More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1688 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_2980  phosphoribosylamine/glycine ligase  85.81 
 
 
430 aa  755    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0506  phosphoribosylamine/glycine ligase  75.35 
 
 
430 aa  661    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.437456  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1688  phosphoribosylamine/glycine ligase  100 
 
 
430 aa  861    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2316  phosphoribosylamine/glycine ligase  73.77 
 
 
446 aa  653    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.306508 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1295  phosphoribosylamine/glycine ligase  73.13 
 
 
427 aa  618  1e-176  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.058661  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1056  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.21 
 
 
432 aa  432  1e-120  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3513  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.83 
 
 
433 aa  424  1e-117  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.697778 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2359  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.46 
 
 
430 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.110333 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1000  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.27 
 
 
430 aa  404  1e-111  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.14412  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0840  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.07 
 
 
427 aa  395  1e-109  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.464676 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1100  phosphoribosylamine/glycine ligase  45.93 
 
 
442 aa  384  1e-105  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0363235  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0316  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.84 
 
 
430 aa  377  1e-103  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.412175  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0518  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.7 
 
 
444 aa  373  1e-102  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.604563  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1112  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.33 
 
 
432 aa  369  1e-101  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1390  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.38 
 
 
444 aa  371  1e-101  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1322  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.37 
 
 
445 aa  367  1e-100  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1246  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.48 
 
 
444 aa  365  1e-99  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1379  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.76 
 
 
443 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1638  phosphoribosylamine-glycine ligase  42.56 
 
 
439 aa  343  4e-93  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1645  phosphoribosylamine-glycine ligase  42.56 
 
 
439 aa  341  2e-92  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11500  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.29 
 
 
430 aa  260  3e-68  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.089244  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0663  phosphoribosylamine--glycine ligase  35.65 
 
 
490 aa  255  1.0000000000000001e-66  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0036  phosphoribosylamine/glycine ligase  39.39 
 
 
430 aa  254  2.0000000000000002e-66  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27830  phosphoribosylamine--glycine ligase  38.08 
 
 
421 aa  242  7e-63  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0880  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.15 
 
 
422 aa  240  4e-62  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0526  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.68 
 
 
419 aa  237  4e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1140  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.24 
 
 
430 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1907  phosphoribosylamine--glycine ligase  37.09 
 
 
478 aa  234  3e-60  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.059952  normal  0.308867 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17671  phosphoribosylamine--glycine ligase  32.25 
 
 
434 aa  232  8.000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1696  phosphoribosylamine/glycine ligase  33.33 
 
 
479 aa  230  3e-59  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0911  phosphoribosylamine--glycine ligase  32.25 
 
 
434 aa  230  4e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1628  phosphoribosylamine--glycine ligase  37.3 
 
 
425 aa  230  4e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1034  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.98 
 
 
423 aa  228  2e-58  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23090  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.66 
 
 
425 aa  227  3e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.121893  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4544  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.03 
 
 
428 aa  226  5.0000000000000005e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.185185 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0274  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.43 
 
 
423 aa  224  2e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0026  phosphoribosylamine/glycine ligase  35.19 
 
 
704 aa  224  2e-57  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0264  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.68 
 
 
430 aa  224  2e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.46971  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0058  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.68 
 
 
420 aa  224  2e-57  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1983  phosphoribosylamine--glycine ligase  33.91 
 
 
477 aa  224  3e-57  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.601261  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0459  phosphoribosylamine--glycine ligase  33.87 
 
 
429 aa  224  3e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1899  phosphoribosylamine--glycine ligase  33.72 
 
 
428 aa  223  4e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.543102  normal  0.253787 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0331  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.67 
 
 
423 aa  222  9e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1704  phosphoribosylamine--glycine ligase  33.49 
 
 
428 aa  222  9.999999999999999e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.382123  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0345  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.2 
 
 
423 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0278  phosphoribosylamine--glycine ligase  35.38 
 
 
423 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0280  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.2 
 
 
423 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0271  phosphoribosylamine--glycine ligase  33.96 
 
 
423 aa  220  3e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4975  phosphoribosylamine--glycine ligase  33.79 
 
 
423 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0145  phosphoribosylamine--glycine ligase  33.73 
 
 
419 aa  219  6e-56  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000216858  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3522  phosphoribosylamine--glycine ligase  33.88 
 
 
427 aa  218  1e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.366295  normal  0.0471361 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0551  phosphoribosylamine--glycine ligase  35.13 
 
 
435 aa  218  1e-55  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2692  phosphoribosylamine--glycine ligase  38.79 
 
 
418 aa  218  1e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.813213  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1601  phosphoribosylamine--glycine ligase  32.77 
 
