More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_1907 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_1907  phosphoribosylamine--glycine ligase  100 
 
 		 478 aa  949    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.059952  normal  0.308867 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0106  phosphoribosylamine--glycine ligase  83.47 
 
 		 478 aa  841    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0907034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1894  phosphoribosylamine--glycine ligase  66.94 
 
 		 481 aa  632  1e-180  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2189  phosphoribosylamine--glycine ligase  67.44 
 
 		 477 aa  629  1e-179  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0663  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.28 
 
 		 490 aa  445  1.0000000000000001e-124  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1696  phosphoribosylamine/glycine ligase  41.91 
 
 		 479 aa  345  8.999999999999999e-94  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1983  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.71 
 
 		 477 aa  340  5e-92  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.601261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1322  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.84 
 
 		 445 aa  276  5e-73  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0518  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.18 
 
 		 444 aa  261  3e-68  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.604563  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1246  phosphoribosylamine--glycine ligase  37.33 
 
 		 444 aa  259  9e-68  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1390  phosphoribosylamine--glycine ligase  35.75 
 
 		 444 aa  258  1e-67  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1379  phosphoribosylamine--glycine ligase  35.2 
 
 		 443 aa  248  1e-64  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2359  phosphoribosylamine--glycine ligase  37.97 
 
 		 430 aa  244  3.9999999999999997e-63  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.110333 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3513  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.7 
 
 		 433 aa  239  5.999999999999999e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.697778 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1000  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.05 
 
 		 430 aa  239  5.999999999999999e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.14412  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1100  phosphoribosylamine/glycine ligase  36.82 
 
 		 442 aa  239  1e-61  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0363235  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1688  phosphoribosylamine/glycine ligase  37.09 
 
 		 430 aa  234  3e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1645  phosphoribosylamine-glycine ligase  34.42 
 
 		 439 aa  230  4e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2980  phosphoribosylamine/glycine ligase  36.12 
 
 		 430 aa  230  4e-59  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1638  phosphoribosylamine-glycine ligase  34.42 
 
 		 439 aa  229  6e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0840  phosphoribosylamine--glycine ligase  35.39 
 
 		 427 aa  229  6e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.464676 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1056  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.22 
 
 		 432 aa  228  1e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1112  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.42 
 
 		 432 aa  223  4e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0316  phosphoribosylamine--glycine ligase  33.48 
 
 		 430 aa  223  8e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.412175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0506  phosphoribosylamine/glycine ligase  35.36 
 
 		 430 aa  209  6e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.437456  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2316  phosphoribosylamine/glycine ligase  34.48 
 
 		 446 aa  202  1.9999999999999998e-50  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.306508 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1295  phosphoribosylamine/glycine ligase  36.57 
 
 		 427 aa  201  1.9999999999999998e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.058661  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0264  phosphoribosylamine--glycine ligase  33.33 
 
 		 430 aa  189  1e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.46971  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1532  phosphoribosylamine/glycine ligase  32.72 
 
 		 423 aa  188  2e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.612843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1140  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.64 
 
 		 430 aa  187  3e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1722  phosphoribosylamine--glycine ligase  33.41 
 
 		 425 aa  186  6e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0610  phosphoribosylamine--glycine ligase  31.88 
 
 		 423 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00101284  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1774  phosphoribosylamine--glycine ligase  32.04 
 
 		 428 aa  184  3e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000323466  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0529  phosphoribosylamine--glycine ligase  31.11 
 
 		 429 aa  181  2e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.863272  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0555  phosphoribosylamine--glycine ligase  29.36 
 
 		 424 aa  181  2e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0372  phosphoribosylamine--glycine ligase  30.21 
 
 		 423 aa  180  4e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0676  phosphoribosylamine--glycine ligase  31.11 
 
 		 416 aa  180  4.999999999999999e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1628  phosphoribosylamine--glycine ligase  33.26 
 
 		 425 aa  180  5.999999999999999e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23090  phosphoribosylamine--glycine ligase  30.95 
 
 		 425 aa  179  9e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.121893  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0271  phosphoribosylamine--glycine ligase  29.98 
 
 		 423 aa  179  1e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0127  phosphoribosylamine/glycine ligase  32.41 
 
 		 413 aa  179  1e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0719  phosphoribosylamine--glycine ligase  32.03 
 
 		 426 aa  179  1e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.63678  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0678  phosphoribosylamine--glycine ligase  29.82 
 
 		 416 aa  178  2e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0331  phosphoribosylamine--glycine ligase  29.75 
 
 		 423 aa  177  3e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0345  phosphoribosylamine--glycine ligase  30.28 
 
 		 423 aa  177  3e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4975  phosphoribosylamine--glycine ligase  30.43 
 
 		 423 aa  177  3e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4544  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.85 
 
 		 428 aa  177  4e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.185185 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2180  phosphoribosylamine--glycine ligase  30.25 
 
 		 419 aa  177  4e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.900628  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0036  phosphoribosylamine/glycine ligase  31.11 
 
 		 430 aa  177  4e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0328  phosphoribosylamine--glycine ligase  29.75 
 
 		 423 aa  177  5e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1699  phosphoribosylamine--glycine ligase  30.65 
 
