More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3513 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3513  phosphoribosylamine--glycine ligase  100 
 
 		 433 aa  875    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.697778 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1056  phosphoribosylamine--glycine ligase  65.05 
 
 		 432 aa  591  1e-168  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1000  phosphoribosylamine--glycine ligase  54.4 
 
 		 430 aa  459  9.999999999999999e-129  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.14412  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0840  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.47 
 
 		 427 aa  455  1e-127  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.464676 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1322  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.35 
 
 		 445 aa  448  1e-125  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1246  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.58 
 
 		 444 aa  439  9.999999999999999e-123  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2359  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.96 
 
 		 430 aa  437  1e-121  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.110333 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1379  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.35 
 
 		 443 aa  435  1e-121  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0518  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.9 
 
 		 444 aa  433  1e-120  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.604563  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0316  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.81 
 
 		 430 aa  434  1e-120  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.412175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1390  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.46 
 
 		 444 aa  431  1e-119  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2980  phosphoribosylamine/glycine ligase  52.75 
 
 		 430 aa  426  1e-118  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1688  phosphoribosylamine/glycine ligase  51.83 
 
 		 430 aa  424  1e-117  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1645  phosphoribosylamine-glycine ligase  49.77 
 
 		 439 aa  421  1e-117  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1638  phosphoribosylamine-glycine ligase  50 
 
 		 439 aa  422  1e-117  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1295  phosphoribosylamine/glycine ligase  52.76 
 
 		 427 aa  417  9.999999999999999e-116  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.058661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1100  phosphoribosylamine/glycine ligase  49.32 
 
 		 442 aa  416  9.999999999999999e-116  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0363235  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1112  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.08 
 
 		 432 aa  414  1e-114  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0506  phosphoribosylamine/glycine ligase  51.61 
 
 		 430 aa  407  1.0000000000000001e-112  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.437456  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2316  phosphoribosylamine/glycine ligase  50 
 
 		 446 aa  392  1e-108  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.306508 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1628  phosphoribosylamine--glycine ligase  38.19 
 
 		 425 aa  271  2e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0663  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.87 
 
 		 490 aa  270  5e-71  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0026  phosphoribosylamine/glycine ligase  38.94 
 
 		 704 aa  257  3e-67  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2904  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.7 
 
 		 423 aa  256  5e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000288348  normal  0.785686 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2759  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.51 
 
 		 424 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000179977  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1983  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.76 
 
 		 477 aa  253  7e-66  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.601261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2361  phosphoribosylamine--glycine ligase  37.94 
 
 		 422 aa  252  1e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0526  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.21 
 
 		 419 aa  251  1e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0735  phosphoribosylamine/glycine ligase  37.07 
 
 		 425 aa  250  4e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.525706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1140  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.49 
 
 		 430 aa  249  8e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0264  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.49 
 
 		 430 aa  248  1e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.46971  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0610  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.77 
 
 		 423 aa  246  6.999999999999999e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00101284  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1696  phosphoribosylamine/glycine ligase  35.6 
 
 		 479 aa  246  8e-64  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1532  phosphoribosylamine/glycine ligase  36.34 
 
 		 423 aa  245  9.999999999999999e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.612843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0278  phosphoribosylamine--glycine ligase  38.03 
 
 		 423 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1899  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.87 
 
 		 428 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.543102  normal  0.253787 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1245  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.32 
 
 		 419 aa  244  3e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.495633  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1704  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.87 
 
 		 428 aa  243  3.9999999999999997e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.382123  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0036  phosphoribosylamine/glycine ligase  37 
 
 		 430 aa  243  3.9999999999999997e-63  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1774  phosphoribosylamine--glycine ligase  35.09 
 
 		 428 aa  243  5e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000323466  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0345  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.92 
 
 		 423 aa  240  4e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0106  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.3 
 
 		 478 aa  239  5e-62  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0907034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1907  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.7 
 
 		 478 aa  239  5.999999999999999e-62  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.059952  normal  0.308867 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0127  phosphoribosylamine/glycine ligase  35.7 
 
 		 413 aa  239  8e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3202  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.41 
 
 		 426 aa  239  8e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.462795  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0271  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.38 
 
 		 423 aa  238  1e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0331  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.62 
 
 		 423 aa  238  1e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0286  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.85 
 
 		 423 aa  238  2e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1540  phosphoribosylamine/glycine ligase  36.14 
 
 		 433 aa  238  2e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.427577  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0299  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.85 
 
 		 423 aa  238  2e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0459  phosphoribosylamine--glycine ligase  38.7 
 
