More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0840 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_0840  phosphoribosylamine--glycine ligase  100 
 
 		 427 aa  872    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.464676 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1000  phosphoribosylamine--glycine ligase  68.38 
 
 		 430 aa  590  1e-167  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.14412  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2359  phosphoribosylamine--glycine ligase  65.57 
 
 		 430 aa  578  1e-164  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.110333 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0316  phosphoribosylamine--glycine ligase  60.98 
 
 		 430 aa  533  1e-150  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.412175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1112  phosphoribosylamine--glycine ligase  61.18 
 
 		 432 aa  509  1e-143  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3513  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.47 
 
 		 433 aa  455  1e-127  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.697778 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1056  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.58 
 
 		 432 aa  440  9.999999999999999e-123  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1322  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.23 
 
 		 445 aa  416  9.999999999999999e-116  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1100  phosphoribosylamine/glycine ligase  48.86 
 
 		 442 aa  415  9.999999999999999e-116  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0363235  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2980  phosphoribosylamine/glycine ligase  49.88 
 
 		 430 aa  403  1e-111  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1379  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.29 
 
 		 443 aa  400  9.999999999999999e-111  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1688  phosphoribosylamine/glycine ligase  49.07 
 
 		 430 aa  395  1e-109  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0518  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.15 
 
 		 444 aa  390  1e-107  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.604563  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1390  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.38 
 
 		 444 aa  391  1e-107  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1246  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.61 
 
 		 444 aa  390  1e-107  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1295  phosphoribosylamine/glycine ligase  49.53 
 
 		 427 aa  375  1e-103  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.058661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0506  phosphoribosylamine/glycine ligase  48.25 
 
 		 430 aa  376  1e-103  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.437456  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1638  phosphoribosylamine-glycine ligase  46.21 
 
 		 439 aa  365  1e-100  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1645  phosphoribosylamine-glycine ligase  45.98 
 
 		 439 aa  363  3e-99  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2316  phosphoribosylamine/glycine ligase  48.21 
 
 		 446 aa  362  9e-99  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.306508 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1628  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.36 
 
 		 425 aa  273  3e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0663  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.81 
 
 		 490 aa  265  2e-69  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0264  phosphoribosylamine--glycine ligase  38.93 
 
 		 430 aa  264  3e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.46971  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1444  phosphoribosylamine/glycine ligase  37.7 
 
 		 420 aa  261  2e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0026  phosphoribosylamine/glycine ligase  38.39 
 
 		 704 aa  258  1e-67  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2759  phosphoribosylamine--glycine ligase  38.8 
 
 		 424 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000179977  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0610  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.21 
 
 		 423 aa  251  1e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00101284  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1140  phosphoribosylamine--glycine ligase  38.69 
 
 		 430 aa  250  3e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0735  phosphoribosylamine/glycine ligase  38.28 
 
 		 425 aa  249  7e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.525706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0058  phosphoribosylamine--glycine ligase  37.94 
 
 		 420 aa  248  1e-64  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0526  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.73 
 
 		 419 aa  248  2e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0286  phosphoribosylamine--glycine ligase  37.32 
 
 		 423 aa  246  6.999999999999999e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0299  phosphoribosylamine--glycine ligase  37.32 
 
 		 423 aa  246  6.999999999999999e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2231  phosphoribosylamine--glycine ligase  37.15 
 
 		 423 aa  245  9e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0345  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.94 
 
 		 423 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1427  phosphoribosylamine--glycine ligase  35.05 
 
 		 591 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0278  phosphoribosylamine--glycine ligase  37.09 
 
 		 423 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0331  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.85 
 
 		 423 aa  243  3e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0459  phosphoribosylamine--glycine ligase  35.4 
 
 		 429 aa  243  3.9999999999999997e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0328  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.47 
 
 		 423 aa  243  5e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0271  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.85 
 
 		 423 aa  243  5e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0280  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.94 
 
 		 423 aa  243  6e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0274  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.62 
 
 		 423 aa  242  1e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2904  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.34 
 
 		 423 aa  241  1e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000288348  normal  0.785686 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0909  phosphoribosylamine--glycine ligase  37.08 
 
 		 432 aa  241  1e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0372  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.24 
 
 		 423 aa  242  1e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3175  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.06 
 
 		 418 aa  241  2e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1347  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.1 
 
 		 417 aa  241  2e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.207795  normal  0.112273 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1034  phosphoribosylamine--glycine ligase  37.18 
 
 		 423 aa  241  2e-62  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0960  phosphoribosylamine/glycine ligase  36.88 
 
 		 430 aa  241  2e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1412  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.26 
 
