81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_1279 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_1279  hypothetical protein  100 
 
 
411 aa  853    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.406455  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001066  vibrioferrin ligase/carboxylase protein PvsA  45.81 
 
 
403 aa  347  3e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09340  hypothetical protein  43.55 
 
 
399 aa  324  2e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.035454  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3091  PvsA  43.84 
 
 
394 aa  312  7.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.324185  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3136  putative siderophore biosynthesis protein  44.31 
 
 
388 aa  303  3.0000000000000004e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4786  hypothetical protein  39.46 
 
 
398 aa  283  3.0000000000000004e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01931  vibrioferrin biosynthesis protein PvsA  38.33 
 
 
399 aa  276  4e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0721  hypothetical protein  38.77 
 
 
402 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.446517 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8363  putative siderophore biosynthesis protein  34.55 
 
 
401 aa  204  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3748  protein of unknown function DUF201  33.86 
 
 
388 aa  203  4e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.277412  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2969  hypothetical protein  32.43 
 
 
402 aa  194  2e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3192  argininosuccinate lyase  24.25 
 
 
924 aa  87  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.655648  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1620  argininosuccinate lyase  25.57 
 
 
896 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2122  argininosuccinate lyase  25.57 
 
 
894 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2560  argininosuccinate lyase  25.57 
 
 
904 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1396  argininosuccinate lyase  25.57 
 
 
926 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2646  argininosuccinate lyase  25.57 
 
 
904 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1971  argininosuccinate lyase  23.35 
 
 
891 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2507  argininosuccinate lyase  25.57 
 
 
912 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2002  argininosuccinate lyase  23.88 
 
 
900 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.848902  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2158  argininosuccinate lyase  23.88 
 
 
914 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2022  argininosuccinate lyase  23.88 
 
 
900 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.10658  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0754  protein of unknown function DUF201  28.21 
 
 
409 aa  70.9  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4500  Cysteine synthase  24.76 
 
 
756 aa  67  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.632569  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0292  phosphoribosylglycinamide synthetase, ATP-grasp  23.55 
 
 
407 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0170  phosphoribosylglycinamide synthetase ATP-grasp domain-containing protein  23.55 
 
 
407 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3759  protein of unknown function DUF201  29.03 
 
 
425 aa  60.5  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06063  hypothetical protein  26.99 
 
 
349 aa  58.9  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6149  hypothetical protein  27.72 
 
 
441 aa  58.5  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.669475 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7725  hypothetical protein  27.6 
 
 
411 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.10668  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0996  phosphoribosylglycinamide synthetase  26.29 
 
 
541 aa  57.4  0.0000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000037072 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0200  hypothetical protein  28.96 
 
 
405 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.214933  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2582  D-alanine--D-alanine ligase  38.27 
 
 
304 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1644  D-alanine--D-alanine ligase domain-containing protein  29.37 
 
 
347 aa  52.4  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4069  phosphoribosylglycinamide synthetase ATP-grasp domain-containing protein  27.08 
 
 
389 aa  52  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2428  protein of unknown function DUF201  25.69 
 
 
402 aa  52  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.281403  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2741  D-alanine--D-alanine ligase  38.27 
 
 
304 aa  52  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.199895  hitchhiker  0.00000666317 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0203  D-alanyl-alanine synthetase A  24.69 
 
 
364 aa  51.2  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2524  D-alanine--D-alanine ligase  37.04 
 
 
311 aa  50.8  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0109792  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33390  biotin carboxylase  24.54 
 
 
428 aa  49.3  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.465269 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0275  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  26.62 
 
 
1074 aa  48.9  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2627  D-alanine--D-alanine ligase  34.57 
 
 
304 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000105454 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0875  hypothetical protein  23.72 
 
 
420 aa  47.8  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.728931 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0730  hypothetical protein  24.09 
 
 
436 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3093  hypothetical protein  23.75 
 
 
440 aa  47.8  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3626  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  28.1 
 
 
432 aa  47.4  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1929  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  25.51 
 
 
411 aa  47.8  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1308  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  27.66 
 
 
1082 aa  47.4  0.0005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0662  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  22.88 
 
 
1072 aa  47.4  0.0005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2610  D-alanine--D-alanine ligase  33.33 
 
 
304 aa  47  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.5132  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2435  D-alanine--D-alanine ligase  33.33 
 
 
304 aa  47  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.470821  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1164  protein of unknown function DUF201  26.13 
 
 
437 aa  47  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4068  hypothetical protein  22.34 
 
 
413 aa  47  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2666  D-alanine--D-alanine ligase  33.33 
 
 
304 aa  46.6  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.555621  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2628  D-alanine--D-alanine ligase  33.33 
 
 
304 aa  46.6  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.292335  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2356  D-alanine--D-alanine ligase  33.33 
 
 
304 aa  46.6  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3265  hypothetical protein  22.82 
 
 
412 aa  46.6  0.0008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2390  D-alanine--D-alanine ligase  33.33 
 
 
304 aa  46.6  0.0009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.593473  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1262  carbamoyl phosphate synthase large subunit  25.99 
 
 
1057 aa  46.6  0.0009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1287  carbamoyl phosphate synthase large subunit  25.99 
 
 
1057 aa  46.6  0.0009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.867856  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6153  protein of unknown function DUF201  25.23 
 
 
397 aa  45.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.496627  normal  0.0716856 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6148  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  25.66 
 
 
408 aa  45.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.631903 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0769  carbamoyl phosphate synthase large subunit  26.76 
 
 
1057 aa  45.1  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5090  hypothetical protein  23.17 
 
 
453 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0260  D-alanyl-alanine synthetase A  23.87 
 
 
361 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.649407  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0559  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.56 
 
 
1059 aa  45.1  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5770  hypothetical protein  23.17 
 
 
453 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0282385 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0791  biotin carboxylase  34.12 
 
 
411 aa  45.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0232  D-alanyl-alanine synthetase A  23.46 
 
 
362 aa  44.7  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5065  D-alanyl-alanine synthetase A  23.87 
 
 
361 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.250957  normal  0.846892 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0899  hypothetical protein  23.43 
 
 
406 aa  44.3  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0718  hypothetical protein  23.43 
 
 
406 aa  44.3  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.555879  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0732  hypothetical protein  23.43 
 
 
406 aa  44.3  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0279  D-alanyl-alanine synthetase A  23.55 
 
 
361 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0265  D-alanyl-alanine synthetase A  23.55 
 
 
361 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1012  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  25 
 
 
1079 aa  43.5  0.006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2020  phosphoribosylglycinamide synthetase  25.7 
 
 
407 aa  43.5  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4648  protein of unknown function DUF201  21.88 
 
 
404 aa  43.5  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.896666  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0257  D-alanyl-alanine synthetase A  23.55 
 
 
361 aa  43.5  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0219  D-alanyl-alanine synthetase A  23.55 
 
 
361 aa  43.5  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0217  D-alanyl-alanine synthetase A  23.55 
 
 
361 aa  43.5  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>