More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0663 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0663  phosphoribosylamine--glycine ligase  100 
 
 
490 aa  988    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1907  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.28 
 
 
478 aa  445  1.0000000000000001e-124  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.059952  normal  0.308867 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1894  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.1 
 
 
481 aa  442  1e-123  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0106  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.27 
 
 
478 aa  441  9.999999999999999e-123  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0907034  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2189  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.12 
 
 
477 aa  421  1e-116  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1983  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.04 
 
 
477 aa  392  1e-108  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.601261  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1696  phosphoribosylamine/glycine ligase  44.91 
 
 
479 aa  392  1e-107  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1322  phosphoribosylamine--glycine ligase  38.07 
 
 
445 aa  279  7e-74  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0518  phosphoribosylamine--glycine ligase  37.91 
 
 
444 aa  274  3e-72  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.604563  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1379  phosphoribosylamine--glycine ligase  38.97 
 
 
443 aa  274  3e-72  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1390  phosphoribosylamine--glycine ligase  37.83 
 
 
444 aa  273  6e-72  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1246  phosphoribosylamine--glycine ligase  37.83 
 
 
444 aa  270  5e-71  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3513  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.87 
 
 
433 aa  270  5.9999999999999995e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.697778 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2359  phosphoribosylamine--glycine ligase  35.01 
 
 
430 aa  265  1e-69  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.110333 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0840  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.81 
 
 
427 aa  265  2e-69  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.464676 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1638  phosphoribosylamine-glycine ligase  36.34 
 
 
439 aa  265  2e-69  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1645  phosphoribosylamine-glycine ligase  36.34 
 
 
439 aa  263  4e-69  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2980  phosphoribosylamine/glycine ligase  35.97 
 
 
430 aa  259  6e-68  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1100  phosphoribosylamine/glycine ligase  36.01 
 
 
442 aa  258  1e-67  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0363235  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1688  phosphoribosylamine/glycine ligase  35.65 
 
 
430 aa  255  1.0000000000000001e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1000  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.59 
 
 
430 aa  250  4e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.14412  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1112  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.52 
 
 
432 aa  248  1e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1056  phosphoribosylamine--glycine ligase  35.31 
 
 
432 aa  249  1e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0316  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.86 
 
 
430 aa  246  6.999999999999999e-64  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.412175  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1295  phosphoribosylamine/glycine ligase  35.68 
 
 
427 aa  239  5.999999999999999e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.058661  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2316  phosphoribosylamine/glycine ligase  34.05 
 
 
446 aa  233  7.000000000000001e-60  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.306508 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0506  phosphoribosylamine/glycine ligase  34.36 
 
 
430 aa  228  2e-58  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.437456  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0026  phosphoribosylamine/glycine ligase  31.72 
 
 
704 aa  189  7e-47  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0526  phosphoribosylamine--glycine ligase  33.41 
 
 
419 aa  189  1e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23090  phosphoribosylamine--glycine ligase  30.4 
 
 
425 aa  185  2.0000000000000003e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.121893  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1532  phosphoribosylamine/glycine ligase  33.56 
 
 
423 aa  184  3e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.612843  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1628  phosphoribosylamine--glycine ligase  33.18 
 
 
425 aa  180  4e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0036  phosphoribosylamine/glycine ligase  32.03 
 
 
430 aa  179  1e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3467  phosphoribosylamine--glycine ligase  31.7 
 
 
423 aa  178  2e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0529  phosphoribosylamine--glycine ligase  32.28 
 
 
429 aa  177  5e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.863272  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1444  phosphoribosylamine/glycine ligase  31.19 
 
 
420 aa  177  6e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2180  phosphoribosylamine--glycine ligase  31.45 
 
 
419 aa  176  6e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.900628  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11500  phosphoribosylamine--glycine ligase  31.63 
 
 
430 aa  176  7e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.089244  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0471  phosphoribosylamine--glycine ligase  32.05 
 
 
423 aa  175  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0991  phosphoribosylamine--glycine ligase  33.8 
 
 
425 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1774  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.25 
 
 
428 aa  175  1.9999999999999998e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000323466  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0127  phosphoribosylamine/glycine ligase  36.39 
 
 
413 aa  174  1.9999999999999998e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0838  phosphoribosylamine--glycine ligase  31.47 
 
 
425 aa  174  3.9999999999999995e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.083606  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1245  phosphoribosylamine--glycine ligase  30.93 
 
 
419 aa  173  5.999999999999999e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.495633  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0422  phosphoribosylamine--glycine ligase  33.11 
 
 
427 aa  170  5e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0610  phosphoribosylamine--glycine ligase  30.22 
 
 
423 aa  169  1e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00101284  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0264  phosphoribosylamine--glycine ligase  30.87 
 
 
430 aa  169  1e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.46971  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0328  phosphoribosylamine--glycine ligase  29.67 
 
 
423 aa  168  2e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1999  phosphoribosylamine--glycine ligase  31.63 
 
 
429 aa  168  2e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00638776  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1722  phosphoribosylamine--glycine ligase  30.55 
 
 
425 aa  168  2e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0735  phosphoribosylamine/glycine ligase  31.33 
 
 
425 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.525706  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27830  phosphoribosylamine--glycine ligase  30.31 
 
