More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1000 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1000  phosphoribosylamine--glycine ligase  100 
 
 		 430 aa  870    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.14412  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0840  phosphoribosylamine--glycine ligase  68.38 
 
 		 427 aa  611  9.999999999999999e-175  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.464676 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2359  phosphoribosylamine--glycine ligase  66.43 
 
 		 430 aa  574  1.0000000000000001e-162  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.110333 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0316  phosphoribosylamine--glycine ligase  60.75 
 
 		 430 aa  530  1e-149  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.412175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1112  phosphoribosylamine--glycine ligase  61.97 
 
 		 432 aa  508  9.999999999999999e-143  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3513  phosphoribosylamine--glycine ligase  54.4 
 
 		 433 aa  474  1e-132  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.697778 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1056  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.74 
 
 		 432 aa  451  1e-125  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1100  phosphoribosylamine/glycine ligase  52.5 
 
 		 442 aa  445  1.0000000000000001e-124  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0363235  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2980  phosphoribosylamine/glycine ligase  52.19 
 
 		 430 aa  429  1e-119  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1688  phosphoribosylamine/glycine ligase  51.27 
 
 		 430 aa  421  1e-116  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1295  phosphoribosylamine/glycine ligase  51.62 
 
 		 427 aa  398  9.999999999999999e-111  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.058661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1379  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.5 
 
 		 443 aa  398  9.999999999999999e-111  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1322  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.83 
 
 		 445 aa  399  9.999999999999999e-111  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0518  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.83 
 
 		 444 aa  397  1e-109  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.604563  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1390  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.83 
 
 		 444 aa  395  1e-108  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1246  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.38 
 
 		 444 aa  391  1e-107  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0506  phosphoribosylamine/glycine ligase  49.19 
 
 		 430 aa  387  1e-106  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.437456  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1645  phosphoribosylamine-glycine ligase  47.13 
 
 		 439 aa  379  1e-104  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1638  phosphoribosylamine-glycine ligase  47.13 
 
 		 439 aa  378  1e-103  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2316  phosphoribosylamine/glycine ligase  49.44 
 
 		 446 aa  376  1e-103  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.306508 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1628  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.94 
 
 		 425 aa  268  2e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0264  phosphoribosylamine--glycine ligase  38.69 
 
 		 430 aa  267  2.9999999999999995e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.46971  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1140  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.37 
 
 		 430 aa  263  4e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0663  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.59 
 
 		 490 aa  261  1e-68  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0526  phosphoribosylamine--glycine ligase  38.24 
 
 		 419 aa  258  2e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1444  phosphoribosylamine/glycine ligase  37.7 
 
 		 420 aa  256  4e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1907  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.05 
 
 		 478 aa  251  2e-65  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.059952  normal  0.308867 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0459  phosphoribosylamine--glycine ligase  37.94 
 
 		 429 aa  249  5e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0960  phosphoribosylamine/glycine ligase  38.39 
 
 		 430 aa  248  1e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0106  phosphoribosylamine--glycine ligase  38.88 
 
 		 478 aa  248  1e-64  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0907034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2361  phosphoribosylamine--glycine ligase  37.97 
 
 		 422 aa  246  6.999999999999999e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3175  phosphoribosylamine--glycine ligase  38.44 
 
 		 418 aa  246  6.999999999999999e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2759  phosphoribosylamine--glycine ligase  38.14 
 
 		 424 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000179977  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3379  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.19 
 
 		 414 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.104647 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0610  phosphoribosylamine--glycine ligase  37.88 
 
 		 423 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00101284  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1532  phosphoribosylamine/glycine ligase  38.93 
 
 		 423 aa  243  3.9999999999999997e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.612843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2591  phosphoribosylamine--glycine ligase  38.32 
 
 		 423 aa  243  5e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2231  phosphoribosylamine--glycine ligase  38.35 
 
 		 423 aa  241  2e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1034  phosphoribosylamine--glycine ligase  38.18 
 
 		 423 aa  241  2.9999999999999997e-62  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1427  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.79 
 
 		 591 aa  240  2.9999999999999997e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1983  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.28 
 
 		 477 aa  240  4e-62  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.601261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0880  phosphoribosylamine--glycine ligase  37.76 
 
 		 422 aa  239  8e-62  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2552  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.88 
 
 		 426 aa  238  1e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0177333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3845  phosphoribosylamine--glycine ligase  38.12 
 
 		 423 aa  238  1e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000183828  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1347  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.57 
 
 		 417 aa  238  1e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.207795  normal  0.112273 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2904  phosphoribosylamine--glycine ligase  37.56 
 
 		 423 aa  238  2e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000288348  normal  0.785686 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2180  phosphoribosylamine--glycine ligase  35.98 
 
 		 419 aa  237  4e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.900628  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1480  phosphoribosylamine/glycine ligase  34.98 
 
