112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_7724 on replicon NC_010627
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010627  Bphy_7724  putative biotin carboxylase  100 
 
 		 430 aa  869    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.211642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0791  biotin carboxylase  36.52 
 
 		 411 aa  195  1e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3467  hypothetical protein  35.11 
 
 		 407 aa  152  1e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2607  hypothetical protein  35.52 
 
 		 439 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.954723 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6148  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  33.99 
 
 		 408 aa  136  9e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.631903 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6150  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  30.05 
 
 		 410 aa  135  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.639194 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2023  hypothetical protein  33.23 
 
 		 408 aa  128  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4524  Biotin carboxylase-like protein  34.6 
 
 		 403 aa  123  6e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.799309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2846  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain- containing protein  29.71 
 
 		 404 aa  106  8e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.435021  normal  0.117516 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0874  nikkomycin biosynthesis domain protein  28.63 
 
 		 417 aa  99  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3673  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  31.06 
 
 		 407 aa  94.7  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06054  hypothetical protein  31.58 
 
 		 329 aa  90.1  6e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2026  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  26.13 
 
 		 423 aa  81.6  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0875  hypothetical protein  29.24 
 
 		 414 aa  79.7  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0202  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  26.8 
 
 		 388 aa  79.3  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.658271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0877  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain-containing protein ATP-grasp  29.14 
 
 		 386 aa  74.7  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.656066  normal  0.993359 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1164  protein of unknown function DUF201  25.24 
 
 		 437 aa  73.2  0.000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2328  hypothetical protein  27.46 
 
 		 385 aa  68.9  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3192  argininosuccinate lyase  26.44 
 
 		 924 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.655648  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0177  hypothetical protein  25.45 
 
 		 411 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1396  argininosuccinate lyase  26.28 
 
 		 926 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2020  phosphoribosylglycinamide synthetase  28.24 
 
 		 407 aa  68.2  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2646  argininosuccinate lyase  25.97 
 
 		 904 aa  67  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2507  argininosuccinate lyase  25.82 
 
 		 912 aa  67  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2560  argininosuccinate lyase  25.97 
 
 		 904 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2122  argininosuccinate lyase  27.05 
 
 		 894 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0730  hypothetical protein  26.69 
 
 		 436 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1620  argininosuccinate lyase  26.89 
 
 		 896 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0162  hypothetical protein  22.74 
 
 		 414 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3501  biotin carboxylase  37.3 
 
 		 159 aa  65.9  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2987  phosphoribosylglycinamide synthetase  24.59 
 
 		 410 aa  66.2  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.0000000000875543  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4069  phosphoribosylglycinamide synthetase ATP-grasp domain-containing protein  24.89 
 
 		 389 aa  63.9  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1642  hypothetical protein  26.32 
 
 		 392 aa  63.5  0.000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37420  biotin carboxylase  26.56 
 
 		 405 aa  62.4  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.442231 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4648  protein of unknown function DUF201  28.74 
 
 		 404 aa  62.4  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.896666  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1971  argininosuccinate lyase  26.76 
 
 		 891 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2144  phosphoribosylglycinamide synthetase  28.99 
 
 		 416 aa  60.8  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0200  hypothetical protein  26.44 
 
 		 405 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.214933  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6153  protein of unknown function DUF201  26.51 
 
 		 397 aa  58.9  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.496627  normal  0.0716856 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2668  phosphoribosylglycinamide synthetase  26.56 
 
 		 415 aa  58.9  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5518  phosphoribosylglycinamide synthetase  29.62 
 
 		 403 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.398662  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5882  phosphoribosylglycinamide synthetase  29.62 
 
 		 403 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.47867 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3626  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  30 
 
 		 432 aa  57.8  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7725  hypothetical protein  25.45 
 
 		 411 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.10668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6391  phosphoribosylglycinamide synthetase  32.53 
 
 		 403 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.782672  normal  0.167257 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4094  biotin carboxylase-like protein  27.37 
 
 		 389 aa  55.5  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.138669  normal  0.680577 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0344  phosphoribosylglycinamide synthetase  24.63 
 
 		 424 aa  54.7  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1929  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  23.22 
 
 		 411 aa  54.7  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0194  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain-containing protein ATP-grasp  26.75 
 
 		 419 aa  54.3  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.296569  normal  0.160479 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3759  protein of unknown function DUF201  28.44 
 
 		 425 aa  53.9  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0573  phosphoribosylglycinamide synthetase  26.78 
 
 		 420 aa  53.9  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.23534  normal  0.22349 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2162  hypothetical protein  25.99 
 
 		 414 aa  53.5  0.000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.337945  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1270  protein of unknown function DUF201  23.77 
 