 		 422 aa  240  2.9999999999999997e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.8215  normal  0.900094 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0360  Phosphoribosylamine--glycine ligase  38.07 
 
 		 430 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4975  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.15 
 
 		 423 aa  239  8e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0619  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.85 
 
 		 427 aa  238  1e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.374111  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1532  phosphoribosylamine/glycine ligase  36.92 
 
 		 423 aa  238  1e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.612843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2043  phosphoribosylamine--glycine ligase  37.12 
 
 		 421 aa  237  4e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.453314 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2361  phosphoribosylamine--glycine ligase  35.9 
 
 		 422 aa  237  4e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2389  phosphoribosylamine--glycine ligase  35.21 
 
 		 422 aa  236  6e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0880  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.47 
 
 		 422 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23090  phosphoribosylamine--glycine ligase  35.65 
 
 		 425 aa  235  1.0000000000000001e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.121893  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0838  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.17 
 
 		 425 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.083606  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2191  phosphoribosylamine--glycine ligase  35.21 
 
 		 422 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1989  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.98 
 
 		 422 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.187802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2692  phosphoribosylamine--glycine ligase  38.41 
 
 		 418 aa  233  4.0000000000000004e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.813213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3451  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.55 
 
 		 428 aa  233  4.0000000000000004e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.264337  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0266  phosphoribosylamine--glycine ligase  35.19 
 
 		 427 aa  233  5e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000213794  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0471  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.82 
 
 		 423 aa  233  7.000000000000001e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1699  phosphoribosylamine--glycine ligase  35.8 
 
 		 427 aa  233  7.000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.251383  normal  0.989876 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3871  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.08 
 
 		 435 aa  232  9e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.485049  normal  0.0530756 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3845  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.58 
 
 		 423 aa  231  1e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000183828  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11500  phosphoribosylamine--glycine ligase  37.35 
 
 		 430 aa  232  1e-59  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.089244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0266  phosphoribosylamine/glycine ligase  35.36 
 
 		 424 aa  231  2e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0172  phosphoribosylamine--glycine ligase  37.67 
 
 		 429 aa  231  3e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1540  phosphoribosylamine/glycine ligase  37.33 
 
 		 433 aa  230  3e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.427577  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0535  phosphoribosylamine--glycine ligase  35.76 
 
 		 427 aa  230  4e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.201111 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1338  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.25 
 
 		 430 aa  230  4e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0043  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.53 
 
 		 421 aa  229  5e-59  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2827  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.97 
 
 		 437 aa  229  5e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000587328  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3379  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.1 
 
 		 414 aa  229  5e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.104647 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1907  phosphoribosylamine--glycine ligase  35.39 
 
 		 478 aa  229  5e-59  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.059952  normal  0.308867 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3523  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.35 
 
 		 423 aa  229  6e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0437232 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1245  phosphoribosylamine--glycine ligase  35.36 
 
 		 419 aa  229  6e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.495633  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2871  phosphoribosylamine/glycine ligase  37.18 
 
 		 449 aa  229  7e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0927595 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0036  phosphoribosylamine/glycine ligase  38.35 
 
 		 430 aa  229  9e-59  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1488  phosphoribosylamine--glycine ligase  40 
 
 		 420 aa  228  1e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3149  phosphoribosylamine--glycine ligase  37.56 
 
 		 433 aa  228  1e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.868678  normal  0.802626 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4180  phosphoribosylamine/glycine ligase  35.61 
 
 		 435 aa  228  1e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.94163  normal  0.510323 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0784  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.98 
 
 		 422 aa  229  1e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.110869  normal  0.244609 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2180  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.64 
 
 		 419 aa  229  1e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.900628  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1999  phosphoribosylamine--glycine ligase  35.35 
 
 		 429 aa  228  1e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00638776  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1480  phosphoribosylamine/glycine ligase  33.18 
 
 		 419 aa  228  2e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1626  phosphoribosylamine--glycine ligase  35.63 
 
 		 432 aa  228  2e-58  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0659  phosphoribosylamine--glycine ligase  35.24 
 
 		 413 aa  227  3e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.80081  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2552  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.43 
 
 		 426 aa  227  3e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0177333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0529  phosphoribosylamine--glycine ligase  35.51 
 
 		 429 aa  227  3e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.863272  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1353  phosphoribosylamine--glycine ligase  33.26 
 
 		 427 aa  226  4e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.2506  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3457  phosphoribosylamine--glycine ligase  33.88 
 
 		 423 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.021302  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3665  phosphoribosylamine--glycine ligase  37.7 
 
 		 428 aa  226  6e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2467  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.71 
 
 		 420 aa  226  7e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0419834  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1400  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.25 
 
 		 420 aa  226  7e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>