More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2144 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_2144  phosphoribosylglycinamide synthetase  100 
 
 		 416 aa  835    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2668  phosphoribosylglycinamide synthetase  61.17 
 
 		 415 aa  484  1e-135  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3626  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  39.18 
 
 		 432 aa  251  2e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4648  protein of unknown function DUF201  39.03 
 
 		 404 aa  220  3.9999999999999997e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.896666  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4500  Cysteine synthase  33.98 
 
 		 756 aa  118  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.632569  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2428  protein of unknown function DUF201  29.02 
 
 		 402 aa  107  4e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.281403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1270  protein of unknown function DUF201  25.44 
 
 		 399 aa  97.4  4e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.964812  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1432  hypothetical protein  29.34 
 
 		 424 aa  95.9  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.502147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1518  protein of unknown function DUF201  28.3 
 
 		 424 aa  94.7  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2737  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  24.17 
 
 		 723 aa  92.8  1e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2251  phosphoribosylglycinamide synthetase  25.72 
 
 		 418 aa  92  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000511987 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1423  protein of unknown function DUF201  28.06 
 
 		 424 aa  92  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.369206  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2438  hypothetical protein  32.94 
 
 		 410 aa  90.1  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.658373 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3759  protein of unknown function DUF201  33.77 
 
 		 425 aa  89  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2440  biotin carboxylase-like  28.24 
 
 		 424 aa  88.6  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.459774  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0194  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain-containing protein ATP-grasp  31.17 
 
 		 419 aa  87.8  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.296569  normal  0.160479 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2987  phosphoribosylglycinamide synthetase  28.86 
 
 		 410 aa  84.7  0.000000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.0000000000875543  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0619  phosphoribosylglycinamide synthetase  27.72 
 
 		 410 aa  84  0.000000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.241949  hitchhiker  0.00233057 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0573  phosphoribosylglycinamide synthetase  27.05 
 
 		 420 aa  84  0.000000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.23534  normal  0.22349 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0754  protein of unknown function DUF201  27.11 
 
 		 409 aa  84  0.000000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2020  phosphoribosylglycinamide synthetase  28.22 
 
 		 407 aa  82  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7725  hypothetical protein  29.15 
 
 		 411 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.10668  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0170  phosphoribosylglycinamide synthetase ATP-grasp domain-containing protein  22.56 
 
 		 407 aa  80.5  0.00000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0292  phosphoribosylglycinamide synthetase, ATP-grasp  22.56 
 
 		 407 aa  80.5  0.00000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1498  biotin carboxylase-like  34.24 
 
 		 428 aa  80.5  0.00000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6153  protein of unknown function DUF201  27.57 
 
 		 397 aa  79.3  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.496627  normal  0.0716856 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1119  biotin carboxylase  27.17 
 
 		 411 aa  79.3  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1929  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  26.56 
 
 		 411 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3660  hypothetical protein  31.77 
 
 		 411 aa  79.3  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.853995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2148  hypothetical protein  27.11 
 
 		 414 aa  77.4  0.0000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.149546 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0449  putative glycolate oxidase  23.85 
 
 		 404 aa  77.4  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1388  hypothetical protein  24.85 
 
 		 395 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0314212 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37420  biotin carboxylase  27.63 
 
 		 405 aa  75.9  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.442231 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2002  argininosuccinate lyase  29.94 
 
 		 900 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.848902  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0875  hypothetical protein  30.04 
 
 		 420 aa  75.9  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.728931 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2158  argininosuccinate lyase  29.94 
 
 		 914 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1164  protein of unknown function DUF201  27.27 
 
 		 437 aa  74.3  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2022  argininosuccinate lyase  29.94 
 
 		 900 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.10658  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1514  hypothetical protein  23.96 
 
 		 412 aa  73.9  0.000000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5090  hypothetical protein  27.89 
 
 		 453 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5770  hypothetical protein  27.89 
 
 		 453 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0282385 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4069  phosphoribosylglycinamide synthetase ATP-grasp domain-containing protein  28.47 
 
 		 389 aa  73.6  0.000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2663  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  28.49 
 
 		 413 aa  73.6  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33390  biotin carboxylase  30.45 
 
 		 428 aa  71.6  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.465269 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0418  hypothetical protein  29.01 
 
 		 411 aa  72.4  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6149  hypothetical protein  31.13 
 
 		 441 aa  71.2  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.669475 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1724  protein of unknown function DUF201  27.86 
 
 		 401 aa  71.2  0.00000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2209  CarB family protein  27.23 
 
 		 543 aa  70.9  0.00000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.304362  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2135  phosphoribosylglycinamide synthetase  28.44 
 
 		 412 aa  69.3  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.165665  normal  0.504192 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3064  hypothetical protein  33.67 
 
