148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6149 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_6149  hypothetical protein  100 
 
 		 441 aa  899    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.669475 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3093  hypothetical protein  40 
 
 		 440 aa  288  1e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0170  phosphoribosylglycinamide synthetase ATP-grasp domain-containing protein  23.9 
 
 		 407 aa  101  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0292  phosphoribosylglycinamide synthetase, ATP-grasp  23.9 
 
 		 407 aa  101  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0573  phosphoribosylglycinamide synthetase  28.67 
 
 		 420 aa  84  0.000000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.23534  normal  0.22349 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2987  phosphoribosylglycinamide synthetase  27.07 
 
 		 410 aa  81.3  0.00000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.0000000000875543  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2209  CarB family protein  29.18 
 
 		 543 aa  80.5  0.00000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.304362  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7725  hypothetical protein  31.12 
 
 		 411 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.10668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37420  biotin carboxylase  28.65 
 
 		 405 aa  77  0.0000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.442231 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1498  biotin carboxylase-like  28.81 
 
 		 428 aa  76.3  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1388  hypothetical protein  24.86 
 
 		 395 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0314212 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2428  protein of unknown function DUF201  24.75 
 
 		 402 aa  75.1  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.281403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4648  protein of unknown function DUF201  30.64 
 
 		 404 aa  74.7  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.896666  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0754  protein of unknown function DUF201  30.28 
 
 		 409 aa  74.3  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0755  protein of unknown function DUF201  26.22 
 
 		 398 aa  73.9  0.000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3759  protein of unknown function DUF201  26.52 
 
 		 425 aa  72  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2020  phosphoribosylglycinamide synthetase  27.88 
 
 		 407 aa  71.6  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2144  phosphoribosylglycinamide synthetase  31.13 
 
 		 416 aa  71.2  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2969  hypothetical protein  28.26 
 
 		 402 aa  69.3  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0194  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain-containing protein ATP-grasp  29.03 
 
 		 419 aa  67.8  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.296569  normal  0.160479 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1971  argininosuccinate lyase  30.53 
 
 		 891 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3192  argininosuccinate lyase  30.7 
 
 		 924 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.655648  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3626  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  27.49 
 
 		 432 aa  66.6  0.0000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1396  argininosuccinate lyase  30.43 
 
 		 926 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4069  phosphoribosylglycinamide synthetase ATP-grasp domain-containing protein  26.91 
 
 		 389 aa  66.6  0.0000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0619  phosphoribosylglycinamide synthetase  26.55 
 
 		 410 aa  66.6  0.0000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.241949  hitchhiker  0.00233057 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1270  protein of unknown function DUF201  22.67 
 
 		 399 aa  66.2  0.000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.964812  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2646  argininosuccinate lyase  30.25 
 
 		 904 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2507  argininosuccinate lyase  30 
 
 		 912 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2560  argininosuccinate lyase  30.25 
 
 		 904 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2737  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  25.79 
 
 		 723 aa  65.1  0.000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2959  phosphoribosylglycinamide synthetase  22.69 
 
 		 405 aa  62.8  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2251  phosphoribosylglycinamide synthetase  24.9 
 
 		 418 aa  62.4  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000511987 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2122  argininosuccinate lyase  31.03 
 
 		 894 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1514  hypothetical protein  31.74 
 
 		 412 aa  62.4  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1929  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  26.22 
 
 		 411 aa  62.4  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2663  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  29.77 
 
 		 413 aa  62  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1620  argininosuccinate lyase  30.77 
 
 		 896 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4500  Cysteine synthase  28.46 
 
 		 756 aa  60.8  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.632569  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1164  protein of unknown function DUF201  24.6 
 
 		 437 aa  60.8  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1553  phosphoribosylglycinamide synthetase, ATP-grasp, putative  23.86 
 
 		 267 aa  60.1  0.00000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1279  hypothetical protein  27.72 
 
 		 411 aa  58.5  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.406455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2669  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  28.57 
 
 		 1069 aa  58.9  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1644  D-alanine--D-alanine ligase domain-containing protein  26.64 
 
 		 347 aa  58.9  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6150  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  25.17 
 
 		 410 aa  58.5  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.639194 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4786  hypothetical protein  26.55 
 
 		 398 aa  57  0.0000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2595  putative carbamoyl-phosphate-synthetase  21.94 
 
 		 398 aa  57  0.0000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.605395  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4068  hypothetical protein  28.22 
 
 		 413 aa  57  0.0000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02890  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  24 
 
 		 1067 aa  56.6  0.0000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3748  protein of unknown function DUF201  26.8 
 
