More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_05461 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_05461  phosphoribosylamine--glycine ligase  100 
 
 
438 aa  882    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.958381 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2122  phosphoribosylamine--glycine ligase  73.39 
 
 
435 aa  639    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0551  phosphoribosylamine--glycine ligase  68.04 
 
 
435 aa  572  1.0000000000000001e-162  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13941  phosphoribosylamine--glycine ligase  60.73 
 
 
446 aa  569  1e-161  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.144546  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17671  phosphoribosylamine--glycine ligase  58.02 
 
 
434 aa  533  1e-150  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0911  phosphoribosylamine--glycine ligase  58.25 
 
 
434 aa  534  1e-150  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15411  phosphoribosylglycinamide synthetase  50.82 
 
 
443 aa  472  1e-132  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  decreased coverage  0.000363118  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15261  phosphoribosylglycinamide synthetase  49.09 
 
 
443 aa  470  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.56284  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1438  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.86 
 
 
443 aa  464  1e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15011  phosphoribosylglycinamide synthetase  49.41 
 
 
445 aa  460  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1775  phosphoribosylamine/glycine ligase  51.29 
 
 
433 aa  392  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.780493 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0925  phosphoribosylamine--glycine ligase  54.72 
 
 
433 aa  388  1e-107  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3227  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.88 
 
 
425 aa  378  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0779  phosphoribosylamine/glycine ligase  47.87 
 
 
428 aa  372  1e-101  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00193673  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3997  phosphoribosylamine/glycine ligase  47.63 
 
 
423 aa  371  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4039  phosphoribosylamine/glycine ligase  47.63 
 
 
423 aa  371  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.324775  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1471  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.68 
 
 
423 aa  363  3e-99  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0600936 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1532  phosphoribosylamine/glycine ligase  47.38 
 
 
423 aa  357  2.9999999999999997e-97  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.612843  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1983  phosphoribosylamine/glycine ligase  45.15 
 
 
423 aa  353  2e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.853313 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2212  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.84 
 
 
426 aa  352  8.999999999999999e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5622  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.21 
 
 
425 aa  350  2e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23090  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.65 
 
 
425 aa  350  3e-95  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.121893  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0983  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.21 
 
 
425 aa  348  9e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0720926  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2043  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.86 
 
 
421 aa  348  1e-94  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.453314 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1480  phosphoribosylamine/glycine ligase  43.78 
 
 
419 aa  347  2e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1014  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.1 
 
 
425 aa  347  3e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2333  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.84 
 
 
426 aa  346  4e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0928506  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3175  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.41 
 
 
418 aa  345  8e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1384  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.73 
 
 
425 aa  345  1e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.563842  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1239  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.73 
 
 
425 aa  345  1e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0277108  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0793  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.5 
 
 
425 aa  344  2e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.296273  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1230  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.5 
 
 
425 aa  344  2e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1300  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.5 
 
 
432 aa  344  2e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.617554  normal  0.088058 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1074  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.5 
 
 
425 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.497421  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1885  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.5 
 
 
425 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.132048  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0357  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.5 
 
 
425 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.659716  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27830  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.46 
 
 
421 aa  341  2e-92  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3260  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.02 
 
 
432 aa  340  2e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.207571  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2361  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.1 
 
 
422 aa  341  2e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2318  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.5 
 
 
426 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.57608 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0401  phosphoribosylamine/glycine ligase  45.71 
 
 
428 aa  340  4e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000120381  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2295  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.13 
 
 
426 aa  339  5e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0312  phosphoribosylamine/glycine ligase  47.51 
 
 
426 aa  338  9.999999999999999e-92  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1704  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.94 
 
 
428 aa  337  1.9999999999999998e-91  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.382123  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1899  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.71 
 
 
428 aa  336  5e-91  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.543102  normal  0.253787 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0360  Phosphoribosylamine--glycine ligase  43.84 
 
 
430 aa  335  9e-91  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2389  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.61 
 
 
422 aa  335  1e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2065  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.94 
 
 
425 aa  335  1e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.19426 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1683  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.89 
 
 
426 aa  335  1e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.138512  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06541  phosphoribosylamine-glycine ligase (Eurofung)  41.65 
 
