More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0659 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0659  phosphoribosylamine--glycine ligase  100 
 
 		 413 aa  850    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.80081  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1156  phosphoribosylamine--glycine ligase  70.15 
 
 		 415 aa  607  9.999999999999999e-173  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1134  phosphoribosylamine--glycine ligase  70.15 
 
 		 415 aa  607  9.999999999999999e-173  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0264  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.49 
 
 		 430 aa  433  1e-120  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.46971  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1140  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.83 
 
 		 430 aa  414  1e-114  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0286  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.52 
 
 		 423 aa  398  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0274  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.76 
 
 		 423 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0299  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.52 
 
 		 423 aa  398  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0372  phosphoribosylamine--glycine ligase  50 
 
 		 423 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0278  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.52 
 
 		 423 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0331  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.28 
 
 		 423 aa  398  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0280  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.28 
 
 		 423 aa  395  1e-109  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0271  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.04 
 
 		 423 aa  397  1e-109  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4975  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.76 
 
 		 423 aa  398  1e-109  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0345  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.28 
 
 		 423 aa  397  1e-109  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0328  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.76 
 
 		 423 aa  394  1e-108  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0880  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.19 
 
 		 422 aa  361  2e-98  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2180  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.97 
 
 		 419 aa  359  4e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.900628  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0960  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.9 
 
 		 426 aa  354  2e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0026  phosphoribosylamine/glycine ligase  44.66 
 
 		 704 aa  353  2.9999999999999997e-96  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0058  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.66 
 
 		 420 aa  353  4e-96  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1601  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.04 
 
 		 413 aa  352  5e-96  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0529  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.16 
 
 		 429 aa  351  1e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.863272  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23090  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.29 
 
 		 425 aa  349  6e-95  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.121893  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0043  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.08 
 
 		 421 aa  348  1e-94  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2361  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.94 
 
 		 422 aa  347  2e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0471  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.97 
 
 		 423 aa  347  3e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1412  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.62 
 
 		 422 aa  345  8e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.8215  normal  0.900094 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0735  phosphoribosylamine/glycine ligase  44.1 
 
 		 425 aa  345  1e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.525706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2591  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.31 
 
 		 423 aa  345  1e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4104  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.69 
 
 		 427 aa  340  2e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0422  phosphoribosylamine--glycine ligase  44 
 
 		 427 aa  340  2.9999999999999998e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4419  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.47 
 
 		 429 aa  340  2.9999999999999998e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.160091  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3467  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.84 
 
 		 423 aa  339  5e-92  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4506  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.24 
 
 		 429 aa  339  7e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0278032 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3451  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.23 
 
 		 428 aa  339  7e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.264337  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2231  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.19 
 
 		 423 aa  338  8e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1863  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.69 
 
 		 442 aa  338  9e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.466784  hitchhiker  0.0074915 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1626  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.44 
 
 		 432 aa  338  9e-92  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1034  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.29 
 
 		 423 aa  338  9.999999999999999e-92  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0578  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.16 
 
 		 425 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2652  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.59 
 
 		 429 aa  338  9.999999999999999e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4508  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.24 
 
 		 429 aa  338  9.999999999999999e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0778373 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4386  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.24 
 
 		 429 aa  338  9.999999999999999e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.677738 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3862  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.69 
 
 		 429 aa  337  1.9999999999999998e-91  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.256361  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03882  phosphoribosylamine-glycine ligase  43.78 
 
 		 429 aa  337  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000860274  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2552  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.53 
 
 		 426 aa  337  2.9999999999999997e-91  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0177333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4453  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.78 
 
 		 429 aa  337  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0221711  hitchhiker  0.000392069 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03835  hypothetical protein  43.78 
 
 		 429 aa  337  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000931477  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4239  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.78 
 
 		 429 aa  337  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00124381  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0909  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.99 
 
 		 432 aa  337  2.9999999999999997e-91  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4582  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.01 
 
 		 429 aa  337  2.9999999999999997e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.213422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0292  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.49 
 
 		 427 aa  336  3.9999999999999995e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00181025  normal  0.0133648 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4020  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.78 
 
 		 429 aa  336  5e-91  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000927217  normal  0.0101467 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4548  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.78 
 
 		 429 aa  336  5e-91  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000304372  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03941  Phosphoribosylamine-glycine ligase  42.13 
 
 		 430 aa  336  5.999999999999999e-91  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0414  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.69 
 
 		 427 aa  335  7e-91  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.31965  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1245  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.31 
 
 		 419 aa  335  1e-90  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.495633  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0224  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.76 
 
 		 428 aa  335  1e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0267401  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00211  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.78 
 
 		 429 aa  334  2e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1353  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.98 
 
 		 427 aa  334  2e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.2506  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3708  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.79 
 
 		 428 aa  334  2e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0202463  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0266  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.09 
 
 		 427 aa  334  2e-90  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000213794  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3988  phosphoribosylamine/glycine ligase  43.32 
 
 		 429 aa  333  3e-90  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0361396  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0535  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.4 
 
 		 427 aa  333  3e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.201111 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5474  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.32 
 
 		 429 aa  333  3e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.13476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4496  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.32 
 
 		 429 aa  333  3e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000225394  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3523  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.65 
 
 		 423 aa  333  4e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0437232 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002184  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.55 
 
 		 429 aa  333  5e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.25624  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3845  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.88 
 
 		 423 aa  333  5e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000183828  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0228  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.52 
 
 		 428 aa  332  6e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0316556  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0215  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.36 
 
 		 430 aa  331  1e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0406099  normal  0.0125796 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4613  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.33 
 
 		 431 aa  331  2e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.302277 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0036  phosphoribosylamine/glycine ligase  44.42 
 
 		 430 aa  330  2e-89  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0392  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.79 
 
 		 424 aa  330  2e-89  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.423575  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0360  Phosphoribosylamine--glycine ligase  41.45 
 
 		 430 aa  331  2e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0707  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.22 
 
 		 429 aa  331  2e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3457  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.18 
 
 		 423 aa  330  3e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.021302  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0610  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.12 
 
 		 423 aa  329  4e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00101284  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0145  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.58 
 
 		 419 aa  329  5.0000000000000004e-89  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000216858  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1699  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.35 
 
 		 427 aa  329  6e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.251383  normal  0.989876 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0177  phosphoribosylamine/glycine ligase  41.26 
 
 		 429 aa  329  6e-89  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.348487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0555  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.45 
 
 		 424 aa  328  8e-89  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2323  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.41 
 
 		 429 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.125717  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4876  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.62 
 
 		 431 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4698  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.39 
 
 		 430 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.744432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0676  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.9 
 
 		 416 aa  327  2.0000000000000001e-88  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5575  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.99 
 
 		 429 aa  327  3e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0619  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.69 
 
 		 427 aa  327  3e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.374111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0678  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.14 
 
 		 416 aa  327  3e-88  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64220  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.22 
 
 		 429 aa  327  3e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.88359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1722  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.75 
 
 		 425 aa  326  4.0000000000000003e-88  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4823  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.39 
 
 		 431 aa  325  6e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0172  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.09 
 
 		 429 aa  325  8.000000000000001e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3173  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.22 
 
 		 428 aa  325  9e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0826007  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06880  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.25 
 
 		 426 aa  323  5e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.285428  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0700  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.2 
 
 		 414 aa  322  6e-87  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3844  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.69 
 
 		 428 aa  322  7e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000315171  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0464  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.69 
 
 		 428 aa  321  9.999999999999999e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00032027  normal  0.0111484 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11500  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.66 
 
 		 430 aa  321  9.999999999999999e-87  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.089244  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>