117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_5770 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008061  Bcen_5090  hypothetical protein  100 
 
 		 453 aa  925    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5770  hypothetical protein  100 
 
 		 453 aa  925    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0282385 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4648  protein of unknown function DUF201  27.35 
 
 		 404 aa  103  6e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.896666  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0170  phosphoribosylglycinamide synthetase ATP-grasp domain-containing protein  25.68 
 
 		 407 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0292  phosphoribosylglycinamide synthetase, ATP-grasp  25.68 
 
 		 407 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2148  hypothetical protein  27.75 
 
 		 414 aa  84.3  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.149546 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3469  hypothetical protein  26.14 
 
 		 429 aa  83.6  0.000000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2668  phosphoribosylglycinamide synthetase  26.88 
 
 		 415 aa  82.8  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33390  biotin carboxylase  29.8 
 
 		 428 aa  80.1  0.00000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.465269 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2663  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  28.76 
 
 		 413 aa  79.3  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0573  phosphoribosylglycinamide synthetase  24.64 
 
 		 420 aa  78.2  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.23534  normal  0.22349 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0793  biotin carboxylase  34.96 
 
 		 437 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3660  hypothetical protein  28.37 
 
 		 411 aa  77  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.853995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1929  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  23.68 
 
 		 411 aa  74.3  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2144  phosphoribosylglycinamide synthetase  27.89 
 
 		 416 aa  73.9  0.000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0730  hypothetical protein  23.73 
 
 		 436 aa  73.6  0.000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4500  Cysteine synthase  26.56 
 
 		 756 aa  67  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.632569  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7725  hypothetical protein  29.13 
 
 		 411 aa  67  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.10668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1432  hypothetical protein  26.28 
 
 		 424 aa  66.2  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.502147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2987  phosphoribosylglycinamide synthetase  25.36 
 
 		 410 aa  65.9  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.0000000000875543  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2158  argininosuccinate lyase  26.42 
 
 		 914 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2440  biotin carboxylase-like  26.73 
 
 		 424 aa  65.1  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.459774  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2002  argininosuccinate lyase  26.1 
 
 		 900 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.848902  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2022  argininosuccinate lyase  26.1 
 
 		 900 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.10658  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3626  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  27.16 
 
 		 432 aa  63.9  0.000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0875  hypothetical protein  25.84 
 
 		 420 aa  64.3  0.000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.728931 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2020  phosphoribosylglycinamide synthetase  22.56 
 
 		 407 aa  63.2  0.000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3064  hypothetical protein  26.92 
 
 		 441 aa  62.8  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000514586 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4786  hypothetical protein  26.55 
 
 		 398 aa  62  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0996  phosphoribosylglycinamide synthetase  25.83 
 
 		 541 aa  61.6  0.00000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000037072 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1518  protein of unknown function DUF201  26.65 
 
 		 424 aa  60.8  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6388  phosphoribosylglycinamide synthetase  25 
 
 		 422 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.357309  normal  0.160447 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2135  phosphoribosylglycinamide synthetase  25.74 
 
 		 412 aa  59.7  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.165665  normal  0.504192 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1423  protein of unknown function DUF201  26.35 
 
 		 424 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.369206  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1270  protein of unknown function DUF201  25.27 
 
 		 399 aa  58.2  0.0000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.964812  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0344  phosphoribosylglycinamide synthetase  22.77 
 
 		 424 aa  57  0.0000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0721  hypothetical protein  26.18 
 
 		 402 aa  57  0.0000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.446517 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2428  protein of unknown function DUF201  24.92 
 
 		 402 aa  56.6  0.0000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.281403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3552  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain-containing protein  21.96 
 
 		 373 aa  55.8  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.138111  normal  0.272734 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0912  biotin carboxylase-like protein  25.44 
 
 		 410 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.527326 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6153  protein of unknown function DUF201  26.79 
 
 		 397 aa  56.2  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.496627  normal  0.0716856 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37420  biotin carboxylase  22.61 
 
 		 405 aa  56.2  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.442231 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5515  phosphoribosylglycinamide synthetase  23.49 
 
 		 422 aa  55.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.330375  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5879  phosphoribosylglycinamide synthetase  23.49 
 
 		 422 aa  55.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.521142  normal  0.293972 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3192  argininosuccinate lyase  23.93 
 
 		 924 aa  55.5  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.655648  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0200  hypothetical protein  21.75 
 
 		 405 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.214933  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1396  argininosuccinate lyase  23.78 
 
 		 926 aa  54.7  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2251  phosphoribosylglycinamide synthetase  24.12 
 
 		 418 aa  54.7  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000511987 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1971  argininosuccinate lyase  23.75 
 