 		 427 aa  176  7e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.251383  normal  0.989876 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0274  phosphoribosylamine--glycine ligase  29.98 
 
 		 423 aa  176  9e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2361  phosphoribosylamine--glycine ligase  30.5 
 
 		 422 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0526  phosphoribosylamine--glycine ligase  30.72 
 
 		 419 aa  176  9.999999999999999e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11500  phosphoribosylamine--glycine ligase  30.87 
 
 		 430 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.089244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1999  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.32 
 
 		 429 aa  175  1.9999999999999998e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00638776  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0280  phosphoribosylamine--glycine ligase  29.79 
 
 		 423 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27830  phosphoribosylamine--glycine ligase  31.11 
 
 		 421 aa  173  5e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2122  phosphoribosylamine--glycine ligase  32.41 
 
 		 435 aa  173  5.999999999999999e-42  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3845  phosphoribosylamine--glycine ligase  31.35 
 
 		 423 aa  173  5.999999999999999e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000183828  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0286  phosphoribosylamine--glycine ligase  29.75 
 
 		 423 aa  173  6.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0299  phosphoribosylamine--glycine ligase  29.75 
 
 		 423 aa  173  6.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1427  phosphoribosylamine--glycine ligase  30.3 
 
 		 591 aa  172  9e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0911  phosphoribosylamine--glycine ligase  28.18 
 
 		 434 aa  172  1e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0422  phosphoribosylamine--glycine ligase  30.48 
 
 		 427 aa  172  1e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2759  phosphoribosylamine--glycine ligase  30.25 
 
 		 424 aa  172  1e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000179977  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0612  phosphoribosylamine--glycine ligase  33.87 
 
 		 430 aa  172  1e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000692344  hitchhiker  0.00000110971 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0735  phosphoribosylamine/glycine ligase  31.6 
 
 		 425 aa  172  2e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.525706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3379  phosphoribosylamine--glycine ligase  30.3 
 
 		 414 aa  171  2e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.104647 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1416  phosphoribosylamine/glycine ligase  29.63 
 
 		 413 aa  171  2e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000507728  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15261  phosphoribosylglycinamide synthetase  28.83 
 
 		 443 aa  172  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.56284  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1245  phosphoribosylamine--glycine ligase  29.1 
 
 		 419 aa  171  3e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.495633  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17671  phosphoribosylamine--glycine ligase  27.95 
 
 		 434 aa  171  3e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0756  phosphoribosylamine/glycine ligase  32.18 
 
 		 424 aa  170  5e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.721746  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0026  phosphoribosylamine/glycine ligase  30.89 
 
 		 704 aa  170  6e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0414  phosphoribosylamine--glycine ligase  30.48 
 
 		 427 aa  169  8e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.31965  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3149  phosphoribosylamine--glycine ligase  32.87 
 
 		 433 aa  169  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.868678  normal  0.802626 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0619  phosphoribosylamine--glycine ligase  30.41 
 
 		 427 aa  169  1e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.374111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0401  phosphoribosylamine/glycine ligase  31.25 
 
 		 428 aa  169  1e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000120381  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2552  phosphoribosylamine--glycine ligase  31.42 
 
 		 426 aa  168  2e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0177333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13941  phosphoribosylamine--glycine ligase  28.38 
 
 		 446 aa  168  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.144546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0535  phosphoribosylamine--glycine ligase  31.11 
 
 		 427 aa  168  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.201111 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0960  phosphoribosylamine--glycine ligase  29.26 
 
 		 426 aa  167  2.9999999999999998e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2231  phosphoribosylamine--glycine ligase  30.88 
 
 		 423 aa  167  4e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0279  phosphoribosylamine/glycine ligase  31.42 
 
 		 417 aa  167  4e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1444  phosphoribosylamine/glycine ligase  29.16 
 
 		 420 aa  167  4e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0578  phosphoribosylamine--glycine ligase  31.57 
 
 		 425 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2904  phosphoribosylamine--glycine ligase  30.8 
 
 		 423 aa  166  6.9999999999999995e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000288348  normal  0.785686 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1412  phosphoribosylamine--glycine ligase  31.12 
 
 		 422 aa  166  8e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.8215  normal  0.900094 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0296  phosphoribosylamine--glycine ligase  29.68 
 
 		 426 aa  166  9e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0172  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.01 
 
 		 429 aa  166  1.0000000000000001e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2591  phosphoribosylamine--glycine ligase  30.11 
 
 		 423 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3457  phosphoribosylamine--glycine ligase  30.5 
 
 		 423 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.021302  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1488  phosphoribosylamine--glycine ligase  35.48 
 
 		 420 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0278  phosphoribosylamine--glycine ligase  28.57 
 
 		 423 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0551  phosphoribosylamine--glycine ligase  32.35 
 
 		 435 aa  165  2.0000000000000002e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1480  phosphoribosylamine/glycine ligase  29.95 
 
 		 419 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0360  Phosphoribosylamine--glycine ligase  31.74 
 
 		 430 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3219  phosphoribosylamine--glycine ligase  31.88 
 
 		 429 aa  165  2.0000000000000002e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.708681 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15411  phosphoribosylglycinamide synthetase  27.33 
 
 		 443 aa  165  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  decreased coverage  0.000363118  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>