68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_44930 on replicon NC_011673
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011673  PHATRDRAFT_44930  predicted protein  100 
 
 
575 aa  1196    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.541672  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37283  predicted protein  33.52 
 
 
1033 aa  160  8e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1007  hypothetical protein  31.87 
 
 
427 aa  129  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2432  hypothetical protein  27.73 
 
 
430 aa  125  2e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5879  phosphoribosylglycinamide synthetase  30.81 
 
 
422 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.521142  normal  0.293972 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5515  phosphoribosylglycinamide synthetase  30.81 
 
 
422 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.330375  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0072  hypothetical protein  30.75 
 
 
414 aa  125  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4142  hypothetical protein  30.75 
 
 
414 aa  124  3e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.16964  normal  0.023954 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4090  hypothetical protein  30.46 
 
 
414 aa  122  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.572464  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6388  phosphoribosylglycinamide synthetase  30.52 
 
 
422 aa  121  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.357309  normal  0.160447 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0416  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.09 
 
 
726 aa  121  3e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0147603  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2162  hypothetical protein  25.41 
 
 
414 aa  108  4e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.337945  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0344  phosphoribosylglycinamide synthetase  29.48 
 
 
424 aa  107  6e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0996  phosphoribosylglycinamide synthetase  26.58 
 
 
541 aa  106  9e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000037072 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0875  hypothetical protein  27.97 
 
 
420 aa  98.2  4e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.728931 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0240  hypothetical protein  26.36 
 
 
410 aa  94.7  4e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0240  hypothetical protein  25.93 
 
 
410 aa  94  7e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2135  phosphoribosylglycinamide synthetase  25.6 
 
 
412 aa  84.3  0.000000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.165665  normal  0.504192 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0912  biotin carboxylase-like protein  25.51 
 
 
410 aa  74.3  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.527326 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3626  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  27.44 
 
 
432 aa  67.4  0.0000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3759  protein of unknown function DUF201  24.22 
 
 
425 aa  65.9  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0177  hypothetical protein  30.2 
 
 
411 aa  65.5  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1270  protein of unknown function DUF201  23.55 
 
 
399 aa  63.5  0.00000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.964812  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2251  phosphoribosylglycinamide synthetase  24.51 
 
 
418 aa  63.5  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000511987 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01931  vibrioferrin biosynthesis protein PvsA  29.39 
 
 
399 aa  62.4  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0170  phosphoribosylglycinamide synthetase ATP-grasp domain-containing protein  28.23 
 
 
407 aa  62.8  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0292  phosphoribosylglycinamide synthetase, ATP-grasp  28.23 
 
 
407 aa  62.8  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3673  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  26.09 
 
 
407 aa  58.9  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2020  phosphoribosylglycinamide synthetase  25.09 
 
 
407 aa  58.2  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0619  phosphoribosylglycinamide synthetase  23.45 
 
 
410 aa  57  0.0000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.241949  hitchhiker  0.00233057 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09340  hypothetical protein  26.83 
 
 
399 aa  55.8  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.035454  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8363  putative siderophore biosynthesis protein  26.71 
 
 
401 aa  54.3  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2969  hypothetical protein  25.51 
 
 
402 aa  53.9  0.000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2987  phosphoribosylglycinamide synthetase  26.44 
 
 
410 aa  53.5  0.000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.0000000000875543  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1164  protein of unknown function DUF201  23.86 
 
 
437 aa  53.1  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5090  hypothetical protein  21.14 
 
 
453 aa  52.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5770  hypothetical protein  21.14 
 
 
453 aa  52.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0282385 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2428  protein of unknown function DUF201  24.56 
 
 
402 aa  52  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.281403  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7725  hypothetical protein  23.26 
 
 
411 aa  51.6  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.10668  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4500  Cysteine synthase  28.77 
 
 
756 aa  51.6  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.632569  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6391  phosphoribosylglycinamide synthetase  29.35 
 
 
403 aa  51.6  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.782672  normal  0.167257 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4069  phosphoribosylglycinamide synthetase ATP-grasp domain-containing protein  23.73 
 
 
389 aa  50.4  0.00008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001066  vibrioferrin ligase/carboxylase protein PvsA  30.28 
 
 
403 aa  50.4  0.00009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5882  phosphoribosylglycinamide synthetase  28.49 
 
 
403 aa  49.7  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.47867 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37420  biotin carboxylase  24.81 
 
 
405 aa  48.9  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.442231 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5518  phosphoribosylglycinamide synthetase  28.49 
 
 
403 aa  49.7  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.398662  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0721  hypothetical protein  26.87 
 
 
402 aa  48.5  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.446517 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3136  putative siderophore biosynthesis protein  26.34 
 
 
388 aa  47.8  0.0006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3748  protein of unknown function DUF201  29.53 
 
 
388 aa  47.8  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.277412  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4648  protein of unknown function DUF201  26 
 
 
404 aa  47.4  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.896666  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0730  hypothetical protein  22.86 
 
 
436 aa  46.6  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0194  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain-containing protein ATP-grasp  25.56 
 
 
419 aa  46.2  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.296569  normal  0.160479 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2026  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  24.55 
 
 
423 aa  46.6  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1432  hypothetical protein  26 
 
 
424 aa  45.8  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.502147  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2663  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  26.48 
 
 
413 aa  45.8  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4786  hypothetical protein  24.55 
 
 
398 aa  45.4  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2646  argininosuccinate lyase  25.81 
 
 
904 aa  45.8  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2507  argininosuccinate lyase  25.81 
 
 
912 aa  45.8  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1119  phosphoribosylamine--glycine ligase  22.73 
 
 
421 aa  44.7  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.624592 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2070  carbamoyl phosphate synthase large subunit  25 
 
 
1029 aa  44.7  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2668  phosphoribosylglycinamide synthetase  27.78 
 
 
415 aa  44.3  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1396  argininosuccinate lyase  25.27 
 
 
926 aa  44.3  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2122  argininosuccinate lyase  25.27 
 
 
894 aa  43.9  0.007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3192  argininosuccinate lyase  25.27 
 
 
924 aa  44.3  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.655648  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1620  argininosuccinate lyase  25.27 
 
 
896 aa  43.9  0.007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2560  argininosuccinate lyase  25.27 
 
 
904 aa  43.9  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22630  biotin carboxylase  28.24 
 
 
333 aa  43.9  0.009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.405302 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4275  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  25.63 
 
 
1124 aa  43.5  0.01  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.40687  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>