 		 891 aa  54.3  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1700  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  23.05 
 
 		 1496 aa  54.7  0.000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4068  hypothetical protein  26.36 
 
 		 413 aa  54.3  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2507  argininosuccinate lyase  23.32 
 
 		 912 aa  53.1  0.000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44930  predicted protein  21.17 
 
 		 575 aa  53.1  0.000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.541672  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3759  protein of unknown function DUF201  25.57 
 
 		 425 aa  53.1  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1553  phosphoribosylglycinamide synthetase, ATP-grasp, putative  22.4 
 
 		 267 aa  52.8  0.00001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2122  argininosuccinate lyase  23.51 
 
 		 894 aa  52.8  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2560  argininosuccinate lyase  23.47 
 
 		 904 aa  53.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4069  phosphoribosylglycinamide synthetase ATP-grasp domain-containing protein  23.33 
 
 		 389 aa  53.1  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0194  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain-containing protein ATP-grasp  25.1 
 
 		 419 aa  53.1  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.296569  normal  0.160479 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1620  argininosuccinate lyase  23.32 
 
 		 896 aa  52  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2646  argininosuccinate lyase  23.47 
 
 		 904 aa  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14770  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  22.73 
 
 		 1117 aa  51.6  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3835  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.53 
 
 		 1154 aa  50.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.863015  normal  0.842487 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2438  hypothetical protein  26.83 
 
 		 410 aa  50.8  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.658373 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0754  protein of unknown function DUF201  21.14 
 
 		 409 aa  50.8  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1388  hypothetical protein  23.33 
 
 		 395 aa  50.4  0.00007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0314212 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0202  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  26.34 
 
 		 388 aa  50.1  0.00008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.658271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0168  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  29.7 
 
 		 283 aa  50.1  0.00009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000000151287  normal  0.111818 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1516  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.53 
 
 		 1109 aa  49.7  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12690  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  21.58 
 
 		 1118 aa  49.7  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0359466  normal  0.0639836 
 
 
-
 
NC_003296  RS03057  hypothetical protein  26.56 
 
 		 449 aa  48.5  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.450613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3091  PvsA  25 
 
 		 394 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.324185  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3242  hypothetical protein  25.38 
 
 		 432 aa  48.9  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0085  carbamoylphosphate synthase large subunit  20.15 
 
 		 1127 aa  48.5  0.0003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0899  hypothetical protein  22.07 
 
 		 406 aa  48.1  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0718  hypothetical protein  22.07 
 
 		 406 aa  48.1  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.555879  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0732  hypothetical protein  22.07 
 
 		 406 aa  48.1  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1724  protein of unknown function DUF201  24.02 
 
 		 401 aa  47.8  0.0004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0318  lysine biosynthesis enzyme LysX  36.51 
 
 		 288 aa  47.4  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1308  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  20.98 
 
 		 1082 aa  47.4  0.0005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0672  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  23.55 
 
 		 1107 aa  47.4  0.0006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.715776 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2162  hypothetical protein  21.4 
 
 		 414 aa  47  0.0008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.337945  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1007  hypothetical protein  21.53 
 
 		 427 aa  46.6  0.0009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0197  hypothetical protein  23.21 
 
 		 391 aa  46.2  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2886  carbamoyl phosphate synthase large subunit  21.5 
 
 		 1082 aa  46.2  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.827795  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1849  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  23.98 
 
 		 1115 aa  46.2  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0917  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  19.52 
 
 		 1131 aa  46.2  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37283  predicted protein  20.64 
 
 		 1033 aa  46.6  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6975  phosphoribosylglycinamide synthetase  28.91 
 
 		 398 aa  46.2  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.646892  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0240  hypothetical protein  25.12 
 
 		 410 aa  45.4  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0240  hypothetical protein  25.12 
 
 		 410 aa  45.8  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1477  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  21.61 
 
 		 1054 aa  45.8  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.438417  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1298  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  22.07 
 
 		 1093 aa  45.8  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0243124 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0912  alpha-L-glutamate ligase  23 
 
 		 271 aa  45.4  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.966867  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1846  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  21.61 
 
 		 1111 aa  45.4  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.422098 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2718  pyruvate carboxylase subunit A  25.52 
 
 		 471 aa  45.1  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2591  pyruvate carboxylase subunit A  24.9 
 
 		 471 aa  44.7  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8363  putative siderophore biosynthesis protein  29.45 
 
 		 401 aa  45.1  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1279  hypothetical protein  23.17 
 
 		 411 aa  45.1  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.406455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0444  lysine biosynthesis enzyme LysX  27.08 
 
 		 272 aa  44.7  0.003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0001654  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>