More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_1379 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0518  phosphoribosylamine--glycine ligase  82.58 
 
 
444 aa  745    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.604563  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1322  phosphoribosylamine--glycine ligase  75.57 
 
 
445 aa  684    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1390  phosphoribosylamine--glycine ligase  83.71 
 
 
444 aa  751    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1246  phosphoribosylamine--glycine ligase  83.03 
 
 
444 aa  747    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1379  phosphoribosylamine--glycine ligase  100 
 
 
443 aa  885    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3513  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.35 
 
 
433 aa  435  1e-121  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.697778 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1100  phosphoribosylamine/glycine ligase  51.35 
 
 
442 aa  422  1e-117  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0363235  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1056  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.44 
 
 
432 aa  421  1e-116  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0840  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.29 
 
 
427 aa  400  9.999999999999999e-111  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.464676 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0316  phosphoribosylamine--glycine ligase  50 
 
 
430 aa  387  1e-106  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.412175  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2359  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.89 
 
 
430 aa  383  1e-105  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.110333 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1000  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.5 
 
 
430 aa  380  1e-104  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.14412  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1112  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.91 
 
 
432 aa  375  1e-103  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1645  phosphoribosylamine-glycine ligase  46.07 
 
 
439 aa  372  1e-102  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1638  phosphoribosylamine-glycine ligase  46.07 
 
 
439 aa  372  1e-102  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2980  phosphoribosylamine/glycine ligase  45.6 
 
 
430 aa  362  9e-99  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1688  phosphoribosylamine/glycine ligase  43.76 
 
 
430 aa  353  2.9999999999999997e-96  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1295  phosphoribosylamine/glycine ligase  43.18 
 
 
427 aa  345  1e-93  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.058661  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0506  phosphoribosylamine/glycine ligase  43.67 
 
 
430 aa  344  2e-93  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.437456  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2316  phosphoribosylamine/glycine ligase  41.48 
 
 
446 aa  330  4e-89  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.306508 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0663  phosphoribosylamine--glycine ligase  38.97 
 
 
490 aa  274  2.0000000000000002e-72  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1983  phosphoribosylamine--glycine ligase  37.72 
 
 
477 aa  265  1e-69  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.601261  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1696  phosphoribosylamine/glycine ligase  36.92 
 
 
479 aa  259  1e-67  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0526  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.49 
 
 
419 aa  251  3e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1907  phosphoribosylamine--glycine ligase  35.2 
 
 
478 aa  248  1e-64  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.059952  normal  0.308867 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0036  phosphoribosylamine/glycine ligase  37.18 
 
 
430 aa  248  2e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0106  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.2 
 
 
478 aa  245  9.999999999999999e-64  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0907034  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0026  phosphoribosylamine/glycine ligase  35.29 
 
 
704 aa  241  2.9999999999999997e-62  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2904  phosphoribosylamine--glycine ligase  35.29 
 
 
423 aa  239  1e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000288348  normal  0.785686 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1628  phosphoribosylamine--glycine ligase  35.28 
 
 
425 aa  237  3e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2180  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.84 
 
 
419 aa  236  7e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.900628  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0459  phosphoribosylamine--glycine ligase  35.46 
 
 
429 aa  236  7e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1245  phosphoribosylamine--glycine ligase  35.55 
 
 
419 aa  235  1.0000000000000001e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.495633  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0610  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.17 
 
 
423 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00101284  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1999  phosphoribosylamine--glycine ligase  33.11 
 
 
429 aa  233  5e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00638776  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2361  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.93 
 
 
422 aa  232  1e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0431  phosphoribosylamine--glycine ligase  33.26 
 
 
433 aa  232  1e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0264  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.01 
 
 
430 aa  231  1e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.46971  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2189  phosphoribosylamine--glycine ligase  35.33 
 
 
477 aa  231  2e-59  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11500  phosphoribosylamine--glycine ligase  35.47 
 
 
430 aa  230  3e-59  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.089244  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1444  phosphoribosylamine/glycine ligase  35.02 
 
 
420 aa  231  3e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1894  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.48 
 
 
481 aa  229  1e-58  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0440  phosphoribosylamine--glycine ligase  33.71 
 
 
432 aa  228  2e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3219  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.01 
 
 
429 aa  228  2e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.708681 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002184  phosphoribosylamine--glycine ligase  33.11 
 
 
429 aa  227  3e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.25624  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1532  phosphoribosylamine/glycine ligase  33.18 
 
 
423 aa  227  3e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.612843  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1140  phosphoribosylamine--glycine ligase  35.39 
 
 
430 aa  225  1e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0444  phosphoribosylamine--glycine ligase  33.48 
 
 
432 aa  225  1e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2231  phosphoribosylamine--glycine ligase  35 
 
 
423 aa  224  2e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1034  phosphoribosylamine--glycine ligase  35.89 
 