 
413 aa  218  1e-55  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3467  phosphoribosylamine--glycine ligase  35.05 
 
 
423 aa  218  1e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13941  phosphoribosylamine--glycine ligase  32.16 
 
 
446 aa  218  2e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.144546  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1540  phosphoribosylamine/glycine ligase  34.78 
 
 
433 aa  218  2e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.427577  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3202  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.42 
 
 
426 aa  218  2e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.462795  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0286  phosphoribosylamine--glycine ligase  33.96 
 
 
423 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0372  phosphoribosylamine--glycine ligase  33.96 
 
 
423 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0299  phosphoribosylamine--glycine ligase  33.96 
 
 
423 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0106  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.88 
 
 
478 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0907034  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0328  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.2 
 
 
423 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2261  phosphoribosylamine--glycine ligase  35.55 
 
 
420 aa  215  9.999999999999999e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2684  phosphoribosylamine/glycine ligase  34.39 
 
 
432 aa  215  9.999999999999999e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0337126  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1908  phosphoribosylamine/glycine ligase  35.55 
 
 
420 aa  215  9.999999999999999e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1400  phosphoribosylamine--glycine ligase  35.15 
 
 
420 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3379  phosphoribosylamine--glycine ligase  33.81 
 
 
414 aa  214  2.9999999999999995e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.104647 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15411  phosphoribosylglycinamide synthetase  31.07 
 
 
443 aa  213  3.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  decreased coverage  0.000363118  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2122  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.89 
 
 
435 aa  213  5.999999999999999e-54  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15261  phosphoribosylglycinamide synthetase  31.07 
 
 
443 aa  213  7e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.56284  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1729  phosphoribosylamine--glycine ligase  32.95 
 
 
430 aa  211  1e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.576125 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1438  phosphoribosylamine--glycine ligase  31.69 
 
 
443 aa  211  1e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1969  phosphoribosylamine--glycine ligase  32.72 
 
 
433 aa  212  1e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.949647 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3175  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.97 
 
 
418 aa  211  2e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06541  phosphoribosylamine-glycine ligase (Eurofung)  31.98 
 
 
809 aa  210  4e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2904  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.19 
 
 
423 aa  210  4e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000288348  normal  0.785686 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0991  phosphoribosylamine--glycine ligase  35.31 
 
 
425 aa  210  4e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2180  phosphoribosylamine--glycine ligase  32.17 
 
 
419 aa  209  6e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.900628  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2361  phosphoribosylamine--glycine ligase  33.64 
 
 
422 aa  209  7e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1532  phosphoribosylamine/glycine ligase  32.86 
 
 
423 aa  209  7e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.612843  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1774  phosphoribosylamine--glycine ligase  32.71 
 
 
428 aa  209  7e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000323466  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1894  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.62 
 
 
481 aa  209  8e-53  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2759  phosphoribosylamine--glycine ligase  32.87 
 
 
424 aa  209  8e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000179977  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1775  phosphoribosylamine/glycine ligase  34.52 
 
 
433 aa  209  9e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.780493 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1401  phosphoribosylamine--glycine ligase  30.89 
 
 
442 aa  208  1e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0221  phosphoribosylamine/glycine ligase  33.49 
 
 
427 aa  208  1e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.529077 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0610  phosphoribosylamine--glycine ligase  32.87 
 
 
423 aa  207  2e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00101284  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0208  phosphoribosylamine--glycine ligase  35.43 
 
 
439 aa  207  2e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.428663 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1245  phosphoribosylamine--glycine ligase  31.22 
 
 
419 aa  208  2e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.495633  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3457  phosphoribosylamine--glycine ligase  32.62 
 
 
423 aa  207  2e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.021302  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3149  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.34 
 
 
433 aa  207  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.868678  normal  0.802626 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4180  phosphoribosylamine/glycine ligase  34.92 
 
 
435 aa  208  2e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.94163  normal  0.510323 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2231  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.66 
 
 
423 aa  207  4e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0043  phosphoribosylamine--glycine ligase  33.17 
 
 
421 aa  206  5e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2552  phosphoribosylamine--glycine ligase  33.88 
 
 
426 aa  206  5e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0177333  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0127  phosphoribosylamine/glycine ligase  33.41 
 
 
413 aa  206  5e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3523  phosphoribosylamine--glycine ligase  32.62 
 
 
423 aa  206  5e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0437232 
 
 
-
 
NC_002936  DET0838  phosphoribosylamine--glycine ligase  33.18 
 
 
425 aa  206  7e-52  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.083606  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2871  phosphoribosylamine/glycine ligase  34.75 
 
 
449 aa  206  8e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0927595 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>