261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2135 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_2135  phosphoribosylglycinamide synthetase  100 
 
 
412 aa  829    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.165665  normal  0.504192 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0996  phosphoribosylglycinamide synthetase  25.87 
 
 
541 aa  160  3e-38  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000037072 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0416  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.08 
 
 
726 aa  160  3e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0147603  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0344  phosphoribosylglycinamide synthetase  29.46 
 
 
424 aa  153  7e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2162  hypothetical protein  28.47 
 
 
414 aa  151  2e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.337945  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1007  hypothetical protein  30.98 
 
 
427 aa  149  1.0000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37283  predicted protein  27.12 
 
 
1033 aa  147  3e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4090  hypothetical protein  27.8 
 
 
414 aa  142  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.572464  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4142  hypothetical protein  27.8 
 
 
414 aa  141  1.9999999999999998e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.16964  normal  0.023954 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0072  hypothetical protein  27.8 
 
 
414 aa  141  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6388  phosphoribosylglycinamide synthetase  31.35 
 
 
422 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.357309  normal  0.160447 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5515  phosphoribosylglycinamide synthetase  30.81 
 
 
422 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.330375  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5879  phosphoribosylglycinamide synthetase  30.81 
 
 
422 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.521142  normal  0.293972 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0875  hypothetical protein  28.04 
 
 
420 aa  123  6e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.728931 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0912  biotin carboxylase-like protein  27.89 
 
 
410 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.527326 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2432  hypothetical protein  25.36 
 
 
430 aa  112  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0240  hypothetical protein  27.01 
 
 
410 aa  112  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0240  hypothetical protein  26.76 
 
 
410 aa  110  6e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44930  predicted protein  25.6 
 
 
575 aa  84.3  0.000000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.541672  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0170  phosphoribosylglycinamide synthetase ATP-grasp domain-containing protein  30.57 
 
 
407 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0292  phosphoribosylglycinamide synthetase, ATP-grasp  30.57 
 
 
407 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2020  phosphoribosylglycinamide synthetase  27.3 
 
 
407 aa  80.9  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7725  hypothetical protein  24.92 
 
 
411 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.10668  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3626  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  29.23 
 
 
432 aa  79.3  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4648  protein of unknown function DUF201  32.38 
 
 
404 aa  75.1  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.896666  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1929  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  26.25 
 
 
411 aa  73.6  0.000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2987  phosphoribosylglycinamide synthetase  30.67 
 
 
410 aa  72  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.0000000000875543  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2428  protein of unknown function DUF201  25.09 
 
 
402 aa  72  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.281403  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3265  hypothetical protein  29.15 
 
 
412 aa  70.5  0.00000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3192  argininosuccinate lyase  26.07 
 
 
924 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.655648  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2144  phosphoribosylglycinamide synthetase  28.44 
 
 
416 aa  69.3  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3660  hypothetical protein  31.62 
 
 
411 aa  69.3  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.853995  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2668  phosphoribosylglycinamide synthetase  28.07 
 
 
415 aa  69.3  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1396  argininosuccinate lyase  25.9 
 
 
926 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0194  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain-containing protein ATP-grasp  29.3 
 
 
419 aa  68.2  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.296569  normal  0.160479 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2560  argininosuccinate lyase  25.57 
 
 
904 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2646  argininosuccinate lyase  25.57 
 
 
904 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3759  protein of unknown function DUF201  27.38 
 
 
425 aa  65.9  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2507  argininosuccinate lyase  25.96 
 
 
912 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2022  argininosuccinate lyase  27.09 
 
 
900 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.10658  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1532  phosphoribosylamine/glycine ligase  28.19 
 
 
423 aa  64.3  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.612843  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2158  argininosuccinate lyase  27.09 
 
 
914 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2122  argininosuccinate lyase  26.48 
 
 
894 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2002  argininosuccinate lyase  27.09 
 
 
900 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.848902  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1620  argininosuccinate lyase  26.3 
 
 
896 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0924  phosphoribosylamine--glycine ligase  26.56 
 
 
421 aa  63.9  0.000000005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0449  putative glycolate oxidase  22.5 
 
 
404 aa  62.8  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0418  hypothetical protein  27.85 
 
 
411 aa  62.8  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8363  putative siderophore biosynthesis protein  27.47 
 
 
401 aa  62.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4774  phosphoribosylamine/glycine ligase  32.79 
 
 
421 aa  62.8  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1401  protein of unknown function DUF201  27.5 
 
 
409 aa  62.4  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2737  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  21.2 
 
