74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2846 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2846  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain- containing protein  100 
 
 		 404 aa  841    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.435021  normal  0.117516 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4524  Biotin carboxylase-like protein  54.95 
 
 		 403 aa  484  1e-135  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.799309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7724  putative biotin carboxylase  29.71 
 
 		 430 aa  106  7e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.211642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6150  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  25.8 
 
 		 410 aa  99.8  7e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.639194 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0791  biotin carboxylase  29.64 
 
 		 411 aa  98.2  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2023  hypothetical protein  28.27 
 
 		 408 aa  97.8  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3673  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  30.04 
 
 		 407 aa  95.9  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6148  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  28.17 
 
 		 408 aa  95.5  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.631903 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0874  nikkomycin biosynthesis domain protein  29.34 
 
 		 417 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2020  phosphoribosylglycinamide synthetase  25.77 
 
 		 407 aa  80.5  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2986  carbamoyl-phosphate synthase large chain  26.27 
 
 		 431 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.556183  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0875  hypothetical protein  28.1 
 
 		 414 aa  73.9  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3256  putative carbamoyl-phosphate synthase large chain  25.58 
 
 		 420 aa  73.6  0.000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.077916  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0162  hypothetical protein  23.14 
 
 		 414 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0202  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  23.12 
 
 		 388 aa  68.9  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.658271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0619  phosphoribosylglycinamide synthetase  22.55 
 
 		 410 aa  65.1  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.241949  hitchhiker  0.00233057 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3245  hypothetical protein  25.42 
 
 		 419 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.837509  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1498  biotin carboxylase-like  25.16 
 
 		 428 aa  63.2  0.000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1642  hypothetical protein  22.61 
 
 		 392 aa  63.2  0.000000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2328  hypothetical protein  24.67 
 
 		 385 aa  62.8  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0006  hypothetical protein  23.21 
 
 		 387 aa  61.6  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2595  putative carbamoyl-phosphate-synthetase  25.1 
 
 		 398 aa  61.6  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.605395  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3467  hypothetical protein  25.74 
 
 		 407 aa  60.8  0.00000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2607  hypothetical protein  26.67 
 
 		 439 aa  60.8  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.954723 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0292  phosphoribosylglycinamide synthetase, ATP-grasp  22.02 
 
 		 407 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0170  phosphoribosylglycinamide synthetase ATP-grasp domain-containing protein  22.02 
 
 		 407 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3626  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  24.24 
 
 		 432 aa  59.7  0.00000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0010  hypothetical protein  24.37 
 
 		 392 aa  59.3  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  decreased coverage  0.00788782  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1270  protein of unknown function DUF201  23.74 
 
 		 399 aa  58.5  0.0000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.964812  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06054  hypothetical protein  26.6 
 
 		 329 aa  58.2  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3242  hypothetical protein  24.39 
 
 		 432 aa  58.2  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06063  hypothetical protein  23.92 
 
 		 349 aa  58.2  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1119  biotin carboxylase  23.05 
 
 		 411 aa  55.8  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2209  CarB family protein  24.71 
 
 		 543 aa  55.8  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.304362  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1164  protein of unknown function DUF201  25.61 
 
 		 437 aa  55.5  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3759  protein of unknown function DUF201  24.35 
 
 		 425 aa  53.9  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0194  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain-containing protein ATP-grasp  22.87 
 
 		 419 aa  53.9  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.296569  normal  0.160479 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2428  protein of unknown function DUF201  23.58 
 
 		 402 aa  53.5  0.000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.281403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0877  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain-containing protein ATP-grasp  22.57 
 
 		 386 aa  53.5  0.000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.656066  normal  0.993359 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1588  D-alanyl-alanine synthetase A  24.31 
 
 		 316 aa  52.8  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000341303  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1915  hypothetical protein  23.64 
 
 		 432 aa  52.4  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.402909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0996  phosphoribosylglycinamide synthetase  23.08 
 
 		 541 aa  52  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000037072 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2987  phosphoribosylglycinamide synthetase  22.36 
 
 		 410 aa  51.6  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.0000000000875543  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2026  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  25.98 
 
 		 423 aa  51.6  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3093  hypothetical protein  23.58 
 
 		 440 aa  50.8  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0200  hypothetical protein  23.22 
 
 		 405 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.214933  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1491  hypothetical protein  23.35 
 
 		 409 aa  50.1  0.00007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4069  phosphoribosylglycinamide synthetase ATP-grasp domain-containing protein  21.34 
 
 		 389 aa  48.9  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1388  hypothetical protein  22.11 
 
 		 395 aa  48.9  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0314212 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1268  phosphoribosylglycinamide synthetase  21.99 
 
 		 400 aa  49.7  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.584392  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4406  D-alanine--D-alanine ligase  23.95 
 
 		 319 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.206514  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0754  protein of unknown function DUF201  23.13 
 
 		 409 aa  47  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09340  hypothetical protein  22.51 
 
 		 399 aa  47  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.035454  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4068  hypothetical protein  22.73 
 
 		 413 aa  46.6  0.0009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2663  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  26.18 
 
 		 413 aa  46.2  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1457  hypothetical protein  21.88 
 
 		 407 aa  45.1  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.939415  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1553  phosphoribosylglycinamide synthetase, ATP-grasp, putative  24.07 
 
 		 267 aa  45.1  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1401  protein of unknown function DUF201  21.51 
 
 		 409 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7725  hypothetical protein  22.49 
 
 		 411 aa  45.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.10668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3468  hypothetical protein  23.84 
 
 		 425 aa  44.7  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3265  hypothetical protein  20.97 
 
 		 412 aa  44.3  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57320  D-alanine--D-alanine ligase  22.17 
 
 		 319 aa  44.3  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1360  D-alanine/D-alanine ligase  24.34 
 
 		 319 aa  43.9  0.005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03057  hypothetical protein  21.01 
 
 		 449 aa  43.9  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.450613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2135  phosphoribosylglycinamide synthetase  22.22 
 
 		 412 aa  43.9  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.165665  normal  0.504192 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1475  hypothetical protein  22.27 
 
 		 407 aa  43.5  0.007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.843921 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0573  phosphoribosylglycinamide synthetase  22.38 
 
 		 420 aa  43.5  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.23534  normal  0.22349 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0637  hypothetical protein  23.65 
 
 		 484 aa  43.1  0.008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.110504  normal  0.0645726 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2251  phosphoribosylglycinamide synthetase  21.49 
 
 		 418 aa  43.1  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000511987 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1724  protein of unknown function DUF201  20.17 
 
 		 401 aa  43.1  0.008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33390  biotin carboxylase  22.55 
 
 		 428 aa  43.1  0.008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.465269 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0418  hypothetical protein  19.16 
 
 		 411 aa  43.1  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5088  D-alanine--D-alanine ligase  25.98 
 
 		 329 aa  43.1  0.01  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2199  D-alanine--D-alanine ligase  22.75 
 
 		 305 aa  43.1  0.01  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.171774  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>