More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1246 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009635  Maeo_1322  phosphoribosylamine--glycine ligase  76.02 
 
 		 445 aa  681    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1390  phosphoribosylamine--glycine ligase  93.47 
 
 		 444 aa  839    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0518  phosphoribosylamine--glycine ligase  94.14 
 
 		 444 aa  848    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.604563  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1246  phosphoribosylamine--glycine ligase  100 
 
 		 444 aa  892    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1379  phosphoribosylamine--glycine ligase  83.03 
 
 		 443 aa  747    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3513  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.58 
 
 		 433 aa  439  9.999999999999999e-123  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.697778 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1100  phosphoribosylamine/glycine ligase  52.93 
 
 		 442 aa  427  1e-118  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0363235  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1056  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.31 
 
 		 432 aa  416  9.999999999999999e-116  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2359  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.06 
 
 		 430 aa  393  1e-108  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.110333 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0840  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.61 
 
 		 427 aa  390  1e-107  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.464676 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0316  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.9 
 
 		 430 aa  382  1e-105  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.412175  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1645  phosphoribosylamine-glycine ligase  47.42 
 
 		 439 aa  381  1e-104  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1638  phosphoribosylamine-glycine ligase  47.42 
 
 		 439 aa  381  1e-104  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1112  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.29 
 
 		 432 aa  374  1e-102  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2980  phosphoribosylamine/glycine ligase  47.52 
 
 		 430 aa  372  1e-102  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1000  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.38 
 
 		 430 aa  372  1e-102  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.14412  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1688  phosphoribosylamine/glycine ligase  45.48 
 
 		 430 aa  365  1e-99  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1295  phosphoribosylamine/glycine ligase  45.15 
 
 		 427 aa  361  2e-98  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.058661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0506  phosphoribosylamine/glycine ligase  44.12 
 
 		 430 aa  345  8e-94  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.437456  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2316  phosphoribosylamine/glycine ligase  44.64 
 
 		 446 aa  340  2.9999999999999998e-92  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.306508 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0663  phosphoribosylamine--glycine ligase  37.83 
 
 		 490 aa  270  5e-71  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1983  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.01 
 
 		 477 aa  268  2e-70  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.601261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1907  phosphoribosylamine--glycine ligase  37.33 
 
 		 478 aa  259  8e-68  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.059952  normal  0.308867 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0526  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.78 
 
 		 419 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1696  phosphoribosylamine/glycine ligase  37.74 
 
 		 479 aa  249  9e-65  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0106  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.85 
 
 		 478 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0907034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0036  phosphoribosylamine/glycine ligase  38.39 
 
 		 430 aa  246  9e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1245  phosphoribosylamine--glycine ligase  35.88 
 
 		 419 aa  241  1e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.495633  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1628  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.28 
 
 		 425 aa  242  1e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1140  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.88 
 
 		 430 aa  242  1e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0610  phosphoribosylamine--glycine ligase  35.16 
 
 		 423 aa  240  4e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00101284  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2189  phosphoribosylamine--glycine ligase  36 
 
 		 477 aa  238  2e-61  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2904  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.55 
 
 		 423 aa  236  7e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000288348  normal  0.785686 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0264  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.57 
 
 		 430 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.46971  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3585  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.69 
 
 		 432 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0440  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.47 
 
 		 432 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2180  phosphoribosylamine--glycine ligase  35.57 
 
 		 419 aa  233  4.0000000000000004e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.900628  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0431  phosphoribosylamine--glycine ligase  33.18 
 
 		 433 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1774  phosphoribosylamine--glycine ligase  35.6 
 
 		 428 aa  233  4.0000000000000004e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000323466  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2361  phosphoribosylamine--glycine ligase  35.23 
 
 		 422 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1532  phosphoribosylamine/glycine ligase  33.87 
 
 		 423 aa  233  5e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.612843  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0441  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.92 
 
 		 432 aa  233  7.000000000000001e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0519  phosphoribosylamine/glycine ligase  35.94 
 
 		 415 aa  231  2e-59  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.941545  normal  0.807449 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0444  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.24 
 
 		 432 aa  231  2e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3845  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.25 
 
 		 423 aa  230  4e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000183828  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0419  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.47 
 
 		 432 aa  229  5e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0360  Phosphoribosylamine--glycine ligase  33.18 
 
 		 430 aa  229  9e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3841  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.47 
 
 		 432 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.111405 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11500  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.53 
 
 		 430 aa  228  2e-58  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.089244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2231  phosphoribosylamine--glycine ligase  35.02 
 
 		 423 aa  228  2e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4037  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.24 
 
 		 432 aa  227  4e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3914  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.24 
 
 		 432 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2827  phosphoribosylamine--glycine ligase  33.26 
 
 		 437 aa  225  1e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000587328  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3402  phosphoribosylamine--glycine ligase  33.33 
 
 		 432 aa  225  1e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3871  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.72 
 
