More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1894 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_1907  phosphoribosylamine--glycine ligase  66.94 
 
 		 478 aa  647    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.059952  normal  0.308867 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2189  phosphoribosylamine--glycine ligase  70.38 
 
 		 477 aa  657    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1894  phosphoribosylamine--glycine ligase  100 
 
 		 481 aa  951    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0106  phosphoribosylamine--glycine ligase  66.74 
 
 		 478 aa  648    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0907034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0663  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.02 
 
 		 490 aa  451  1e-125  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1696  phosphoribosylamine/glycine ligase  42.36 
 
 		 479 aa  346  4e-94  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1983  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.94 
 
 		 477 aa  324  2e-87  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.601261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1322  phosphoribosylamine--glycine ligase  35.59 
 
 		 445 aa  238  2e-61  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1379  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.48 
 
 		 443 aa  237  3e-61  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0840  phosphoribosylamine--glycine ligase  35.28 
 
 		 427 aa  229  7e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.464676 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1390  phosphoribosylamine--glycine ligase  35.41 
 
 		 444 aa  229  9e-59  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0518  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.79 
 
 		 444 aa  228  2e-58  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.604563  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1246  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.62 
 
 		 444 aa  225  2e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3513  phosphoribosylamine--glycine ligase  35.14 
 
 		 433 aa  223  7e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.697778 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2980  phosphoribosylamine/glycine ligase  36.32 
 
 		 430 aa  221  1.9999999999999999e-56  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2359  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.4 
 
 		 430 aa  220  5e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.110333 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1688  phosphoribosylamine/glycine ligase  36.62 
 
 		 430 aa  219  1e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0506  phosphoribosylamine/glycine ligase  38.37 
 
 		 430 aa  218  2e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.437456  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1100  phosphoribosylamine/glycine ligase  35.5 
 
 		 442 aa  218  2.9999999999999998e-55  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0363235  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1112  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.76 
 
 		 432 aa  216  8e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1000  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.5 
 
 		 430 aa  215  9.999999999999999e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.14412  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1645  phosphoribosylamine-glycine ligase  35.5 
 
 		 439 aa  214  1.9999999999999998e-54  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1638  phosphoribosylamine-glycine ligase  35.28 
 
 		 439 aa  213  5.999999999999999e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2316  phosphoribosylamine/glycine ligase  36.38 
 
 		 446 aa  207  3e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.306508 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1295  phosphoribosylamine/glycine ligase  38.41 
 
 		 427 aa  202  9.999999999999999e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.058661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1056  phosphoribosylamine--glycine ligase  33.77 
 
 		 432 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0316  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.72 
 
 		 430 aa  194  3e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.412175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0026  phosphoribosylamine/glycine ligase  33.33 
 
 		 704 aa  186  7e-46  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0036  phosphoribosylamine/glycine ligase  33.94 
 
 		 430 aa  185  2.0000000000000003e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0526  phosphoribosylamine--glycine ligase  31.66 
 
 		 419 aa  182  1e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23090  phosphoribosylamine--glycine ligase  32.05 
 
 		 425 aa  181  2.9999999999999997e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.121893  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1427  phosphoribosylamine--glycine ligase  33.19 
 
 		 591 aa  180  5.999999999999999e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11500  phosphoribosylamine--glycine ligase  32.14 
 
 		 430 aa  179  7e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.089244  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0610  phosphoribosylamine--glycine ligase  31.89 
 
 		 423 aa  179  9e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00101284  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2180  phosphoribosylamine--glycine ligase  31.58 
 
 		 419 aa  176  7e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.900628  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0274  phosphoribosylamine--glycine ligase  31.91 
 
 		 423 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1444  phosphoribosylamine/glycine ligase  29.59 
 
 		 420 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1628  phosphoribosylamine--glycine ligase  33.56 
 
 		 425 aa  174  2.9999999999999996e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0271  phosphoribosylamine--glycine ligase  31.15 
 
 		 423 aa  173  5.999999999999999e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0264  phosphoribosylamine--glycine ligase  31.37 
 
 		 430 aa  173  5.999999999999999e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.46971  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1532  phosphoribosylamine/glycine ligase  35 
 
 		 423 aa  173  5.999999999999999e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.612843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0676  phosphoribosylamine--glycine ligase  29.93 
 
 		 416 aa  173  7.999999999999999e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3302  phosphoribosylamine--glycine ligase  30.89 
 
 		 422 aa  172  9e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0635766 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0331  phosphoribosylamine--glycine ligase  30.91 
 
 		 423 aa  172  1e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0555  phosphoribosylamine--glycine ligase  29.84 
 
 		 424 aa  172  1e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0127  phosphoribosylamine/glycine ligase  33.26 
 
 		 413 aa  171  2e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0280  phosphoribosylamine--glycine ligase  31.45 
 
 		 423 aa  171  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0279  phosphoribosylamine/glycine ligase  33.78 
 
 		 417 aa  172  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4975  phosphoribosylamine--glycine ligase  31.69 
 
 		 423 aa  171  3e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15011  phosphoribosylglycinamide synthetase  27.85 
 
 		 445 aa  171  3e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0735  phosphoribosylamine/glycine ligase  32.06 
 
 		 425 aa  171  4e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.525706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1722  phosphoribosylamine--glycine ligase  31.97 
 
