More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_0756 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013522  Taci_0756  phosphoribosylamine/glycine ligase  100 
 
 
424 aa  847    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.721746  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1300  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.31 
 
 
432 aa  362  1e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.617554  normal  0.088058 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2212  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.44 
 
 
426 aa  360  3e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0983  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.18 
 
 
425 aa  360  4e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0720926  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3260  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.31 
 
 
432 aa  359  6e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.207571  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5622  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.84 
 
 
425 aa  358  7e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2318  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.68 
 
 
426 aa  358  9e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.57608 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2333  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.31 
 
 
426 aa  358  9e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0928506  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3668  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.84 
 
 
425 aa  357  1.9999999999999998e-97  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0360  Phosphoribosylamine--glycine ligase  46.1 
 
 
430 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2295  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.44 
 
 
426 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1238  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.24 
 
 
425 aa  356  3.9999999999999996e-97  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0617  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.9 
 
 
425 aa  354  2e-96  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1683  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.21 
 
 
426 aa  353  2e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.138512  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2389  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.66 
 
 
422 aa  353  2.9999999999999997e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2065  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.81 
 
 
425 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.19426 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1989  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.89 
 
 
422 aa  353  4e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.187802  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2191  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.13 
 
 
422 aa  352  5e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1014  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.23 
 
 
425 aa  352  1e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1230  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.99 
 
 
425 aa  350  4e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1384  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.23 
 
 
425 aa  349  6e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.563842  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1239  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.23 
 
 
425 aa  349  6e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0277108  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002184  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.13 
 
 
429 aa  348  8e-95  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.25624  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0793  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.99 
 
 
425 aa  348  1e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.296273  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1885  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.99 
 
 
425 aa  348  1e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.132048  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1074  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.99 
 
 
425 aa  348  1e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.497421  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0357  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.99 
 
 
425 aa  348  1e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.659716  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0438  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.24 
 
 
430 aa  347  2e-94  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.199076  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3451  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.63 
 
 
428 aa  347  2e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.264337  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0224  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.5 
 
 
428 aa  347  3e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0267401  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02964  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.76 
 
 
429 aa  346  4e-94  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2988  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.74 
 
 
428 aa  346  5e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1999  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.58 
 
 
429 aa  346  5e-94  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00638776  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2871  phosphoribosylamine/glycine ligase  45.05 
 
 
449 aa  345  8e-94  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0927595 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0292  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.16 
 
 
427 aa  345  1e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00181025  normal  0.0133648 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0361  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.58 
 
 
427 aa  343  2e-93  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.292405  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00211  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.19 
 
 
429 aa  344  2e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0784  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.47 
 
 
422 aa  344  2e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.110869  normal  0.244609 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23090  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.94 
 
 
425 aa  344  2e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.121893  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2652  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.43 
 
 
429 aa  342  5e-93  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0177  phosphoribosylamine/glycine ligase  44.47 
 
 
429 aa  343  5e-93  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.348487  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4386  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.92 
 
 
429 aa  341  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.677738 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0228  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.55 
 
 
428 aa  341  2e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0316556  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0612  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.34 
 
 
430 aa  340  2.9999999999999998e-92  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000692344  hitchhiker  0.00000110971 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4508  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.69 
 
 
429 aa  339  4e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0778373 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4419  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.69 
 
 
429 aa  339  4e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.160091  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3665  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.63 
 
 
428 aa  339  4e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0555  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.22 
 
 
431 aa  339  5e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3708  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.19 
 
 
428 aa  339  5e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0202463  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2523  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.47 
 
 
422 aa  339  5e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0909  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.05 
 
 
432 aa  339  5e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27830  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.55 
 
 
421 aa  338  8e-92  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4239  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.92 
 
 
429 aa  338  8e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00124381  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0997  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.22 
 
 
430 aa  338  9.999999999999999e-92  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4548  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.19 
 
 
429 aa  338  9.999999999999999e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000304372  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1540  phosphoribosylamine/glycine ligase  44.86 
 
