111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3748 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_3748  protein of unknown function DUF201  100 
 
 
388 aa  774    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.277412  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2969  hypothetical protein  52.22 
 
 
402 aa  338  7e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8363  putative siderophore biosynthesis protein  52.48 
 
 
401 aa  336  2.9999999999999997e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4786  hypothetical protein  43.75 
 
 
398 aa  281  1e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0721  hypothetical protein  42.14 
 
 
402 aa  263  4.999999999999999e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.446517 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01931  vibrioferrin biosynthesis protein PvsA  40.61 
 
 
399 aa  239  6.999999999999999e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3091  PvsA  40.2 
 
 
394 aa  228  2e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.324185  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3136  putative siderophore biosynthesis protein  38.38 
 
 
388 aa  225  9e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09340  hypothetical protein  41.21 
 
 
399 aa  221  1.9999999999999999e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.035454  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001066  vibrioferrin ligase/carboxylase protein PvsA  34.25 
 
 
403 aa  211  1e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1279  hypothetical protein  32.92 
 
 
411 aa  207  2e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.406455  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3192  argininosuccinate lyase  28.82 
 
 
924 aa  88.2  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.655648  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1396  argininosuccinate lyase  28.65 
 
 
926 aa  87.4  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1971  argininosuccinate lyase  27.71 
 
 
891 aa  86.7  7e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2560  argininosuccinate lyase  28.32 
 
 
904 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2646  argininosuccinate lyase  28.32 
 
 
904 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2507  argininosuccinate lyase  28.16 
 
 
912 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1620  argininosuccinate lyase  30.23 
 
 
896 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2122  argininosuccinate lyase  30.23 
 
 
894 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2158  argininosuccinate lyase  27.83 
 
 
914 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2002  argininosuccinate lyase  27.83 
 
 
900 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.848902  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2022  argininosuccinate lyase  27.83 
 
 
900 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.10658  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4500  Cysteine synthase  27.36 
 
 
756 aa  74.3  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.632569  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0730  hypothetical protein  26.75 
 
 
436 aa  73.2  0.000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2251  phosphoribosylglycinamide synthetase  26.83 
 
 
418 aa  73.2  0.000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000511987 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0754  protein of unknown function DUF201  24.75 
 
 
409 aa  69.3  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2428  protein of unknown function DUF201  24.38 
 
 
402 aa  68.6  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.281403  normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0170  phosphoribosylglycinamide synthetase ATP-grasp domain-containing protein  24.39 
 
 
407 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0292  phosphoribosylglycinamide synthetase, ATP-grasp  24.39 
 
 
407 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0899  hypothetical protein  27.08 
 
 
406 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0718  hypothetical protein  27.08 
 
 
406 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.555879  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0732  hypothetical protein  27.08 
 
 
406 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2148  hypothetical protein  30.08 
 
 
414 aa  62  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.149546 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1423  protein of unknown function DUF201  32.86 
 
 
424 aa  62  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.369206  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1518  protein of unknown function DUF201  32.86 
 
 
424 aa  62  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2440  biotin carboxylase-like  31.92 
 
 
424 aa  61.6  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.459774  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0755  protein of unknown function DUF201  26.18 
 
 
398 aa  60.5  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2987  phosphoribosylglycinamide synthetase  25.37 
 
 
410 aa  58.5  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.0000000000875543  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1164  protein of unknown function DUF201  25.62 
 
 
437 aa  58.2  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0912  biotin carboxylase-like protein  25.71 
 
 
410 aa  57  0.0000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.527326 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0573  phosphoribosylglycinamide synthetase  28.29 
 
 
420 aa  56.6  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.23534  normal  0.22349 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6149  hypothetical protein  26.8 
 
 
441 aa  56.2  0.0000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.669475 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0200  hypothetical protein  25.42 
 
 
405 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.214933  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2020  phosphoribosylglycinamide synthetase  27.24 
 
 
407 aa  55.8  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33390  biotin carboxylase  27.14 
 
 
428 aa  55.8  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.465269 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7725  hypothetical protein  27.64 
 
 
411 aa  54.7  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.10668  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2663  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  25.24 
 
 
413 aa  53.5  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3093  hypothetical protein  26.64 
 
