More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_1189 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_1189  phosphoribosylamine/glycine ligase  100 
 
 		 417 aa  842    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000704507  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0909  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.65 
 
 		 432 aa  372  1e-102  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0555  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.24 
 
 		 424 aa  367  1e-100  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1300  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.42 
 
 		 432 aa  362  6e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.617554  normal  0.088058 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2389  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.81 
 
 		 422 aa  360  3e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5622  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.34 
 
 		 425 aa  358  7e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3260  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.68 
 
 		 432 aa  358  9e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.207571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2295  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.47 
 
 		 426 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1267  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.39 
 
 		 437 aa  357  1.9999999999999998e-97  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00682849  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1989  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.81 
 
 		 422 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.187802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2212  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.21 
 
 		 426 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1683  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.47 
 
 		 426 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.138512  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2318  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.24 
 
 		 426 aa  356  5e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.57608 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2333  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.44 
 
 		 426 aa  356  5e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0928506  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0983  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.36 
 
 		 425 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0720926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1338  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.57 
 
 		 430 aa  355  8.999999999999999e-97  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1899  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.25 
 
 		 428 aa  355  1e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.543102  normal  0.253787 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0617  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.49 
 
 		 425 aa  355  1e-96  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2191  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.21 
 
 		 422 aa  354  2e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1704  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.25 
 
 		 428 aa  354  2e-96  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.382123  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2065  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.81 
 
 		 425 aa  353  2e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.19426 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1952  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.82 
 
 		 427 aa  353  2.9999999999999997e-96  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2361  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.68 
 
 		 422 aa  353  2.9999999999999997e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3202  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.96 
 
 		 426 aa  353  2.9999999999999997e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.462795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2759  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.69 
 
 		 424 aa  353  4e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000179977  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1238  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.72 
 
 		 425 aa  352  5.9999999999999994e-96  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0707  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.71 
 
 		 429 aa  352  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1014  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.24 
 
 		 425 aa  352  7e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1230  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.4 
 
 		 425 aa  352  8.999999999999999e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1074  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.4 
 
 		 425 aa  351  1e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.497421  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1885  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.4 
 
 		 425 aa  351  1e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.132048  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0612  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.66 
 
 		 430 aa  351  1e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.147919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2231  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.6 
 
 		 423 aa  351  1e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3451  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.42 
 
 		 428 aa  351  1e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.264337  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5575  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.24 
 
 		 429 aa  351  1e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0348  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.58 
 
 		 422 aa  351  1e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.6128 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0793  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.4 
 
 		 425 aa  351  1e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.296273  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0357  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.4 
 
 		 425 aa  351  1e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.659716  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1239  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.4 
 
 		 425 aa  350  2e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0277108  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1384  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.4 
 
 		 425 aa  350  2e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.563842  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1442  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.26 
 
 		 426 aa  350  3e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.577495  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0735  phosphoribosylamine/glycine ligase  44.08 
 
 		 425 aa  349  5e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.525706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3668  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.65 
 
 		 425 aa  349  5e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0438  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.03 
 
 		 430 aa  349  5e-95  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.199076  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0361  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.22 
 
 		 427 aa  348  8e-95  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.292405  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1729  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.85 
 
 		 430 aa  348  8e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.576125 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06880  phosphoribosylamine--glycine ligase  44 
 
 		 426 aa  348  9e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.285428  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0177  phosphoribosylamine/glycine ligase  43.9 
 
 		 429 aa  348  1e-94  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.348487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4407  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.66 
 
 		 431 aa  347  2e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.357121 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4613  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.16 
 
 		 431 aa  347  2e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.302277 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0784  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.4 
 
 		 422 aa  347  2e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.110869  normal  0.244609 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64220  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.53 
 
 		 429 aa  347  3e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.88359  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4823  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.4 
 
 		 431 aa  346  4e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0224  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.19 
 
 		 428 aa  346  4e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0267401  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3149  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.99 
 
 		 433 aa  346  5e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.868678  normal  0.802626 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4867  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.96 
 
 		 431 aa  345  7e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2684  phosphoribosylamine/glycine ligase  43.4 
 
 		 432 aa  345  8e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0337126  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4698  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.16 
 
 		 430 aa  345  1e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.744432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0228  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.19 
 
 		 428 aa  344  2e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0316556  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23090  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.84 
 
 		 425 aa  344  2e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.121893  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2342  phosphoribosylamine/glycine ligase  43.13 
 
 		 428 aa  344  2e-93  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.51337  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03941  Phosphoribosylamine-glycine ligase  42.92 
 
 		 430 aa  343  2.9999999999999997e-93  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4876  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.92 
 
 		 431 aa  343  4e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4239  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.56 
 
 		 426 aa  342  7e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.636159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1753  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.39 
 
 		 437 aa  341  2e-92  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.528627  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3457  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.65 
 
 		 423 aa  340  2e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.021302  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2323  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.52 
 
 		 429 aa  341  2e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.125717  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1969  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.26 
 
 		 433 aa  340  2e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.949647 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3219  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.61 
 
 		 429 aa  340  2e-92  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.708681 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0434  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.5 
 
 		 424 aa  341  2e-92  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0266  phosphoribosylamine/glycine ligase  44.24 
 
 		 424 aa  340  2.9999999999999998e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3523  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.89 
 
 		 423 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0437232 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0610  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.89 
 
 		 423 aa  339  5e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00101284  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4453  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.79 
 
 		 429 aa  339  5.9999999999999996e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0221711  hitchhiker  0.000392069 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1245  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.81 
 
 		 419 aa  338  7e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.495633  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2591  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.42 
 
 		 423 aa  338  7e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03882  phosphoribosylamine-glycine ligase  44.03 
 
 		 429 aa  338  9e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000860274  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03835  hypothetical protein  44.03 
 
 		 429 aa  338  9e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000931477  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3988  phosphoribosylamine/glycine ligase  43.79 
 
 		 429 aa  338  9.999999999999999e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0361396  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4239  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.03 
 
 		 429 aa  338  9.999999999999999e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00124381  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2523  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.63 
 
 		 422 aa  338  9.999999999999999e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1427  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.09 
 
 		 591 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4548  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.03 
 
 		 429 aa  338  9.999999999999999e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000304372  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4020  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.03 
 
 		 429 aa  338  9.999999999999999e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000927217  normal  0.0101467 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4496  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.79 
 
 		 429 aa  338  9.999999999999999e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000225394  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1626  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.61 
 
 		 432 aa  337  1.9999999999999998e-91  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3845  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.36 
 
 		 423 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000183828  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2453  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.08 
 
 		 424 aa  337  2.9999999999999997e-91  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.386914  normal  0.350843 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5474  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.56 
 
 		 429 aa  336  3.9999999999999995e-91  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.13476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2076  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.51 
 
 		 438 aa  336  3.9999999999999995e-91  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.552059  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0431  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.02 
 
 		 433 aa  336  5.999999999999999e-91  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1775  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.65 
 
 		 412 aa  335  7e-91  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0464  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.51 
 
 		 428 aa  335  7e-91  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00032027  normal  0.0111484 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0266  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.39 
 
 		 427 aa  335  9e-91  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000213794  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1419  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.69 
 
 		 425 aa  335  9e-91  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3522  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.79 
 
 		 427 aa  335  9e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.366295  normal  0.0471361 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002184  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.18 
 
 		 429 aa  334  1e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.25624  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1722  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.69 
 
 		 425 aa  335  1e-90  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0492  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.52 
 
 		 414 aa  335  1e-90  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0264  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.05 
 
 		 430 aa  334  2e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.46971  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>