More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4024 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_4024  phosphoribosylamine--glycine ligase  100 
 
 		 430 aa  855    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.197328  normal  0.0741894 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02964  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.3 
 
 		 429 aa  382  1e-105  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3845  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.01 
 
 		 423 aa  379  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000183828  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0610  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.95 
 
 		 423 aa  379  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00101284  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2043  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.54 
 
 		 421 aa  382  1e-104  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.453314 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2759  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.42 
 
 		 424 aa  380  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000179977  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1540  phosphoribosylamine/glycine ligase  49.07 
 
 		 433 aa  381  1e-104  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.427577  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3997  phosphoribosylamine/glycine ligase  48.48 
 
 		 423 aa  376  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4039  phosphoribosylamine/glycine ligase  48.48 
 
 		 423 aa  376  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.324775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1480  phosphoribosylamine/glycine ligase  46.35 
 
 		 419 aa  373  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2361  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.7 
 
 		 422 aa  372  1e-102  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3219  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.5 
 
 		 429 aa  374  1e-102  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.708681 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3871  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.17 
 
 		 435 aa  372  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.485049  normal  0.0530756 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3149  phosphoribosylamine--glycine ligase  48 
 
 		 433 aa  369  1e-101  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.868678  normal  0.802626 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03941  Phosphoribosylamine-glycine ligase  46.96 
 
 		 430 aa  370  1e-101  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4327  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.15 
 
 		 431 aa  369  1e-101  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.101605  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3523  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.01 
 
 		 423 aa  369  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0437232 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4104  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.24 
 
 		 427 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6598  phosphoribosylamine/glycine ligase  49.41 
 
 		 423 aa  370  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.204932  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0224  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.2 
 
 		 428 aa  369  1e-101  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0267401  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0292  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.62 
 
 		 427 aa  367  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00181025  normal  0.0133648 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2652  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.5 
 
 		 429 aa  365  1e-100  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3457  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.01 
 
 		 423 aa  367  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.021302  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0438  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.73 
 
 		 430 aa  367  1e-100  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.199076  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4180  phosphoribosylamine/glycine ligase  47.71 
 
 		 435 aa  368  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.94163  normal  0.510323 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2342  phosphoribosylamine/glycine ligase  47.42 
 
 		 428 aa  366  1e-100  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.51337  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2871  phosphoribosylamine/glycine ligase  47.89 
 
 		 449 aa  368  1e-100  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0927595 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1626  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.83 
 
 		 432 aa  365  1e-100  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0627  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.88 
 
 		 425 aa  366  1e-100  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.154285 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2904  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.01 
 
 		 423 aa  365  1e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000288348  normal  0.785686 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0228  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.5 
 
 		 428 aa  363  3e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0316556  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3844  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.15 
 
 		 428 aa  363  3e-99  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000315171  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2231  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.18 
 
 		 423 aa  363  4e-99  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3665  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.96 
 
 		 428 aa  362  5.0000000000000005e-99  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0646  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.25 
 
 		 436 aa  362  5.0000000000000005e-99  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0464  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.15 
 
 		 428 aa  362  5.0000000000000005e-99  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00032027  normal  0.0111484 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0356  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.15 
 
 		 428 aa  362  7.0000000000000005e-99  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0104682  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2843  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.9 
 
 		 430 aa  359  4e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.294227  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1427  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.24 
 
 		 591 aa  359  5e-98  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0529  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.65 
 
 		 429 aa  359  5e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.863272  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2591  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.31 
 
 		 423 aa  358  8e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002184  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.03 
 
 		 429 aa  358  9e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.25624  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4506  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.2 
 
 		 429 aa  357  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0278032 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0177  phosphoribosylamine/glycine ligase  47.32 
 
 		 429 aa  357  2.9999999999999997e-97  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.348487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1442  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.18 
 
 		 426 aa  356  3.9999999999999996e-97  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.577495  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0875  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.24 
 
 		 430 aa  356  5e-97  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.712895  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3451  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.86 
 
 		 428 aa  356  5e-97  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.264337  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06880  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.73 
 
 		 426 aa  355  5.999999999999999e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.285428  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0360  Phosphoribosylamine--glycine ligase  46.5 
 
 		 430 aa  355  7.999999999999999e-97  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1245  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.84 
 
