More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA1620 on replicon NC_006348
Organism: Burkholderia mallei ATCC 23344



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA1620  argininosuccinate lyase  100 
 
 
896 aa  1786    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2646  argininosuccinate lyase  98.56 
 
 
904 aa  1686    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1971  argininosuccinate lyase  88.67 
 
 
891 aa  1503    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3192  argininosuccinate lyase  99.22 
 
 
924 aa  1687    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.655648  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2560  argininosuccinate lyase  98.56 
 
 
904 aa  1686    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1396  argininosuccinate lyase  99.56 
 
 
926 aa  1692    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2122  argininosuccinate lyase  99.67 
 
 
894 aa  1695    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2507  argininosuccinate lyase  97.7 
 
 
912 aa  1668    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2022  argininosuccinate lyase  40.62 
 
 
900 aa  505  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.10658  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2158  argininosuccinate lyase  40.31 
 
 
914 aa  501  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2002  argininosuccinate lyase  40.5 
 
 
900 aa  501  1e-140  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.848902  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2437  fumarate lyase  37.35 
 
 
477 aa  237  6e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.383399 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4386  argininosuccinate lyase  31.52 
 
 
499 aa  213  1e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.886782 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0740  argininosuccinate lyase  30.63 
 
 
463 aa  191  7e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.121768  normal  0.29697 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1827  argininosuccinate lyase  33.7 
 
 
462 aa  189  2e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.986813  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1169  argininosuccinate lyase  32.98 
 
 
462 aa  185  3e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.807635  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2438  hypothetical protein  37.85 
 
 
410 aa  184  6e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.658373 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1807  argininosuccinate lyase  31.46 
 
 
461 aa  184  9.000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1781  argininosuccinate lyase  28.99 
 
 
479 aa  179  2e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0498  argininosuccinate lyase  28.12 
 
 
462 aa  178  4e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3660  argininosuccinate lyase  30.7 
 
 
462 aa  178  4e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3714  argininosuccinate lyase  30.7 
 
 
462 aa  178  4e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.564837 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2418  argininosuccinate lyase  34.17 
 
 
461 aa  177  6e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00024267  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4764  argininosuccinate lyase  29.75 
 
 
462 aa  177  7e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0126  argininosuccinate lyase  30.4 
 
 
462 aa  177  8e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.013786  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4363  argininosuccinate lyase  29.75 
 
 
463 aa  177  8e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4737  argininosuccinate lyase  29.75 
 
 
462 aa  177  9e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0435199  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4527  argininosuccinate lyase  29.48 
 
 
462 aa  177  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4374  argininosuccinate lyase  29.75 
 
 
462 aa  177  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.24188  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4459  argininosuccinate lyase  30.03 
 
 
462 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0185476  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4879  argininosuccinate lyase  29.48 
 
 
462 aa  177  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4763  argininosuccinate lyase  29.75 
 
 
463 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00012697  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2284  argininosuccinate lyase  36.09 
 
 
464 aa  175  3.9999999999999995e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0400918 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4747  argininosuccinate lyase  29.48 
 
 
462 aa  174  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2151  argininosuccinate lyase  34.78 
 
 
475 aa  174  5.999999999999999e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000172098  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3305  argininosuccinate lyase  29.48 
 
 
462 aa  174  7.999999999999999e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167787  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2475  argininosuccinate lyase  33.5 
 
 
474 aa  173  1e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000124507 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1229  argininosuccinate lyase  33.72 
 
 
459 aa  172  2e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2889  argininosuccinate lyase  30.08 
 
 
462 aa  171  5e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.438761 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0178  argininosuccinate lyase  30.11 
 
 
458 aa  170  1e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0576  argininosuccinate lyase  28.18 
 
 
492 aa  170  1e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.0000000512851  decreased coverage  0.000219195 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2754  argininosuccinate lyase  31.99 
 
 
467 aa  170  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3006  argininosuccinate lyase  28.24 
 
 
462 aa  169  2e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00365153  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0739  argininosuccinate lyase  31.2 
 
 
474 aa  169  2e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.730139  normal  0.199189 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0123  argininosuccinate lyase  29.38 
 
 
459 aa  169  2e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.001821  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0345  argininosuccinate lyase  32.98 
 
 
459 aa  169  2.9999999999999998e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1208  argininosuccinate lyase  28.03 
 
 
481 aa  168  2.9999999999999998e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1168  argininosuccinate lyase  25.54 
 
 
487 aa  169  2.9999999999999998e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3110  argininosuccinate lyase  35.53 
 
 
467 aa  168  4e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03845  argininosuccinate lyase  36.31 
 
