168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_0912 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_0912  biotin carboxylase-like protein  100 
 
 		 410 aa  842    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.527326 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2135  phosphoribosylglycinamide synthetase  27.89 
 
 		 412 aa  118  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.165665  normal  0.504192 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0875  hypothetical protein  25.37 
 
 		 420 aa  118  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.728931 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0416  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.28 
 
 		 726 aa  99.8  7e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0147603  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4142  hypothetical protein  24.75 
 
 		 414 aa  97.1  5e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.16964  normal  0.023954 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0072  hypothetical protein  24.75 
 
 		 414 aa  96.7  7e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4090  hypothetical protein  24.5 
 
 		 414 aa  94.7  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.572464  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2162  hypothetical protein  25.18 
 
 		 414 aa  94.4  3e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.337945  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37283  predicted protein  23.58 
 
 		 1033 aa  93.6  6e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1007  hypothetical protein  24.26 
 
 		 427 aa  90.1  7e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5515  phosphoribosylglycinamide synthetase  23.21 
 
 		 422 aa  87.4  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.330375  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5879  phosphoribosylglycinamide synthetase  23.21 
 
 		 422 aa  87.4  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.521142  normal  0.293972 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6388  phosphoribosylglycinamide synthetase  22.96 
 
 		 422 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.357309  normal  0.160447 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0996  phosphoribosylglycinamide synthetase  21.77 
 
 		 541 aa  85.1  0.000000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000037072 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0240  hypothetical protein  23.74 
 
 		 410 aa  84.7  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0344  phosphoribosylglycinamide synthetase  24.7 
 
 		 424 aa  84.7  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0240  hypothetical protein  22.8 
 
 		 410 aa  84  0.000000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7725  hypothetical protein  25.51 
 
 		 411 aa  79.7  0.00000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.10668  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2432  hypothetical protein  23.13 
 
 		 430 aa  77.4  0.0000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44930  predicted protein  25.51 
 
 		 575 aa  74.3  0.000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.541672  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0730  hypothetical protein  22.66 
 
 		 436 aa  73.6  0.000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2002  argininosuccinate lyase  25.5 
 
 		 900 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.848902  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2158  argininosuccinate lyase  25.5 
 
 		 914 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2022  argininosuccinate lyase  25.5 
 
 		 900 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.10658  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0170  phosphoribosylglycinamide synthetase ATP-grasp domain-containing protein  24 
 
 		 407 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0292  phosphoribosylglycinamide synthetase, ATP-grasp  24 
 
 		 407 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1929  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  25.39 
 
 		 411 aa  70.1  0.00000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3265  hypothetical protein  25.31 
 
 		 412 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2737  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  23.96 
 
 		 723 aa  67.4  0.0000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4090  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  26.1 
 
 		 660 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.734303  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3851  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  29.57 
 
 		 704 aa  65.9  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.551732  normal  0.392028 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3626  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  25.52 
 
 		 432 aa  65.5  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09340  hypothetical protein  25.94 
 
 		 399 aa  63.5  0.000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.035454  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1270  protein of unknown function DUF201  27.13 
 
 		 399 aa  63.5  0.000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.964812  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3192  argininosuccinate lyase  29.53 
 
 		 924 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.655648  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3091  PvsA  23.8 
 
 		 394 aa  63.2  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.324185  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1620  argininosuccinate lyase  31.46 
 
 		 896 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2122  argininosuccinate lyase  31.46 
 
 		 894 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2560  argininosuccinate lyase  31.46 
 
 		 904 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0194  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain-containing protein ATP-grasp  24.26 
 
 		 419 aa  62.8  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.296569  normal  0.160479 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1396  argininosuccinate lyase  31.46 
 
 		 926 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0200  hypothetical protein  24.36 
 
 		 405 aa  62  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.214933  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2646  argininosuccinate lyase  31.46 
 
 		 904 aa  62  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2507  argininosuccinate lyase  31.46 
 
 		 912 aa  62  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8363  putative siderophore biosynthesis protein  25.78 
 
 		 401 aa  61.2  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6412  3-methylcrotonoyl-CoA carboxylase, alpha subunit  25.86 
 
 		 656 aa  61.2  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.792756  normal  0.0296411 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1401  protein of unknown function DUF201  29.41 
 
 		 409 aa  61.2  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01931  vibrioferrin biosynthesis protein PvsA  24.13 
 