 
723 aa  61.6  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6150  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  26.26 
 
 
410 aa  61.6  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.639194 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1270  protein of unknown function DUF201  23.68 
 
 
399 aa  62  0.00000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.964812  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1971  argininosuccinate lyase  25.57 
 
 
891 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0459  phosphoribosylamine--glycine ligase  28.36 
 
 
429 aa  60.8  0.00000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0899  hypothetical protein  25.77 
 
 
406 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0718  hypothetical protein  25.77 
 
 
406 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.555879  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0732  hypothetical protein  25.77 
 
 
406 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5090  hypothetical protein  25.74 
 
 
453 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5770  hypothetical protein  25.74 
 
 
453 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0282385 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4975  phosphoribosylamine--glycine ligase  23.77 
 
 
423 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2413  phosphoribosylamine/glycine ligase  30.39 
 
 
436 aa  58.9  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.545734  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0274  phosphoribosylamine--glycine ligase  22.98 
 
 
423 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0280  phosphoribosylamine--glycine ligase  24.06 
 
 
423 aa  58.9  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3149  phosphoribosylamine--glycine ligase  30.05 
 
 
433 aa  58.9  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.868678  normal  0.802626 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0573  phosphoribosylglycinamide synthetase  25.86 
 
 
420 aa  58.5  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.23534  normal  0.22349 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1164  protein of unknown function DUF201  26.03 
 
 
437 aa  58.2  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2959  phosphoribosylglycinamide synthetase  24.79 
 
 
405 aa  58.5  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2209  CarB family protein  24.6 
 
 
543 aa  58.2  0.0000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.304362  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2180  phosphoribosylamine--glycine ligase  27.56 
 
 
419 aa  57.8  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.900628  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0328  phosphoribosylamine--glycine ligase  23.69 
 
 
423 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1514  hypothetical protein  24.68 
 
 
412 aa  57.8  0.0000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6153  protein of unknown function DUF201  27.08 
 
 
397 aa  57.8  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.496627  normal  0.0716856 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3134  phosphoribosylamine/glycine ligase  32.04 
 
 
428 aa  57.4  0.0000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.808887  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0345  phosphoribosylamine--glycine ligase  23.46 
 
 
423 aa  57  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0372  phosphoribosylamine--glycine ligase  23.15 
 
 
423 aa  57  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09340  hypothetical protein  23.89 
 
 
399 aa  56.6  0.0000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.035454  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0755  protein of unknown function DUF201  23.14 
 
 
398 aa  56.2  0.0000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0730  hypothetical protein  27.19 
 
 
436 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0264  phosphoribosylamine--glycine ligase  26.09 
 
 
430 aa  56.2  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.46971  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4786  hypothetical protein  26 
 
 
398 aa  55.8  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6903  phosphoribosylamine/glycine ligase  29.58 
 
 
419 aa  55.8  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2663  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  28.22 
 
 
413 aa  55.1  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0331  phosphoribosylamine--glycine ligase  23.1 
 
 
423 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0271  phosphoribosylamine--glycine ligase  22.67 
 
 
423 aa  55.5  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4069  phosphoribosylglycinamide synthetase ATP-grasp domain-containing protein  26.88 
 
 
389 aa  55.5  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0286  phosphoribosylamine--glycine ligase  24.35 
 
 
423 aa  54.7  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0880  phosphoribosylamine--glycine ligase  25 
 
 
422 aa  54.7  0.000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0299  phosphoribosylamine--glycine ligase  24.35 
 
 
423 aa  54.7  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13941  phosphoribosylamine--glycine ligase  28.57 
 
 
446 aa  54.7  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.144546  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33390  biotin carboxylase  27.88 
 
 
428 aa  54.7  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.465269 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0278  phosphoribosylamine--glycine ligase  23.36 
 
 
423 aa  54.3  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0911  phosphoribosylamine--glycine ligase  28.57 
 
 
434 aa  54.3  0.000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4068  hypothetical protein  26.37 
 
 
413 aa  54.3  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0991  phosphoribosylamine--glycine ligase  30.24 
 
 
425 aa  54.3  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0700  phosphoribosylamine--glycine ligase  27.42 
 
 
414 aa  54.3  0.000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17671  phosphoribosylamine--glycine ligase  28.03 
 
 
434 aa  54.3  0.000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27830  phosphoribosylamine--glycine ligase  24.28 
 
 
421 aa  54.3  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23300  phosphoribosylamine--glycine ligase  30 
 
 
433 aa  53.9  0.000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>