 		 425 aa  170  4e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1245  phosphoribosylamine--glycine ligase  30.66 
 
 		 419 aa  170  7e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.495633  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0372  phosphoribosylamine--glycine ligase  31.46 
 
 		 423 aa  169  8e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3379  phosphoribosylamine--glycine ligase  32.05 
 
 		 414 aa  169  9e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.104647 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0345  phosphoribosylamine--glycine ligase  30.41 
 
 		 423 aa  169  1e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0286  phosphoribosylamine--glycine ligase  30.91 
 
 		 423 aa  168  2e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3457  phosphoribosylamine--glycine ligase  31.98 
 
 		 423 aa  168  2e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.021302  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0299  phosphoribosylamine--glycine ligase  30.91 
 
 		 423 aa  168  2e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3149  phosphoribosylamine--glycine ligase  33.87 
 
 		 433 aa  168  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.868678  normal  0.802626 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0401  phosphoribosylamine/glycine ligase  31.75 
 
 		 428 aa  168  2e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000120381  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1999  phosphoribosylamine--glycine ligase  32.88 
 
 		 429 aa  168  2e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00638776  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1156  phosphoribosylamine--glycine ligase  31.39 
 
 		 415 aa  167  5e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1134  phosphoribosylamine--glycine ligase  31.39 
 
 		 415 aa  167  5e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1946  phosphoribosylamine--glycine ligase  31.97 
 
 		 420 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0479651 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0678  phosphoribosylamine--glycine ligase  29.25 
 
 		 416 aa  166  5.9999999999999996e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27830  phosphoribosylamine--glycine ligase  33.71 
 
 		 421 aa  166  6.9999999999999995e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0278  phosphoribosylamine--glycine ligase  30.45 
 
 		 423 aa  166  8e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1140  phosphoribosylamine--glycine ligase  33.41 
 
 		 430 aa  166  8e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0328  phosphoribosylamine--glycine ligase  30.93 
 
 		 423 aa  166  9e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2904  phosphoribosylamine--glycine ligase  32.2 
 
 		 423 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000288348  normal  0.785686 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0224  phosphoribosylamine--glycine ligase  31.44 
 
 		 428 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0267401  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3523  phosphoribosylamine--glycine ligase  31.76 
 
 		 423 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0437232 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2759  phosphoribosylamine--glycine ligase  31.35 
 
 		 424 aa  164  3e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000179977  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13941  phosphoribosylamine--glycine ligase  28.64 
 
 		 446 aa  164  4.0000000000000004e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.144546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002184  phosphoribosylamine--glycine ligase  31.53 
 
 		 429 aa  164  4.0000000000000004e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.25624  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4544  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.68 
 
 		 428 aa  164  4.0000000000000004e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.185185 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17671  phosphoribosylamine--glycine ligase  28.6 
 
 		 434 aa  163  5.0000000000000005e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2591  phosphoribosylamine--glycine ligase  31.12 
 
 		 423 aa  163  6e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3845  phosphoribosylamine--glycine ligase  31.59 
 
 		 423 aa  163  7e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000183828  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1952  phosphoribosylamine--glycine ligase  29.62 
 
 		 427 aa  162  9e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15261  phosphoribosylglycinamide synthetase  26.65 
 
 		 443 aa  162  1e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.56284  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0911  phosphoribosylamine--glycine ligase  28.38 
 
 		 434 aa  162  1e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0228  phosphoribosylamine--glycine ligase  30.98 
 
 		 428 aa  162  1e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0316556  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1034  phosphoribosylamine--glycine ligase  31.29 
 
 		 423 aa  162  1e-38  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0266  phosphoribosylamine--glycine ligase  31.83 
 
 		 427 aa  162  1e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000213794  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2361  phosphoribosylamine--glycine ligase  31.51 
 
 		 422 aa  162  2e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00211  phosphoribosylamine--glycine ligase  31.08 
 
 		 429 aa  161  2e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2323  phosphoribosylamine--glycine ligase  30.84 
 
 		 429 aa  161  2e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.125717  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23300  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.16 
 
 		 433 aa  162  2e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1107  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  27.4 
 
 		 1631 aa  161  3e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0459  phosphoribosylamine--glycine ligase  30.22 
 
 		 429 aa  160  4e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1774  phosphoribosylamine--glycine ligase  29.33 
 
 		 428 aa  160  4e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000323466  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0231  phosphoribosylamine--glycine ligase  29.91 
 
 		 425 aa  160  5e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.595549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1653  phosphoribosylamine--glycine ligase  32.05 
 
 		 427 aa  160  6e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1480  phosphoribosylamine/glycine ligase  29.75 
 
 		 419 aa  160  6e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15411  phosphoribosylglycinamide synthetase  27.11 
 
 		 443 aa  160  6e-38  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  decreased coverage  0.000363118  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0612  phosphoribosylamine--glycine ligase  32.12 
 
 		 430 aa  160  7e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000692344  hitchhiker  0.00000110971 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2728  phosphoribosylamine--glycine ligase  31.95 
 
 		 420 aa  159  8e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0882976  normal  0.135316 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0348  phosphoribosylamine--glycine ligase  30.04 
 
 		 422 aa  159  9e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.6128 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>