More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_1100 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_1100  phosphoribosylamine/glycine ligase  100 
 
 
442 aa  890    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0363235  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1390  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.38 
 
 
444 aa  434  1e-120  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0518  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.38 
 
 
444 aa  432  1e-120  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.604563  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1322  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.91 
 
 
445 aa  430  1e-119  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1246  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.93 
 
 
444 aa  427  1e-118  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1379  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.35 
 
 
443 aa  422  1e-117  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1000  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.5 
 
 
430 aa  424  1e-117  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.14412  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0840  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.86 
 
 
427 aa  415  9.999999999999999e-116  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.464676 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3513  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.32 
 
 
433 aa  416  9.999999999999999e-116  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.697778 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2359  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.94 
 
 
430 aa  396  1e-109  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.110333 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0316  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.11 
 
 
430 aa  395  1e-109  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.412175  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1112  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.64 
 
 
432 aa  392  1e-108  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2980  phosphoribosylamine/glycine ligase  47.73 
 
 
430 aa  389  1e-107  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1688  phosphoribosylamine/glycine ligase  45.93 
 
 
430 aa  384  1e-105  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1056  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.7 
 
 
432 aa  379  1e-104  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1645  phosphoribosylamine-glycine ligase  45.54 
 
 
439 aa  372  1e-102  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1638  phosphoribosylamine-glycine ligase  45.76 
 
 
439 aa  373  1e-102  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0506  phosphoribosylamine/glycine ligase  44.32 
 
 
430 aa  365  1e-100  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.437456  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1295  phosphoribosylamine/glycine ligase  45.89 
 
 
427 aa  362  5.0000000000000005e-99  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.058661  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2316  phosphoribosylamine/glycine ligase  45.49 
 
 
446 aa  361  1e-98  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.306508 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1628  phosphoribosylamine--glycine ligase  37.73 
 
 
425 aa  268  1e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0663  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.01 
 
 
490 aa  258  1e-67  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1532  phosphoribosylamine/glycine ligase  35.7 
 
 
423 aa  253  4.0000000000000004e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.612843  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1983  phosphoribosylamine--glycine ligase  38.41 
 
 
477 aa  252  9.000000000000001e-66  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.601261  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0526  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.72 
 
 
419 aa  249  5e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1696  phosphoribosylamine/glycine ligase  36.32 
 
 
479 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1907  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.82 
 
 
478 aa  239  1e-61  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.059952  normal  0.308867 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1034  phosphoribosylamine--glycine ligase  35.99 
 
 
423 aa  234  2.0000000000000002e-60  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0106  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.9 
 
 
478 aa  231  2e-59  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0907034  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3467  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.19 
 
 
423 aa  231  3e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0264  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.32 
 
 
430 aa  230  3e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.46971  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1444  phosphoribosylamine/glycine ligase  36.95 
 
 
420 aa  229  6e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0197  phosphoribosylamine/glycine ligase  35.43 
 
 
415 aa  228  1e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1140  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.18 
 
 
430 aa  228  2e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23090  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.56 
 
 
425 aa  228  2e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.121893  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0026  phosphoribosylamine/glycine ligase  34.87 
 
 
704 aa  227  3e-58  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2361  phosphoribosylamine--glycine ligase  33.87 
 
 
422 aa  227  3e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3457  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.72 
 
 
423 aa  226  9e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.021302  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35150  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.76 
 
 
429 aa  224  2e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3523  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.26 
 
 
423 aa  223  4e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0437232 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2904  phosphoribosylamine--glycine ligase  33.64 
 
 
423 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000288348  normal  0.785686 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0610  phosphoribosylamine--glycine ligase  33.33 
 
 
423 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00101284  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0221  phosphoribosylamine/glycine ligase  33.42 
 
 
427 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.529077 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0127  phosphoribosylamine/glycine ligase  33.72 
 
 
413 aa  220  3e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3149  phosphoribosylamine--glycine ligase  35.32 
 
 
433 aa  221  3e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.868678  normal  0.802626 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3845  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.56 
 
 
423 aa  220  3.9999999999999997e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000183828  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2189  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.27 
 
 
477 aa  219  6e-56  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1704  phosphoribosylamine--glycine ligase  32.12 
 
 
428 aa  219  1e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.382123  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0519  phosphoribosylamine/glycine ligase  35.63 
 
 
415 aa  218  1e-55  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.941545  normal  0.807449 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1899  phosphoribosylamine--glycine ligase  32.27 
 
 
428 aa  218  1e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.543102  normal  0.253787 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1245  phosphoribosylamine--glycine ligase  35.65 
 
 
419 aa  218  2e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.495633  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0170  phosphoribosylamine/glycine ligase  33.33 
 
 
420 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.133071  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11500  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.54 
 
