More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_2251 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_2251  phosphoribosylglycinamide synthetase  100 
 
 
418 aa  823    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000511987 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2440  biotin carboxylase-like  49.88 
 
 
424 aa  354  1e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.459774  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1423  protein of unknown function DUF201  49.64 
 
 
424 aa  353  4e-96  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.369206  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1518  protein of unknown function DUF201  49.16 
 
 
424 aa  352  8.999999999999999e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1432  hypothetical protein  49.76 
 
 
424 aa  345  1e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.502147  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1164  protein of unknown function DUF201  42.96 
 
 
437 aa  331  1e-89  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1724  protein of unknown function DUF201  33.74 
 
 
401 aa  186  8e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4500  Cysteine synthase  35.04 
 
 
756 aa  147  5e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.632569  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0449  putative glycolate oxidase  29.62 
 
 
404 aa  140  6e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2428  protein of unknown function DUF201  27.66 
 
 
402 aa  127  3e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.281403  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0418  hypothetical protein  31.79 
 
 
411 aa  124  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1119  biotin carboxylase  28.27 
 
 
411 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2737  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  27.3 
 
 
723 aa  118  1.9999999999999998e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0573  phosphoribosylglycinamide synthetase  27.68 
 
 
420 aa  114  3e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.23534  normal  0.22349 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33390  biotin carboxylase  26.47 
 
 
428 aa  112  1.0000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.465269 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0619  phosphoribosylglycinamide synthetase  27.9 
 
 
410 aa  109  8.000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.241949  hitchhiker  0.00233057 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3759  protein of unknown function DUF201  30.65 
 
 
425 aa  104  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7725  hypothetical protein  30.55 
 
 
411 aa  103  5e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.10668  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1270  protein of unknown function DUF201  25.85 
 
 
399 aa  102  1e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.964812  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2020  phosphoribosylglycinamide synthetase  26.73 
 
 
407 aa  97.8  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3626  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  27.23 
 
 
432 aa  96.3  8e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2144  phosphoribosylglycinamide synthetase  26.26 
 
 
416 aa  95.9  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2663  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  26.81 
 
 
413 aa  96.3  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1514  hypothetical protein  26.69 
 
 
412 aa  93.6  5e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0875  hypothetical protein  31.85 
 
 
420 aa  93.6  6e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.728931 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4648  protein of unknown function DUF201  29.15 
 
 
404 aa  92.8  9e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.896666  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0754  protein of unknown function DUF201  24.23 
 
 
409 aa  91.7  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2668  phosphoribosylglycinamide synthetase  26.45 
 
 
415 aa  89.7  8e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3265  hypothetical protein  26.69 
 
 
412 aa  89.4  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2148  hypothetical protein  26.2 
 
 
414 aa  89  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.149546 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37420  biotin carboxylase  25 
 
 
405 aa  88.2  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.442231 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1401  protein of unknown function DUF201  25.76 
 
 
409 aa  86.7  7e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2209  CarB family protein  25.97 
 
 
543 aa  86.7  8e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.304362  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0344  phosphoribosylglycinamide synthetase  32.9 
 
 
424 aa  85.5  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0996  phosphoribosylglycinamide synthetase  26.16 
 
 
541 aa  82  0.00000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000037072 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1929  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  24.11 
 
 
411 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0170  phosphoribosylglycinamide synthetase ATP-grasp domain-containing protein  24.54 
 
 
407 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0292  phosphoribosylglycinamide synthetase, ATP-grasp  24.54 
 
 
407 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14410  carbamoylphosphate synthase large subunit  29.66 
 
 
423 aa  80.1  0.00000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2438  hypothetical protein  31.96 
 
 
410 aa  79.7  0.00000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.658373 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0791  biotin carboxylase  26.4 
 
 
411 aa  80.1  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2987  phosphoribosylglycinamide synthetase  25.56 
 
 
410 aa  79.3  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.0000000000875543  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0755  protein of unknown function DUF201  23.86 
 
 
398 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0730  hypothetical protein  26.16 
 
 
436 aa  77  0.0000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8363  putative siderophore biosynthesis protein  29.65 
 
 
401 aa  76.6  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1388  hypothetical protein  23.05 
 
 
395 aa  76.3  0.0000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0314212 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4069  phosphoribosylglycinamide synthetase ATP-grasp domain-containing protein  22.29 
 
 
389 aa  75.9  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3660  hypothetical protein  30.28 
 
 
411 aa  76.3  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.853995  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2959  phosphoribosylglycinamide synthetase  28.79 
 
 
405 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6153  protein of unknown function DUF201  28.05 
 
