More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_3134 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_3134  phosphoribosylamine/glycine ligase  100 
 
 		 428 aa  829    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.808887  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35150  phosphoribosylamine--glycine ligase  71.66 
 
 		 429 aa  570  1e-161  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2413  phosphoribosylamine/glycine ligase  68.2 
 
 		 436 aa  554  1e-156  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.545734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3187  phosphoribosylamine--glycine ligase  66.28 
 
 		 438 aa  535  1e-151  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3600  phosphoribosylamine/glycine ligase  68.92 
 
 		 433 aa  529  1e-149  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3406  phosphoribosylamine--glycine ligase  65.96 
 
 		 446 aa  530  1e-149  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2960  phosphoribosylamine/glycine ligase  70.05 
 
 		 433 aa  506  9.999999999999999e-143  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0197  phosphoribosylamine/glycine ligase  63.66 
 
 		 415 aa  497  1e-139  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0170  phosphoribosylamine/glycine ligase  62.14 
 
 		 420 aa  485  1e-136  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.133071  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18510  phosphoribosylamine--glycine ligase  62.76 
 
 		 429 aa  479  1e-134  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3013  phosphoribosylamine--glycine ligase  60.71 
 
 		 424 aa  476  1e-133  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0279  phosphoribosylamine/glycine ligase  63.46 
 
 		 417 aa  476  1e-133  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4342  phosphoribosylamine--glycine ligase  65.62 
 
 		 416 aa  477  1e-133  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.466735  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23300  phosphoribosylamine--glycine ligase  64.92 
 
 		 433 aa  472  1e-132  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4636  phosphoribosylamine/glycine ligase  60.95 
 
 		 416 aa  469  1.0000000000000001e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.728715  normal  0.385617 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6903  phosphoribosylamine/glycine ligase  61.4 
 
 		 419 aa  461  1e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0386  Phosphoribosylamine--glycine ligase  60.82 
 
 		 410 aa  455  1e-127  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6145  phosphoribosylamine/glycine ligase  62.56 
 
 		 411 aa  455  1e-127  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.106409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38170  phosphoribosylamine--glycine ligase  60.79 
 
 		 429 aa  448  1e-125  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0134  phosphoribosylamine--glycine ligase  60.98 
 
 		 416 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.415315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2127  phosphoribosylamine--glycine ligase  62.06 
 
 		 420 aa  436  1e-121  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0140  phosphoribosylamine--glycine ligase  61.36 
 
 		 416 aa  434  1e-120  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000376127 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4774  phosphoribosylamine/glycine ligase  62.38 
 
 		 421 aa  430  1e-119  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4100  phosphoribosylamine--glycine ligase  68.96 
 
 		 404 aa  422  1e-117  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.464449 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0831  phosphoribosylamine/glycine ligase  57.28 
 
 		 417 aa  422  1e-117  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0251625  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10787  phosphoribosylamine--glycine ligase  56.84 
 
 		 422 aa  421  1e-117  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05830  phosphoribosylamine--glycine ligase  57.14 
 
 		 446 aa  410  1e-113  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.822028  normal  0.495847 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4954  phosphoribosylamine--glycine ligase  57.31 
 
 		 422 aa  410  1e-113  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.1743 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4571  phosphoribosylamine--glycine ligase  57.54 
 
 		 422 aa  411  1e-113  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.840997  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4659  phosphoribosylamine--glycine ligase  57.54 
 
 		 422 aa  411  1e-113  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0824941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0208  phosphoribosylamine--glycine ligase  57.45 
 
 		 439 aa  405  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.428663 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5132  phosphoribosylamine/glycine ligase  56.67 
 
 		 420 aa  402  1e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4370  phosphoribosylamine--glycine ligase  57.21 
 
 		 436 aa  399  9.999999999999999e-111  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.766514 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3626  phosphoribosylamine/glycine ligase  56.43 
 
 		 411 aa  397  1e-109  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.241782  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5150  phosphoribosylamine--glycine ligase  56.84 
 
 		 430 aa  395  1e-109  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1608  phosphoribosylamine--glycine ligase  56.05 
 
 		 427 aa  394  1e-108  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0026  phosphoribosylamine/glycine ligase  50.12 
 
 		 704 aa  377  1e-103  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0991  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.7 
 
 		 425 aa  364  1e-99  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1699  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.55 
 
 		 427 aa  358  9.999999999999999e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.251383  normal  0.989876 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1777  phosphoribosylamine/glycine ligase  47.2 
 
 		 428 aa  357  1.9999999999999998e-97  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0471  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.01 
 
 		 423 aa  355  8.999999999999999e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0529  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.06 
 
