More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1295 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_2980  phosphoribosylamine/glycine ligase  72.96 
 
 
430 aa  646    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1295  phosphoribosylamine/glycine ligase  100 
 
 
427 aa  842    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.058661  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1688  phosphoribosylamine/glycine ligase  73.13 
 
 
430 aa  633  1e-180  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0506  phosphoribosylamine/glycine ligase  73.6 
 
 
430 aa  621  1e-177  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.437456  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2316  phosphoribosylamine/glycine ligase  73.42 
 
 
446 aa  619  1e-176  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.306508 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3513  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.76 
 
 
433 aa  431  1e-120  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.697778 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2359  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.42 
 
 
430 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.110333 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1056  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.38 
 
 
432 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1000  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.62 
 
 
430 aa  398  1e-109  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.14412  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0840  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.53 
 
 
427 aa  387  1e-106  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.464676 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1100  phosphoribosylamine/glycine ligase  45.89 
 
 
442 aa  375  1e-103  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0363235  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0518  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.92 
 
 
444 aa  375  1e-103  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.604563  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1390  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.37 
 
 
444 aa  374  1e-102  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1246  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.15 
 
 
444 aa  370  1e-101  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1112  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.32 
 
 
432 aa  366  1e-100  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0316  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.69 
 
 
430 aa  360  3e-98  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.412175  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1379  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.18 
 
 
443 aa  358  9.999999999999999e-98  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1322  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.18 
 
 
445 aa  356  3.9999999999999996e-97  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1638  phosphoribosylamine-glycine ligase  43.02 
 
 
439 aa  330  3e-89  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1645  phosphoribosylamine-glycine ligase  43.02 
 
 
439 aa  328  8e-89  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0663  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.32 
 
 
490 aa  254  2.0000000000000002e-66  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11500  phosphoribosylamine--glycine ligase  38.99 
 
 
430 aa  235  9e-61  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.089244  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0036  phosphoribosylamine/glycine ligase  39.22 
 
 
430 aa  235  9e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1140  phosphoribosylamine--glycine ligase  37.74 
 
 
430 aa  229  5e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0264  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.41 
 
 
430 aa  227  3e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.46971  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2122  phosphoribosylamine--glycine ligase  40 
 
 
435 aa  226  7e-58  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17671  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.12 
 
 
434 aa  224  2e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0911  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.27 
 
 
434 aa  222  9.999999999999999e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0526  phosphoribosylamine--glycine ligase  35.88 
 
 
419 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1601  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.04 
 
 
413 aa  218  2e-55  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1774  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.58 
 
 
428 aa  216  5e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000323466  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0551  phosphoribosylamine--glycine ligase  38.1 
 
 
435 aa  216  5.9999999999999996e-55  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0459  phosphoribosylamine--glycine ligase  33.79 
 
 
429 aa  212  7.999999999999999e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0386  Phosphoribosylamine--glycine ligase  39.71 
 
 
410 aa  212  9e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0880  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.17 
 
 
422 aa  212  1e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1444  phosphoribosylamine/glycine ligase  33.33 
 
 
420 aa  212  1e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1696  phosphoribosylamine/glycine ligase  33.63 
 
 
479 aa  211  2e-53  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1628  phosphoribosylamine--glycine ligase  38.34 
 
 
425 aa  211  2e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0058  phosphoribosylamine--glycine ligase  37.19 
 
 
420 aa  211  2e-53  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1532  phosphoribosylamine/glycine ligase  35.63 
 
 
423 aa  211  3e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.612843  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0170  phosphoribosylamine/glycine ligase  39.18 
 
 
420 aa  210  3e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.133071  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1907  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.57 
 
 
478 aa  210  3e-53  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.059952  normal  0.308867 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0328  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.12 
 
 
423 aa  210  4e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0274  phosphoribosylamine--glycine ligase  33.65 
 
 
423 aa  210  4e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0286  phosphoribosylamine--glycine ligase  33.65 
 
 
423 aa  209  7e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0299  phosphoribosylamine--glycine ligase  33.65 
 
 
423 aa  209  7e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0331  phosphoribosylamine--glycine ligase  33.41 
 
 
423 aa  209  8e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4975  phosphoribosylamine--glycine ligase  33.95 
 
 
423 aa  209  8e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0372  phosphoribosylamine--glycine ligase  33.89 
 
 
423 aa  208  1e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27830  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.36 
 
 
421 aa  209  1e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0345  phosphoribosylamine--glycine ligase  33.65 
 
 
423 aa  209  1e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4636  phosphoribosylamine/glycine ligase  37.62 
 
 
416 aa  208  1e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.728715  normal  0.385617 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0127  phosphoribosylamine/glycine ligase  35.53 
 
