More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4648 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4648  protein of unknown function DUF201  100 
 
 		 404 aa  785    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.896666  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3626  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  42.68 
 
 		 432 aa  252  8.000000000000001e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2144  phosphoribosylglycinamide synthetase  39.03 
 
 		 416 aa  226  8e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2668  phosphoribosylglycinamide synthetase  36.82 
 
 		 415 aa  216  7e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2987  phosphoribosylglycinamide synthetase  32.46 
 
 		 410 aa  139  1e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.0000000000875543  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4500  Cysteine synthase  37.86 
 
 		 756 aa  132  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.632569  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7725  hypothetical protein  33.43 
 
 		 411 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.10668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1270  protein of unknown function DUF201  30.71 
 
 		 399 aa  124  2e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.964812  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0573  phosphoribosylglycinamide synthetase  32.29 
 
 		 420 aa  123  6e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.23534  normal  0.22349 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0170  phosphoribosylglycinamide synthetase ATP-grasp domain-containing protein  27.6 
 
 		 407 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0292  phosphoribosylglycinamide synthetase, ATP-grasp  27.6 
 
 		 407 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1164  protein of unknown function DUF201  29.03 
 
 		 437 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0194  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain-containing protein ATP-grasp  33.44 
 
 		 419 aa  110  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.296569  normal  0.160479 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2737  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  25.25 
 
 		 723 aa  111  3e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2002  argininosuccinate lyase  32.46 
 
 		 900 aa  110  6e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.848902  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2158  argininosuccinate lyase  32.46 
 
 		 914 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33390  biotin carboxylase  33.44 
 
 		 428 aa  109  7.000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.465269 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2022  argininosuccinate lyase  32.46 
 
 		 900 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.10658  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5090  hypothetical protein  27.9 
 
 		 453 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5770  hypothetical protein  27.9 
 
 		 453 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0282385 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1929  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  27.73 
 
 		 411 aa  107  3e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1401  protein of unknown function DUF201  25.96 
 
 		 409 aa  106  9e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2438  hypothetical protein  35.82 
 
 		 410 aa  106  9e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.658373 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3265  hypothetical protein  29.6 
 
 		 412 aa  104  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2663  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  29.08 
 
 		 413 aa  105  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2020  phosphoribosylglycinamide synthetase  31.75 
 
 		 407 aa  101  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1514  hypothetical protein  27.27 
 
 		 412 aa  101  3e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2428  protein of unknown function DUF201  28.19 
 
 		 402 aa  100  4e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.281403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3660  hypothetical protein  31.38 
 
 		 411 aa  96.7  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.853995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4068  hypothetical protein  28.29 
 
 		 413 aa  95.9  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3192  argininosuccinate lyase  31.82 
 
 		 924 aa  94.4  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.655648  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2507  argininosuccinate lyase  31.95 
 
 		 912 aa  94.7  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2646  argininosuccinate lyase  31.55 
 
 		 904 aa  93.6  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1396  argininosuccinate lyase  31.63 
 
 		 926 aa  93.6  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0200  hypothetical protein  29.66 
 
 		 405 aa  93.6  6e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.214933  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2251  phosphoribosylglycinamide synthetase  29.56 
 
 		 418 aa  93.2  7e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000511987 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2440  biotin carboxylase-like  30.3 
 
 		 424 aa  92.8  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.459774  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0754  protein of unknown function DUF201  27.62 
 
 		 409 aa  92.4  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1971  argininosuccinate lyase  30.64 
 
 		 891 aa  91.7  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2560  argininosuccinate lyase  31.25 
 
 		 904 aa  92  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1432  hypothetical protein  30.51 
 
 		 424 aa  90.5  4e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.502147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2122  argininosuccinate lyase  32.7 
 
 		 894 aa  90.5  5e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1119  biotin carboxylase  28.4 
 
 		 411 aa  89.7  8e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1620  argininosuccinate lyase  32.49 
 
 		 896 aa  89.7  9e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1518  protein of unknown function DUF201  30.82 
 
 		 424 aa  89.7  9e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1423  protein of unknown function DUF201  31.12 
 
 		 424 aa  89.4  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.369206  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1388  hypothetical protein  25.09 
 
 		 395 aa  87  6e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0314212 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3759  protein of unknown function DUF201  35.56 
 
 		 425 aa  86.3  9e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2148  hypothetical protein  27.22 
 
 		 414 aa  86.3  9e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.149546 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6153  protein of unknown function DUF201  29.85 
 
 		 397 aa  85.1  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.496627  normal  0.0716856 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6302  hypothetical protein  32.65 
 
 		 401 aa  84  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0344575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0619  phosphoribosylglycinamide synthetase  27.84 
 