 
433 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.427577  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4506  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.45 
 
 
429 aa  338  9.999999999999999e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0278032 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4020  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.19 
 
 
429 aa  338  9.999999999999999e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000927217  normal  0.0101467 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0529  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.26 
 
 
429 aa  338  9.999999999999999e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.863272  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4582  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.45 
 
 
429 aa  338  9.999999999999999e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.213422  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03882  phosphoribosylamine-glycine ligase  43.19 
 
 
429 aa  337  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000860274  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1753  phosphoribosylamine--glycine ligase  44 
 
 
437 aa  337  1.9999999999999998e-91  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.528627  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03941  Phosphoribosylamine-glycine ligase  42.66 
 
 
430 aa  337  1.9999999999999998e-91  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0266  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.55 
 
 
427 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000213794  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3862  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.19 
 
 
429 aa  337  1.9999999999999998e-91  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.256361  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03835  hypothetical protein  43.19 
 
 
429 aa  337  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000931477  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0434  phosphoribosylamine--glycine ligase  44 
 
 
424 aa  337  2.9999999999999997e-91  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5474  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.96 
 
 
429 aa  336  3.9999999999999995e-91  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.13476  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1704  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.59 
 
 
428 aa  336  3.9999999999999995e-91  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.382123  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2843  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.46 
 
 
430 aa  336  3.9999999999999995e-91  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.294227  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2552  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.6 
 
 
426 aa  336  5.999999999999999e-91  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0177333  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0875  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.69 
 
 
430 aa  336  5.999999999999999e-91  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.712895  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1899  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.59 
 
 
428 aa  335  7e-91  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.543102  normal  0.253787 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4453  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.69 
 
 
429 aa  335  7e-91  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0221711  hitchhiker  0.000392069 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0392  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.08 
 
 
424 aa  335  9e-91  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.423575  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0170  phosphoribosylamine/glycine ligase  46.59 
 
 
420 aa  334  2e-90  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.133071  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0215  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.98 
 
 
430 aa  334  2e-90  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0406099  normal  0.0125796 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0348  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.52 
 
 
422 aa  334  2e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.6128 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3458  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.66 
 
 
423 aa  333  3e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2323  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.9 
 
 
429 aa  333  4e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.125717  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4104  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.65 
 
 
427 aa  333  4e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0519  phosphoribosylamine/glycine ligase  40.33 
 
 
415 aa  333  4e-90  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.941545  normal  0.807449 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3988  phosphoribosylamine/glycine ligase  42.22 
 
 
429 aa  333  5e-90  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0361396  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4496  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.22 
 
 
429 aa  333  5e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000225394  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3219  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.92 
 
 
429 aa  332  5e-90  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.708681 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1416  phosphoribosylamine/glycine ligase  41.23 
 
 
413 aa  332  6e-90  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000507728  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1245  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.48 
 
 
419 aa  332  7.000000000000001e-90  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.495633  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1041  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.27 
 
 
424 aa  331  1e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.714358  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2180  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.19 
 
 
419 aa  331  1e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.900628  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1419  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.18 
 
 
425 aa  331  1e-89  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0676  phosphoribosylamine--glycine ligase  38.9 
 
 
416 aa  331  1e-89  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5964  phosphoribosylamine/glycine ligase  42.45 
 
 
428 aa  330  3e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.262465 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1729  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.96 
 
 
430 aa  330  3e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.576125 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1722  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.06 
 
 
425 aa  329  5.0000000000000004e-89  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2684  phosphoribosylamine/glycine ligase  41.88 
 
 
432 aa  329  6e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0337126  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02975  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.51 
 
 
427 aa  329  6e-89  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0569996  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2231  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.36 
 
 
423 aa  329  7e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0264  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.8 
 
 
430 aa  329  7e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.46971  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1442  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.18 
 
 
426 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.577495  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17671  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.95 
 
 
434 aa  327  2.0000000000000001e-88  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>