More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2359 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_2359  phosphoribosylamine--glycine ligase  100 
 
 		 430 aa  870    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.110333 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0840  phosphoribosylamine--glycine ligase  65.57 
 
 		 427 aa  578  1e-164  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.464676 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1000  phosphoribosylamine--glycine ligase  66.43 
 
 		 430 aa  549  1e-155  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.14412  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0316  phosphoribosylamine--glycine ligase  61.07 
 
 		 430 aa  519  1e-146  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.412175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1112  phosphoribosylamine--glycine ligase  61.36 
 
 		 432 aa  520  1e-146  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3513  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.96 
 
 		 433 aa  437  1e-121  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.697778 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1056  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.04 
 
 		 432 aa  423  1e-117  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1688  phosphoribosylamine/glycine ligase  50.46 
 
 		 430 aa  406  1.0000000000000001e-112  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2980  phosphoribosylamine/glycine ligase  50.23 
 
 		 430 aa  403  1e-111  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0518  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.29 
 
 		 444 aa  400  9.999999999999999e-111  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.604563  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1100  phosphoribosylamine/glycine ligase  46.94 
 
 		 442 aa  396  1e-109  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0363235  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0506  phosphoribosylamine/glycine ligase  50.46 
 
 		 430 aa  393  1e-108  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.437456  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1295  phosphoribosylamine/glycine ligase  52.42 
 
 		 427 aa  394  1e-108  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.058661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1246  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.06 
 
 		 444 aa  393  1e-108  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1390  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.29 
 
 		 444 aa  393  1e-108  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1322  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.61 
 
 		 445 aa  392  1e-108  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1379  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.89 
 
 		 443 aa  383  1e-105  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1645  phosphoribosylamine-glycine ligase  47.6 
 
 		 439 aa  379  1e-104  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1638  phosphoribosylamine-glycine ligase  47.83 
 
 		 439 aa  381  1e-104  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2316  phosphoribosylamine/glycine ligase  50.55 
 
 		 446 aa  374  1e-102  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.306508 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0264  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.93 
 
 		 430 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.46971  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1140  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.5 
 
 		 430 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0526  phosphoribosylamine--glycine ligase  37.91 
 
 		 419 aa  265  8e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0663  phosphoribosylamine--glycine ligase  35.01 
 
 		 490 aa  265  1e-69  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11500  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.59 
 
 		 430 aa  264  2e-69  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.089244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1628  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.51 
 
 		 425 aa  263  4e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1245  phosphoribosylamine--glycine ligase  38.21 
 
 		 419 aa  260  3e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.495633  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1480  phosphoribosylamine/glycine ligase  35.81 
 
 		 419 aa  258  1e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2361  phosphoribosylamine--glycine ligase  38.19 
 
 		 422 aa  257  3e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2759  phosphoribosylamine--glycine ligase  38.28 
 
 		 424 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000179977  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1444  phosphoribosylamine/glycine ligase  39.53 
 
 		 420 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1532  phosphoribosylamine/glycine ligase  39.39 
 
 		 423 aa  254  3e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.612843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2904  phosphoribosylamine--glycine ligase  38.57 
 
 		 423 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000288348  normal  0.785686 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0026  phosphoribosylamine/glycine ligase  38.62 
 
 		 704 aa  252  8.000000000000001e-66  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0360  Phosphoribosylamine--glycine ligase  39.49 
 
 		 430 aa  250  3e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0459  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.09 
 
 		 429 aa  251  3e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0610  phosphoribosylamine--glycine ligase  37.35 
 
 		 423 aa  249  7e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00101284  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1427  phosphoribosylamine--glycine ligase  37.53 
 
 		 591 aa  248  1e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3467  phosphoribosylamine--glycine ligase  38.08 
 
 		 423 aa  248  2e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0345  phosphoribosylamine--glycine ligase  37.74 
 
 		 423 aa  248  2e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0274  phosphoribosylamine--glycine ligase  37.41 
 
 		 423 aa  247  3e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2231  phosphoribosylamine--glycine ligase  37.7 
 
 		 423 aa  246  4e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0036  phosphoribosylamine/glycine ligase  39.12 
 
 		 430 aa  246  4e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23090  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.18 
 
 		 425 aa  246  4.9999999999999997e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.121893  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0372  phosphoribosylamine--glycine ligase  37.26 
 
 		 423 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1347  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.43 
 
 		 417 aa  246  4.9999999999999997e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.207795  normal  0.112273 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1540  phosphoribosylamine/glycine ligase  40.6 
 
 		 433 aa  246  6e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.427577  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0328  phosphoribosylamine--glycine ligase  37.03 
 
 		 423 aa  245  9e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2591  phosphoribosylamine--glycine ligase  37.7 
 
 		 423 aa  245  9e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0286  phosphoribosylamine--glycine ligase  37.18 
 
