More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0424 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_0424  phosphoribosylamine--glycine ligase  100 
 
 		 426 aa  870    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0597  phosphoribosylamine/glycine ligase  65.8 
 
 		 424 aa  588  1e-167  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0949  phosphoribosylamine--glycine ligase  59.14 
 
 		 417 aa  521  1e-147  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0492  phosphoribosylamine--glycine ligase  61.23 
 
 		 414 aa  523  1e-147  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0233  phosphoribosylamine--glycine ligase  59.62 
 
 		 417 aa  518  1e-146  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0504  phosphoribosylamine--glycine ligase  59.14 
 
 		 416 aa  504  1e-141  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1387  phosphoribosylamine--glycine ligase  60.33 
 
 		 416 aa  499  1e-140  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1266  phosphoribosylamine--glycine ligase  60.33 
 
 		 416 aa  500  1e-140  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0475  phosphoribosylamine--glycine ligase  59.86 
 
 		 416 aa  497  1e-139  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.49391  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1261  phosphoribosylamine--glycine ligase  58.67 
 
 		 415 aa  498  1e-139  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3219  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.69 
 
 		 429 aa  367  1e-100  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.708681 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2389  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.76 
 
 		 422 aa  364  1e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2652  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.12 
 
 		 429 aa  363  2e-99  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1989  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.53 
 
 		 422 aa  363  3e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.187802  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0555  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.63 
 
 		 431 aa  362  7.0000000000000005e-99  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0266  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.89 
 
 		 427 aa  362  8e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000213794  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3451  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.06 
 
 		 428 aa  362  8e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.264337  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002184  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.66 
 
 		 429 aa  362  1e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.25624  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3668  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.89 
 
 		 425 aa  359  5e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2191  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.62 
 
 		 422 aa  359  6e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00211  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.89 
 
 		 429 aa  358  7e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0360  Phosphoribosylamine--glycine ligase  41.96 
 
 		 430 aa  358  9.999999999999999e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2591  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.86 
 
 		 423 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1300  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.86 
 
 		 432 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.617554  normal  0.088058 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1653  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.29 
 
 		 427 aa  356  3.9999999999999996e-97  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0215  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.4 
 
 		 430 aa  355  8.999999999999999e-97  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0406099  normal  0.0125796 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5622  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.47 
 
 		 425 aa  354  2e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4419  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.49 
 
 		 429 aa  353  2e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.160091  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0292  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.92 
 
 		 427 aa  353  2.9999999999999997e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00181025  normal  0.0133648 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0784  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.45 
 
 		 422 aa  353  2.9999999999999997e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.110869  normal  0.244609 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2759  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.47 
 
 		 424 aa  353  4e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000179977  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4386  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.26 
 
 		 429 aa  353  4e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.677738 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0997  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.16 
 
 		 430 aa  352  5e-96  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2988  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.26 
 
 		 428 aa  352  5.9999999999999994e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0983  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.17 
 
 		 425 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0720926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1999  phosphoribosylamine--glycine ligase  42 
 
 		 429 aa  352  8e-96  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00638776  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3845  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.26 
 
 		 423 aa  352  8e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000183828  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2295  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.84 
 
 		 426 aa  352  8.999999999999999e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1014  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.84 
 
 		 425 aa  352  1e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1774  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.06 
 
 		 428 aa  351  1e-95  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000323466  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4508  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.82 
 
 		 429 aa  351  2e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0778373 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3260  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.17 
 
 		 432 aa  351  2e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.207571  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03882  phosphoribosylamine-glycine ligase  42.79 
 
 		 429 aa  350  3e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000860274  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1230  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.61 
 
 		 425 aa  350  3e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2212  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.38 
 
 		 426 aa  350  3e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2318  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.61 
 
 		 426 aa  350  3e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.57608 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2065  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.09 
 
 		 425 aa  350  3e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.19426 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03835  hypothetical protein  42.79 
 
 		 429 aa  350  3e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000931477  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3665  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.23 
 
 		 428 aa  350  3e-95  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1683  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.84 
 
 		 426 aa  350  3e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.138512  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4506  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.82 
 
 		 429 aa  350  3e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0278032 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5575  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.19 
 
 		 429 aa  350  4e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3457  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.97 
 
 		 423 aa  349  4e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.021302  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4876  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.66 
 
 		 431 aa  349  5e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4613  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.42 
 
 		 431 aa  349  5e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.302277 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4582  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.79 
 
 		 429 aa  349  6e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.213422  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06880  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.23 
 
 		 426 aa  349  6e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.285428  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2843  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.69 
 
 		 430 aa  349  6e-95  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.294227  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0224  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.19 
 
 		 428 aa  348  1e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0267401  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4548  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.56 
 
 		 429 aa  348  1e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000304372  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4020  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.56 
 
 		 429 aa  348  1e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000927217  normal  0.0101467 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5474  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.09 
 
 		 429 aa  348  1e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.13476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0909  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.1 
 
 		 432 aa  348  1e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3862  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.46 
 
 		 429 aa  348  1e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.256361  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2333  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.38 
 
 		 426 aa  348  1e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0928506  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0532  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.76 
 
 		 426 aa  348  1e-94  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4453  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.09 
 
 		 429 aa  347  2e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0221711  hitchhiker  0.000392069 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4698  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.42 
 
 		 430 aa  347  2e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.744432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2871  phosphoribosylamine/glycine ligase  42.76 
 
 		 449 aa  347  2e-94  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0927595 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0617  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.79 
 
 		 425 aa  347  2e-94  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4823  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.42 
 
 		 431 aa  347  3e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1885  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.38 
 
 		 425 aa  347  3e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.132048  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1074  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.38 
 
 		 425 aa  347  3e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.497421  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0793  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.38 
 
 		 425 aa  347  3e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.296273  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0357  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.38 
 
 		 425 aa  347  3e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.659716  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1384  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.38 
 
 		 425 aa  346  4e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.563842  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03941  Phosphoribosylamine-glycine ligase  41.53 
 
 		 430 aa  346  4e-94  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1239  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.38 
 
 		 425 aa  346  4e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0277108  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1238  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.12 
 
 		 425 aa  346  4e-94  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3523  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.5 
 
 		 423 aa  346  5e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0437232 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0875  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.51 
 
 		 430 aa  345  6e-94  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.712895  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3988  phosphoribosylamine/glycine ligase  42.09 
 
 		 429 aa  345  7e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0361396  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4496  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.09 
 
 		 429 aa  345  7e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000225394  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0228  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.72 
 
 		 428 aa  345  8e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0316556  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4407  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.26 
 
 		 431 aa  345  1e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.357121 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1626  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.03 
 
 		 432 aa  344  1e-93  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64220  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.72 
 
 		 429 aa  344  1e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.88359  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0610  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.56 
 
 		 423 aa  344  2e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00101284  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02964  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.67 
 
 		 429 aa  344  2e-93  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4239  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.09 
 
 		 429 aa  344  2e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00124381  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0707  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.19 
 
 		 429 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3844  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.26 
 
 		 428 aa  343  2.9999999999999997e-93  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000315171  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4867  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.79 
 
 		 431 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1442  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.45 
 
 		 426 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.577495  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0438  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.03 
 
 		 430 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.199076  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0171  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.56 
 
 		 428 aa  342  5e-93  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0487  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.72 
 
 		 427 aa  342  5e-93  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.493201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0464  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.26 
 
 		 428 aa  342  7e-93  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00032027  normal  0.0111484 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0348  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.45 
 
 		 422 aa  342  7e-93  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.6128 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0356  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.26 
 
 		 428 aa  342  1e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0104682  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>