 		 441 aa  69.3  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000514586 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2162  hypothetical protein  26.61 
 
 		 414 aa  68.2  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.337945  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0714  carbamoyl phosphate synthase large subunit  30.8 
 
 		 1074 aa  68.2  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.278068 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3093  hypothetical protein  28.26 
 
 		 440 aa  68.6  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03057  hypothetical protein  26.51 
 
 		 449 aa  67  0.0000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.450613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3192  argininosuccinate lyase  28.09 
 
 		 924 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.655648  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1396  argininosuccinate lyase  27.88 
 
 		 926 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0240  hypothetical protein  26.82 
 
 		 410 aa  65.1  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0240  hypothetical protein  26.82 
 
 		 410 aa  65.1  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2646  argininosuccinate lyase  27.47 
 
 		 904 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2507  argininosuccinate lyase  27.64 
 
 		 912 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0593  carbamoyl phosphate synthase large subunit  29.6 
 
 		 1074 aa  64.7  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.820402  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1971  argininosuccinate lyase  26.97 
 
 		 891 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2560  argininosuccinate lyase  27.47 
 
 		 904 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2595  putative carbamoyl-phosphate-synthetase  26.72 
 
 		 398 aa  64.3  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.605395  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3242  hypothetical protein  26.33 
 
 		 432 aa  64.3  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0996  phosphoribosylglycinamide synthetase  27.43 
 
 		 541 aa  63.9  0.000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000037072 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3647  carbamoyl phosphate synthase large subunit  29.15 
 
 		 1074 aa  63.5  0.000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2503  carbamoyl phosphate synthase large subunit  28.25 
 
 		 1076 aa  63.9  0.000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001066  vibrioferrin ligase/carboxylase protein PvsA  27.01 
 
 		 403 aa  63.5  0.000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0555  carbamoyl phosphate synthase large subunit  29.6 
 
 		 1074 aa  63.5  0.000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.770872  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3840  carbamoyl phosphate synthase large subunit  28.7 
 
 		 1074 aa  63.2  0.000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6150  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  25.55 
 
 		 410 aa  62.8  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.639194 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3265  hypothetical protein  22.79 
 
 		 412 aa  62.4  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0200  hypothetical protein  26.19 
 
 		 405 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.214933  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4142  hypothetical protein  29.05 
 
 		 414 aa  62.4  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.16964  normal  0.023954 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0072  hypothetical protein  29.05 
 
 		 414 aa  62.4  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0783  carbamoyl phosphate synthase large subunit  27.8 
 
 		 1077 aa  62.4  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.523621  normal  0.328934 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0730  hypothetical protein  23.22 
 
 		 436 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3582  carbamoyl phosphate synthase large subunit  27.8 
 
 		 1077 aa  62.4  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3453  carbamoyl phosphate synthase large subunit  27.8 
 
 		 1077 aa  62.4  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.755127  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4090  hypothetical protein  28.57 
 
 		 414 aa  62  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.572464  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1967  carbamoyl phosphate synthase large subunit  27.11 
 
 		 1076 aa  60.8  0.00000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0074  carbamoyl phosphate synthase large subunit  28.25 
 
 		 1075 aa  60.8  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0791  biotin carboxylase  26.29 
 
 		 411 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0071  carbamoyl phosphate synthase large subunit  28.25 
 
 		 1075 aa  60.8  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.423134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0075  carbamoyl phosphate synthase large subunit  28.25 
 
 		 1075 aa  60.8  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0073  carbamoyl phosphate synthase large subunit  28.25 
 
 		 1075 aa  60.8  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.841404  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0071  carbamoyl phosphate synthase large subunit  28.25 
 
 		 1075 aa  60.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7724  putative biotin carboxylase  28.99 
 
 		 430 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.211642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4510  D-alanine--D-alanine ligase  30.05 
 
 		 318 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.926971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3365  putative carbamoyl-phosphate-synthetase protein  24.8 
 
 		 384 aa  59.7  0.00000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.131382  normal  0.291758 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2122  argininosuccinate lyase  27.72 
 
 		 894 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3566  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  28.25 
 
 		 1073 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4385  D-alanine--D-alanine ligase  28.96 
 
 		 318 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0215233  normal  0.165436 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0586  carbamoyl phosphate synthase large subunit  27.56 
 
 		 1076 aa  59.3  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.221423  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1620  argininosuccinate lyase  27.51 
 
 		 896 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0946  D-alanine--D-alanine ligase  30.05 
 
 		 318 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0037  carbamoyl phosphate synthase large subunit  28.25 
 
 		 1073 aa  58.9  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0034  carbamoyl phosphate synthase large subunit  28.25 
 
 		 1073 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0305  carbamoyl phosphate synthase large subunit  29.52 
 
 		 1089 aa  58.9  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>