 
440 aa  53.5  0.000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1207  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  24.71 
 
 
1059 aa  53.1  0.000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5518  phosphoribosylglycinamide synthetase  25.7 
 
 
403 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.398662  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5882  phosphoribosylglycinamide synthetase  25.7 
 
 
403 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.47867 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3759  protein of unknown function DUF201  27.42 
 
 
425 aa  52.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1270  protein of unknown function DUF201  27.62 
 
 
399 aa  52.8  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.964812  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0791  biotin carboxylase  26.27 
 
 
411 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2737  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  23.15 
 
 
723 aa  52  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4069  phosphoribosylglycinamide synthetase ATP-grasp domain-containing protein  25.7 
 
 
389 aa  52  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2144  phosphoribosylglycinamide synthetase  27.71 
 
 
416 aa  52  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2209  CarB family protein  23.47 
 
 
543 aa  51.2  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.304362  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6391  phosphoribosylglycinamide synthetase  25.61 
 
 
403 aa  50.8  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.782672  normal  0.167257 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6153  protein of unknown function DUF201  25.08 
 
 
397 aa  50.4  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.496627  normal  0.0716856 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6229  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP- binding  28.35 
 
 
643 aa  48.9  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2959  phosphoribosylglycinamide synthetase  28.37 
 
 
405 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1432  hypothetical protein  28.46 
 
 
424 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.502147  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1401  protein of unknown function DUF201  24.79 
 
 
409 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0668  ATP-grasp protein-like protein  28.12 
 
 
393 aa  48.9  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0449  putative glycolate oxidase  23.97 
 
 
404 aa  47.4  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0194  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain-containing protein ATP-grasp  28.03 
 
 
419 aa  47.8  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.296569  normal  0.160479 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1644  D-alanine--D-alanine ligase domain-containing protein  27.21 
 
 
347 aa  47.4  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44930  predicted protein  29.53 
 
 
575 aa  47.8  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.541672  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3931  carbamoyl phosphate synthase large subunit  24.1 
 
 
1072 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1879  carbamoyl phosphate synthase large subunit  25.57 
 
 
1110 aa  47  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.99136 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3064  hypothetical protein  24.6 
 
 
441 aa  47  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000514586 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1684  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  22.83 
 
 
1071 aa  46.6  0.0007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000705985  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1302  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  22.71 
 
 
1082 aa  46.6  0.0007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3628  carbamoyl phosphate synthase large subunit  24.1 
 
 
1072 aa  46.6  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1042  carbamoyl phosphate synthase large subunit  21.17 
 
 
1060 aa  45.8  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3265  hypothetical protein  26.42 
 
 
412 aa  45.8  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2438  hypothetical protein  28.61 
 
 
410 aa  45.8  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.658373 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2576  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.16 
 
 
1067 aa  46.2  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2304  urea carboxylase  26.02 
 
 
1209 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.198231  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2668  phosphoribosylglycinamide synthetase  25.11 
 
 
415 aa  45.8  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3737  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.59 
 
 
1072 aa  45.1  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3645  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.59 
 
 
1072 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0418  hypothetical protein  23.39 
 
 
411 aa  45.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4025  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.59 
 
 
1072 aa  45.1  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2781  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  23.78 
 
 
667 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0940378  normal  0.476201 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2897  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.16 
 
 
1067 aa  45.4  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2713  biotin carboxylase  25.25 
 
 
260 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2365  hypothetical protein  25.25 
 
 
260 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4068  hypothetical protein  23.9 
 
 
413 aa  45.4  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3935  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.59 
 
 
1072 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.144651  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3984  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.59 
 
 
1072 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3900  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.59 
 
 
1072 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000425405 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1929  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  25.32 
 
 
411 aa  45.1  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2882  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  30.51 
 
 
493 aa  44.7  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6042  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  25.37 
 
 
451 aa  44.3  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.650251  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1775  D-alanine--D-alanine ligase domain protein  34.62 
 
 
331 aa  44.3  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.286204  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0021  hypothetical protein  28.95 
 
 
382 aa  44.3  0.004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2535  carbamoyl phosphate synthase large subunit  24.24 
 
 
1072 aa  44.3  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.900385  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5425  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  25.37 
 
 
451 aa  44.3  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.943443 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>