 
809 aa  334  2e-90  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2323  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.02 
 
 
429 aa  334  2e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.125717  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0627  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.69 
 
 
425 aa  334  2e-90  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.154285 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1989  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.13 
 
 
422 aa  333  5e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.187802  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1338  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.22 
 
 
430 aa  332  7.000000000000001e-90  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0838  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.65 
 
 
425 aa  332  8e-90  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.083606  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2652  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.74 
 
 
429 aa  331  2e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0127  phosphoribosylamine/glycine ligase  45.95 
 
 
413 aa  330  2e-89  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2453  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.44 
 
 
424 aa  330  3e-89  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.386914  normal  0.350843 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0036  phosphoribosylamine/glycine ligase  43.44 
 
 
430 aa  330  3e-89  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3379  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.11 
 
 
414 aa  330  3e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.104647 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4104  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.79 
 
 
427 aa  330  3e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11500  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.76 
 
 
430 aa  330  3e-89  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.089244  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3668  phosphoribosylamine--glycine ligase  44 
 
 
425 aa  329  7e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0946  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.69 
 
 
420 aa  329  7e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1540  phosphoribosylamine/glycine ligase  44.84 
 
 
433 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.427577  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3665  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.55 
 
 
428 aa  328  1.0000000000000001e-88  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1628  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.66 
 
 
425 aa  328  1.0000000000000001e-88  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2552  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.42 
 
 
426 aa  327  2.0000000000000001e-88  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0177333  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2231  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.89 
 
 
423 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0960  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.68 
 
 
426 aa  328  2.0000000000000001e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0735  phosphoribosylamine/glycine ligase  42.99 
 
 
425 aa  328  2.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.525706  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1952  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.06 
 
 
427 aa  327  2.0000000000000001e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0177  phosphoribosylamine/glycine ligase  43.36 
 
 
429 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.348487  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0026  phosphoribosylamine/glycine ligase  43.56 
 
 
704 aa  327  3e-88  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2191  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.18 
 
 
422 aa  326  5e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2342  phosphoribosylamine/glycine ligase  43.3 
 
 
428 aa  326  5e-88  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.51337  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0172  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.6 
 
 
429 aa  325  7e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0221  phosphoribosylamine/glycine ligase  44.58 
 
 
427 aa  325  8.000000000000001e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.529077 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1699  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.36 
 
 
427 aa  325  9e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.251383  normal  0.989876 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3202  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.82 
 
 
426 aa  324  1e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.462795  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1442  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.08 
 
 
426 aa  325  1e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.577495  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2684  phosphoribosylamine/glycine ligase  44.24 
 
 
432 aa  325  1e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0337126  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0215  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.42 
 
 
430 aa  325  1e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0406099  normal  0.0125796 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0434  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.28 
 
 
424 aa  324  2e-87  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1753  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.28 
 
 
437 aa  323  3e-87  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.528627  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0519  phosphoribosylamine/glycine ligase  40.67 
 
 
415 aa  323  3e-87  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.941545  normal  0.807449 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3149  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.12 
 
 
433 aa  323  3e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.868678  normal  0.802626 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1774  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.92 
 
 
428 aa  323  4e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000323466  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1245  phosphoribosylamine--glycine ligase  37.91 
 
 
419 aa  323  5e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.495633  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0784  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.47 
 
 
422 aa  323  5e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.110869  normal  0.244609 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1238  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.79 
 
 
425 aa  322  6e-87  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1330  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.61 
 
 
421 aa  322  8e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.152836  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0438  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.47 
 
 
430 aa  322  8e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.199076  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1969  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.66 
 
 
433 aa  322  8e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.949647 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0617  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.79 
 
 
425 aa  322  9.000000000000001e-87  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1999  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.86 
 
 
429 aa  321  9.999999999999999e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00638776  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0197  phosphoribosylamine/glycine ligase  44.94 
 
 
415 aa  322  9.999999999999999e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3458  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.89 
 
 
423 aa  321  9.999999999999999e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1863  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.31 
 
 
442 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.466784  hitchhiker  0.0074915 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1777  phosphoribosylamine/glycine ligase  43.69 
 
 
428 aa  322  9.999999999999999e-87  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>