 
421 aa  167  2.9999999999999998e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2323  phosphoribosylamine--glycine ligase  29.84 
 
 
429 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.125717  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06541  phosphoribosylamine-glycine ligase (Eurofung)  30.22 
 
 
809 aa  167  5e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1412  phosphoribosylamine--glycine ligase  30.87 
 
 
422 aa  167  5e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.8215  normal  0.900094 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0372  phosphoribosylamine--glycine ligase  29.5 
 
 
423 aa  167  5e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0909  phosphoribosylamine--glycine ligase  31.42 
 
 
432 aa  166  5.9999999999999996e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2361  phosphoribosylamine--glycine ligase  30 
 
 
422 aa  166  6.9999999999999995e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1427  phosphoribosylamine--glycine ligase  29.67 
 
 
591 aa  166  8e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2552  phosphoribosylamine--glycine ligase  30.56 
 
 
426 aa  166  9e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0177333  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0414  phosphoribosylamine--glycine ligase  32.89 
 
 
427 aa  165  1.0000000000000001e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.31965  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0231  phosphoribosylamine--glycine ligase  29.6 
 
 
425 aa  166  1.0000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.595549  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2863  phosphoribosylamine--glycine ligase  30.6 
 
 
426 aa  165  2.0000000000000002e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0385682  normal  0.548732 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0612  phosphoribosylamine--glycine ligase  31.43 
 
 
430 aa  164  2.0000000000000002e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000692344  hitchhiker  0.00000110971 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1034  phosphoribosylamine--glycine ligase  33.7 
 
 
423 aa  164  4.0000000000000004e-39  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1140  phosphoribosylamine--glycine ligase  29.73 
 
 
430 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2988  phosphoribosylamine--glycine ligase  29.75 
 
 
428 aa  163  5.0000000000000005e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0459  phosphoribosylamine--glycine ligase  30.93 
 
 
429 aa  163  6e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1699  phosphoribosylamine--glycine ligase  30.48 
 
 
427 aa  163  7e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.251383  normal  0.989876 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3219  phosphoribosylamine--glycine ligase  29.69 
 
 
429 aa  162  9e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.708681 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2342  phosphoribosylamine/glycine ligase  30.89 
 
 
428 aa  162  1e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.51337  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0880  phosphoribosylamine--glycine ligase  29.4 
 
 
422 aa  162  1e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1480  phosphoribosylamine/glycine ligase  29.69 
 
 
419 aa  161  2e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1653  phosphoribosylamine--glycine ligase  29.09 
 
 
427 aa  162  2e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0331  phosphoribosylamine--glycine ligase  29.41 
 
 
423 aa  161  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0719  phosphoribosylamine--glycine ligase  31.01 
 
 
426 aa  161  2e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.63678  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03941  Phosphoribosylamine-glycine ligase  29.66 
 
 
430 aa  161  2e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3845  phosphoribosylamine--glycine ligase  29.18 
 
 
423 aa  160  6e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000183828  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0401  phosphoribosylamine/glycine ligase  30.48 
 
 
428 aa  160  7e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000120381  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0278  phosphoribosylamine--glycine ligase  29.82 
 
 
423 aa  159  1e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0286  phosphoribosylamine--glycine ligase  29.19 
 
 
423 aa  159  1e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0271  phosphoribosylamine--glycine ligase  28.96 
 
 
423 aa  159  1e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0299  phosphoribosylamine--glycine ligase  29.19 
 
 
423 aa  159  1e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0345  phosphoribosylamine--glycine ligase  28.44 
 
 
423 aa  159  1e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0676  phosphoribosylamine--glycine ligase  31.03 
 
 
416 aa  159  1e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0555  phosphoribosylamine--glycine ligase  29.53 
 
 
431 aa  159  2e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002184  phosphoribosylamine--glycine ligase  29.53 
 
 
429 aa  158  2e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.25624  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0266  phosphoribosylamine--glycine ligase  28.73 
 
 
427 aa  158  2e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000213794  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1419  phosphoribosylamine--glycine ligase  28.57 
 
 
425 aa  159  2e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0635  phosphoribosylamine--glycine ligase  29.91 
 
 
420 aa  158  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0280  phosphoribosylamine--glycine ligase  29.71 
 
 
423 aa  158  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3451  phosphoribosylamine--glycine ligase  29.82 
 
 
428 aa  158  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.264337  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0274  phosphoribosylamine--glycine ligase  28.96 
 
 
423 aa  158  3e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN00440  purine nucleotide biosynthesis-related protein, putative  32.72 
 
 
802 aa  157  3e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0221  phosphoribosylamine/glycine ligase  31.75 
 
 
427 aa  158  3e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.529077 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17671  phosphoribosylamine--glycine ligase  29.58 
 
 
434 aa  158  3e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2231  phosphoribosylamine--glycine ligase  29.87 
 
 
423 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3149  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.82 
 
 
433 aa  157  5.0000000000000005e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.868678  normal  0.802626 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13941  phosphoribosylamine--glycine ligase  30.95 
 
 
446 aa  157  5.0000000000000005e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.144546  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1353  phosphoribosylamine--glycine ligase  29.67 
 
 
427 aa  157  6e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.2506  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>