 		 410 aa  82  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.241949  hitchhiker  0.00233057 
 
 
-
 
NC_003296  RS03057  hypothetical protein  30.85 
 
 		 449 aa  82.8  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.450613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0449  putative glycolate oxidase  26.24 
 
 		 404 aa  82  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1724  protein of unknown function DUF201  29.08 
 
 		 401 aa  80.1  0.00000000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2135  phosphoribosylglycinamide synthetase  32.38 
 
 		 412 aa  80.1  0.00000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.165665  normal  0.504192 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3552  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain-containing protein  30.94 
 
 		 373 aa  79.3  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.138111  normal  0.272734 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6149  hypothetical protein  30.64 
 
 		 441 aa  79  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.669475 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2209  CarB family protein  27.66 
 
 		 543 aa  78.2  0.0000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.304362  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37420  biotin carboxylase  27.97 
 
 		 405 aa  77  0.0000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.442231 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4069  phosphoribosylglycinamide synthetase ATP-grasp domain-containing protein  28.28 
 
 		 389 aa  76.3  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00086  carbamoyl phosphate synthase large subunit  27.71 
 
 		 1080 aa  74.3  0.000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0779  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  26.93 
 
 		 1068 aa  73.9  0.000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0332696  hitchhiker  0.000231672 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0996  phosphoribosylglycinamide synthetase  28.35 
 
 		 541 aa  73.2  0.000000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000037072 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0516  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  27.03 
 
 		 447 aa  73.2  0.000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0701369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3242  hypothetical protein  26.27 
 
 		 432 aa  72.8  0.000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1268  phosphoribosylglycinamide synthetase  23.1 
 
 		 400 aa  72.8  0.000000000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.584392  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0051  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase  26.59 
 
 		 448 aa  72.4  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1812  carbamoyl phosphate synthase large subunit  27.84 
 
 		 1080 aa  72.4  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00557421  normal  0.0258544 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1007  hypothetical protein  30.65 
 
 		 427 aa  72.4  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1128  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  26.35 
 
 		 1068 aa  72  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2931  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  28.7 
 
 		 454 aa  71.6  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.103239 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1981  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  26.72 
 
 		 1078 aa  71.2  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00635498 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2524  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  26.35 
 
 		 1078 aa  70.1  0.00000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0237548  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1562  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  26.35 
 
 		 1077 aa  69.7  0.00000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4786  hypothetical protein  29.03 
 
 		 398 aa  69.7  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0755  protein of unknown function DUF201  25.85 
 
 		 398 aa  68.2  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3018  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  25.22 
 
 		 1074 aa  68.9  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2572  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit, glutamine-dependent  26.35 
 
 		 1073 aa  68.2  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0164695  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3001  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  27.76 
 
 		 1104 aa  67.4  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105986  normal  0.458872 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05461  phosphoribosylamine--glycine ligase  27.85 
 
 		 438 aa  67.4  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.958381 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6975  phosphoribosylglycinamide synthetase  30.83 
 
 		 398 aa  67.4  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.646892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0939  carbamoyl phosphate synthase large subunit  26.17 
 
 		 1068 aa  67  0.0000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.245842  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2308  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  26.57 
 
 		 1082 aa  67  0.0000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3203  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  28.41 
 
 		 454 aa  67  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0368168 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2959  phosphoribosylglycinamide synthetase  23.96 
 
 		 405 aa  67  0.0000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1900  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  26.57 
 
 		 1082 aa  66.2  0.0000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00662116  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0875  hypothetical protein  28.51 
 
 		 420 aa  66.2  0.0000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.728931 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1864  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  25.15 
 
 		 1082 aa  65.9  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000611023  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1477  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  26.84 
 
 		 1054 aa  66.2  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.438417  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0977  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  25.44 
 
 		 1072 aa  65.9  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.270817  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2595  putative carbamoyl-phosphate-synthetase  24.52 
 
 		 398 aa  65.9  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.605395  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1276  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  26.57 
 
 		 1081 aa  65.5  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.104945  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2678  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  26.84 
 
 		 1067 aa  65.5  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2550  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  26.84 
 
 		 1067 aa  65.5  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1775  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  27.51 
 
 		 1073 aa  65.5  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0103005  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01931  vibrioferrin biosynthesis protein PvsA  30.48 
 
 		 399 aa  65.1  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1774  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  26.27 
 
 		 1081 aa  65.1  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000157385  normal  0.0854041 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2038  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  28.66 
 
 		 1109 aa  65.5  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00373357 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0371  hypothetical protein  25.1 
 
 		 290 aa  65.5  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000731332  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>