 		 435 aa  224  2e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.485049  normal  0.0530756 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0292  phosphoribosylamine--glycine ligase  33.79 
 
 		 427 aa  224  2e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00181025  normal  0.0133648 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2759  phosphoribosylamine--glycine ligase  32.66 
 
 		 424 aa  224  3e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000179977  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4180  phosphoribosylamine/glycine ligase  34.49 
 
 		 435 aa  224  3e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.94163  normal  0.510323 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27830  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.43 
 
 		 421 aa  223  7e-57  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2113  phosphoribosylamine/glycine ligase  36.3 
 
 		 416 aa  222  9e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000276572  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1444  phosphoribosylamine/glycine ligase  34.78 
 
 		 420 aa  222  9.999999999999999e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3175  phosphoribosylamine--glycine ligase  32.79 
 
 		 418 aa  222  9.999999999999999e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0529  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.44 
 
 		 429 aa  222  9.999999999999999e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.863272  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1894  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.62 
 
 		 481 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002184  phosphoribosylamine--glycine ligase  33.03 
 
 		 429 aa  221  3e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.25624  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0295  phosphoribosylamine--glycine ligase  32.41 
 
 		 430 aa  221  3e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2684  phosphoribosylamine/glycine ligase  34.55 
 
 		 432 aa  220  3.9999999999999997e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0337126  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0127  phosphoribosylamine/glycine ligase  33.33 
 
 		 413 aa  220  3.9999999999999997e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3523  phosphoribosylamine--glycine ligase  33.03 
 
 		 423 aa  220  3.9999999999999997e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0437232 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1999  phosphoribosylamine--glycine ligase  32.35 
 
 		 429 aa  220  3.9999999999999997e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00638776  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23090  phosphoribosylamine--glycine ligase  32.41 
 
 		 425 aa  219  5e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.121893  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1034  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.18 
 
 		 423 aa  220  5e-56  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4327  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.27 
 
 		 431 aa  219  6e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.101605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0735  phosphoribosylamine/glycine ligase  35.16 
 
 		 425 aa  219  6e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.525706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0784  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.26 
 
 		 422 aa  219  6e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.110869  normal  0.244609 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3219  phosphoribosylamine--glycine ligase  33.26 
 
 		 429 aa  219  7e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.708681 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0880  phosphoribosylamine--glycine ligase  35.86 
 
 		 422 aa  219  8.999999999999998e-56  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2191  phosphoribosylamine--glycine ligase  33.26 
 
 		 422 aa  219  1e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3149  phosphoribosylamine--glycine ligase  36.51 
 
 		 433 aa  219  1e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.868678  normal  0.802626 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1989  phosphoribosylamine--glycine ligase  33.33 
 
 		 422 aa  219  1e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.187802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2389  phosphoribosylamine--glycine ligase  33.33 
 
 		 422 aa  218  1e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00211  phosphoribosylamine--glycine ligase  33.26 
 
 		 429 aa  218  2e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0443  phosphoribosylamine--glycine ligase  32.87 
 
 		 430 aa  218  2e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.201644 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3202  phosphoribosylamine--glycine ligase  33.26 
 
 		 426 aa  218  2e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.462795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2652  phosphoribosylamine--glycine ligase  32.43 
 
 		 429 aa  217  2.9999999999999998e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0619  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.15 
 
 		 427 aa  216  5e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.374111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3457  phosphoribosylamine--glycine ligase  32.56 
 
 		 423 aa  216  5e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.021302  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0555  phosphoribosylamine--glycine ligase  35.45 
 
 		 424 aa  216  5e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0838  phosphoribosylamine--glycine ligase  33.49 
 
 		 425 aa  216  5.9999999999999996e-55  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.083606  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1777  phosphoribosylamine/glycine ligase  33.41 
 
 		 428 aa  216  7e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0026  phosphoribosylamine/glycine ligase  33.71 
 
 		 704 aa  216  9e-55  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0438  phosphoribosylamine--glycine ligase  31.31 
 
 		 430 aa  215  9.999999999999999e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.199076  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4544  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.25 
 
 		 428 aa  215  9.999999999999999e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.185185 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3413  phosphoribosylamine--glycine ligase  33.1 
 
 		 433 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.872928 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2453  phosphoribosylamine--glycine ligase  31.82 
 
 		 424 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.386914  normal  0.350843 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1729  phosphoribosylamine--glycine ligase  33.86 
 
 		 430 aa  215  9.999999999999999e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.576125 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3379  phosphoribosylamine--glycine ligase  33.57 
 
 		 414 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.104647 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0756  phosphoribosylamine/glycine ligase  31.64 
 
 		 424 aa  215  1.9999999999999998e-54  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.721746  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0492  phosphoribosylamine--glycine ligase  31.14 
 
 		 433 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1412  phosphoribosylamine--glycine ligase  34.7 
 
 		 422 aa  214  1.9999999999999998e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.8215  normal  0.900094 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>