamine--glycine ligase  64.05 
 
 
422 aa  450  1e-125  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.1743 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0140  phosphoribosylamine--glycine ligase  63.97 
 
 
416 aa  449  1e-125  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000376127 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4571  phosphoribosylamine--glycine ligase  64.05 
 
 
422 aa  451  1e-125  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.840997  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2960  phosphoribosylamine/glycine ligase  61.95 
 
 
433 aa  449  1e-125  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4659  phosphoribosylamine--glycine ligase  64.05 
 
 
422 aa  451  1e-125  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0824941  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1608  phosphoribosylamine--glycine ligase  61.9 
 
 
427 aa  445  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5150  phosphoribosylamine--glycine ligase  63.57 
 
 
430 aa  448  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3626  phosphoribosylamine/glycine ligase  61.35 
 
 
411 aa  438  1e-121  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.241782  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4774  phosphoribosylamine/glycine ligase  62.2 
 
 
421 aa  435  1e-121  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2127  phosphoribosylamine--glycine ligase  64.15 
 
 
420 aa  436  1e-121  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23300  phosphoribosylamine--glycine ligase  59.04 
 
 
433 aa  433  1e-120  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5132  phosphoribosylamine/glycine ligase  61.2 
 
 
420 aa  431  1e-119  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0208  phosphoribosylamine--glycine ligase  59.66 
 
 
439 aa  425  1e-118  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.428663 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4100  phosphoribosylamine--glycine ligase  67.08 
 
 
404 aa  420  1e-116  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.464449 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4370  phosphoribosylamine--glycine ligase  58.7 
 
 
436 aa  416  9.999999999999999e-116  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.766514 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05830  phosphoribosylamine--glycine ligase  55.56 
 
 
446 aa  399  9.999999999999999e-111  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.822028  normal  0.495847 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0026  phosphoribosylamine/glycine ligase  49.41 
 
 
704 aa  384  1e-105  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0991  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.83 
 
 
425 aa  369  1e-101  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0646  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.53 
 
 
436 aa  362  6e-99  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2361  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.63 
 
 
422 aa  358  9.999999999999999e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2231  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.99 
 
 
423 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4544  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.42 
 
 
428 aa  356  3.9999999999999996e-97  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.185185 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0459  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.78 
 
 
429 aa  355  1e-96  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0960  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.79 
 
 
426 aa  355  1e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1480  phosphoribosylamine/glycine ligase  44.6 
 
 
419 aa  353  2e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1699  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.29 
 
 
427 aa  351  1e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.251383  normal  0.989876 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0807  phosphoribosylamine/glycine ligase  50.96 
 
 
427 aa  352  1e-95  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.966412 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0627  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.27 
 
 
425 aa  351  2e-95  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.154285 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0529  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.79 
 
 
429 aa  350  3e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.863272  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2552  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.81 
 
 
426 aa  349  5e-95  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0177333  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0471  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.84 
 
 
423 aa  349  5e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1777  phosphoribosylamine/glycine ligase  46.48 
 
 
428 aa  348  7e-95  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0535  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.97 
 
 
427 aa  348  1e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.201111 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3173  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.34 
 
 
428 aa  348  1e-94  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0826007  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0578  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.97 
 
 
425 aa  346  5e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336164  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23090  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.31 
 
 
425 aa  345  1e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.121893  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3149  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.55 
 
 
433 aa  344  2e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.868678  normal  0.802626 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0172  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.85 
 
 
429 aa  343  4e-93  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0735  phosphoribosylamine/glycine ligase  46.59 
 
 
425 aa  342  5e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.525706  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0619  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.56 
 
 
427 aa  342  5.999999999999999e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.374111  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2043  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.88 
 
 
421 aa  342  8e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.453314 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3845  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.28 
 
 
423 aa  342  9e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000183828  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1140  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.86 
 
 
430 aa  341  1e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0610  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.68 
 
 
423 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00101284  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0264  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.17 
 
 
430 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.46971  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1400  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.54 
 
 
420 aa  340  4e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0036  phosphoribosylamine/glycine ligase  47.04 
 
 
430 aa  340  4e-92  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0401  phosphoribosylamine/glycine ligase  49.16 
 
 
428 aa  339  4e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000120381  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1442  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.1 
 
 
426 aa  339  7e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.577495  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1412  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.85 
 
 
422 aa  338  1.9999999999999998e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.8215  normal  0.900094 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0345  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.76 
 
 
423 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0177  phosphoribosylamine/glycine ligase  48.6 
 
 
429 aa  337  2.9999999999999997e-91  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.348487  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0909  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.95 
 
 
432 aa  336  3.9999999999999995e-91  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4029  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.74 
 
 
420 aa  336  3.9999999999999995e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2759  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.31 
 
 
424 aa  336  5e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000179977  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2904  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.73 
 
 
423 aa  336  5.999999999999999e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000288348  normal  0.785686 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27830  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.38 
 
 
421 aa  335  7.999999999999999e-91  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3302  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.29 
 
 
422 aa  335  9e-91  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0635766 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3379  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.46 
 
 
414 aa  335  1e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.104647 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0331  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.52 
 
 
423 aa  335  1e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2453  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.56 
 
 
424 aa  334  1e-90  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.386914  normal  0.350843 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3227  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.78 
 
 
425 aa  334  2e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0756  phosphoribosylamine/glycine ligase  46.59 
 
 
424 aa  334  2e-90  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.721746  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2591  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.79 
 
 
423 aa  333  2e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0271  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.52 
 
 
423 aa  333  3e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4619  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.74 
 
 
427 aa  333  4e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2389  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.79 
 
 
422 aa  333  5e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0526  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.54 
 
 
419 aa  333  5e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0875  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.1 
 
 
430 aa  333  5e-90  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.712895  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0997  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.1 
 
 
430 aa  332  6e-90  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0286  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.52 
 
 
423 aa  332  8e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0299  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.52 
 
 
423 aa  332  8e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0422  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.27 
 
 
427 aa  332  8e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2191  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.79 
 
 
422 aa  332  1e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0372  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.05 
 
 
423 aa  331  1e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0414  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.27 
 
 
427 aa  331  1e-89  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.31965  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0274  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.05 
 
 
423 aa  331  1e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0312  phosphoribosylamine/glycine ligase  49.76 
 
 
426 aa  331  2e-89  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0880  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.6 
 
 
422 aa  330  2e-89  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0280  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.81 
 
 
423 aa  331  2e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>