More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1112 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_1112  phosphoribosylamine--glycine ligase  100 
 
 
432 aa  893    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2359  phosphoribosylamine--glycine ligase  61.36 
 
 
430 aa  541  9.999999999999999e-153  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.110333 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0840  phosphoribosylamine--glycine ligase  61.18 
 
 
427 aa  528  1e-149  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.464676 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0316  phosphoribosylamine--glycine ligase  61.12 
 
 
430 aa  521  1e-146  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.412175  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1000  phosphoribosylamine--glycine ligase  61.97 
 
 
430 aa  504  1e-141  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.14412  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3513  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.08 
 
 
433 aa  424  1e-117  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.697778 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1056  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.88 
 
 
432 aa  413  1e-114  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1322  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.41 
 
 
445 aa  411  1e-113  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1645  phosphoribosylamine-glycine ligase  50.11 
 
 
439 aa  407  1.0000000000000001e-112  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1638  phosphoribosylamine-glycine ligase  50.11 
 
 
439 aa  407  1.0000000000000001e-112  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1100  phosphoribosylamine/glycine ligase  48.64 
 
 
442 aa  407  1.0000000000000001e-112  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0363235  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0518  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.27 
 
 
444 aa  395  1e-109  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.604563  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1246  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.29 
 
 
444 aa  390  1e-107  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1379  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.91 
 
 
443 aa  391  1e-107  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1390  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.59 
 
 
444 aa  390  1e-107  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1688  phosphoribosylamine/glycine ligase  47.33 
 
 
430 aa  383  1e-105  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2980  phosphoribosylamine/glycine ligase  46.51 
 
 
430 aa  374  1e-102  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1295  phosphoribosylamine/glycine ligase  47.32 
 
 
427 aa  362  5.0000000000000005e-99  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.058661  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0506  phosphoribosylamine/glycine ligase  45.35 
 
 
430 aa  360  4e-98  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.437456  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2316  phosphoribosylamine/glycine ligase  45.09 
 
 
446 aa  355  1e-96  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.306508 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0663  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.52 
 
 
490 aa  260  4e-68  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0264  phosphoribosylamine--glycine ligase  38.08 
 
 
430 aa  257  3e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.46971  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1140  phosphoribosylamine--glycine ligase  38.64 
 
 
430 aa  257  3e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3379  phosphoribosylamine--glycine ligase  37.2 
 
 
414 aa  256  4e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.104647 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1696  phosphoribosylamine/glycine ligase  34.09 
 
 
479 aa  256  6e-67  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0526  phosphoribosylamine--glycine ligase  38.48 
 
 
419 aa  253  5.000000000000001e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3871  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.9 
 
 
435 aa  248  2e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.485049  normal  0.0530756 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3523  phosphoribosylamine--glycine ligase  37.53 
 
 
423 aa  248  2e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0437232 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1532  phosphoribosylamine/glycine ligase  37.53 
 
 
423 aa  246  8e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.612843  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3457  phosphoribosylamine--glycine ligase  37.06 
 
 
423 aa  245  9e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.021302  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1983  phosphoribosylamine--glycine ligase  35.22 
 
 
477 aa  245  9.999999999999999e-64  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.601261  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4180  phosphoribosylamine/glycine ligase  36.67 
 
 
435 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.94163  normal  0.510323 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2591  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.95 
 
 
423 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1427  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.45 
 
 
591 aa  243  3e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1034  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.01 
 
 
423 aa  244  3e-63  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1444  phosphoribosylamine/glycine ligase  36.08 
 
 
420 aa  243  3e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11500  phosphoribosylamine--glycine ligase  38.23 
 
 
430 aa  243  6e-63  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.089244  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2361  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.13 
 
 
422 aa  242  7e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3260  phosphoribosylamine--glycine ligase  35.42 
 
 
432 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.207571  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0036  phosphoribosylamine/glycine ligase  38.44 
 
 
430 aa  241  1e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0026  phosphoribosylamine/glycine ligase  35.99 
 
 
704 aa  241  2e-62  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1300  phosphoribosylamine--glycine ligase  35.19 
 
 
432 aa  240  5e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.617554  normal  0.088058 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2231  phosphoribosylamine--glycine ligase  37.67 
 
 
423 aa  239  6.999999999999999e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23090  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.03 
 
 
425 aa  238  1e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.121893  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0292  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.57 
 
 
427 aa  238  1e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00181025  normal  0.0133648 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1628  phosphoribosylamine--glycine ligase  38.02 
 
