More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1983 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1696  phosphoribosylamine/glycine ligase  63.47 
 
 		 479 aa  649    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1983  phosphoribosylamine--glycine ligase  100 
 
 		 477 aa  972    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.601261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0663  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.04 
 
 		 490 aa  392  1e-108  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0106  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.95 
 
 		 478 aa  340  4e-92  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0907034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1907  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.71 
 
 		 478 aa  340  5e-92  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.059952  normal  0.308867 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2189  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.82 
 
 		 477 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1894  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.94 
 
 		 481 aa  316  5e-85  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0518  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.2 
 
 		 444 aa  271  2e-71  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.604563  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1390  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.64 
 
 		 444 aa  270  5e-71  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1246  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.01 
 
 		 444 aa  268  2e-70  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1322  phosphoribosylamine--glycine ligase  37.95 
 
 		 445 aa  266  5e-70  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1379  phosphoribosylamine--glycine ligase  37.72 
 
 		 443 aa  265  1e-69  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3513  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.76 
 
 		 433 aa  253  7e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.697778 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1100  phosphoribosylamine/glycine ligase  38.41 
 
 		 442 aa  252  1e-65  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0363235  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0316  phosphoribosylamine--glycine ligase  35.49 
 
 		 430 aa  241  2e-62  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.412175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1112  phosphoribosylamine--glycine ligase  35.7 
 
 		 432 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1638  phosphoribosylamine-glycine ligase  33.48 
 
 		 439 aa  236  7e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1000  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.98 
 
 		 430 aa  235  2.0000000000000002e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.14412  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1645  phosphoribosylamine-glycine ligase  33.71 
 
 		 439 aa  234  3e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2359  phosphoribosylamine--glycine ligase  35.59 
 
 		 430 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.110333 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1688  phosphoribosylamine/glycine ligase  33.91 
 
 		 430 aa  224  3e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0840  phosphoribosylamine--glycine ligase  32.96 
 
 		 427 aa  222  9e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.464676 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2980  phosphoribosylamine/glycine ligase  34.55 
 
 		 430 aa  219  7e-56  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0526  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.15 
 
 		 419 aa  206  5e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1056  phosphoribosylamine--glycine ligase  32.33 
 
 		 432 aa  206  7e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0026  phosphoribosylamine/glycine ligase  33.33 
 
 		 704 aa  200  3.9999999999999996e-50  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1295  phosphoribosylamine/glycine ligase  33.58 
 
 		 427 aa  196  9e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.058661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0036  phosphoribosylamine/glycine ligase  34.55 
 
 		 430 aa  195  1e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0345  phosphoribosylamine--glycine ligase  31.57 
 
 		 423 aa  194  3e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1034  phosphoribosylamine--glycine ligase  33.18 
 
 		 423 aa  193  5e-48  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4613  phosphoribosylamine--glycine ligase  29.8 
 
 		 431 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.302277 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0274  phosphoribosylamine--glycine ligase  31.1 
 
 		 423 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0471  phosphoribosylamine--glycine ligase  33.5 
 
 		 423 aa  191  4e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0271  phosphoribosylamine--glycine ligase  30.6 
 
 		 423 aa  190  5e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0331  phosphoribosylamine--glycine ligase  30.6 
 
 		 423 aa  190  5e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1412  phosphoribosylamine--glycine ligase  32.96 
 
 		 422 aa  190  5e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.8215  normal  0.900094 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0535  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.54 
 
 		 427 aa  190  5e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.201111 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23090  phosphoribosylamine--glycine ligase  30.86 
 
 		 425 aa  190  5e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.121893  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0960  phosphoribosylamine--glycine ligase  31.9 
 
 		 426 aa  189  7e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0280  phosphoribosylamine--glycine ligase  30.82 
 
 		 423 aa  189  7e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0264  phosphoribosylamine--glycine ligase  32.44 
 
 		 430 aa  189  8e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.46971  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4975  phosphoribosylamine--glycine ligase  31.98 
 
 		 423 aa  189  8e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4698  phosphoribosylamine--glycine ligase  30.84 
 
 		 430 aa  189  1e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.744432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1400  phosphoribosylamine--glycine ligase  33.56 
 
 		 420 aa  189  1e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27830  phosphoribosylamine--glycine ligase  32.52 
 
 		 421 aa  189  1e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4876  phosphoribosylamine--glycine ligase  30.84 
 
 		 431 aa  189  1e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0372  phosphoribosylamine--glycine ligase  31.1 
 
 		 423 aa  189  1e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0328  phosphoribosylamine--glycine ligase  31.1 
 
 		 423 aa  188  2e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0286  phosphoribosylamine--glycine ligase  30.38 
 
 		 423 aa  188  2e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0299  phosphoribosylamine--glycine ligase  30.38 
 
 		 423 aa  188  2e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0278  phosphoribosylamine--glycine ligase  32.39 
 
 		 423 aa  188  2e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1774  phosphoribosylamine--glycine ligase  32.81 
 
 		 428 aa  188  2e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000323466  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4823  phosphoribosylamine--glycine ligase  30.61 
 
 		 431 aa  187  3e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0578  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.22 
 