 
397 aa  73.9  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.496627  normal  0.0716856 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2969  hypothetical protein  29.25 
 
 
402 aa  73.2  0.000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0200  hypothetical protein  24.45 
 
 
405 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.214933  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2158  argininosuccinate lyase  29.64 
 
 
914 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2002  argininosuccinate lyase  29.64 
 
 
900 aa  70.1  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.848902  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3748  protein of unknown function DUF201  28.26 
 
 
388 aa  69.3  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.277412  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2022  argininosuccinate lyase  29.64 
 
 
900 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.10658  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0194  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain-containing protein ATP-grasp  25.23 
 
 
419 aa  68.2  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.296569  normal  0.160479 
 
 
-
 
NC_003296  RS03057  hypothetical protein  28.91 
 
 
449 aa  67.8  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.450613  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3552  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain-containing protein  24.82 
 
 
373 aa  67  0.0000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.138111  normal  0.272734 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3242  hypothetical protein  25.4 
 
 
432 aa  66.2  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6149  hypothetical protein  25.09 
 
 
441 aa  66.2  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.669475 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1268  phosphoribosylglycinamide synthetase  22.36 
 
 
400 aa  66.2  0.000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.584392  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4982  D-alanine--D-alanine ligase  29.06 
 
 
319 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.380222  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6150  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  32.16 
 
 
410 aa  64.7  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.639194 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44930  predicted protein  24.05 
 
 
575 aa  63.2  0.000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.541672  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37283  predicted protein  24.85 
 
 
1033 aa  63.2  0.000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1112  hypothetical protein  24.32 
 
 
433 aa  63.2  0.000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1498  biotin carboxylase-like  29.48 
 
 
428 aa  61.6  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3425  D-alanine--D-alanine ligase  28.21 
 
 
304 aa  62  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.346126  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4786  hypothetical protein  24.75 
 
 
398 aa  61.6  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5515  phosphoribosylglycinamide synthetase  25.86 
 
 
422 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.330375  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57320  D-alanine--D-alanine ligase  28.57 
 
 
319 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5879  phosphoribosylglycinamide synthetase  25.86 
 
 
422 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.521142  normal  0.293972 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1472  D-alanine--D-alanine ligase  27.45 
 
 
326 aa  61.6  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.269509  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2595  putative carbamoyl-phosphate-synthetase  23.55 
 
 
398 aa  60.8  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.605395  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2978  D-alanine--D-alanine ligase  27.31 
 
 
332 aa  60.8  0.00000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00577366  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6388  phosphoribosylglycinamide synthetase  25.08 
 
 
422 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.357309  normal  0.160447 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0899  hypothetical protein  30.31 
 
 
406 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0732  hypothetical protein  30.31 
 
 
406 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0718  hypothetical protein  30.31 
 
 
406 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.555879  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0946  D-alanine--D-alanine ligase  27.23 
 
 
318 aa  60.5  0.00000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427679  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6391  phosphoribosylglycinamide synthetase  29.55 
 
 
403 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.782672  normal  0.167257 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4510  D-alanine--D-alanine ligase  27.23 
 
 
318 aa  60.1  0.00000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.926971  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0333  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  30.43 
 
 
1087 aa  58.9  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.639877  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3668  D-alanine--D-alanine ligase  27.2 
 
 
332 aa  59.3  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.497942  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1339  D-alanine--D-alanine ligase  26.09 
 
 
318 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.266833  normal  0.0340242 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1971  argininosuccinate lyase  27.02 
 
 
891 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0907  hypothetical protein  25.49 
 
 
433 aa  58.5  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.68427  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4385  D-alanine--D-alanine ligase  26.73 
 
 
318 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0215233  normal  0.165436 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3192  argininosuccinate lyase  25.42 
 
 
924 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.655648  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0874  nikkomycin biosynthesis domain protein  25.29 
 
 
417 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5518  phosphoribosylglycinamide synthetase  29.15 
 
 
403 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.398662  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5882  phosphoribosylglycinamide synthetase  29.15 
 
 
403 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.47867 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1396  argininosuccinate lyase  25.25 
 
 
926 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1202  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  27.56 
 
 
1089 aa  57.4  0.0000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3455  D-alanine/D-alanine ligase  29 
 
 
336 aa  57.4  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0409597  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0452  D-alanine/D-alanine ligase  26.61 
 
 
324 aa  57  0.0000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0742321  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2162  hypothetical protein  24.3 
 
 
414 aa  57  0.0000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.337945  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1584  putative carbamoyl-phosphate-synthetase protein  23.25 
 
 
393 aa  57  0.0000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1852  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  27.17 
 
 
1072 aa  56.6  0.0000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>