 
425 aa  238  2e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1245  phosphoribosylamine--glycine ligase  37.09 
 
 
419 aa  238  2e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.495633  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4327  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.6 
 
 
431 aa  237  3e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.101605  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3845  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.19 
 
 
423 aa  237  3e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000183828  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1412  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.85 
 
 
422 aa  237  4e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.8215  normal  0.900094 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2904  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.05 
 
 
423 aa  236  4e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000288348  normal  0.785686 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0224  phosphoribosylamine--glycine ligase  35.96 
 
 
428 aa  237  4e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0267401  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2212  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.87 
 
 
426 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0372  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.19 
 
 
423 aa  236  6e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2389  phosphoribosylamine--glycine ligase  33.8 
 
 
422 aa  236  7e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4544  phosphoribosylamine--glycine ligase  37.64 
 
 
428 aa  236  8e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.185185 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1907  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.42 
 
 
478 aa  236  9e-61  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.059952  normal  0.308867 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0784  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.27 
 
 
422 aa  235  9e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.110869  normal  0.244609 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0610  phosphoribosylamine--glycine ligase  35.81 
 
 
423 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00101284  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0328  phosphoribosylamine--glycine ligase  35.96 
 
 
423 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1777  phosphoribosylamine/glycine ligase  35.33 
 
 
428 aa  235  1.0000000000000001e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0228  phosphoribosylamine--glycine ligase  35.73 
 
 
428 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0316556  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1989  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.03 
 
 
422 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.187802  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0459  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.51 
 
 
429 aa  235  1.0000000000000001e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1863  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.47 
 
 
442 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.466784  hitchhiker  0.0074915 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1626  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.59 
 
 
432 aa  233  3e-60  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2191  phosphoribosylamine--glycine ligase  33.8 
 
 
422 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0880  phosphoribosylamine--glycine ligase  38.3 
 
 
422 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5622  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.49 
 
 
425 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1969  phosphoribosylamine--glycine ligase  33.64 
 
 
433 aa  233  4.0000000000000004e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.949647 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0386  Phosphoribosylamine--glycine ligase  38.01 
 
 
410 aa  233  4.0000000000000004e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1774  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.88 
 
 
428 aa  233  4.0000000000000004e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000323466  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0274  phosphoribosylamine--glycine ligase  35.73 
 
 
423 aa  233  5e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1384  phosphoribosylamine--glycine ligase  35.09 
 
 
425 aa  233  5e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.563842  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0983  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.49 
 
 
425 aa  233  5e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0720926  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1239  phosphoribosylamine--glycine ligase  35.09 
 
 
425 aa  233  5e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0277108  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0106  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.42 
 
 
478 aa  233  5e-60  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0907034  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4975  phosphoribosylamine--glycine ligase  35.94 
 
 
423 aa  233  6e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38170  phosphoribosylamine--glycine ligase  35.48 
 
 
429 aa  233  7.000000000000001e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1419  phosphoribosylamine--glycine ligase  35.57 
 
 
425 aa  232  8.000000000000001e-60  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0793  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.86 
 
 
425 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.296273  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1230  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.86 
 
 
425 aa  232  9e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0286  phosphoribosylamine--glycine ligase  35.73 
 
 
423 aa  231  1e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1885  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.86 
 
 
425 aa  232  1e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.132048  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0357  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.86 
 
 
425 aa  232  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.659716  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1074  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.86 
 
 
425 aa  232  1e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.497421  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0299  phosphoribosylamine--glycine ligase  35.73 
 
 
423 aa  231  1e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0177  phosphoribosylamine/glycine ligase  37.24 
 
 
429 aa  232  1e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.348487  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0331  phosphoribosylamine--glycine ligase  35.73 
 
 
423 aa  232  1e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0271  phosphoribosylamine--glycine ligase  35.5 
 
 
423 aa  231  2e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3668  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.33 
 
 
425 aa  231  2e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2065  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.49 
 
 
425 aa  231  2e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.19426 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0438  phosphoribosylamine--glycine ligase  35.54 
 
 
430 aa  231  2e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.199076  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1014  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.63 
 
 
425 aa  231  2e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3175  phosphoribosylamine--glycine ligase  35.75 
 
 
418 aa  231  2e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0348  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.89 
 
 
422 aa  231  2e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.6128 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2333  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.64 
 
 
426 aa  231  2e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0928506  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2759  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.19 
 
 
424 aa  231  2e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000179977  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0172  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.98 
 
 
429 aa  231  3e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3467  phosphoribosylamine--glycine ligase  38.23 
 
 
423 aa  230  3e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>