 		 425 aa  187  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0506  phosphoribosylamine/glycine ligase  32.04 
 
 		 430 aa  186  5e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.437456  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1107  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  32.1 
 
 		 1631 aa  186  9e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11500  phosphoribosylamine--glycine ligase  32.36 
 
 		 430 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.089244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15011  phosphoribosylglycinamide synthetase  31.06 
 
 		 445 aa  185  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2316  phosphoribosylamine/glycine ligase  31.43 
 
 		 446 aa  185  2.0000000000000003e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.306508 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1628  phosphoribosylamine--glycine ligase  31.38 
 
 		 425 aa  185  2.0000000000000003e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00211  phosphoribosylamine--glycine ligase  29.61 
 
 		 429 aa  184  3e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0529  phosphoribosylamine--glycine ligase  30.61 
 
 		 429 aa  184  3e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.863272  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15411  phosphoribosylglycinamide synthetase  31.52 
 
 		 443 aa  183  5.0000000000000004e-45  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  decreased coverage  0.000363118  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4039  phosphoribosylamine/glycine ligase  31.22 
 
 		 423 aa  183  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.324775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3997  phosphoribosylamine/glycine ligase  31.22 
 
 		 423 aa  183  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2843  phosphoribosylamine--glycine ligase  31.83 
 
 		 430 aa  183  7e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.294227  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1427  phosphoribosylamine--glycine ligase  30.6 
 
 		 591 aa  183  7e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0414  phosphoribosylamine--glycine ligase  31.05 
 
 		 427 aa  182  1e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.31965  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0519  phosphoribosylamine/glycine ligase  31.12 
 
 		 415 aa  182  1e-44  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.941545  normal  0.807449 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0422  phosphoribosylamine--glycine ligase  30.81 
 
 		 427 aa  181  2e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2361  phosphoribosylamine--glycine ligase  30.22 
 
 		 422 aa  182  2e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002184  phosphoribosylamine--glycine ligase  30.33 
 
 		 429 aa  181  2.9999999999999997e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.25624  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1999  phosphoribosylamine--glycine ligase  29.09 
 
 		 429 aa  181  2.9999999999999997e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00638776  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0647  phosphoribosylamine--glycine ligase  32.39 
 
 		 426 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0115748  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2342  phosphoribosylamine/glycine ligase  32.28 
 
 		 428 aa  180  4.999999999999999e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.51337  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3451  phosphoribosylamine--glycine ligase  28.93 
 
 		 428 aa  180  4.999999999999999e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.264337  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0127  phosphoribosylamine/glycine ligase  32.88 
 
 		 413 aa  179  7e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1480  phosphoribosylamine/glycine ligase  31.45 
 
 		 419 aa  179  8e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2652  phosphoribosylamine--glycine ligase  29.37 
 
 		 429 aa  179  1e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0880  phosphoribosylamine--glycine ligase  31.9 
 
 		 422 aa  179  1e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1626  phosphoribosylamine--glycine ligase  31.24 
 
 		 432 aa  179  1e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0612  phosphoribosylamine--glycine ligase  31.52 
 
 		 430 aa  179  1e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000692344  hitchhiker  0.00000110971 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64220  phosphoribosylamine--glycine ligase  30.02 
 
 		 429 aa  179  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.88359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5964  phosphoribosylamine/glycine ligase  32.26 
 
 		 428 aa  178  2e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.262465 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1532  phosphoribosylamine/glycine ligase  32.21 
 
 		 423 aa  178  2e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.612843  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0838  phosphoribosylamine--glycine ligase  31.13 
 
 		 425 aa  177  3e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.083606  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1140  phosphoribosylamine--glycine ligase  33.04 
 
 		 430 aa  177  3e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0058  phosphoribosylamine--glycine ligase  30.61 
 
 		 420 aa  177  3e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0707  phosphoribosylamine--glycine ligase  31.08 
 
 		 429 aa  177  3e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15261  phosphoribosylglycinamide synthetase  32.21 
 
 		 443 aa  176  7e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.56284  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1969  phosphoribosylamine--glycine ligase  31.54 
 
 		 433 aa  176  8e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.949647 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5575  phosphoribosylamine--glycine ligase  30.02 
 
 		 429 aa  176  8e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1041  phosphoribosylamine--glycine ligase  31.29 
 
 		 424 aa  176  9e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.714358  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0170  phosphoribosylamine/glycine ligase  32.51 
 
 		 420 aa  176  9e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.133071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1729  phosphoribosylamine--glycine ligase  30.84 
 
 		 430 aa  176  9e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.576125 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0424  phosphoribosylamine--glycine ligase  30.8 
 
 		 426 aa  176  9.999999999999999e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1777  phosphoribosylamine/glycine ligase  34.99 
 
 		 428 aa  175  9.999999999999999e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0459  phosphoribosylamine--glycine ligase  32.02 
 
 		 429 aa  175  9.999999999999999e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0172  phosphoribosylamine--glycine ligase  32.45 
 
 		 429 aa  174  1.9999999999999998e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0266  phosphoribosylamine--glycine ligase  29.61 
 
 		 427 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000213794  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>