51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCAH187_A3256 on replicon NC_011658
Organism: Bacillus cereus AH187



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_3245  hypothetical protein  94.75 
 
 
419 aa  813    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.837509  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3256  putative carbamoyl-phosphate synthase large chain  100 
 
 
420 aa  858    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.077916  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2986  carbamoyl-phosphate synthase large chain  95.69 
 
 
431 aa  825    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.556183  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0755  protein of unknown function DUF201  27.02 
 
 
398 aa  97.4  4e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2020  phosphoribosylglycinamide synthetase  25.4 
 
 
407 aa  96.7  6e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3759  protein of unknown function DUF201  23.28 
 
 
425 aa  92.8  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06063  hypothetical protein  23.41 
 
 
349 aa  88.2  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2428  protein of unknown function DUF201  26.79 
 
 
402 aa  77.8  0.0000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.281403  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2846  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain- containing protein  25.58 
 
 
404 aa  73.6  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.435021  normal  0.117516 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1270  protein of unknown function DUF201  23.91 
 
 
399 aa  61.6  0.00000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.964812  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4069  phosphoribosylglycinamide synthetase ATP-grasp domain-containing protein  23.44 
 
 
389 aa  62  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0170  phosphoribosylglycinamide synthetase ATP-grasp domain-containing protein  26.14 
 
 
407 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0292  phosphoribosylglycinamide synthetase, ATP-grasp  26.14 
 
 
407 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0791  biotin carboxylase  21.67 
 
 
411 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1971  argininosuccinate lyase  25.69 
 
 
891 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2002  argininosuccinate lyase  21.37 
 
 
900 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.848902  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2158  argininosuccinate lyase  21.37 
 
 
914 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2022  argininosuccinate lyase  21.37 
 
 
900 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.10658  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3093  hypothetical protein  23.37 
 
 
440 aa  58.9  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3192  argininosuccinate lyase  24.77 
 
 
924 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.655648  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2122  argininosuccinate lyase  29.79 
 
 
894 aa  57  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2987  phosphoribosylglycinamide synthetase  23.53 
 
 
410 aa  57  0.0000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.0000000000875543  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1620  argininosuccinate lyase  29.79 
 
 
896 aa  57  0.0000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2560  argininosuccinate lyase  29.79 
 
 
904 aa  57  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1396  argininosuccinate lyase  24.09 
 
 
926 aa  57  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0730  hypothetical protein  23.36 
 
 
436 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37283  predicted protein  24.7 
 
 
1033 aa  55.5  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2507  argininosuccinate lyase  29.08 
 
 
912 aa  55.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2646  argininosuccinate lyase  29.08 
 
 
904 aa  55.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4500  Cysteine synthase  23.57 
 
 
756 aa  53.5  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.632569  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2737  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  19.17 
 
 
723 aa  52.8  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3467  hypothetical protein  22.36 
 
 
407 aa  52.4  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4524  Biotin carboxylase-like protein  23.73 
 
 
403 aa  51.6  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.799309  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33390  biotin carboxylase  22.36 
 
 
428 aa  51.6  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.465269 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6149  hypothetical protein  20.17 
 
 
441 aa  51.2  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.669475 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2663  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  19.82 
 
 
413 aa  49.7  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03057  hypothetical protein  22.38 
 
 
449 aa  49.3  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.450613  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1119  biotin carboxylase  21.76 
 
 
411 aa  49.7  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7725  hypothetical protein  21.49 
 
 
411 aa  48.5  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.10668  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0619  phosphoribosylglycinamide synthetase  20.05 
 
 
410 aa  48.9  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.241949  hitchhiker  0.00233057 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2148  hypothetical protein  20.05 
 
 
414 aa  47.8  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.149546 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0177  hypothetical protein  25.59 
 
 
411 aa  47.8  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0010  hypothetical protein  23.92 
 
 
392 aa  47.8  0.0004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  decreased coverage  0.00788782  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3468  hypothetical protein  25.24 
 
 
425 aa  47.4  0.0005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0418  hypothetical protein  20.82 
 
 
411 aa  46.6  0.0009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0201  glutathione synthetase  25.69 
 
 
323 aa  44.7  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.137628  normal  0.558302 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0220  glutathione synthetase  25.69 
 
 
323 aa  44.7  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000248825 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1771  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  28.43 
 
 
740 aa  45.1  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.212253  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0200  hypothetical protein  22.61 
 
 
405 aa  44.3  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.214933  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1642  hypothetical protein  27.94 
 
 
392 aa  43.9  0.006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0345  glutathione synthetase  26.39 
 
 
324 aa  43.5  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.791895 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>