 
423 aa  224  3e-57  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3523  phosphoribosylamine--glycine ligase  33.11 
 
 
423 aa  224  3e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0437232 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3845  phosphoribosylamine--glycine ligase  33.49 
 
 
423 aa  223  4.9999999999999996e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000183828  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3585  phosphoribosylamine--glycine ligase  33.48 
 
 
432 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2591  phosphoribosylamine--glycine ligase  32.41 
 
 
423 aa  223  6e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2113  phosphoribosylamine/glycine ligase  37.44 
 
 
416 aa  222  9e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000276572  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00211  phosphoribosylamine--glycine ligase  32.81 
 
 
429 aa  222  9.999999999999999e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1774  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.68 
 
 
428 aa  222  9.999999999999999e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000323466  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3457  phosphoribosylamine--glycine ligase  32.88 
 
 
423 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.021302  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3149  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.28 
 
 
433 aa  221  9.999999999999999e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.868678  normal  0.802626 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0441  phosphoribosylamine--glycine ligase  33.33 
 
 
432 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0295  phosphoribosylamine--glycine ligase  31.82 
 
 
430 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1338  phosphoribosylamine--glycine ligase  32.13 
 
 
430 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0328  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.93 
 
 
423 aa  221  3e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0492  phosphoribosylamine--glycine ligase  31.99 
 
 
433 aa  220  3e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1427  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.09 
 
 
591 aa  220  5e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3175  phosphoribosylamine--glycine ligase  31.8 
 
 
418 aa  219  5e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4037  phosphoribosylamine--glycine ligase  33.33 
 
 
432 aa  219  7e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3914  phosphoribosylamine--glycine ligase  33.33 
 
 
432 aa  219  7.999999999999999e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4975  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.83 
 
 
423 aa  219  7.999999999999999e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0372  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.47 
 
 
423 aa  219  8.999999999999998e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2652  phosphoribosylamine--glycine ligase  33.26 
 
 
429 aa  219  1e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3841  phosphoribosylamine--glycine ligase  33.33 
 
 
432 aa  218  1e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.111405 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0532  phosphoribosylamine--glycine ligase  33.11 
 
 
426 aa  219  1e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0419  phosphoribosylamine--glycine ligase  33.33 
 
 
432 aa  218  2e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2759  phosphoribosylamine--glycine ligase  32.57 
 
 
424 aa  216  5e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000179977  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0529  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.25 
 
 
429 aa  216  5e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.863272  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0443  phosphoribosylamine--glycine ligase  31.97 
 
 
430 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.201644 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2318  phosphoribosylamine--glycine ligase  32.35 
 
 
426 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.57608 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0331  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.7 
 
 
423 aa  216  7e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1989  phosphoribosylamine--glycine ligase  31.74 
 
 
422 aa  216  7e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.187802  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1412  phosphoribosylamine--glycine ligase  33.87 
 
 
422 aa  216  7e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.8215  normal  0.900094 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4327  phosphoribosylamine--glycine ligase  33.18 
 
 
431 aa  216  7e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.101605  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2389  phosphoribosylamine--glycine ligase  31.74 
 
 
422 aa  216  8e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2295  phosphoribosylamine--glycine ligase  32.58 
 
 
426 aa  216  8e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3402  phosphoribosylamine--glycine ligase  32.89 
 
 
432 aa  216  8e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0345  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.02 
 
 
423 aa  216  9e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0519  phosphoribosylamine/glycine ligase  34.86 
 
 
415 aa  216  9e-55  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.941545  normal  0.807449 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0286  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.47 
 
 
423 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0299  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.47 
 
 
423 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27830  phosphoribosylamine--glycine ligase  33.86 
 
 
421 aa  215  9.999999999999999e-55  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0360  Phosphoribosylamine--glycine ligase  32.58 
 
 
430 aa  215  9.999999999999999e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0274  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.47 
 
 
423 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2843  phosphoribosylamine--glycine ligase  32.88 
 
 
430 aa  214  1.9999999999999998e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.294227  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23090  phosphoribosylamine--glycine ligase  33.33 
 
 
425 aa  214  1.9999999999999998e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.121893  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1729  phosphoribosylamine--glycine ligase  32.43 
 
 
430 aa  215  1.9999999999999998e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.576125 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2988  phosphoribosylamine--glycine ligase  32.58 
 
 
428 aa  214  2.9999999999999995e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0880  phosphoribosylamine--glycine ligase  35.55 
 
 
422 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1683  phosphoribosylamine--glycine ligase  32.58 
 
 
426 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.138512  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0266  phosphoribosylamine/glycine ligase  32.19 
 
 
424 aa  213  3.9999999999999995e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3458  phosphoribosylamine--glycine ligase  32.95 
 
 
423 aa  213  3.9999999999999995e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>