26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1941 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_3838  hypothetical protein  85.25 
 
 		 428 aa  780    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1941  hypothetical protein  100 
 
 		 428 aa  894    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0907  hypothetical protein  47.53 
 
 		 433 aa  413  1e-114  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.68427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1720  hypothetical protein  46.14 
 
 		 432 aa  395  1e-108  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.26756  normal  0.377885 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1112  hypothetical protein  45.43 
 
 		 433 aa  383  1e-105  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1497  hypothetical protein  43.57 
 
 		 433 aa  371  1e-101  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08450  hypothetical protein  41.78 
 
 		 422 aa  345  1e-93  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1253  hypothetical protein  39.91 
 
 		 444 aa  330  3e-89  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.325224 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2914  hypothetical protein  40.76 
 
 		 432 aa  324  1e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0970289 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1362  hypothetical protein  39.61 
 
 		 438 aa  321  1.9999999999999998e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0529728  normal  0.404278 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0433  hypothetical protein  25.26 
 
 		 426 aa  139  1e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1717  hypothetical protein  30.24 
 
 		 468 aa  127  3e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000202258 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1610  hypothetical protein  25.41 
 
 		 423 aa  125  2e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000640568  unclonable  5.93437e-23 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1771  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  25.47 
 
 		 740 aa  83.2  0.000000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.212253  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3093  hypothetical protein  22.57 
 
 		 440 aa  57.8  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0089  hypothetical protein  22.75 
 
 		 431 aa  57  0.0000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.678836  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0573  phosphoribosylglycinamide synthetase  23.92 
 
 		 420 aa  55.5  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.23534  normal  0.22349 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0741  carbamoyl phosphate synthase large subunit  24.08 
 
 		 1040 aa  50.4  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7724  putative biotin carboxylase  26.36 
 
 		 430 aa  49.3  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.211642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14410  carbamoylphosphate synthase large subunit  23.19 
 
 		 423 aa  49.3  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0849  D-alanyl-alanine synthetase A  23.23 
 
 		 350 aa  48.9  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.37801  normal  0.165136 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3085  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  22.84 
 
 		 1076 aa  47  0.0007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2595  putative carbamoyl-phosphate-synthetase  22.1 
 
 		 398 aa  46.2  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.605395  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0730  hypothetical protein  21.03 
 
 		 436 aa  43.5  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2987  phosphoribosylglycinamide synthetase  20.95 
 
 		 410 aa  43.1  0.009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.0000000000875543  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1105  urea carboxylase  25.96 
 
 		 1208 aa  43.1  0.009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.480964  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>