 		 429 aa  353  5e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.863272  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0578  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.83 
 
 		 425 aa  352  5e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2453  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.47 
 
 		 424 aa  352  8e-96  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.386914  normal  0.350843 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0807  phosphoribosylamine/glycine ligase  53.55 
 
 		 427 aa  351  1e-95  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.966412 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0535  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.94 
 
 		 427 aa  349  5e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.201111 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0960  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.65 
 
 		 426 aa  348  7e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0438  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.52 
 
 		 430 aa  347  3e-94  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.199076  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0172  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.14 
 
 		 429 aa  345  8.999999999999999e-94  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4619  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.13 
 
 		 427 aa  342  5.999999999999999e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3379  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.71 
 
 		 414 aa  342  8e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.104647 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2552  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.6 
 
 		 426 aa  341  1e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0177333  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3862  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.11 
 
 		 429 aa  341  1e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.256361  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3665  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.82 
 
 		 428 aa  342  1e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0414  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.32 
 
 		 427 aa  340  2.9999999999999998e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.31965  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1722  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.36 
 
 		 425 aa  340  2.9999999999999998e-92  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0264  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.67 
 
 		 430 aa  340  4e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.46971  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2231  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.57 
 
 		 423 aa  339  5.9999999999999996e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0422  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.09 
 
 		 427 aa  338  9e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0627  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.86 
 
 		 425 aa  338  9e-92  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.154285 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0875  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.32 
 
 		 430 aa  338  9.999999999999999e-92  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.712895  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0224  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.65 
 
 		 428 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0267401  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5474  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.44 
 
 		 429 aa  337  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.13476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0231  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.07 
 
 		 425 aa  337  1.9999999999999998e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.595549  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3708  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.53 
 
 		 428 aa  337  2.9999999999999997e-91  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0202463  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11500  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.95 
 
 		 430 aa  336  3.9999999999999995e-91  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.089244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4453  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.44 
 
 		 429 aa  336  3.9999999999999995e-91  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0221711  hitchhiker  0.000392069 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0036  phosphoribosylamine/glycine ligase  49.65 
 
 		 430 aa  336  3.9999999999999995e-91  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0909  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.98 
 
 		 432 aa  336  5e-91  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23090  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.79 
 
 		 425 aa  335  9e-91  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.121893  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03882  phosphoribosylamine-glycine ligase  47.44 
 
 		 429 aa  335  1e-90  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000860274  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03835  hypothetical protein  47.44 
 
 		 429 aa  335  1e-90  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000931477  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4548  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.44 
 
 		 429 aa  335  1e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000304372  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3149  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.75 
 
 		 433 aa  335  1e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.868678  normal  0.802626 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4020  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.44 
 
 		 429 aa  335  1e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000927217  normal  0.0101467 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02964  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.91 
 
 		 429 aa  334  2e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1353  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.07 
 
 		 427 aa  334  2e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.2506  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4239  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.21 
 
 		 429 aa  334  2e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00124381  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4386  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.98 
 
 		 429 aa  334  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.677738 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0228  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.83 
 
 		 428 aa  333  3e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0316556  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4508  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.74 
 
 		 429 aa  333  4e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0778373 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1480  phosphoribosylamine/glycine ligase  45.58 
 
 		 419 aa  332  6e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4419  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.74 
 
 		 429 aa  332  6e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.160091  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2904  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.75 
 
 		 423 aa  332  7.000000000000001e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000288348  normal  0.785686 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4506  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.51 
 
 		 429 aa  332  8e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0278032 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3988  phosphoribosylamine/glycine ligase  47.21 
 
 		 429 aa  331  1e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0361396  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1412  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.86 
 
 		 422 aa  331  1e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.8215  normal  0.900094 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0646  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.55 
 
 		 436 aa  331  1e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4496  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.21 
 
 		 429 aa  331  1e-89  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000225394  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4582  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.51 
 
 		 429 aa  332  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.213422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0215  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.17 
 
 		 430 aa  332  1e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0406099  normal  0.0125796 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03941  Phosphoribosylamine-glycine ligase  45.88 
 
 		 430 aa  331  2e-89  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1863  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.03 
 
 		 442 aa  330  3e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.466784  hitchhiker  0.0074915 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0619  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.82 
 
 		 427 aa  330  3e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.374111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4104  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.56 
 
 		 427 aa  329  5.0000000000000004e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002184  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.72 
 
 		 429 aa  329  7e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.25624  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3458  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.1 
 
 		 423 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0997  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.69 
 
 		 430 aa  328  1.0000000000000001e-88  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2591  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.08 
 
 		 423 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3845  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.6 
 
 		 423 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000183828  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>