 		 419 aa  236  6e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0348  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.24 
 
 		 422 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.6128 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23090  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.43 
 
 		 425 aa  234  2.0000000000000002e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.121893  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0735  phosphoribosylamine/glycine ligase  38.46 
 
 		 425 aa  234  3e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.525706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3202  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.66 
 
 		 426 aa  234  3e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.462795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2043  phosphoribosylamine--glycine ligase  37.94 
 
 		 421 aa  233  4.0000000000000004e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.453314 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0360  Phosphoribosylamine--glycine ligase  38.64 
 
 		 430 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0026  phosphoribosylamine/glycine ligase  37.15 
 
 		 704 aa  233  5e-60  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0328  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.91 
 
 		 423 aa  233  6e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2692  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.81 
 
 		 418 aa  233  6e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.813213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1353  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.8 
 
 		 427 aa  232  8.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.2506  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2389  phosphoribosylamine--glycine ligase  35.46 
 
 		 422 aa  232  9e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2827  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.74 
 
 		 437 aa  232  9e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000587328  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0058  phosphoribosylamine--glycine ligase  37.47 
 
 		 420 aa  232  9e-60  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2191  phosphoribosylamine--glycine ligase  35.46 
 
 		 422 aa  232  1e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0274  phosphoribosylamine--glycine ligase  35.63 
 
 		 423 aa  232  1e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0271  phosphoribosylamine--glycine ligase  35.14 
 
 		 423 aa  231  2e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1412  phosphoribosylamine--glycine ligase  35.65 
 
 		 422 aa  231  2e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.8215  normal  0.900094 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0286  phosphoribosylamine--glycine ligase  35.14 
 
 		 423 aa  231  3e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0299  phosphoribosylamine--glycine ligase  35.14 
 
 		 423 aa  231  3e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0331  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.91 
 
 		 423 aa  231  3e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3457  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.71 
 
 		 423 aa  230  4e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.021302  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1899  phosphoribosylamine--glycine ligase  33.88 
 
 		 428 aa  230  4e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.543102  normal  0.253787 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0280  phosphoribosylamine--glycine ligase  35.55 
 
 		 423 aa  229  6e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4104  phosphoribosylamine--glycine ligase  35.03 
 
 		 427 aa  229  6e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1704  phosphoribosylamine--glycine ligase  33.88 
 
 		 428 aa  229  6e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.382123  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0372  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.92 
 
 		 423 aa  229  6e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1134  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.24 
 
 		 415 aa  229  7e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1156  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.24 
 
 		 415 aa  229  7e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1989  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.99 
 
 		 422 aa  229  7e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.187802  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0345  phosphoribosylamine--glycine ligase  35.15 
 
 		 423 aa  229  8e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3871  phosphoribosylamine--glycine ligase  37.82 
 
 		 435 aa  229  8e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.485049  normal  0.0530756 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2523  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.68 
 
 		 422 aa  229  9e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4975  phosphoribosylamine--glycine ligase  35.15 
 
 		 423 aa  229  9e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0555  phosphoribosylamine--glycine ligase  35.1 
 
 		 424 aa  228  1e-58  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0617  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.51 
 
 		 425 aa  228  1e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3149  phosphoribosylamine--glycine ligase  37.35 
 
 		 433 aa  228  1e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.868678  normal  0.802626 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1863  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.79 
 
 		 442 aa  228  1e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.466784  hitchhiker  0.0074915 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3523  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.47 
 
 		 423 aa  228  1e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0437232 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1419  phosphoribosylamine--glycine ligase  35.5 
 
 		 425 aa  228  2e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0659  phosphoribosylamine--glycine ligase  35.24 
 
 		 413 aa  228  2e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.80081  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0909  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.53 
 
 		 432 aa  228  2e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0278  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.24 
 
 		 423 aa  228  2e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1338  phosphoribosylamine--glycine ligase  35.19 
 
 		 430 aa  227  3e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0172  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.21 
 
 		 429 aa  227  3e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1540  phosphoribosylamine/glycine ligase  37.91 
 
 		 433 aa  227  3e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.427577  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0784  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.32 
 
 		 422 aa  227  3e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.110869  normal  0.244609 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0312  phosphoribosylamine/glycine ligase  39.77 
 
 		 426 aa  227  4e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2122  phosphoribosylamine--glycine ligase  35.76 
 
 		 435 aa  226  5.0000000000000005e-58  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0619  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.97 
 
 		 427 aa  226  5.0000000000000005e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.374111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0266  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.28 
 
 		 427 aa  226  9e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000213794  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1245  phosphoribosylamine--glycine ligase  35.14 
 
 		 419 aa  225  1e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.495633  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0043  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.66 
 
 		 421 aa  225  1e-57  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>