 
430 aa  216  5e-55  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.089244  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3871  phosphoribosylamine--glycine ligase  33.03 
 
 
435 aa  216  7e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.485049  normal  0.0530756 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4180  phosphoribosylamine/glycine ligase  32.8 
 
 
435 aa  216  8e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.94163  normal  0.510323 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0459  phosphoribosylamine--glycine ligase  33.93 
 
 
429 aa  215  9.999999999999999e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0619  phosphoribosylamine--glycine ligase  35.57 
 
 
427 aa  215  1.9999999999999998e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.374111  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4636  phosphoribosylamine/glycine ligase  33.8 
 
 
416 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.728715  normal  0.385617 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0735  phosphoribosylamine/glycine ligase  33.95 
 
 
425 aa  214  2.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.525706  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0036  phosphoribosylamine/glycine ligase  35.03 
 
 
430 aa  214  2.9999999999999995e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1894  phosphoribosylamine--glycine ligase  35.5 
 
 
481 aa  213  7e-54  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0991  phosphoribosylamine--glycine ligase  33.8 
 
 
425 aa  213  7e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3202  phosphoribosylamine--glycine ligase  33.03 
 
 
426 aa  213  7e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.462795  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2453  phosphoribosylamine--glycine ligase  32.95 
 
 
424 aa  213  7.999999999999999e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.386914  normal  0.350843 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0529  phosphoribosylamine--glycine ligase  33.25 
 
 
429 aa  212  9e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.863272  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27830  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.2 
 
 
421 aa  212  1e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2180  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.95 
 
 
419 aa  212  1e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.900628  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3013  phosphoribosylamine--glycine ligase  33.72 
 
 
424 aa  212  1e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2759  phosphoribosylamine--glycine ligase  32.87 
 
 
424 aa  212  1e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000179977  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1540  phosphoribosylamine/glycine ligase  33.49 
 
 
433 aa  211  2e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.427577  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0278  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.48 
 
 
423 aa  211  3e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0286  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.04 
 
 
423 aa  210  4e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0299  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.04 
 
 
423 aa  210  4e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0331  phosphoribosylamine--glycine ligase  33.57 
 
 
423 aa  210  4e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1300  phosphoribosylamine--glycine ligase  32.05 
 
 
432 aa  210  5e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.617554  normal  0.088058 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1412  phosphoribosylamine--glycine ligase  35 
 
 
422 aa  209  7e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.8215  normal  0.900094 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0880  phosphoribosylamine--glycine ligase  33.72 
 
 
422 aa  209  7e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0372  phosphoribosylamine--glycine ligase  33.25 
 
 
423 aa  209  7e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3379  phosphoribosylamine--glycine ligase  31.33 
 
 
414 aa  209  8e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.104647 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1777  phosphoribosylamine/glycine ligase  30.75 
 
 
428 aa  209  9e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0271  phosphoribosylamine--glycine ligase  33.57 
 
 
423 aa  209  1e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN00440  purine nucleotide biosynthesis-related protein, putative  32.67 
 
 
802 aa  209  1e-52  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2231  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.1 
 
 
423 aa  209  1e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1601  phosphoribosylamine--glycine ligase  33.86 
 
 
413 aa  208  1e-52  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0328  phosphoribosylamine--glycine ligase  33.02 
 
 
423 aa  207  2e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0134  phosphoribosylamine--glycine ligase  33.41 
 
 
416 aa  207  3e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.415315  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0231  phosphoribosylamine--glycine ligase  35 
 
 
425 aa  207  3e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.595549  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1400  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.16 
 
 
420 aa  207  3e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4327  phosphoribosylamine--glycine ligase  32.56 
 
 
431 aa  207  4e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.101605  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0555  phosphoribosylamine--glycine ligase  33.87 
 
 
424 aa  206  5e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0274  phosphoribosylamine--glycine ligase  33.33 
 
 
423 aa  206  5e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2591  phosphoribosylamine--glycine ligase  31.94 
 
 
423 aa  206  5e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0401  phosphoribosylamine/glycine ligase  31.4 
 
 
428 aa  206  6e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000120381  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4975  phosphoribosylamine--glycine ligase  33.57 
 
 
423 aa  206  7e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3260  phosphoribosylamine--glycine ligase  31.81 
 
 
432 aa  206  8e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.207571  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0280  phosphoribosylamine--glycine ligase  33.57 
 
 
423 aa  206  9e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0345  phosphoribosylamine--glycine ligase  33.1 
 
 
423 aa  205  1e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1729  phosphoribosylamine--glycine ligase  33.41 
 
 
430 aa  205  1e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.576125 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2552  phosphoribosylamine--glycine ligase  33.18 
 
 
426 aa  204  2e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0177333  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2065  phosphoribosylamine--glycine ligase  31.9 
 
 
425 aa  205  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.19426 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>