 		 399 aa  53.5  0.000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.964812  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0006  hypothetical protein  22.81 
 
 		 387 aa  53.1  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0875  hypothetical protein  24.78 
 
 		 420 aa  52.4  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.728931 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0421  hypothetical protein  21.99 
 
 		 321 aa  52.8  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1514  hypothetical protein  25.15 
 
 		 412 aa  52.8  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6975  phosphoribosylglycinamide synthetase  32.11 
 
 		 398 aa  52.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.646892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5515  phosphoribosylglycinamide synthetase  28.1 
 
 		 422 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.330375  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5879  phosphoribosylglycinamide synthetase  28.1 
 
 		 422 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.521142  normal  0.293972 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0906  biotin carboxylase-like protein  27.1 
 
 		 386 aa  52.4  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.17944  hitchhiker  0.00104382 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0619  phosphoribosylglycinamide synthetase  25.68 
 
 		 410 aa  52.4  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.241949  hitchhiker  0.00233057 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4090  hypothetical protein  26.87 
 
 		 414 aa  50.4  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.572464  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3064  hypothetical protein  28.34 
 
 		 441 aa  50.8  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000514586 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4500  Cysteine synthase  26.97 
 
 		 756 aa  50.8  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.632569  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2438  hypothetical protein  29.32 
 
 		 410 aa  50.4  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.658373 
 
 
-
 
NC_003296  RS03057  hypothetical protein  23.95 
 
 		 449 aa  50.1  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.450613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2484  carbamoyl phosphate synthase-like protein  26.16 
 
 		 354 aa  49.7  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.834927  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1007  hypothetical protein  23.33 
 
 		 427 aa  49.7  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1941  hypothetical protein  26.36 
 
 		 428 aa  49.3  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4142  hypothetical protein  26.43 
 
 		 414 aa  48.9  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.16964  normal  0.023954 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0072  hypothetical protein  26.43 
 
 		 414 aa  48.9  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6388  phosphoribosylglycinamide synthetase  28.79 
 
 		 422 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.357309  normal  0.160447 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1462  protein of unknown function DUF201  27.85 
 
 		 318 aa  48.9  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.127358  normal  0.969827 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0170  phosphoribosylglycinamide synthetase ATP-grasp domain-containing protein  22.22 
 
 		 407 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1401  protein of unknown function DUF201  22.97 
 
 		 409 aa  47.8  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37283  predicted protein  23.73 
 
 		 1033 aa  48.1  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0292  phosphoribosylglycinamide synthetase, ATP-grasp  22.22 
 
 		 407 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3093  hypothetical protein  27.63 
 
 		 440 aa  48.1  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33390  biotin carboxylase  25.85 
 
 		 428 aa  47.8  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.465269 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2628  D-alanine--D-alanine ligase  30.95 
 
 		 304 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.292335  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2666  D-alanine--D-alanine ligase  30.95 
 
 		 304 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.555621  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1268  phosphoribosylglycinamide synthetase  22.67 
 
 		 400 aa  47.4  0.0005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.584392  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2524  D-alanine--D-alanine ligase  32.14 
 
 		 311 aa  47  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0109792  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2582  D-alanine--D-alanine ligase  30.95 
 
 		 304 aa  47  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2595  putative carbamoyl-phosphate-synthetase  22.41 
 
 		 398 aa  47  0.0007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.605395  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01931  vibrioferrin biosynthesis protein PvsA  25.24 
 
 		 399 aa  47  0.0007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2627  D-alanine--D-alanine ligase  30.95 
 
 		 304 aa  47  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000105454 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2428  protein of unknown function DUF201  28.85 
 
 		 402 aa  46.6  0.0008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.281403  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2435  D-alanine--D-alanine ligase  30.95 
 
 		 304 aa  46.2  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.470821  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2356  D-alanine--D-alanine ligase  30.95 
 
 		 304 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2610  D-alanine--D-alanine ligase  30.95 
 
 		 304 aa  46.2  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.5132  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3469  hypothetical protein  24.26 
 
 		 429 aa  46.2  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2741  D-alanine--D-alanine ligase  24.32 
 
 		 304 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.199895  hitchhiker  0.00000666317 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6302  hypothetical protein  32.54 
 
 		 401 aa  45.8  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0344575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0754  protein of unknown function DUF201  24.52 
 
 		 409 aa  46.6  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2209  CarB family protein  26.67 
 
 		 543 aa  45.4  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.304362  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2390  D-alanine--D-alanine ligase  30.95 
 
 		 304 aa  45.8  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.593473  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0010  hypothetical protein  21.89 
 
 		 392 aa  45.4  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  decreased coverage  0.00788782  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3552  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain-containing protein  26.95 
 
 		 373 aa  45.4  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.138111  normal  0.272734 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>