 
457 aa  168  5e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4026  argininosuccinate lyase  36.31 
 
 
457 aa  168  5e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4194  argininosuccinate lyase  36.31 
 
 
457 aa  168  5e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4499  argininosuccinate lyase  36.31 
 
 
457 aa  168  5e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.512894  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0158  argininosuccinate lyase  33.33 
 
 
458 aa  168  5e-40  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4446  argininosuccinate lyase  36.31 
 
 
457 aa  168  5e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4056  argininosuccinate lyase  36.31 
 
 
457 aa  168  5e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.52602 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0761  argininosuccinate lyase  31.97 
 
 
481 aa  168  5e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1025  argininosuccinate lyase  30.13 
 
 
491 aa  168  5e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.414548  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0682  argininosuccinate lyase  28.88 
 
 
466 aa  167  5e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0126  argininosuccinate lyase  30.32 
 
 
459 aa  168  5e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.900188  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03794  hypothetical protein  36.31 
 
 
457 aa  168  5e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4778  argininosuccinate lyase  34.89 
 
 
457 aa  167  6.9999999999999995e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00418415 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5420  argininosuccinate lyase  36.45 
 
 
457 aa  167  8e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4058  argininosuccinate lyase  35.4 
 
 
457 aa  167  9e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4407  argininosuccinate lyase  36.45 
 
 
457 aa  167  9e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0966471 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0732  argininosuccinate lyase  31.74 
 
 
461 aa  167  9e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0166776  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0197  argininosuccinate lyase  36.02 
 
 
457 aa  166  1.0000000000000001e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.274279  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2702  argininosuccinate lyase  29.67 
 
 
459 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0125  argininosuccinate lyase  33.13 
 
 
464 aa  167  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00111  argininosuccinate lyase  30.77 
 
 
463 aa  166  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.642056  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2024  argininosuccinate lyase  32.53 
 
 
482 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0998023 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4249  argininosuccinate lyase  35.4 
 
 
457 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.951659  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3917  argininosuccinate lyase  36.34 
 
 
457 aa  166  2.0000000000000002e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.705842  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2158  argininosuccinate lyase  35.53 
 
 
472 aa  165  3e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000750754  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0184  argininosuccinate lyase  32.51 
 
 
468 aa  165  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1299  argininosuccinate lyase  33.06 
 
 
463 aa  165  4.0000000000000004e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000094319  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47620  argininosuccinate lyase  32.82 
 
 
464 aa  165  4.0000000000000004e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0254  argininosuccinate lyase  33.75 
 
 
464 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0065  argininosuccinate lyase  33.13 
 
 
464 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02920  argininosuccinate lyase  30.45 
 
 
464 aa  164  5.0000000000000005e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0206  argininosuccinate lyase  32.51 
 
 
499 aa  164  6e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6070  argininosuccinate lyase  35.26 
 
 
472 aa  164  6e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.566647  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0352  argininosuccinate lyase  34.95 
 
 
474 aa  164  7e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.843873  normal  0.960581 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0129  argininosuccinate lyase  35.4 
 
 
457 aa  164  8.000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0004  argininosuccinate lyase  26.9 
 
 
491 aa  164  8.000000000000001e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.52791 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3896  argininosuccinate lyase  35.4 
 
 
457 aa  164  8.000000000000001e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2673  argininosuccinate lyase  31.04 
 
 
468 aa  164  8.000000000000001e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.973964  hitchhiker  0.00000000000598016 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3544  argininosuccinate lyase  33.42 
 
 
452 aa  163  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.441008  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1339  argininosuccinate lyase  30.07 
 
 
463 aa  163  1e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00121  argininosuccinate lyase  30.73 
 
 
462 aa  164  1e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.669318  hitchhiker  0.00196346 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0209  argininosuccinate lyase  32.51 
 
 
464 aa  163  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.822129  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0548  argininosuccinate lyase  26.23 
 
 
463 aa  162  2e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1123  argininosuccinate lyase ArgH-like protein  29 
 
 
458 aa  162  2e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.168929 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4333  argininosuccinate lyase  35.51 
 
 
458 aa  162  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4087  argininosuccinate lyase  35.4 
 
 
457 aa  163  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26580  argininosuccinate lyase  29.77 
 
 
466 aa  162  2e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000988334  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1791  argininosuccinate lyase  28.42 
 
 
461 aa  163  2e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4454  argininosuccinate lyase  35.51 
 
 
458 aa  162  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000120209 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0572  argininosuccinate lyase  37.5 
 
 
456 aa  162  3e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4528  argininosuccinate lyase  35.51 
 
 
458 aa  162  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.260421  hitchhiker  0.0000184312 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>