 
413 aa  208  2e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0271  phosphoribosylamine--glycine ligase  33.41 
 
 
423 aa  208  2e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0925  phosphoribosylamine--glycine ligase  37.17 
 
 
433 aa  208  2e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13941  phosphoribosylamine--glycine ligase  33.33 
 
 
446 aa  207  3e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.144546  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0145  phosphoribosylamine--glycine ligase  33.97 
 
 
419 aa  207  3e-52  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000216858  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0106  phosphoribosylamine--glycine ligase  35.16 
 
 
478 aa  207  3e-52  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0907034  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35150  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.79 
 
 
429 aa  206  5e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0280  phosphoribosylamine--glycine ligase  33.49 
 
 
423 aa  206  6e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1034  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.4 
 
 
423 aa  206  7e-52  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0278  phosphoribosylamine--glycine ligase  32.7 
 
 
423 aa  205  1e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1908  phosphoribosylamine/glycine ligase  35.55 
 
 
420 aa  204  3e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2261  phosphoribosylamine--glycine ligase  35.55 
 
 
420 aa  204  3e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0043  phosphoribosylamine--glycine ligase  35.8 
 
 
421 aa  202  7e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0991  phosphoribosylamine--glycine ligase  35.22 
 
 
425 aa  202  7e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1400  phosphoribosylamine--glycine ligase  38.04 
 
 
420 aa  201  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0279  phosphoribosylamine/glycine ligase  38.04 
 
 
417 aa  201  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3467  phosphoribosylamine--glycine ligase  33.72 
 
 
423 aa  201  3e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0197  phosphoribosylamine/glycine ligase  38.37 
 
 
415 aa  201  3e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4370  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.88 
 
 
436 aa  200  3e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.766514 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3379  phosphoribosylamine--glycine ligase  35.76 
 
 
414 aa  200  3e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.104647 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1245  phosphoribosylamine--glycine ligase  32.3 
 
 
419 aa  199  7e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.495633  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4039  phosphoribosylamine/glycine ligase  33.68 
 
 
423 aa  199  7e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.324775  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3997  phosphoribosylamine/glycine ligase  33.68 
 
 
423 aa  199  7e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4544  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.49 
 
 
428 aa  199  9e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.185185 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1347  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.69 
 
 
417 aa  199  1.0000000000000001e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.207795  normal  0.112273 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3600  phosphoribosylamine/glycine ligase  38.11 
 
 
433 aa  197  2.0000000000000003e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0519  phosphoribosylamine/glycine ligase  34.18 
 
 
415 aa  198  2.0000000000000003e-49  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.941545  normal  0.807449 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1983  phosphoribosylamine--glycine ligase  32.8 
 
 
477 aa  197  3e-49  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.601261  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15411  phosphoribosylglycinamide synthetase  30.84 
 
 
443 aa  197  4.0000000000000005e-49  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  decreased coverage  0.000363118  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1338  phosphoribosylamine--glycine ligase  33.73 
 
 
430 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23090  phosphoribosylamine--glycine ligase  32.56 
 
 
425 aa  196  8.000000000000001e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.121893  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1969  phosphoribosylamine--glycine ligase  33.49 
 
 
433 aa  196  8.000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.949647 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3871  phosphoribosylamine--glycine ligase  35.43 
 
 
435 aa  196  8.000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.485049  normal  0.0530756 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3013  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.13 
 
 
424 aa  196  1e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1894  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.98 
 
 
481 aa  195  1e-48  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2180  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.34 
 
 
419 aa  195  1e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.900628  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0026  phosphoribosylamine/glycine ligase  33.02 
 
 
704 aa  195  1e-48  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2759  phosphoribosylamine--glycine ligase  33.88 
 
 
424 aa  195  1e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000179977  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4327  phosphoribosylamine--glycine ligase  35.68 
 
 
431 aa  195  1e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.101605  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2552  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.75 
 
 
426 aa  194  2e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0177333  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1729  phosphoribosylamine--glycine ligase  33.49 
 
 
430 aa  194  2e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.576125 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0134  phosphoribosylamine--glycine ligase  38.07 
 
 
416 aa  194  2e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.415315  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6903  phosphoribosylamine/glycine ligase  36.19 
 
 
419 aa  194  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2413  phosphoribosylamine/glycine ligase  35.1 
 
 
436 aa  194  3e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.545734  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0208  phosphoribosylamine--glycine ligase  37.71 
 
 
439 aa  194  3e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.428663 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3175  phosphoribosylamine--glycine ligase  35.76 
 
 
418 aa  193  4e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3149  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.03 
 
 
433 aa  194  4e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.868678  normal  0.802626 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2189  phosphoribosylamine--glycine ligase  35.59 
 
 
477 aa  193  5e-48  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>