 		 423 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4037  phosphoribosylamine--glycine ligase  37.24 
 
 		 432 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0299  phosphoribosylamine--glycine ligase  37.18 
 
 		 423 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0419  phosphoribosylamine--glycine ligase  37.39 
 
 		 432 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2180  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.98 
 
 		 419 aa  244  1.9999999999999999e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.900628  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0266  phosphoribosylamine/glycine ligase  35.98 
 
 		 424 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0271  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.71 
 
 		 423 aa  243  3e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1907  phosphoribosylamine--glycine ligase  37.97 
 
 		 478 aa  244  3e-63  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.059952  normal  0.308867 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0735  phosphoribosylamine/glycine ligase  39.21 
 
 		 425 aa  244  3e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.525706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0280  phosphoribosylamine--glycine ligase  37.03 
 
 		 423 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0331  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.71 
 
 		 423 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1777  phosphoribosylamine/glycine ligase  37.24 
 
 		 428 aa  243  3.9999999999999997e-63  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3841  phosphoribosylamine--glycine ligase  37.39 
 
 		 432 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.111405 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3914  phosphoribosylamine--glycine ligase  37.24 
 
 		 432 aa  243  7e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4975  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.94 
 
 		 423 aa  241  1e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1696  phosphoribosylamine/glycine ligase  34.39 
 
 		 479 aa  241  2e-62  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1753  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.45 
 
 		 437 aa  241  2e-62  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.528627  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4544  phosphoribosylamine--glycine ligase  38.94 
 
 		 428 aa  241  2e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.185185 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1999  phosphoribosylamine--glycine ligase  37.56 
 
 		 429 aa  241  2e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00638776  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0659  phosphoribosylamine--glycine ligase  35.95 
 
 		 413 aa  240  2.9999999999999997e-62  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.80081  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3523  phosphoribosylamine--glycine ligase  35.43 
 
 		 423 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0437232 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3845  phosphoribosylamine--glycine ligase  35.81 
 
 		 423 aa  240  4e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000183828  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0434  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.53 
 
 		 424 aa  240  4e-62  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3402  phosphoribosylamine--glycine ligase  37.01 
 
 		 432 aa  239  6.999999999999999e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1034  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.7 
 
 		 423 aa  239  9e-62  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2342  phosphoribosylamine/glycine ligase  36.41 
 
 		 428 aa  239  9e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.51337  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1412  phosphoribosylamine--glycine ligase  38.12 
 
 		 422 aa  238  1e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.8215  normal  0.900094 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0441  phosphoribosylamine--glycine ligase  37.16 
 
 		 432 aa  238  1e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3457  phosphoribosylamine--glycine ligase  35.2 
 
 		 423 aa  239  1e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.021302  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0278  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.85 
 
 		 423 aa  238  1e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1729  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.7 
 
 		 430 aa  239  1e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.576125 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0465  phosphoribosylamine--glycine ligase  37.01 
 
 		 435 aa  238  2e-61  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0431  phosphoribosylamine--glycine ligase  37.18 
 
 		 433 aa  238  2e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3871  phosphoribosylamine--glycine ligase  37.12 
 
 		 435 aa  238  2e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.485049  normal  0.0530756 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1774  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.43 
 
 		 428 aa  238  2e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000323466  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3149  phosphoribosylamine--glycine ligase  38.04 
 
 		 433 aa  237  3e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.868678  normal  0.802626 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2827  phosphoribosylamine--glycine ligase  37.39 
 
 		 437 aa  237  3e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000587328  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3465  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.74 
 
 		 456 aa  237  3e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0221  phosphoribosylamine/glycine ligase  37.76 
 
 		 427 aa  237  4e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.529077 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4180  phosphoribosylamine/glycine ligase  36.88 
 
 		 435 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.94163  normal  0.510323 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0106  phosphoribosylamine--glycine ligase  38.13 
 
 		 478 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0907034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00211  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.55 
 
 		 429 aa  236  8e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2043  phosphoribosylamine--glycine ligase  38.43 
 
 		 421 aa  236  8e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.453314 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0348  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.92 
 
 		 422 aa  235  9e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.6128 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0880  phosphoribosylamine--glycine ligase  38.56 
 
 		 422 aa  235  9e-61  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0719  phosphoribosylamine--glycine ligase  38.64 
 
 		 426 aa  235  9e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.63678  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0127  phosphoribosylamine/glycine ligase  37.68 
 
 		 413 aa  235  9e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3379  phosphoribosylamine--glycine ligase  37.53 
 
 		 414 aa  235  1.0000000000000001e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.104647 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002184  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.64 
 
 		 429 aa  235  1.0000000000000001e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.25624  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0471  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.32 
 
 		 423 aa  235  1.0000000000000001e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1338  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.18 
 
 		 430 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>