 		 399 aa  60.1  0.00000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37420  biotin carboxylase  22.47 
 
 		 405 aa  59.3  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.442231 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1971  argininosuccinate lyase  26.51 
 
 		 891 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2153  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP- binding protein  27.66 
 
 		 643 aa  58.2  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6229  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP- binding  25.31 
 
 		 643 aa  57.8  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6042  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  27.13 
 
 		 451 aa  57.4  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.650251  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2148  hypothetical protein  30.94 
 
 		 414 aa  57  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.149546 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5425  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  27.13 
 
 		 451 aa  57  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.943443 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1473  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP- binding protein  26.38 
 
 		 666 aa  56.6  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3748  protein of unknown function DUF201  25.71 
 
 		 388 aa  56.6  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.277412  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0754  protein of unknown function DUF201  24.27 
 
 		 409 aa  56.6  0.0000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5090  hypothetical protein  25.44 
 
 		 453 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3891  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  25.93 
 
 		 525 aa  55.8  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5770  hypothetical protein  25.44 
 
 		 453 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0282385 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3635  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  25.22 
 
 		 662 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.165726  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3136  putative siderophore biosynthesis protein  25.68 
 
 		 388 aa  55.8  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3630  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding protein  25.11 
 
 		 662 aa  55.8  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3703  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  25.11 
 
 		 662 aa  55.8  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2553  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  26.53 
 
 		 660 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.503906 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2438  hypothetical protein  25.91 
 
 		 410 aa  55.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.658373 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2564  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  25.41 
 
 		 447 aa  55.1  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4786  hypothetical protein  22.91 
 
 		 398 aa  54.7  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3759  protein of unknown function DUF201  24.4 
 
 		 425 aa  54.7  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2987  phosphoribosylglycinamide synthetase  23.32 
 
 		 410 aa  54.7  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.0000000000875543  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2020  phosphoribosylglycinamide synthetase  26.61 
 
 		 407 aa  54.3  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2440  biotin carboxylase-like  24.03 
 
 		 424 aa  53.9  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.459774  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2274  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  26.38 
 
 		 459 aa  53.9  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.41756  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6150  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  24.6 
 
 		 410 aa  53.9  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.639194 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0196  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  25.11 
 
 		 660 aa  53.5  0.000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.469913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0029  protein of unknown function DUF201  23.21 
 
 		 386 aa  53.5  0.000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2969  hypothetical protein  24 
 
 		 402 aa  53.1  0.000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4500  Cysteine synthase  24.91 
 
 		 756 aa  52.4  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.632569  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2251  phosphoribosylglycinamide synthetase  28.83 
 
 		 418 aa  53.1  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000511987 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03803  biotin carboxylase  25.42 
 
 		 675 aa  52.4  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0906  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  26.64 
 
 		 452 aa  52  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0899  hypothetical protein  24.91 
 
 		 406 aa  52.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2426  pyruvate carboxylase subunit A  24.27 
 
 		 498 aa  51.6  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1716  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  24.91 
 
 		 447 aa  52  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.305928  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0718  hypothetical protein  24.91 
 
 		 406 aa  52.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.555879  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0732  hypothetical protein  24.91 
 
 		 406 aa  52.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0902  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  26.64 
 
 		 452 aa  52  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1514  hypothetical protein  21.9 
 
 		 412 aa  51.6  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30510  acetyl/propionyl-CoA carboxylase, alpha subunit  24.46 
 
 		 665 aa  50.8  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.434229 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1604  carbamoyl-phosphate synthetase large chain  24.89 
 
 		 668 aa  50.8  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0456964  normal  0.316567 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1518  protein of unknown function DUF201  23.77 
 
 		 424 aa  50.4  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1423  protein of unknown function DUF201  23.69 
 
 		 424 aa  50.4  0.00006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.369206  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0138  pyruvate carboxylase subunit A  23.53 
 
 		 500 aa  50.4  0.00006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.732252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_985  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  25.91 
 
 		 1079 aa  50.4  0.00006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3064  hypothetical protein  23.81 
 
 		 441 aa  50.4  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000514586 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0791  biotin carboxylase  22.42 
 
 		 411 aa  50.1  0.00007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0755  protein of unknown function DUF201  21.79 
 
 		 398 aa  50.1  0.00007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1202  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  25.91 
 
 		 1089 aa  50.1  0.00008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2602  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  30.93 
 
 		 447 aa  49.7  0.00009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000536628  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>