24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1915 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_1457  hypothetical protein  80.25 
 
 
407 aa  700    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.939415  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1475  hypothetical protein  75.06 
 
 
407 aa  662    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.843921 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1915  hypothetical protein  100 
 
 
432 aa  887    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.402909  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1491  hypothetical protein  77.15 
 
 
409 aa  681    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4524  Biotin carboxylase-like protein  25.3 
 
 
403 aa  70.1  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.799309  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1498  biotin carboxylase-like  25.66 
 
 
428 aa  58.5  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2023  hypothetical protein  26.52 
 
 
408 aa  58.9  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0170  phosphoribosylglycinamide synthetase ATP-grasp domain-containing protein  22.87 
 
 
407 aa  56.6  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0292  phosphoribosylglycinamide synthetase, ATP-grasp  22.87 
 
 
407 aa  56.6  0.0000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3673  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  22.12 
 
 
407 aa  54.3  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0875  hypothetical protein  28.44 
 
 
414 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2846  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain- containing protein  23.64 
 
 
404 aa  52.4  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.435021  normal  0.117516 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3759  protein of unknown function DUF201  24.9 
 
 
425 aa  50.8  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7725  hypothetical protein  23.6 
 
 
411 aa  50.4  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.10668  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6150  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  20.25 
 
 
410 aa  49.7  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.639194 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0874  nikkomycin biosynthesis domain protein  21.38 
 
 
417 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6149  hypothetical protein  25 
 
 
441 aa  47.4  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.669475 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14410  carbamoylphosphate synthase large subunit  23.72 
 
 
423 aa  46.6  0.0008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6148  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  23.67 
 
 
408 aa  46.6  0.0009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.631903 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3265  hypothetical protein  24.83 
 
 
412 aa  45.4  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3093  hypothetical protein  28.81 
 
 
440 aa  45.1  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2020  phosphoribosylglycinamide synthetase  26.11 
 
 
407 aa  44.7  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37420  biotin carboxylase  24.59 
 
 
405 aa  44.7  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.442231 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0162  hypothetical protein  24.33 
 
 
414 aa  44.7  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>