 		 419 aa  354  1e-96  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.495633  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00211  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.22 
 
 		 429 aa  355  1e-96  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0414  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.18 
 
 		 427 aa  354  2e-96  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.31965  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4453  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.2 
 
 		 429 aa  354  2e-96  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0221711  hitchhiker  0.000392069 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1863  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.74 
 
 		 442 aa  354  2e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.466784  hitchhiker  0.0074915 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4508  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.96 
 
 		 429 aa  354  2e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0778373 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0909  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.26 
 
 		 432 aa  354  2e-96  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0312  phosphoribosylamine/glycine ligase  49.41 
 
 		 426 aa  353  2e-96  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2988  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.33 
 
 		 428 aa  354  2e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0036  phosphoribosylamine/glycine ligase  46.43 
 
 		 430 aa  353  2.9999999999999997e-96  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1775  phosphoribosylamine/glycine ligase  47.76 
 
 		 433 aa  353  2.9999999999999997e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.780493 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0422  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.95 
 
 		 427 aa  353  2.9999999999999997e-96  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1952  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.71 
 
 		 427 aa  353  4e-96  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4239  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.2 
 
 		 429 aa  352  5e-96  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00124381  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4582  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.73 
 
 		 429 aa  353  5e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.213422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5474  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.5 
 
 		 429 aa  352  5.9999999999999994e-96  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.13476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0997  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.54 
 
 		 430 aa  352  5.9999999999999994e-96  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4419  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.73 
 
 		 429 aa  352  7e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.160091  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4020  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.2 
 
 		 429 aa  352  8.999999999999999e-96  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000927217  normal  0.0101467 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0555  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.2 
 
 		 431 aa  352  8.999999999999999e-96  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4548  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.2 
 
 		 429 aa  352  8.999999999999999e-96  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000304372  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0266  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.96 
 
 		 427 aa  352  1e-95  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000213794  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3379  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.97 
 
 		 414 aa  351  1e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.104647 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03882  phosphoribosylamine-glycine ligase  47.2 
 
 		 429 aa  350  2e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000860274  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3988  phosphoribosylamine/glycine ligase  46.96 
 
 		 429 aa  350  2e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0361396  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03835  hypothetical protein  47.2 
 
 		 429 aa  350  2e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000931477  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4496  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.96 
 
 		 429 aa  350  2e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000225394  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1628  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.92 
 
 		 425 aa  350  3e-95  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1946  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.1 
 
 		 420 aa  350  3e-95  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0479651 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2863  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.39 
 
 		 426 aa  350  4e-95  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0385682  normal  0.548732 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2180  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.44 
 
 		 419 aa  349  4e-95  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.900628  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3467  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.23 
 
 		 423 aa  349  5e-95  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4386  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.5 
 
 		 429 aa  349  5e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.677738 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0735  phosphoribosylamine/glycine ligase  46.59 
 
 		 425 aa  348  8e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.525706  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2191  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.43 
 
 		 422 aa  348  8e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1353  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.54 
 
 		 427 aa  348  8e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.2506  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0784  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.01 
 
 		 422 aa  348  1e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.110869  normal  0.244609 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0471  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.75 
 
 		 423 aa  348  1e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0707  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.79 
 
 		 429 aa  347  2e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1983  phosphoribosylamine/glycine ligase  45.65 
 
 		 423 aa  347  2e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.853313 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1777  phosphoribosylamine/glycine ligase  46.73 
 
 		 428 aa  347  3e-94  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0779  phosphoribosylamine/glycine ligase  44.26 
 
 		 428 aa  347  3e-94  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00193673  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0215  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.79 
 
 		 430 aa  347  3e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0406099  normal  0.0125796 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4029  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.46 
 
 		 420 aa  347  3e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0635  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.12 
 
 		 420 aa  346  5e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6062  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.12 
 
 		 442 aa  346  6e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.498795  normal  0.336807 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2827  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.03 
 
 		 437 aa  345  7e-94  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000587328  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23090  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.06 
 
 		 425 aa  345  1e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.121893  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1699  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.28 
 
 		 427 aa  345  1e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.251383  normal  0.989876 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1523  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.71 
 
 		 424 aa  345  1e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0737922 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1774  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.59 
 
 		 428 aa  344  1e-93  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000323466  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>