More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_1929 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_1929  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  100 
 
 		 411 aa  829    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1270  protein of unknown function DUF201  27.01 
 
 		 399 aa  116  6.9999999999999995e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.964812  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2959  phosphoribosylglycinamide synthetase  26.08 
 
 		 405 aa  107  3e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0619  phosphoribosylglycinamide synthetase  30.92 
 
 		 410 aa  107  4e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.241949  hitchhiker  0.00233057 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3626  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  27.69 
 
 		 432 aa  106  6e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0449  putative glycolate oxidase  26.02 
 
 		 404 aa  105  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33390  biotin carboxylase  28.34 
 
 		 428 aa  103  4e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.465269 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2668  phosphoribosylglycinamide synthetase  26.56 
 
 		 415 aa  100  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4648  protein of unknown function DUF201  27.04 
 
 		 404 aa  100  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.896666  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0573  phosphoribosylglycinamide synthetase  26.41 
 
 		 420 aa  100  5e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.23534  normal  0.22349 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1518  protein of unknown function DUF201  26.48 
 
 		 424 aa  97.8  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2440  biotin carboxylase-like  26.18 
 
 		 424 aa  95.9  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.459774  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1423  protein of unknown function DUF201  26.24 
 
 		 424 aa  94.7  3e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.369206  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2209  CarB family protein  26.6 
 
 		 543 aa  94.4  4e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.304362  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0194  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain-containing protein ATP-grasp  28.48 
 
 		 419 aa  94  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.296569  normal  0.160479 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3265  hypothetical protein  24.57 
 
 		 412 aa  93.6  6e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1401  protein of unknown function DUF201  25.61 
 
 		 409 aa  88.2  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2737  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  25.96 
 
 		 723 aa  87.8  3e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4500  Cysteine synthase  28.9 
 
 		 756 aa  87.8  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.632569  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1742  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  32.24 
 
 		 385 aa  86.3  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3759  protein of unknown function DUF201  28.27 
 
 		 425 aa  86.3  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2026  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  27.36 
 
 		 423 aa  85.1  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2002  argininosuccinate lyase  22.78 
 
 		 900 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.848902  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2022  argininosuccinate lyase  22.78 
 
 		 900 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.10658  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2158  argininosuccinate lyase  22.78 
 
 		 914 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3660  hypothetical protein  29.41 
 
 		 411 aa  83.6  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.853995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37420  biotin carboxylase  26.67 
 
 		 405 aa  81.6  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.442231 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2020  phosphoribosylglycinamide synthetase  26.6 
 
 		 407 aa  81.6  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1164  protein of unknown function DUF201  23.43 
 
 		 437 aa  81.6  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2251  phosphoribosylglycinamide synthetase  24.4 
 
 		 418 aa  80.9  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000511987 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2987  phosphoribosylglycinamide synthetase  26.74 
 
 		 410 aa  80.1  0.00000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.0000000000875543  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0754  protein of unknown function DUF201  23.28 
 
 		 409 aa  79  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2144  phosphoribosylglycinamide synthetase  26.56 
 
 		 416 aa  79.3  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2595  putative carbamoyl-phosphate-synthetase  25.29 
 
 		 398 aa  78.6  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.605395  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7725  hypothetical protein  23.77 
 
 		 411 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.10668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1432  hypothetical protein  25.06 
 
 		 424 aa  77.8  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.502147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6388  phosphoribosylglycinamide synthetase  24.31 
 
 		 422 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.357309  normal  0.160447 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5515  phosphoribosylglycinamide synthetase  23.78 
 
 		 422 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.330375  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5879  phosphoribosylglycinamide synthetase  23.78 
 
 		 422 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.521142  normal  0.293972 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5090  hypothetical protein  23.68 
 
 		 453 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5770  hypothetical protein  23.68 
 
 		 453 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0282385 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2438  hypothetical protein  24.8 
 
 		 410 aa  73.9  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.658373 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2135  phosphoribosylglycinamide synthetase  26.25 
 
 		 412 aa  73.6  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.165665  normal  0.504192 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11841  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  29.03 
 
 		 392 aa  73.2  0.000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.703197  normal  0.0751246 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1724  protein of unknown function DUF201  24.84 
 