 		 429 aa  237  3e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3845  phosphoribosylamine--glycine ligase  35.94 
 
 		 423 aa  237  3e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000183828  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4975  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.66 
 
 		 423 aa  237  3e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0328  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.92 
 
 		 423 aa  236  4e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0274  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.38 
 
 		 423 aa  237  4e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0784  phosphoribosylamine--glycine ligase  35.2 
 
 		 422 aa  236  4e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.110869  normal  0.244609 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0372  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.45 
 
 		 423 aa  236  6e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1444  phosphoribosylamine/glycine ligase  34.43 
 
 		 420 aa  235  9e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2389  phosphoribosylamine--glycine ligase  33.18 
 
 		 422 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0471  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.33 
 
 		 423 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0280  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.45 
 
 		 423 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0348  phosphoribosylamine--glycine ligase  35.9 
 
 		 422 aa  234  3e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.6128 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2122  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.67 
 
 		 435 aa  232  7.000000000000001e-60  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11500  phosphoribosylamine--glycine ligase  35.62 
 
 		 430 aa  233  7.000000000000001e-60  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.089244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2180  phosphoribosylamine--glycine ligase  35.13 
 
 		 419 aa  231  1e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.900628  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3522  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.33 
 
 		 427 aa  232  1e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.366295  normal  0.0471361 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0991  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.73 
 
 		 425 aa  231  1e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0555  phosphoribosylamine--glycine ligase  35.42 
 
 		 424 aa  232  1e-59  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1989  phosphoribosylamine--glycine ligase  32.95 
 
 		 422 aa  232  1e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.187802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4024  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.03 
 
 		 430 aa  231  2e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.197328  normal  0.0741894 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1338  phosphoribosylamine--glycine ligase  33.56 
 
 		 430 aa  231  2e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0551  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.74 
 
 		 435 aa  230  4e-59  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1999  phosphoribosylamine--glycine ligase  33.56 
 
 		 429 aa  229  5e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00638776  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3149  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.61 
 
 		 433 aa  229  7e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.868678  normal  0.802626 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3467  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.43 
 
 		 423 aa  229  8e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3379  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.56 
 
 		 414 aa  228  1e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.104647 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1969  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.01 
 
 		 433 aa  229  1e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.949647 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2189  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.05 
 
 		 477 aa  228  1e-58  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3175  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.88 
 
 		 418 aa  228  2e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0360  Phosphoribosylamine--glycine ligase  33.71 
 
 		 430 aa  227  3e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27830  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.8 
 
 		 421 aa  227  3e-58  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1729  phosphoribosylamine--glycine ligase  33.64 
 
 		 430 aa  226  4e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.576125 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0617  phosphoribosylamine--glycine ligase  33.03 
 
 		 425 aa  226  8e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2191  phosphoribosylamine--glycine ligase  32.63 
 
 		 422 aa  225  1e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1238  phosphoribosylamine--glycine ligase  33.71 
 
 		 425 aa  225  1e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2043  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.66 
 
 		 421 aa  225  1e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.453314 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3457  phosphoribosylamine--glycine ligase  33.49 
 
 		 423 aa  224  2e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.021302  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2231  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.71 
 
 		 423 aa  224  2e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3523  phosphoribosylamine--glycine ligase  33.49 
 
 		 423 aa  224  2e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0437232 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0431  phosphoribosylamine--glycine ligase  32.5 
 
 		 433 aa  224  2e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4327  phosphoribosylamine--glycine ligase  35.78 
 
 		 431 aa  224  3e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.101605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23090  phosphoribosylamine--glycine ligase  33.8 
 
 		 425 aa  223  4.9999999999999996e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.121893  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1300  phosphoribosylamine--glycine ligase  32.34 
 
 		 432 aa  223  6e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.617554  normal  0.088058 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1775  phosphoribosylamine/glycine ligase  36.13 
 
 		 433 aa  223  7e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.780493 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2065  phosphoribosylamine--glycine ligase  32.41 
 
 		 425 aa  223  7e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.19426 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3260  phosphoribosylamine--glycine ligase  32.41 
 
 		 432 aa  223  7e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.207571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0221  phosphoribosylamine/glycine ligase  33.87 
 
 		 427 aa  223  7e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.529077 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4180  phosphoribosylamine/glycine ligase  35.13 
 
 		 435 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.94163  normal  0.510323 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1480  phosphoribosylamine/glycine ligase  33.1 
 
 		 419 aa  222  9.999999999999999e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2591  phosphoribosylamine--glycine ligase  32.79 
 
 		 423 aa  221  9.999999999999999e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>