66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4524 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_4524  Biotin carboxylase-like protein  100 
 
 
403 aa  840    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.799309  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2846  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain- containing protein  54.95 
 
 
404 aa  484  1e-135  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.435021  normal  0.117516 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7724  putative biotin carboxylase  34.6 
 
 
430 aa  123  5e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.211642  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0791  biotin carboxylase  34.04 
 
 
411 aa  111  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3673  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  32.52 
 
 
407 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0874  nikkomycin biosynthesis domain protein  31.3 
 
 
417 aa  102  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6148  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  29.54 
 
 
408 aa  95.5  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.631903 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6150  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  28.02 
 
 
410 aa  84.3  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.639194 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0202  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  25.47 
 
 
388 aa  80.9  0.00000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.658271  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2023  hypothetical protein  27.35 
 
 
408 aa  77.8  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2607  hypothetical protein  26.99 
 
 
439 aa  76.6  0.0000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.954723 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3467  hypothetical protein  29.1 
 
 
407 aa  76.6  0.0000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0875  hypothetical protein  28.15 
 
 
414 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1491  hypothetical protein  26.91 
 
 
409 aa  72.4  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1915  hypothetical protein  25.3 
 
 
432 aa  70.1  0.00000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.402909  normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0170  phosphoribosylglycinamide synthetase ATP-grasp domain-containing protein  21.43 
 
 
407 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0292  phosphoribosylglycinamide synthetase, ATP-grasp  21.43 
 
 
407 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1457  hypothetical protein  25.7 
 
 
407 aa  65.9  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.939415  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2026  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  28.85 
 
 
423 aa  65.1  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06054  hypothetical protein  26.21 
 
 
329 aa  65.5  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2020  phosphoribosylglycinamide synthetase  24.79 
 
 
407 aa  63.5  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2328  hypothetical protein  25.5 
 
 
385 aa  63.2  0.000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2987  phosphoribosylglycinamide synthetase  24.49 
 
 
410 aa  63.2  0.000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.0000000000875543  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37420  biotin carboxylase  28.25 
 
 
405 aa  62  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.442231 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0877  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain-containing protein ATP-grasp  23.59 
 
 
386 aa  60.1  0.00000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.656066  normal  0.993359 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1475  hypothetical protein  23.9 
 
 
407 aa  60.1  0.00000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.843921 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0194  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain-containing protein ATP-grasp  25.87 
 
 
419 aa  58.2  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.296569  normal  0.160479 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0754  protein of unknown function DUF201  24 
 
 
409 aa  57  0.0000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1642  hypothetical protein  24.28 
 
 
392 aa  56.2  0.000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0996  phosphoribosylglycinamide synthetase  21.82 
 
 
541 aa  55.1  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000037072 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1498  biotin carboxylase-like  24.78 
 
 
428 aa  55.5  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6388  phosphoribosylglycinamide synthetase  24.59 
 
 
422 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.357309  normal  0.160447 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2986  carbamoyl-phosphate synthase large chain  22.98 
 
 
431 aa  54.7  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.556183  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5879  phosphoribosylglycinamide synthetase  25.41 
 
 
422 aa  53.5  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.521142  normal  0.293972 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5515  phosphoribosylglycinamide synthetase  25.41 
 
 
422 aa  53.5  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.330375  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1553  phosphoribosylglycinamide synthetase, ATP-grasp, putative  22.02 
 
 
267 aa  53.5  0.000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0177  hypothetical protein  28.65 
 
 
411 aa  53.1  0.000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4500  Cysteine synthase  25.83 
 
 
756 aa  52.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.632569  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1270  protein of unknown function DUF201  22.35 
 
 
399 aa  52.4  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.964812  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3242  hypothetical protein  21.63 
 
 
432 aa  52  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2668  phosphoribosylglycinamide synthetase  24.38 
 
 
415 aa  51.2  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3256  putative carbamoyl-phosphate synthase large chain  23.73 
 
 
420 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.077916  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0162  hypothetical protein  18.88 
 
 
414 aa  50.8  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2595  putative carbamoyl-phosphate-synthetase  23.65 
 
 
398 aa  50.8  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.605395  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3245  hypothetical protein  23.73 
 
 
419 aa  50.4  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.837509  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2209  CarB family protein  28.43 
 
 
543 aa  49.7  0.00009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.304362  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3759  protein of unknown function DUF201  25.51 
 
 
425 aa  49.3  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0200  hypothetical protein  22.18 
 
 
405 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.214933  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01931  vibrioferrin biosynthesis protein PvsA  23.97 
 
 
399 aa  48.5  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1929  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  23.15 
 
 
411 aa  48.5  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4069  phosphoribosylglycinamide synthetase ATP-grasp domain-containing protein  22.59 
 
 
389 aa  48.1  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1164  protein of unknown function DUF201  24.43 
 
 
437 aa  48.1  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03057  hypothetical protein  22.83 
 
 
449 aa  47.4  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.450613  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0418  hypothetical protein  27.65 
 
 
411 aa  46.6  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1847  D-alanyl-alanine synthetase A  22.99 
 
 
328 aa  46.2  0.0009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00879872  normal  0.0251209 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37283  predicted protein  25.88 
 
 
1033 aa  45.8  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3468  hypothetical protein  21.91 
 
 
425 aa  45.4  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0006  hypothetical protein  20.09 
 
 
387 aa  45.1  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2428  protein of unknown function DUF201  22.82 
 
 
402 aa  45.4  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.281403  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1360  D-alanine/D-alanine ligase  32.93 
 
 
319 aa  44.7  0.003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1388  hypothetical protein  19.88 
 
 
395 aa  44.3  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0314212 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3626  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  23.7 
 
 
432 aa  44.3  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0730  hypothetical protein  20.08 
 
 
436 aa  43.5  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2251  phosphoribosylglycinamide synthetase  25.17 
 
 
418 aa  43.5  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000511987 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1401  protein of unknown function DUF201  19.81 
 
 
409 aa  43.5  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0344  phosphoribosylglycinamide synthetase  24.44 
 
 
424 aa  43.5  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>