 		 401 aa  72.8  0.00000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1053  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  30.73 
 
 		 393 aa  72  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000113017  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1119  biotin carboxylase  26.67 
 
 		 411 aa  72.4  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1188  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  29.74 
 
 		 404 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.265969  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2557  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  27.74 
 
 		 392 aa  71.2  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2507  argininosuccinate lyase  25.51 
 
 		 912 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1349  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  30.52 
 
 		 464 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.608306  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1196  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  29.74 
 
 		 404 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.517415  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0036  phosphoribosylamine/glycine ligase  24.91 
 
 		 430 aa  70.1  0.00000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2331  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  28.15 
 
 		 393 aa  70.5  0.00000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.659291 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3192  argininosuccinate lyase  25.52 
 
 		 924 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.655648  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0912  biotin carboxylase-like protein  25.39 
 
 		 410 aa  70.1  0.00000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.527326 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1140  phosphoribosylamine--glycine ligase  24.62 
 
 		 430 aa  69.7  0.00000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1922  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  29.37 
 
 		 404 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.244182  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0318  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  29.37 
 
 		 404 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0201005  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0418  hypothetical protein  27.63 
 
 		 411 aa  69.3  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1396  argininosuccinate lyase  25.35 
 
 		 926 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0832  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  29.37 
 
 		 404 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.815383  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1035  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  29.37 
 
 		 404 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.240382  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0829  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  27.07 
 
 		 388 aa  68.9  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2646  argininosuccinate lyase  25 
 
 		 904 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1971  argininosuccinate lyase  25.08 
 
 		 891 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03057  hypothetical protein  27.15 
 
 		 449 aa  67.8  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.450613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3193  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  41.67 
 
 		 392 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000478447  hitchhiker  1.55264e-21 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1388  hypothetical protein  22.37 
 
 		 395 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0314212 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2560  argininosuccinate lyase  25 
 
 		 904 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1891  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  27.99 
 
 		 389 aa  67.8  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.216866  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1122  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  26.35 
 
 		 388 aa  68.2  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0558  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  25.4 
 
 		 391 aa  67.8  0.0000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2756  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  28.08 
 
 		 393 aa  67.4  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.966815 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0979  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  29.32 
 
 		 476 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0240  hypothetical protein  25.44 
 
 		 410 aa  67.4  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02115  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  27.81 
 
 		 391 aa  67  0.0000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2087  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  29.25 
 
 		 404 aa  67  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0891562 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0097  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  36.36 
 
 		 394 aa  67  0.0000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0240  hypothetical protein  25.35 
 
 		 410 aa  66.6  0.0000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1245  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  27.85 
 
 		 404 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.816462 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0958  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  29.59 
 
 		 404 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3144  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  26.9 
 
 		 408 aa  66.2  0.0000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.520225  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1555  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  25.76 
 
 		 388 aa  66.2  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01931  vibrioferrin biosynthesis protein PvsA  28.21 
 
 		 399 aa  65.9  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2428  protein of unknown function DUF201  25.59 
 
 		 402 aa  65.5  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.281403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2342  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  29.52 
 
 		 404 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0158257 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57320  D-alanine--D-alanine ligase  29.63 
 
 		 319 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2122  argininosuccinate lyase  25.52 
 
 		 894 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1128  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  39 
 
 		 388 aa  64.3  0.000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.55377  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0160  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  39.58 
 
 		 392 aa  64.3  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000791072  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27830  phosphoribosylamine--glycine ligase  21.5 
 
 		 421 aa  63.9  0.000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0850  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  29.03 
 
 		 393 aa  63.9  0.000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0148242  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0302  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  39.58 
 
 		 392 aa  64.3  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000751651  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1620  argininosuccinate lyase  25.35 
 
 		 896 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2238  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  28.57 
 
 		 404 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.335743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2148  hypothetical protein  25.16 
 
 		 414 aa  63.9  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.149546 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0549  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  34 
 
 		 393 aa  64.3  0.000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0292  phosphoribosylglycinamide synthetase, ATP-grasp  23.79 
 
 		 407 aa  63.9  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0170  phosphoribosylglycinamide synthetase ATP-grasp domain-containing protein  23.79 
 
 		 407 aa  63.9  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>