 		 388 aa  55.8  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.277412  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2026  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  24.61 
 
 		 423 aa  56.2  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1401  protein of unknown function DUF201  25.59 
 
 		 409 aa  56.2  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2158  argininosuccinate lyase  25.87 
 
 		 914 aa  55.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3552  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain-containing protein  26.28 
 
 		 373 aa  55.5  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.138111  normal  0.272734 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2002  argininosuccinate lyase  26.74 
 
 		 900 aa  55.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.848902  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0996  phosphoribosylglycinamide synthetase  23.02 
 
 		 541 aa  54.7  0.000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000037072 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0585  D-alanine--D-alanine ligase  40 
 
 		 313 aa  54.3  0.000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.034882  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1432  hypothetical protein  28.34 
 
 		 424 aa  54.3  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.502147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2022  argininosuccinate lyase  26.74 
 
 		 900 aa  53.9  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.10658  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3136  putative siderophore biosynthesis protein  25.97 
 
 		 388 aa  53.9  0.000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3673  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  26.35 
 
 		 407 aa  53.5  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2440  biotin carboxylase-like  26.49 
 
 		 424 aa  53.5  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.459774  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0741  carbamoyl phosphate synthase large subunit  21.74 
 
 		 1040 aa  52.8  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2438  hypothetical protein  28.63 
 
 		 410 aa  52.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.658373 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33390  biotin carboxylase  28.27 
 
 		 428 aa  52.8  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.465269 
 
 
-
 
NC_003296  RS03057  hypothetical protein  27.23 
 
 		 449 aa  52  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.450613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1087  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.18 
 
 		 1062 aa  52.4  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2668  phosphoribosylglycinamide synthetase  27.59 
 
 		 415 aa  52  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1008  D-alanine--D-alanine ligase  28.89 
 
 		 743 aa  52  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1423  protein of unknown function DUF201  25.75 
 
 		 424 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.369206  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1518  protein of unknown function DUF201  25.75 
 
 		 424 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2148  hypothetical protein  27.78 
 
 		 414 aa  51.2  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.149546 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0006  hypothetical protein  28.49 
 
 		 387 aa  51.2  0.00004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3256  putative carbamoyl-phosphate synthase large chain  20.17 
 
 		 420 aa  51.2  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.077916  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22630  biotin carboxylase  25.95 
 
 		 333 aa  50.8  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.405302 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6388  phosphoribosylglycinamide synthetase  28.37 
 
 		 422 aa  50.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.357309  normal  0.160447 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2986  carbamoyl-phosphate synthase large chain  20.18 
 
 		 431 aa  50.4  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.556183  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06063  hypothetical protein  22.62 
 
 		 349 aa  50.4  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0730  hypothetical protein  27.2 
 
 		 436 aa  50.4  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1063  carbamoyl phosphate synthase large subunit  26.17 
 
 		 1110 aa  50.1  0.00008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0010  hypothetical protein  28.65 
 
 		 392 aa  49.3  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  decreased coverage  0.00788782  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2162  hypothetical protein  24.91 
 
 		 414 aa  49.7  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.337945  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2977  D-alanine--D-alanine ligase  26.82 
 
 		 327 aa  49.3  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0635  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.03 
 
 		 1076 aa  48.9  0.0002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0418  hypothetical protein  25.59 
 
 		 411 aa  48.5  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3126  D-alanine--D-alanine ligase  26.26 
 
 		 327 aa  48.9  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5515  phosphoribosylglycinamide synthetase  28.84 
 
 		 422 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.330375  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5879  phosphoribosylglycinamide synthetase  28.84 
 
 		 422 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.521142  normal  0.293972 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1491  hypothetical protein  24.68 
 
 		 409 aa  48.5  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3857  protein of unknown function DUF201  27.56 
 
 		 430 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.214933 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3245  hypothetical protein  19 
 
 		 419 aa  48.5  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.837509  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2639  carbamoyl phosphate synthase large subunit  26.62 
 
 		 1105 aa  48.5  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.239677  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3265  hypothetical protein  23.81 
 
 		 412 aa  47.8  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0791  biotin carboxylase  28.5 
 
 		 411 aa  47.8  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4794  protein of unknown function DUF201  29.19 
 
 		 337 aa  47.8  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1007  hypothetical protein  28.45 
 
 		 427 aa  47.4  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1915  hypothetical protein  25 
 
 		 432 aa  47.4  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.402909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2897  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.84 
 
 		 1067 aa  47  0.0006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2576  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.84 
 
 		 1067 aa  47  0.0006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0420  D-alanine/D-alanine ligase  24.5 
 
 		 299 aa  47  0.0006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000379989  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>