More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH_1006 on replicon NC_007799
Organism: Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007354  Ecaj_0813  phosphoribosylamine--glycine ligase  96.67 
 
 
421 aa  812    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.136066  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1006  phosphoribosylamine--glycine ligase  100 
 
 
421 aa  862    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.283424  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0029  phosphoribosylamine--glycine ligase  56.97 
 
 
423 aa  494  9.999999999999999e-139  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0529  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.24 
 
 
429 aa  412  1e-114  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.863272  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0414  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.48 
 
 
427 aa  402  1e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.31965  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2871  phosphoribosylamine/glycine ligase  46.9 
 
 
449 aa  405  1e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0927595 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2552  phosphoribosylamine--glycine ligase  47 
 
 
426 aa  399  9.999999999999999e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0177333  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0422  phosphoribosylamine--glycine ligase  47 
 
 
427 aa  400  9.999999999999999e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0619  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.51 
 
 
427 aa  395  1e-109  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.374111  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0646  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.39 
 
 
436 aa  395  1e-109  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0392  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.79 
 
 
424 aa  397  1e-109  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.423575  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1699  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.61 
 
 
427 aa  396  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.251383  normal  0.989876 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4104  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.04 
 
 
427 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3173  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.24 
 
 
428 aa  394  1e-108  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0826007  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4029  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.61 
 
 
420 aa  392  1e-108  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1353  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.8 
 
 
427 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.2506  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1863  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.32 
 
 
442 aa  385  1e-106  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.466784  hitchhiker  0.0074915 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1412  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.02 
 
 
422 aa  385  1e-106  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.8215  normal  0.900094 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3149  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.17 
 
 
433 aa  384  1e-105  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.868678  normal  0.802626 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4619  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.89 
 
 
427 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0960  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.23 
 
 
426 aa  377  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0172  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.58 
 
 
429 aa  377  1e-103  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0635  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.71 
 
 
420 aa  377  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0719  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.27 
 
 
426 aa  376  1e-103  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.63678  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4180  phosphoribosylamine/glycine ligase  45.02 
 
 
435 aa  378  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.94163  normal  0.510323 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2591  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.52 
 
 
423 aa  377  1e-103  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2759  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.23 
 
 
424 aa  373  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000179977  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2231  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.99 
 
 
423 aa  372  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0471  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.56 
 
 
423 aa  374  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3871  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.55 
 
 
435 aa  373  1e-102  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.485049  normal  0.0530756 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2863  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.36 
 
 
426 aa  374  1e-102  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0385682  normal  0.548732 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4327  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.87 
 
 
431 aa  372  1e-102  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.101605  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0036  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.57 
 
 
424 aa  372  1e-102  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.413084  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1946  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.81 
 
 
420 aa  375  1e-102  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0479651 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2361  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.86 
 
 
422 aa  369  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0578  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.61 
 
 
425 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336164  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3465  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.58 
 
 
456 aa  368  1e-101  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0535  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.61 
 
 
427 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.201111 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1013  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.93 
 
 
421 aa  366  1e-100  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0926645  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0292  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.22 
 
 
427 aa  367  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00181025  normal  0.0133648 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1540  phosphoribosylamine/glycine ligase  43.16 
 
 
433 aa  365  1e-99  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.427577  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3302  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.81 
 
 
422 aa  363  2e-99  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0635766 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0496  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.99 
 
 
420 aa  363  3e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.18255  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1847  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.99 
 
 
420 aa  362  5.0000000000000005e-99  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.180423  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3523  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.04 
 
 
423 aa  362  7.0000000000000005e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0437232 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6598  phosphoribosylamine/glycine ligase  44.26 
 
 
423 aa  362  8e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.204932  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3457  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.04 
 
 
423 aa  361  1e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.021302  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0372  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.55 
 
 
423 aa  361  1e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03941  Phosphoribosylamine-glycine ligase  41.75 
 
 
430 aa  360  2e-98  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4975  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.84 
 
 
423 aa  360  3e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1245  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.93 
 
 
419 aa  359  5e-98  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.495633  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3845  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.04 
 
 
423 aa  359  6e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000183828  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1774  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.9 
 
 
428 aa  358  8e-98  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000323466  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1140  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.47 
 
 
430 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0280  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.55 
 
 
423 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0328  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.08 
 
 
423 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1427  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.62 
 
 
591 aa  356  5e-97  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0434  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.45 
 
 
424 aa  356  5e-97  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1330  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.6 
 
 
421 aa  356  5e-97  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.152836  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1753  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.45 
 
 
437 aa  355  8.999999999999999e-97  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.528627  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0610  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.71 
 
 
423 aa  355  1e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00101284  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0274  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.84 
 
 
423 aa  355  1e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23090  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.14 
 
 
425 aa  354  1e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.121893  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1777  phosphoribosylamine/glycine ligase  42.08 
 
 
428 aa  353  2e-96  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0286  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.6 
 
 
423 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0299  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.6 
 
 
423 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2728  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.28 
 
 
420 aa  353  4e-96  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0882976  normal  0.135316 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6062  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.26 
 
 
442 aa  352  7e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.498795  normal  0.336807 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2988  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.12 
 
 
428 aa  352  8e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0331  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.6 
 
 
423 aa  352  8e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0627  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.61 
 
 
425 aa  352  8e-96  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.154285 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0266  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.57 
 
 
427 aa  352  8.999999999999999e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000213794  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0271  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.36 
 
 
423 aa  352  1e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0924  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.04 
 
 
421 aa  351  1e-95  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0345  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.36 
 
 
423 aa  350  2e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3219  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.09 
 
 
429 aa  350  3e-95  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.708681 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0177  phosphoribosylamine/glycine ligase  42.99 
 
 
429 aa  350  3e-95  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.348487  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0438  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.59 
 
 
430 aa  350  3e-95  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.199076  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4239  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.41 
 
 
429 aa  348  7e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00124381  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39441  predicted protein  44.58 
 
 
477 aa  349  7e-95  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.178853  normal  0.0538587 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4453  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.94 
 
 
429 aa  348  9e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0221711  hitchhiker  0.000392069 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3451  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.62 
 
 
428 aa  348  1e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.264337  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3708  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.86 
 
 
428 aa  348  1e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0202463  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0909  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.29 
 
 
432 aa  348  1e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1626  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.36 
 
 
432 aa  348  1e-94  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0264  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.65 
 
 
430 aa  347  2e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.46971  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4020  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.94 
 
 
429 aa  347  3e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000927217  normal  0.0101467 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3844  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.29 
 
 
428 aa  347  3e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000315171  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4548  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.94 
 
 
429 aa  347  3e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000304372  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2652  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.62 
 
 
429 aa  347  3e-94  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0464  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.29 
 
 
428 aa  347  3e-94  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00032027  normal  0.0111484 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03882  phosphoribosylamine-glycine ligase  40.94 
 
 
429 aa  346  4e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000860274  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5474  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.47 
 
 
429 aa  346  4e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.13476  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5622  phosphoribosylamine--glycine ligase  41 
 
 
425 aa  346  4e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03835  hypothetical protein  40.94 
 
 
429 aa  346  4e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000931477  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1523  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.68 
 
 
424 aa  345  6e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0737922 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0224  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.86 
 
 
428 aa  345  6e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0267401  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2342  phosphoribosylamine/glycine ligase  40.95 
 
 
428 aa  346  6e-94  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.51337  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2453  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.81 
 
 
424 aa  345  7e-94  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.386914  normal  0.350843 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002184  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.86 
 
 
429 aa  345  7e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.25624  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>